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.2001年1月;68(1):26-37.
doi:10.1086/316954。 Epub 2000年11月21日。

Usher综合征1D和非综合征常染色体隐性聋DFNB12是由新型钙粘蛋白样基因CDH23的等位突变引起的

附属公司

Usher综合征1D和非综合征常染色体隐性聋DFNB12是由新型钙粘蛋白样基因CDH23的等位突变引起的

J M博克等。 美国人类遗传学杂志. 2001年1月.

摘要

导致非综合征常染色体隐性耳聋(DFNB12)和与视网膜色素变性和前庭功能障碍相关的耳聋(USH1D)的基因先前被定位到染色体10q21-q22的重叠区域。对7个分离非综合征常染色体隐性遗传性耳聋的高血缘家族进行分析,以完善DFNB12基因座。在单个家族中,D10S1694和D10S1737之间定义了一个关键区域,相隔约0.55 cM。对该地区的18个候选基因进行了测序。在DFNB12家族和USH1D家族中都发现了一个新的类钙粘蛋白基因CDH23的突变。在5个DFNB12家族中发现6个错义突变,在4个USH1D家族中发现2个无义突变和2个移码突变。CDH23的northern blot分析显示9.5-kb转录本主要在视网膜中表达。CDH23也在耳蜗中表达,如耳蜗cDNA的聚合酶链式反应扩增所证明的那样。

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数字

图1
图1
五个患有DFNB12的近亲家族和三个患有USH1D的家族的系谱,分离CDH23。受USH1D影响的304家系的系谱已在别处公布(Wayne等人,1996年)。黑色符号代表有临床记录的先天性耳聋、视网膜变性和前庭功能障碍患者,如图例所述。显示了PKSR46a家族的基因型和单倍型数据。对于DFNB12型基因座,未受影响个体27的单倍型显示近端断点,位于D10S1694,受影响个体29显示远端断点第10页第1737页。152N13aat是BAC 152N13上鉴定的一个多态性三核苷酸重复序列。
图2
图2
遗传和物理地图DFNB12型PKSR46a家族中由近端和远端断点定义的位点。Marshfield医学研究基金会医学遗传学中心绘制的多态性标记距离图如左图所示。近端断点、标记D10S1694,和远端断点标记D10S1737,显示为染色体上的交叉,链接的标记显示为染色体的黑色圆圈。显示了跨越链接区域的BAC和18个候选基因的突变测序。基因座名称用斜体表示。非斜体条目表示没有相关位点指定的克隆或与其他基因有显著同源性的新基因。BAC contig中有两个缺口,150D20是该区域唯一一个序列完成的BAC。
图3
图3
CDH23型cDNA和钙粘蛋白-23蛋白的结构(GenBank登录号AY010111)。文本中描述的突变显示在蛋白质结构下方,+1G→A供体-剪接体突变显示在结构上方,用箭头表示。第15内含子CDH23型包含编码在相反链上的嵌套基因(FLJ00041[GenBank登录号AK024449])。BLAST分析表明CDH23型和FLJ00041编码在BAC RP23-161B11上。EC表示细胞外钙粘蛋白重复序列,而TM表示TMpred预测的跨膜跨越区域。
图4
图4
Northern印迹分析。1-6车道含有10μg来自视网膜、睫状体、视网膜色素上皮-脉络膜、晶状体、虹膜和大脑的总RNA。9.5–0.24-kb RNA阶梯中的条带位置显示在右边。所示为4d曝光自射线照片。人类视网膜9.5 kb的频带可能是一个双谱带。在磷化氢成像仪屏幕上曝光1周,显示出相同的结果,没有其他波段(数据未显示)。
图5
图5
USH1D和DFNB12代表性家族突变的核苷酸序列,野生型序列显示在突变等位基因下方。的核苷酸和蛋白质序列CDH23型和cadherin-23基于GenBank登录号AY010111的数据。箭头表示突变体的核苷酸发生了改变CDH23型等位基因。A、,304家族中保守供体剪接位点的突变,患有USH1D(Wayne等人,1996年)。经典的GT供体二核苷酸用下划线表示,剪接位点用箭头表示。B、,PKZA56家族无意义突变,USH1D导致翻译提前终止。C、,PKSR46a家族中的错义突变,具有DFNB12,天冬氨酸被天冬酰胺取代。

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