Modulation of tRNAAla identity by inorganic pyrophosphatase

doi:10.1073/pnas.092152799

.2002年4月30日；99(9):5965-70.

doi:10.1073/pnas.092152799。

无机焦磷酸酶对tRNAAla特性的调节

阿列克谢·德沃尔夫森¹, Olke C Uhlenbeck公司

附属公司

PMID： 11983895
预防性维修识别码： PMC122885型
内政部： 10.1073/pnas.092152799

无机焦磷酸酶对tRNAAla特性的调节

阿列克谢·德沃尔夫森等。美国国家科学院程序. 2002.

.2002年4月30日；99(9):5965-70.

doi:10.1073/pnas.092252799。

作者

阿列克谢·德沃尔夫森¹, Olke C Uhlenbeck公司

附属

¹科罗拉多大学化学与生物化学系，美国科罗拉多州博尔德市，邮编80309-0215。

PMID： 11983895
预防性维修识别码： PMC122885型
内政部： 10.1073/pnas.092152799

摘要

开发了一种高灵敏度的tRNA氨酰化分析方法，该方法通过氨基酸附着在3'-（32）P-标记的tRNA上，直接测量氨酰化tRNA的分数。当应用于大肠杆菌丙氨酸-tRNA合成酶时，该方法可以准确测量tRNA（Ala）最有害突变体的氨酰化。在没有和存在无机焦磷酸酶和延伸因子Tu的情况下，评估了tRNA（Ala）身份突变对氨酰化效率（k（cat）/k（M价值减少了几千倍。这些结果部分地调和了体内和体外tRNA（Ala）同一性分析之间的差异。

PubMed免责声明

数字

图1
YFA2氨酰化的时间历程*大肠杆菌*通过我们的TLC分析或传统的掺入法测定AlaRS[^三H] 在1μM tRNA、20μM Ala和5(一)或10 nM AlaRS(B类). (一)3′时程-³²用TLC分析P标记的YFA2氨酰化反应。(B类)在双标签实验中通过TLC（●）或^三H合并（○）。

图2
PPase对tRNA氨基酰化的影响*大肠杆菌*阿拉斯(一和B类)在1μM YFA2和0.25（）、2.5（⋄）、25（□）或250（○）nM AlaRS下进行氨酰化。开放符号，不添加PPase；封闭符号，在PPase的存在下。(C类)在没有PPase的情况下进行YFA2氨酰化的时间过程（○）。在100 nM AlaRS和1μM tRNA下进行氨酰化。10分钟后，10单位/ml PPase(♦) 或添加100 nM AlaRS（□）。

请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

tRNA氨酰化体内结构功能分析的可靠性。
McClain WH、Jou YY、Bhattacharya S、Gabriel K、Schneider J。 McClain WH等人。分子生物学杂志。1999年7月9日；290(2):391-409. doi:10.1006/jmbi.1999.2884。分子生物学杂志。1999 PMID：10390340
大肠杆菌中tmRNA与丙氨酸-tRNA合成酶和延伸因子Tu结合的动力学参数。
Barends S、Wower J、Kraal B。 Barends S等人。生物化学。2000年3月14日；39(10):2652-8. doi:10.1021/bi992439d。生物化学。2000 PMID：10704215
来自大肠杆菌MRE 600的异亮氨酸-tRNA合成酶。氨酰化反应的不同途径取决于焦磷酸酶的存在、焦磷酸交换中底物添加的顺序以及ATP类似物的底物特异性。
Freist W、Sternbach H、Cramer F。 Freist W等人。欧洲生物化学杂志。1982年11月15日；128(2-3):315-29. 欧洲生物化学杂志。1982. PMID：6129973
大肠杆菌中的无机焦磷酸和无机焦磷酸酶。
Kukko-Kalske E，Heinonen J。 Kukko-Kalske E等人。国际生物化学杂志。1985;17(5):575-80. doi:10.1016/0020-711x（85）90288-5。国际生物化学杂志。1985 PMID：2993053 审查。没有可用的摘要。
微生物无机焦磷酸酶。
拉赫蒂·R。拉提R。《微生物评论》，1983年6月；47(2):169-78. doi:10.1128/mr.47.2.169-178.1983。《微生物评论》，1983年。 PMID：6135978 免费PMC文章。审查。没有可用的摘要。

