cTRAP公司

cTRAP公司是一个R包，用于将差异基因表达结果与从连接图 （Subramanian等人，Cell 2017）这样的分析不仅可以推断所观察到的基因表达差异的分子原因，还可以识别可能驱动或逆转特定转录组改变的小分子。

正在安装

生物导体

生物导体中提供cTRAP并可与以下部件一起安装：

如果 (!requireNamespace（必需命名空间）(“生物经理”，悄悄地= 真的))
    安装.包(“生物管理器”)
生物技术经理::安装(“cTRAP”)

github

cTRAP也可以从GitHub安装：

安装.包(“遥控器”)
遥控器::安装github(“nuno-agostinho/cTRAP”)

码头工人

Docker图像基于生物导体码头并包含cTRAP及其依赖项。

1. 拉动最新的Docker图片：

docker pull ghcr.io/nuno-agostinho/ctrap:最新

2. 从Docker图像启动RStudio Web：

docker run-e PASSWORD=bico-p 8787:8787 ghcr.io/nuno-agostinho/ctrap：最新

3. 通过Web浏览器访问RStudio Webhttps://localhost:8787
4. 与用户一起登录RStudio Webrstudio音箱和密码生物的
5. 使用在RStudio Web中加载包库（cTRAP）