PDBML架构资源
蛋白质数据库标记语言(PDBML)提供了XML格式的PDB数据。XML中提供了此格式的描述PDB Exchange数据字典的架构。此架构由生成直接翻译PDBx/mmCIF交换数据字典PDB使用的其他数据字典已经被电子翻译成XML/XSD模式,这些也显示在下面的列表中。
- PDBML格式的数据文件可以从wwPDB下载ftp站点.
- PDBML数据文件以三种形式提供:
- 完全标记的文件,
- 没有原子记录的文件
- 使用更节省空间的atom记录编码的文件
- 安文章提供了PDBML说明。
PDBML:用XML表示存档的大分子结构数据。
John Wesbrook、Nobutoshi Ito、Haruki Nakamura、Kim Henrick和Helen M.Berman,
生物信息学,21(7),988-9922005。