查看所有类似文章

引用人

一种通过tRNA-Seq测量氨酰化的稳健方法。
Davidsen K，Sullivan LB。 Davidsen K等人。埃利夫。2024年7月30日；12：RP91554。doi:10.7554/eLife.91554。埃利夫。2024 PMID：39076160 免费PMC文章。
一种通过tRNA-Seq测量氨基酰化的稳健方法。
Davidsen K，Sullivan LB。 Davidsen K等人。 bioRxiv[预印本]。2024年3月6日2023.07.31.551363。doi:10.1101/2023.07.31.551363。生物Rxiv。2024 更新位置：埃利夫。2024年7月30日；12：RP91554。doi:10.7554/eLife.91554。 PMID：37577502 免费PMC文章。已更新。预打印。
人类EPRS1中的氨基酰化缺陷双等位基因突变与精神运动发育迟缓、癫痫和耳聋相关。
Jin D、Wek SA、Cordova RA、Wek RC、Lacombe D、Michaud V、Musier-Forsyth K。 Jin D等人。临床遗传学。2023年3月；103(3):358-363. doi:10.1111/cge.14269。Epub 2022年12月1日。临床遗传学。2023 PMID：36411955 免费PMC文章。
亮氨酸-tRNA合成酶初始催化步骤的分配是由活性位点肽-方案翻转驱动的。
Pang L、Zanki V、Strelkov SV、Van Aerschot A、Gruic-Schovj I、Weeks SD。 Pang L等人。公共生物。2022年8月29日；5(1):883. doi:10.1038/s42003-022-03825-8。公共生物。2022 PMID：36038645 免费PMC文章。
通过焦磷酸分解逐步调节生产性和流产性转录起始。
Plaskon D、Evensen C、Henderson K、Palatnik B、Ishikuri T、Wang HC、Doughty S、Thomas Record M Jr。 Plaskon D等人。分子生物学杂志。2022年7月15日；434(13):167621. doi:10.1016/j.jmb.2022.167621。Epub 2022年5月6日。分子生物学杂志。2022 PMID：35533764 免费PMC文章。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. Normanly J、Kleina L G、Masson J M、Abelson J、Miller J H.J Mol Biol。1990;213:719–726.-公共医学
1. Sampson J R、DiRenzo A B、Behlen L S、Uhlenbeck O C.科学。1989;243:1363–1366.-公共医学
1. 舒尔曼·L·H，佩尔卡·H·科学。1988;242:765–768.-公共医学
1. Giege R、Sissler M、Florentz C.《核酸研究》1998；26:5017–5035.-项目管理咨询公司-公共医学
1. Rould MA、Perona J J、Soll D、Steitz T A.科学。1989;246:1135–1142.-公共医学

出版物类型

行动

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

物质

行动
行动
行动
行动

赠款和资金

LinkOut-更多资源

[1] Normanly J、Kleina L G、Masson J M、Abelson J、Miller J H.J Mol Biol。1990;213:719–726.-公共医学

[2] Normanly J、Kleina L G、Masson J M、Abelson J、Miller J H.J Mol Biol。1990;213:719–726.-公共医学

[3] Sampson J R、DiRenzo A B、Behlen L S、Uhlenbeck O C.科学。1989;243:1363–1366.-公共医学

[4] Sampson J R、DiRenzo A B、Behlen L S、Uhlenbeck O C.科学。1989;243:1363–1366.-公共医学

[5] 舒尔曼·L·H，佩尔卡·H·科学。1988;242:765–768.-公共医学

[6] 舒尔曼·L·H，佩尔卡·H·科学。1988;242:765–768.-公共医学

[7] Giege R、Sissler M、Florentz C.《核酸研究》1998；26:5017–5035.-项目管理咨询公司-公共医学

[8] Giege R、Sissler M、Florentz C.《核酸研究》1998；26:5017–5035.-项目管理咨询公司-公共医学

[9] Rould MA、Perona J J、Soll D、Steitz T A.科学。1989;246:1135–1142.-公共医学

[10] Rould MA、Perona J J、Soll D、Steitz T A.科学。1989;246:1135–1142.-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

您的RSS源

无机焦磷酸酶对tRNAAla特性的调节

附属

无机焦磷酸酶对tRNAAla特性的调节

作者

附属

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

分子生物学数据库

其他

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

相关信息

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

分子生物学数据库

其他