跳到主要内容

这是2024年10月15日PMC网站的更新预览。了解更多信息

返回当前站点
PMC主页
EMBO Journal徽标Link to The EMBO Journal
.1993年3月；12(3):1141–1151. 数字对象标识：10.1002/j.1460-2075.1993.tb05755.x

二倍体和单倍体原代人类细胞Alu序列中的DNA甲基化。

S Kochanek公司 1,D伦兹 1,W Doerfler公司 1
PMCID:PMC413315 PMID:8384552

摘要

我们研究了人类Alu序列中的DNA甲基化，包括与α1珠蛋白、组织纤溶酶原激活剂（tPA）、促肾上腺皮质激素（ACTH）和血管生成素基因相关的一般和特定Alu序列。我们通过甲基化敏感限制性内切酶切割结合Southern杂交和基因组测序，研究了淋巴细胞、粒细胞、大脑、心肌和精子以及人类HeLa和KB细胞系的DNA。结果总结如下。（i） 在分化的原始人类细胞中，铝元素通常高度甲基化，即使它们位于非常富含5'-CG-3'的区域。这一发现与超甲基化本身是5'-CG-3'序列因脱氨基和随后突变而丢失5-甲基脱氧胞苷（5-mC）的充分条件这一概念不一致。（ii）特定Alu序列中的甲基化水平存在明显差异。（iii）单倍体精子DNA中的Alu元素甲基化程度远低于二倍体细胞。初步数据表明精子含有Alu特异性RNA。（iv）用Alu元件进行的无细胞转录实验结果表明，Alu元件的体外转录可被5'-CG-3'甲基化抑制。Alu元件中高水平的5'-CG-3'甲基化可能导致其普遍的转录不活动。（v） 在铝元素和周围序列中观察到的甲基化模式以细胞类型特异性个体间一致性为特征。

全文

PDF格式
1141

本文中的图像

1142图像
第1142页
1144图像
第1144页
1145图像
第1145页
1146图像
第1146页
1147图像
第1147页
1148图像
第1148页

