跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
比较研究
.2003:19补充1:i315-22。
doi:10.1093/bioinformatics/btg1044。

利用微阵列平台进行基于基因结构的剪接变体反褶积

附属公司
比较研究

利用微阵列平台进行基于基因结构的剪接变体反褶积

Hui Wang(王慧)等。 生物信息学. 2003.

摘要

动机:选择性剪接允许单个基因产生多个mRNA,这些mRNA可以被翻译成功能和结构不同的蛋白质。一个基因可以有多种不同浓度的变体共存。估计每个变异的相对丰度对于研究潜在的生物功能很重要。微阵列是测量基因表达的标准工具。但大多数设计和分析都没有考虑剪接变体。因此,精确的基因表达谱分析需要剪接差异特异性芯片设计和分析算法。

结果:受Li和Wong(2001)的启发,我们开发了一种基于基因结构的算法来确定已知剪接变异体的相对丰度。使用基因结构作为约束条件,在多个实验中对探针强度进行建模。模型参数通过最大似然估计(MLE)过程/框架获得。该算法生成每个变量的相对浓度,以及与每个探针相关的亲和项。通过一组受控尖峰实验以及使用人类剪接变体阵列的内源性组织样本对算法进行验证。

PubMed免责声明

类似文章

引用人