目录

• 主题演讲：整合癌症基因组的系统生物学方法安德烈亚·卡里瓦诺.1 [美国国防部]
• 主题演讲：高分辨率序列和染色质特征预测人类基因组中转录因子的结合克里斯蒂娜·莱斯利.2 [美国国防部]
• 主题演讲：基于DNA的分子器件约翰·雷夫.三 [美国国防部]
• 邀请：凝聚模型中分阶段种群的算法组合方法的新观点保拉·博尼佐尼.4 [美国国防部]
• 受邀：亲属关系发现的快速且理论强大的算法丹尼尔·布朗0001.5 [美国国防部]
• 邀请：调和基因树及其应用奥利弗·尤伦斯坦.6 [美国国防部]
• 受邀：为进化上保守的序列基序搜索大量表观基因组数据森田信一.7 [美国国防部]
• 受邀：比较微生物基因组学吉里·纳拉辛汉.8 [美国国防部]
• 邀请：宏基因组组装的挑战Mihai流行音乐.9 [美国国防部]
• 邀请：使用下一代测序进行多类RNA功能分类保罗·瑞夫金,Yuk Yee Leung先生,王立三,布莱恩·格雷戈里.10 [美国国防部]
• 受邀：通过生物序列分析进行病毒传播丹尼尔·施瓦茨.11 [美国国防部]
• Bcl:：簇：一种在Pymol分子图形系统中结合可视化对生物分子进行聚类的方法纳森亚历山大,尼尔斯·沃泽尔,延斯·梅勒.13-18 [美国国防部]
• 识别差异调节基因Nirmalya Bandyopadhyay公司,马纳斯索马里亚,桑杰·兰卡,塔梅尔·卡维奇.19-25 [美国国防部]
• 用于模拟大型接触网上传染病传播的高性能生物计算基思·比塞特,阿什温·M.阿吉,马达夫·马拉特,吴俊峰.26-32 [美国国防部]
• PIntron：一种通过模式和文本的最大配对来预测基因结构的快速方法保拉·博尼佐尼,吉安卢卡·德尔拉·维多瓦,尤里·皮罗拉,拉斐拉·里兹.33-39 [美国国防部]
• SIPPER：一种将异构数据集成到代谢网络中的灵活方法菲利普·博德伦,达米安·埃维拉德,伊雷娜·鲁苏.40-45 [美国国防部]
• 从ESTs到ESRs：15种昆虫互斥外显子的比较分析帕特里夏·布恩迪亚,徐树宁,千叶亚基拉,中饰演约翰,罗伯特·洛雷多.46-51 [美国国防部]
• 从结构分析研究无序到有序的转变田浩昌,Chih-Yun Chiang（蒋志云）,冯伟林,陈玉凡.52-56 [美国国防部]
• 随机共振和场效应神经元模型中的最大似然参数估计陈军（Jun Chen）,何塞·苏亚雷斯,莫纳尔,阿曼·比哈尔.57-62 [美国国防部]
• 生物序列中频繁模式的挖掘算法陈玲（Ling Chen）,刘伟（音译）.63-68 [美国国防部]
• InfoBarcoding：分子生物标志物中非连续位点的选择大卫·K·Y·邱,彼得·S·C·徐.69-74 [美国国防部]
• 基于GPU的多尺度近似加速分子建模玛扬克·达加,吴俊峰,托马斯·斯科格兰.75至80 [美国国防部]
• 从LC-MS/MS数据推断血清蛋白水解活性彼得罗·迪特瓦尔德,杰里·奥斯特罗斯基,Jakub Karczmarski公司,安娜·甘宾.81-86 [美国国防部]
• 从整个转录组测序数据准确检测和基因分型表达变体豪尔赫·杜伊塔马,普拉莫德·斯利瓦斯塔瓦,离子I.Mandoiu.87-92 [美国国防部]
• 视网膜光学成像的扩展校正模型马丁·埃勒,J.凯纳斯托弗,D.坎宁安,M.博诺,布莱恩·布鲁克斯,罗伯特·邦纳.93-98 [美国国防部]
• 蛋白质刚性聚类分析中的冗余相互作用内奥米·福克斯,伊莱娜·斯特里努.99-104 [美国国防部]
• 基于线性分离基因对的基因子集选择新方法阿米拉利·贾法利安,阿利乌恩·恩贡（Alioune Ngom）.105-110 [美国国防部]
