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.2004年8月27日;573(1-3):83-92.
doi:10.1016/j.febslet.2004.07.055。

秩积:一种在重复微阵列实验中检测差异调节基因的简单而强大的新方法

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秩积:一种在重复微阵列实验中检测差异调节基因的简单而强大的新方法

雷纳百年灵等。 FEBS信函. .
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摘要

微阵列实验分析的主要目标之一是识别在两种实验条件下差异表达的基因。这项任务由于数据的噪音和同时检测的大量基因而变得复杂。在这里,我们提出了一种新的技术来识别差异表达基因,这种差异表达基因不是来自复杂的统计模型,而是来自对生物推理的分析。这项新技术基于从重复实验中计算秩积(RP),既快速又简单。同时,它提供了一种直接且统计上严格的方法来确定每个基因的显著性水平,并允许在微阵列实验的多重测试情况下灵活控制错误检测率和家族错误率。我们在三个生物数据集上使用RP技术,并表明在每种情况下,它都比Tusher等人的微阵列显著性分析(SAM)中实现的非参数t检验变量表现得更可靠和一致。我们还表明,RP结果在高噪声数据中是可靠的。对已识别基因的生理功能的分析表明,RP方法对于识别生物学相关的表达变化非常有效。此外,使用RP可以大幅减少获得可重复结果所需的重复实验数量。

PubMed免责声明

中的注释

  • 关于分析重复实验的秩积法的评论。
    日本科齐奥。 Koziol JA。 FEBS信函。2010年3月5日;584(5):941-4. doi:10.1016/j.fbslet.2010.01.031。Epub 2010年1月20日。 FEBS信函。2010 PMID:20093118 免费PMC文章。

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