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神经科学信息框架

搜索术语

InterLex项目是SciCrunch的核心组成部分,由神经科学信息框架项目(NIF)、,NIDDK信息网络(dkNET)和脊髓损伤开放数据共享库是生物医学术语的动态词典。与百科全书不同,词典提供了一个术语的含义,而不是所有关于它的信息。InterLex的构建旨在帮助改善生物医学科学家交流数据的方式,以便NIF和dkNET可以更容易地找到数据,并提供更强大的方法来集成跨分布式资源的数据。生物医学科学中数据集成的一大障碍是数据库和其他领域中术语的使用不一致文献等资源。当我们使用相同的术语来表示不同的事物时,我们不能轻易提出跨越范围的问题多种资源。例如,如果三个数据库都有关于大脑皮层中表达哪些基因的信息,但它们使用的都不同大脑皮层的定义,那么很难比较它们。InterLex允许数据值的关联(即字段或字段中文本的值)到支持数据终端映射众包的术语。

InterLex建立在NeuroLex的基础上(参见Larson和Martone 2013Neurolex:神经科学知识的在线框架.神经信息学前沿,7:18),包含所有现有的NeuroLex术语。NeuroLex中的初始条目是从NIFSTD本体论。NIFSTD目前有大约60000个概念(包括类和同义词),涵盖大体解剖、细胞、,亚细胞结构、疾病、功能和技术。InterLex使用Web本体语言(OWL)的原语和可以直接导出为各种标准本体格式。

interlex的主要目标是在许多其他现有术语、词典和本体之上提供一个稳定层(即为数据应用程序提供一种联合本体的方法),并提供一组本地和本地映射。未来,InterLex将支持特定于用户的名称空间,以便用户可以自定义其来源的确切定义或本体,以及这些术语的关系。然而,重要的是,InterLex实施了一个简单的规则,即表示相同的术语同一超类下的概念将维护相同的标识符片段(即“ilx1234567”)。然而,每个用户都可以将一个术语“分叉”到自己的名称空间中(例如。http://uri.interlex.org/user/ilx_1234567).这使得关于一个术语或概念的各种观点具有同等的空间,从而可以看到和表达关于一个词汇的各种观点。注册更新以获得有关InterLex更新以及新功能可用时的通知。

NeuroLex的最终内容审查仍在进行中。我们欢迎您的反馈。

NeuroLex现在可以通过InterLex访问,并再次接受贡献。InterLex是一个建立在NeuroLex成功基础上的新工具,旨在弥合社区词典和更正式的本体论之间的差距。我们目前正在进行公开测试,并将继续努力确保NeuroLex的所有内容都已转换。如果您有任何问题或反馈,请通过下面的服务台联系我们。

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