• 利用测度变化探索生物系统SDE模型的行为苏米特·库马尔Jha,克里斯托弗·詹姆斯·朗米德.111-116 [美国国防部]
• 基因表达的有序变化和基因-基因共表达模式的分析赖英磊.117-122 [美国国防部]
• RNA二级结构的最大预期精确结构邻居冯楼,彼得·克洛特.123-128 [美国国防部]
• 分布式临床决策支持的隐私保护框架乔治·马修,佐兰·奥布拉多维奇.129至134 [美国国防部]
• 基于文法的对齐序列RNA假结结构预测方法沟口信义,加藤由纪,Hiroyuki Seki先生.135-140 [美国国防部]
• 利用Hapler对真核生物读取数据进行稳健的单倍型重建肖恩·托·尼尔,斯科特·埃姆里奇.141-146 [美国国防部]
• 流式细胞术测量细胞状态转换的参数建模索米亚迪普塔（Saumyadipta Pyne）,史蒂文·哈斯,萧建豪,Tsung I.Lin（林宗一）.147-152 [美国国防部]
• 利用下一代测序数据识别结构变化的基于模型的聚类方法尹秀萍,马修·海耶斯,李静（音译）.153-158 [美国国防部]
• 跨膜β-桶蛋白的能量分类和结构预测范杜Tran,菲利普·查斯金特,萨阿德·谢赫,Jean-Marc斯特亚特.159-164 [美国国防部]
• 一种改进的用于精确基因组组装的最大似然公式阿迪亚·瓦尔玛,阿比拉姆牧场,斯里尼瓦斯·阿鲁鲁.165-170 [美国国防部]
• 基于平行鱼代理的逻辑回归识别相互作用的SNPs王佳音,金章,吴玉峰.171-177 [美国国防部]
• 使用慎重延迟分散控制器阻止规范网络模型中的传播动力学徐旺,桑迪普·罗伊,阎婉.178-183年 [美国国防部]
• 稳定的茎能shannon熵将非编码RNA与随机背景区分开来王英峰,阿米尔·曼佐尔,Pooya Shareghi公司,蒂莫西·肖,李英伟,拉塞尔·马姆伯格,蔡黎明.184-189 [美国国防部]
• 利用结构方程模型进行比较遗传途径分析小吴,凯瑟琳·夏普,张天一,陈红艳,魏朱,埃伦·李,萨菲赫·塔哈维,丹尼尔·范·德莱利.190-195 [美国国防部]
• 基于对称表示的干细胞图像分割易晓,Tuan D.Pham公司,杰夫·张,周晓波.196-201 [美国国防部]
• 阻塞G：使用简短读取来闭合草图组件中的间隙的管道邢阳,丹尼尔·梅德文,吉里·纳拉辛汉,Deborah Yoder-Himes公司,斯蒂芬·洛里.202-207 [美国国防部]
• 使用现代图形处理单元并行肽谱评分张健（Jian Zhang）,伊恩·麦克奎伦,吴方祥.208-213年 [美国国防部]
• 检测相对重复或水平基因转移的网络模型和有效方法张路欣（Louxin Zhang）,吴彦高,吴桃阳,于正.214-219 [美国国防部]
• 炎症性肠病病-非病回肠粘膜全基因组表达差异的聚类分析张天一,罗伯特·德西蒙,陈红艳,克里斯蒂娜·哈姆,杰弗里·袁,青青宫,史蒂文·亨特,特米斯托克利斯·达索普洛斯,罗德尼·D·纽伯里,丹尼尔·弗兰克,查尔斯·罗伯逊,诺曼·R·佩斯,艾丽卡·索德格伦,乔治·温斯托克,香敏焦,魏朱,埃伦·李.220-225 [美国国防部]
• 基于GPU的局部序列比对的有效成对统计显著性估计张玉红,桑奇特·米斯拉,丹尼尔·洪波,安基特·阿格拉瓦尔,廖伟庚,Alok N.Choudhary公司.226-231 [美国国防部]
• 海报：结直肠癌手术后不良结果的风险预测安基特·阿格拉瓦尔,桑奇特·米斯拉,Alok N.Choudhary公司,卡尔·比利莫里亚.232 [美国国防部]