选定的引用

这些参考文献在PubMed中。这可能不是本文的完整参考文献列表。

  1. Bains W.人类Alu序列的多重起源。分子进化杂志。1986;23(3):189–199. doi:10.1007/BF02115575。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  2. Batzer M.A.，Deininger P.L.一个人类特有的Alu序列亚家族。基因组学。1991年3月；9(3):481–487. doi:10.1016/0888-7543（91）90414-a。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  3. Blin N.，Stafford D.W.从真核生物中分离高分子量DNA的通用方法。《核酸研究》，1976年9月；3(9):2303–2308. doi:10.1093/nar/3.9.2303。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  4. Chandler L.A.、Ghazi H.、Jones P.A.、Boukamp P.、Fusenig N.E.人类c-Ha-ras-1基因的等位基因特异甲基化。单元格。1987年8月28日；50(5):711–717. doi:10.1016/0092-8674（87）90329-1。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  5. Church G.M.，Gilbert W.基因组测序。美国国家科学院院刊，1984年4月；81(7):1991–1995. doi:10.1073/pnas.81.7.1991。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  6. Degen S.J.、Rajput B.、Reich E.人类组织纤溶酶原激活剂基因。生物化学杂志。1986年5月25日；261(15):6972–6985.[公共医学] [谷歌学者]
  7. Deininger P.L.、Jolly D.J.、Rubin C.M.、Friedmann T.、Schmid C.W.对300个核苷酸重新命名的重复人类DNA克隆进行的碱基序列研究。分子生物学杂志。1981年9月5日；151(1):17–33. doi:10.1016/0022-2836（81）90219-9。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  8. Deininger P.L.，Slagel V.K.最近扩增的Alu家族成员共享一个共同的父母Alu序列。分子细胞生物学。1988年10月；8(10):4566–4569. doi:10.1128/mcb.8.10.4566。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  9. Dignam J.D.、Lebovitz R.M.、Roeder R.G.通过RNA聚合酶II在分离哺乳动物细胞核的可溶性提取物中准确启动转录。《核酸研究》，1983年3月11日；11(5):1475–1489. doi:10.1093/nar/11.5.1475。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  10. Dobrzanski P.、Hoeveler A.和Doerfler W.在无细胞转录系统中通过腺病毒启动子的序列特异性甲基化进行灭活。《维罗尔杂志》。1988年11月；62(11):3941–3946. doi:10.1128/jvi.62.11.3941-3946.1988。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  11. Doerfler W.DNA甲基化和基因活性。生物化学年度收益。1983;52:93–124. doi:10.1146/annurev.bi.52.070183.000521。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  12. Feinberg A.P.，Vogelstein B.一种放射性标记DNA限制性内切酶片段以获得高比活性的技术。分析生物化学。1983年7月1日；132(1):6–13. doi:10.1016/0003-2697（83）90418-9。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  13. Gillis S.、Watson J.白细胞介素-2依赖性细胞溶解T细胞系培养。免疫学评论，1981年；54:81–109. doi:10.1111/j.1600-065x.1981.tb00435.x。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  14. Jurka J.，Milosavljevic A.人类Alu基因的重建和分析。分子进化杂志。1991年2月；32(2):105–121. doi:10.1007/BF02515383。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  15. Jüttermann R.、Hosokawa K.、Kochanek S.、Doerfler W.聚合酶III对腺病毒2型VAI RNA的转录被序列特异性甲基化阻断。《维罗尔杂志》。1991年4月；65(4):1735–1742. doi:10.1128/jvi.65.4.1735-1742.1991。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  16. Klenow H.，Overgaard Hansen K.，Patkar S.A.天然DNA聚合酶的蛋白质水解裂解为两个不同的催化片段。检测条件对伴随切割的核酸外切酶活性和聚合酶活性变化的影响。欧洲生物化学杂志。1971年10月14日；22(3):371–381. doi:10.1111/j.1432-1033.1971.tb01554.x。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  17. Kochanek S.、Radbruch A.、Tesch H.、Renz D.、Doerfler W.白细胞亚群和白血病中肿瘤坏死因子α和β人类基因的DNA甲基化谱。美国国家科学院院刊1991年7月1日；88(13):5759–5763. doi:10.1073/pnas.88.13.5759。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  18. Kochanek S.、Toth M.、Dehmel A.、Renz D.、Doerfler W.肿瘤坏死因子α和β人类基因甲基化谱的个体间一致性。美国国家科学院院刊，1990年11月；87(22):8830–8834. doi:10.1073/pnas.87.22.8830。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  19. Korenberg J.R.，Rykowski M.C.人类基因组组织：Alu、系和中期染色体带的分子结构。单元格。1988年5月6日；53(3):391–400. doi:10.1016/0092-8674（88）90159-6。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  20. Kurachi K.、Davie E.W.、Strydom D.J.、Riordan J.F.、Valley B.L.血管生成素（一种人类血管生成因子）的cDNA和基因序列。生物化学。1985年9月24日；24(20):5494–5499. doi:10.1021/bi00341a032。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  21. LEHMAN I.R.、BESSMAN M.J.、SIMMS E.S.、KORNBERG A.脱氧核糖核酸的酶法合成。I.底物的制备和大肠杆菌酶的部分纯化。生物化学杂志。1958年7月；233(1):163–170.[公共医学] [谷歌学者]
