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.2012;7(12):e51566。
doi:10.1371/journal.pone.0051566。 Epub 2012年12月12日。

外显子测序确定USH1C替代外显子中的创始移码突变是常染色体隐性遗传性视网膜色素变性伴迟发性听力损失的原因

附属公司

外显子测序确定USH1C替代外显子中的创始移码突变是常染色体隐性遗传性视网膜色素变性伴迟发性听力损失的原因

萨默·卡特布等。 公共科学图书馆一号. 2012.

摘要

我们采用纯合子作图和全外显子测序(WES)相结合的方法,在也门犹太血统家族中寻找常染色体隐性视网膜色素变性(arRP)的遗传原因。两个arRP也门犹太家庭的纯合子映射揭示了一些纯合子区域。随后对两个指数病例进行的WES分析显示,一个共享的纯合新核苷酸缺失(c.1220delG)导致USH1C的另一个外显子(#15)发生移码(p.Gly407Glufs*56)。对其他也门犹太患者的筛查显示,共有16名纯合子RP患者(对照组的携带者频率为0.008)。眼底镜和视网膜电图检查结果属于典型RP的范围。而其他USH1C突变通常导致Usher I型(包括RP、前庭功能障碍和先天性耳聋),对10名c.1220delG纯合子患者进行听力筛查,结果显示40岁以下患者听力正常,而老年患者表现为轻度至重度高音感音神经性听力损失。这是第一份已知USH1基因突变导致迟发性而非先天性感音神经性聋的报告。在我们队列中的也门犹太患者中,USH1C的c.1220delG突变占RP的23%。

PubMed免责声明

利益冲突声明

竞争利益:提交人声明,不存在相互竞争的利益。

数字

图1
图1。家谱和分离分析美国H1Cc.1220delG突变。
A.为整个外显子组测序选择的两个家族的结构。家族编号显示在相应的家族树上方。填充符号代表受影响的个体,而清晰符号代表未受影响的个人。生成编号显示在左侧,每个符号下方有单独的编号。这个美国H1C基因型表示为:M/M,c.1220delG突变的纯合子;M/+,杂合;+/+,野生型等位基因纯合子。索引框用箭头标记。B.部分的序列色谱图美国H1C对照个体(顶部)、杂合子(中部)和突变纯合子患者(底部)的第15外显子。c.1220delG突变(装箱)导致移码(p.Gly407Glufs*56)。
图2
图2。纯合子患者的眼部表型美国H1Cc.1220delG突变。
(A、C、E)三名患者的彩色眼底照片,年龄分别为13岁(MOL0486 II:3)、33岁(TB16-R12)和72岁(MOL1023-1)。请注意,眼底的严重程度随着年龄的增长而变化,并且存在致密的骨针状色素沉着。(B、D、F)A、C、E所示的三名患者黄斑区的相应眼底自发荧光成像。注意,年轻患者的中央凹周围有荧光环,33岁患者的萎缩低荧光区侵犯黄斑,72岁患者的萎缩低荧光区侵犯黄斑。(G,H,I)通过13 yo(面板G)、33 yo(H)和72 yo(I)中央凹的水平光学相干断层扫描(OCT)横截面美国H1C随着年龄的增长,视网膜,尤其是感光层厚度逐渐减少的患者。其中两例(H,I)患者可见视网膜内液体囊肿(黄斑囊样水肿)。
图3
图3。纯合子患者的听力测试结果美国H1Cc.1220delG突变。
A.患者MOL0486 II:3(13岁)听力正常。B.患有严重SNHL的患者MOL0887-3(44岁),特别是在较高频率下(下降模式)。C、 D.4000 Hz(C)和8000 Hz(D)频率下的听力阈值与年龄的关系。在年轻时,听力功能明显正常,但在40岁之后,敏感性明显降低。对于这10名患者中的每一位,都提供了来自左右耳的数据,显示了双耳之间的对称性。
图4
图4。美国H1C交替剪接的转录物。
答:。美国H1C通过选择性剪接可以产生四种不同的转录本。该方案表示的是美国H1C以及可以产生的选择性分裂的转录本。外显子编号在方框内描述。以前报告的转录本用虚线表示,新的转录本(USH1C_v4)用实线表示。底部面板显示USH1C功能域和相应的编码外显子。B.RT-PCR分析美国H1C拼接变体。由14F和23R引物扩增的249 bp PCR产物(顶面板)(表S1),代表最常见的美国H1C剪接亚型USH1C_v2在不同的人体组织中均有表达。新发现的转录物(USH1C_v4)如中间面板所示(引物14F和16R扩增的189 bp PCR带;表S1),显示出相对较低的表达水平。两种PCR产物都在包括视网膜在内的一些组织中进行了测序和验证。PGM1型RT-PCR用作对照(底部面板)。C.新鉴定的序列色谱图美国H1C剪接异构体。拼接变体(USH1C_v4)包含所有美国H1C描述了编码外显子和新剪接事件(外显子14-外显子15-外显子16)。

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引用人

工具书类

    1. Haim M(2002)《丹麦色素性视网膜炎的流行病学》,《眼科学报》增刊:1-34。-公共医学
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出版物类型

MeSH术语

赠款和资金

本研究得到了美国抗击失明基金会(BR-GE-0510-0490-HUJ to DS)、以色列科学基金会传统生物医学项目(授予DS和TBY编号612/09)以及Yedidut 1研究拨款(授予EB)的资助。资助者在研究设计、数据收集和分析、出版决定或手稿准备方面没有任何作用。