• 海报：基于SEER数据的肺癌死亡率风险计算器安基特·阿格拉瓦尔,桑奇特·米斯拉,拉马纳桑·纳拉亚南,拉里斯·波列佩迪,Alok N.Choudhary公司.233 [美国国防部]
• 海报：ViSpA：病毒谱组装方法伊琳娜·阿斯特罗夫斯卡娅,巴萨姆·托克,塞尔盖·曼古尔,凯利·韦斯特布鲁克斯,离子I.Mandoiu,彼得·巴尔夫,亚历山大·泽利科夫斯基.234 [美国国防部]
• 海报：使用功能性电刺激开发截瘫患者的动态腿关节模型M.比扬扎德,罗齐塔·贾拉尼.235 [美国国防部]
• 海报：利用时滞关联性的上下文似然进行基因调控网络推断维杰恩德·查坦卡尔,普雷塔姆·戈什,穆罕默德·埃拉斯里,爱德华·J·珀金斯.236 [美国国防部]
• 海报：群体遗传参数估计中的拟蒙特卡罗方法池红梅,彼得·贝尔利.237 [美国国防部]
• 海报：MRMPath：一个基于网络的工具，用于识别LCMRM-MS分析的肽转换及其在生物途径中的应用奇基托·J·克拉托,钱德拉哈斯·纳恩,米卡科·卡瓦伊,兰登·威尔逊,斯蒂芬·巴恩斯.238 [美国国防部]
• 海报：基于文献挖掘的基因功能表征和聚类问题维努·达西吉,奥兰多卡拉姆,塞拉贾·皮迪马里.239 [美国国防部]
• 海报：为浏览神经科学本体集合设计可重用的用户界面阿克沙耶·达旺,艾莉森·诺兰.240 [美国国防部]
• 海报：使用高通量焦磷酸测序评估人类结直肠癌样本中活性内源性LINE1逆转录转座子的含量丹华凡,埃里克·拉赫曼,凯文·西尔弗斯坦,大卫·拉盖斯帕达.241 [美国国防部]
• 海报：通过动态编程进行从头蛋白质鉴定杰森·加利亚,安娜·谭·威尔逊,帕特里克·H·马登.242-243 [美国国防部]
• 海报：阿尔茨海默病中Ass42肽聚集过程的电子假说普雷塔姆·戈什,Bhaswati Datta公司,维贾亚拉加万·兰加查里.244 [美国国防部]
• 海报：生物应用中局部形状描述符的比较辛迪·格林,李若思,保罗·海德,阿兰·皮埃尔·皮埃尔,穆乐夫.245 [美国国防部]
• 海报：通过数据同化进行药物基因组途径综合筛选长谷川（Takanori Hasegawa）,山口芮,长崎Masao,Seiya Imoto公司,宫野佐治.246 [美国国防部]
• 海报：预测蛋白质亚核定位的邻域加权K-最近邻方法京沪,马克·席尔德,香河岩.247 [美国国防部]
• 海报：生物化学模型合成苏米特·库马尔Jha,克里斯托弗·詹姆斯·朗米德.248 [美国国防部]
• 海报：分析基因排序算法，从PubMed出版物中提取相关生物医学概念西蒙·科贝克,符文Stre,格雷戈·斯蒂利克,金东金（Jin-Dong Kim）,伊戈尔·佩内克,Yoshimasa Tsuruoka先生,彼得·科科尔,索菲亚·阿纳尼亚杜,Jun-ichi Tsujii先生.249 [美国国防部]
• 海报：H3N2流感疫苗：历史视角火青林,丹尼尔·博利,斯里南德·斯雷瓦赞.250 [美国国防部]
• 海报：用BlenX模拟肿瘤收缩药效学保拉·莱卡,奥赞·卡赫拉马诺古拉里,丹尼尔·莫普戈,科拉多·普里亚米,罗斯·A·苏.251 [美国国防部]
• 海报：使用配对测序数据构建基因组草图詹姆斯林赛,J.张,T.Farnham公司,吴彦祖（Y.Wu）,离子I.Mandoiu,瑞秋·J·O·尼尔,H.萨卢蒂,E.Bullwinkel公司,亚历山大·泽利科夫斯基.252 [美国国防部]
• 海报：区分生物医药文献挖掘中的科学缩写和基因刘国珍,Han Zhang（张涵）,乔治·奎尔霍斯特.253 [美国国防部]
• 海报：用于QSAR建模的GPU加速人工神经网络爱德华·W·洛,尼尔斯·沃泽尔,延斯·梅勒.254 [美国国防部]