  22. Langner K.D.，Weyer U.，Doerfler W.腺病毒E1区对哺乳动物细胞原核基因表达的反式作用：对5'-CCGG-3'甲基化的抗性。美国国家科学院院刊，1986年3月；83(6):1598–1602. doi:10.1073/pnas.83.6.1598。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  23. Ludwig M.、Wohn K.D.、Schleuring W.D.、Olek K.人类组织型纤溶酶原激活物（TPA）基因因Alu插入/缺失事件导致的等位基因二型性。人类遗传学。1992年2月；88(4):388–392. doi:10.1007/BF00215671。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  24. Maxam A.M.，Gilbert W.DNA测序的新方法。美国国家科学院院刊1977年2月；74(2):560–564. doi:10.1073/pnas.74.2.560。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  25. Perez Stable C.，Ayres T.M.，Shen C.K.Alu重复启动子的独特序列组织和功能编程。美国国家科学院院刊，1984年9月；81(17):5291–5295. doi:10.1073/pnas.81.17.5291。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  26. Perez-Stable C.，Shen C.K.Alu家族重复序列的前后启动子元件的竞争和合作功能。分子细胞生物学。1986年6月；6(6):2041–2052. doi:10.1128/mcb.6.6.2041。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  27. Renbaum P.、Abrahamove D.、Fainsod A.、Wilson G.G.、Rottem S.、Razin A.从螺旋体菌株MQ1（M.SssI）克隆、表征CpG DNA甲基化酶编码基因并在大肠杆菌中表达。核酸研究1990年3月11日；18(5):1145–1152. doi:10.1093/nar/18.5.1145。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  28. 罗杰斯J.逆转录酶定义。自然。1983年2月10日；301(5900):460–460. doi:10.1038/301460e0。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  29. Schmid C.W.人类Alu亚家族及其甲基化通过杂交显示。《核酸研究》，1991年10月25日；19(20):5613–5617. doi:10.1093/nar/19.20.5613。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  30. Schmid C.W.，Jelinek W.R.分散重复序列的Alu家族。科学。1982年6月4日；216(4550):1065–1070. doi:10.1126/science.6281889。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  31. Silva A.J.，White R.甲基化模式等位基因蓝图的遗传。单元格。1988年7月15日；54(2):145–152. doi:10.1016/0092-8674（88）90546-6。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  32. Southern E.M.检测凝胶电泳分离的DNA片段中的特定序列。分子生物学杂志。1975年11月5日；98(3):503–517. doi:10.1016/s0022-2836（75）80083-0。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  33. Sutter D.、Westphal M.、Doerfler W.腺病毒12型转化仓鼠细胞基因组中病毒DNA序列的整合模式。单元格。1978年7月；14(3):569–585. doi:10.1016/0092-8674（78）90243-x。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  34. Takahashi H.、Hakamata Y.、Watanabe Y.、Kikuno R.、Miyata T.、Numa S.人类促肾上腺皮质激素-β-脂蛋白前体基因的完整核苷酸序列。《核酸研究》，1983年10月11日；11(19):6847–6858. doi:10.1093/nar/11.19.6847。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  35. Toth M.、Lichtenberg U.和Doerfler W.基因组测序揭示了活性启动子中的5-甲基胞嘧啶游离结构域和预加甲基化模式的扩散。美国国家科学院院刊1989年5月；86(10):3728–3732. doi:10.1073/pnas.86.10.3728。[内政部] [PMC免费文章] [公共医学] [谷歌学者]
  36. Ullu E.、Murphy S.、Melli M.人类7SL RNA由插入alu序列中的140个核苷酸中间重复序列组成。单元格。1982年5月；29(1):195–202. doi:10.1016/0092-8674（82）90103-9。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  37. Weiner A.M.、Deininger P.L.、Efstratiadis A.非病毒逆转录酶：基因、假基因和由遗传信息逆向流动产生的转座子。生物化学年度收益。1986;55:631–661. doi:10.1146/annurev.bi.55.070186.003215。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]
  38. Willard C.、Nguyen H.T.、Schmid C.W.存在至少三个不同的Alu亚科。分子进化杂志。1987;26(3):180–186. doi:10.1007/BF02099850。[内政部] [公共医学] [谷歌学者]

EMBO Journal的文章由以下人员提供自然出版集团

资源