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花生凝集素与Galbeta1-3Gal、甲基T抗原、Galbeta-6GalNAc、Galalpha1-3Gal和Galalpha 1-6Glc络合后的晶体结构，以及在Galalpaha1-3Galbeta1-4Gal存在下生长的晶体的晶体结构已使用100 K下收集的数据进行了测定。水桥作为产生碳水化合物特异性的策略的使用先前是从凝集素与乳糖（Galbeta-14-Glc）和T抗原（Galbeta-13-GalNAc）的复合物中推导出来的。这已通过分析Galbeta1-3Gal和甲基T抗原（Galbeta-3GalNAc-alpha-OMe）的配合物得到证实。对复合物中凝集素-糖相互作用的详细分析表明，当β-单体参与连接时，它们的作用更广泛。正如预期的那样，当链接为1->6时，第二个糖残基是不确定的。在分辨率高于2.5 A的所有结构的水化壳中，都存在二十多个水分子。大多数水分子参与稳定结构，尤其是环。参与凝集素-糖相互作用的水分子也基本保守。凝集素分子相当刚性，似乎不受温度变化的影响。

已经对所有已知结构的jacalin碳水化合物复合物、衍生自该复合物的未发光分子的模型以及X射线结构不可用的相关复合物的模型进行了分子动力学模拟。模拟结果和涉及jacalin的可用晶体结构允许描述分子的相对刚性和柔性区域，以及稳定结构所涉及的氢键的动态变化。局部灵活性似乎与溶剂的可及性有关。涉及侧链的氢键和涉及埋藏水分子的水桥似乎对环结构的稳定很重要。晶体结构中观察到的凝集素-碳水化合物相互作用，与之相关的平均参数来自模拟，堆叠残留物的能量贡献来自量子力学计算，碳水化合物和碳水化合物结合残基位置的分散与已知的jacalin-carbohydrate相互作用热力学参数一致。这些模拟以及X射线结果提供了一个更全面的关于雅卡林与碳水化合物结合的图片，而不仅仅是晶体分析提供的图片。模拟结果证实，在未连接的结构中，水分子往往占据凝集素-碳水化合物复合物中碳水化合物氧所占据的位置。自由凝集素、配体和配合物的模拟中的群体分布表明了构象选择和诱导拟合的结合。