常见问题

问: 我如何获得一个或多个物种中没有同源基因的基因列表?
答: 如果你想获得没有同源基因的基因其他物种,你可以使用获取两个基因组之间的同源序列搜索。低于可选-仅返回以下项的唯一基因:选择物种获取基因。注:inparalogs作为唯一基因被包括在内,但被指明与结果相似。如果你想获得没有同源基因的基因倍数物种,使用比较基因组与比较基因组中的直方图搜索。这是一个2步搜索。在步骤1中,选择要比较的基因组。在搜索的第2步中,您可以选择缺少正射影像对于所有你想用来排除你体内基因的物种当存在直系基因时索引基因组。这将给你的基因在所有的选择的基因组。
为什么此直方图/分析没有直方图分类?
答: Ortholuge使用一个外群物种来计算它的系统发育比率用于观察正交散度。如果没有合适的外群物种,只有交互最佳BLAST预测才能用于分析。

当有可用的外群物种时,一对同源基因将当外群基因组中有基因时,进行Ortholuge分类这与比较物种中的两个直系同源。如果这个外群体基因缺失,无法进行Ortholuge评估。

问: 我可以查看同源基因的基因上下文(或相邻基因)吗?
答: 我们在获取正交图单个基因获取两个基因组之间的同源序列搜索。检查远离的是的在下面显示基因上下文显示中的基因上下文结果表。
问: 基因颜色在基因背景图像中意味着什么?
答: 基因根据其亚细胞定位进行染色。红色,细胞质;黄色的周质膜;橙色,细胞质膜;绿色,外膜;蓝色,细胞外;灰色,未知。