利用信息熵研究基因组突变的新方法

我们报告了一种基于信息论研究遗传序列的非临床数学方法。我们的方法包括通过将基因组拆分为包含固定数量核苷酸的“窗口”来计算基因组的信息熵谱。使用m块信息熵公式计算每个窗口的信息熵值。我们表明基因组的信息熵谱包含足够的信息，可以检测基因突变，并可能预测未来的突变。我们的研究表明，最佳m块大小为2，最佳窗口大小应包含9个以上、33个以下的核苷酸。为了实现所建议的技术，我们创建了免费的专用软件。在此，我们报告了该方法对2019年12月在武汉收集的SARS-CoV-2病毒（MN908947）及其2020年2月从台湾随机选择的变种之一（MT370518）的参考RNA序列的成功测试，显示了7个突变。