• 海报：从高通量测序数据中发现单倍体塞尔盖·曼古尔,亚历山大·泽利科夫斯基.255 [美国国防部]
• 海报：基于序列的基因和亚型表达谱分析方案的实证比较马吕斯·尼古拉,离子I.Mandoiu.256 [美国国防部]
• 海报：生化信号：记忆增强的离散模拟安德烈·鲍恩,米哈拉·鲍恩,阿方索·罗德里格斯·帕东,约翰·杰克.257 [美国国防部]
• 海报：慢性病预防：转化生物信息学方法朱莉安娜·塔罗西·波莱蒂尼,亚历山德拉·阿拉尼兹·马塞多.258 [美国国防部]
• 海报：用局部回归稳健估计DNA甲基化佐佐木松司,森田信一.259 [美国国防部]
• 海报：从全基因组重新测序数据预测拷贝数变异的隐马尔可夫模型沈玉凤,顾一伟,Itsik Pe er公司.260 [美国国防部]
• 海报：PRDDs：二级结构的蛋白质残基距离和角度分布数据库孙晓勇,Ajith Gunaratne公司,吴志军.261 [美国国防部]
• 海报：HORIBALFRE：基于高阶剩余相互作用的折叠再认知算法潘杜拉甘·桑达拉穆蒂（Pandurangan Sundaramurthy）,拉希·斯列尼瓦桑,卡德·沙米尔,苏尼塔·加哈尔,拉马纳森·索德哈米尼.262 [美国国防部]
• 海报：用于绘制疾病相关基因的高性能计算威廉·瓦伦丁-库珀,黄云贵,Sang-Cheol Seok先生,维罗妮卡·维埃兰.263 [美国国防部]
• 海报：基于支持向量机和倾向量表的线性B细胞表位预测王贤伟,亚池林,屯门排,郝腾昌.264 [美国国防部]
• 海报：GPU加速刚体将原子结构拟合到电子密度图中爱德华·W·洛,尼尔斯·沃泽尔,延斯·梅勒.265 [美国国防部]
• 海报：蛋白质内部重复序列的识别和分类辛汉阳,王欣薇,曾黄石,屯门排.266 [美国国防部]
• 研讨会：从超深测序数据推断病毒种群伊琳娜·阿斯特罗夫斯卡娅.267 [美国国防部]
• 研讨会：下一代测序中的纠错方法杜米特鲁·布林扎,菲奥娜·海兰德.268 [美国国防部]
• 研讨会：基于磷的分子单倍型测序的生物信息学管道豪尔赫·杜伊塔马,恩京锡,萨布丽娜·舒尔茨,盖尔·麦克尤恩,托马斯·胡布施,玛格丽特·霍赫（Margret R.Hoehe）.269 [美国国防部]
• 研讨会：使用转录目录和配对RNA-Seq数据来识别差异选择性剪接布莱恩·霍华德,小平·谭,保拉·维罗内塞,斯特芬·海伯.270 [美国国防部]
• 研讨会：来自RNA-Seq数据的转录组组装：目标、算法和挑战魏丽,冯建兴,陶江.271 [美国国防部]
• 研讨会：下一代测序在基因组规模研究中的应用瑞秋·J·O·尼尔,詹姆斯林赛,黎明卡隆,萨哈尔·塞西,托马斯·海德,离子I.Mandoiu,帕斯克.272 [美国国防部]
• 工作坊：你能从下一代测序数据中组装整个基因组吗？Mihai流行音乐.273 [美国国防部]
• 研讨会：序列组装的高效顺序和并行算法桑古瑟瓦·拉贾塞卡兰,邱鼎（Hieu Dinh）,Vamsi Kundeti公司.274 [美国国防部]
• 研讨会：用下一代DNA测序表征结构变体本杰明·拉斐尔,苏珊娜·辛迪,安娜·里兹,阿里·巴希尔.275 [美国国防部]
• 研讨会：用于检测关联的全基因组测序实验设计中的覆盖权衡和功率估计沈玉凤,宋瑞杰,Itsik Pe er公司.276 [美国国防部]
• 研讨会：灵活的读分解，改进了短读错误纠正肖扬,卡琳·S·多尔曼,斯里尼瓦斯·阿鲁鲁.277 [美国国防部]
• 研讨会：表观遗传因子的靶向机制郭成元.278 [美国国防部]
• 研讨会：通过d进行脚本汇编Y.Zhang（张）,D.M.Rao先生,J.米勒,M.Ozden先生,C.梁,J.E.卡罗.279 [美国国防部]