序列数据来自牛持续爆发甲型H5N1禽流感病毒现在可以通过NLM的NCBI资源获得NCBI病毒和NCBI数据集.
这些数据由美国农业部（USDA）,美国疾病控制与预防中心（CDC），的世界卫生组织（WHO）,爱荷华州立大学，以及圣犹大儿童研究医院.
通过NCBI病毒访问
您可以访问GenBank（基因银行）我们档案中所有病毒的病毒序列、注释和元数据，包括Alphainfluenza病毒，通过NCBI病毒。有多种过滤器可用于选择符合您研究兴趣的序列，并且许多元数据字段都进行了规范化，以简化数据比较。例如，以下一组筛选项将提供2023年12月1日至2024年5月16日期间从美国分离的所有H5N1序列，这些序列与人类宿主分离（图1）。要从特定样本类型（如牛奶）中搜索序列，请使用隔离源过滤器。
图1:NCBI病毒流感数据中心浏览器2023年12月1日至2024年5月16日在美国收集的从人类宿主分离的H5N1序列。选定的过滤器显示在图像的左侧。浏览器显示了一组更大的从牛身上分离的H5N1序列.
马上就来！我们正在致力于提供流感基因组，该基因组由按样本元数据分组的全套片段组成，不久将通过NCBI病毒提供。请继续关注更多信息。
需要命令行访问？查看NCBI数据集！
使用NCBI数据集以编程方式访问数据数据集和数据格式命令行工具。使用属名(α-流感病毒)taxid（197911）或NCBI核苷酸加入。您可以按日期、主机和地理位置进行筛选。查看我们的帮助文档在命令行访问上开始。您还可以参考Alphainfluenza病毒文档了解更多详细信息：
你有流感病毒序列数据吗？提交给NCBI！
您可以将您的流感病毒序列数据读取提交给序列读取存档（SRA）或组装基因组数据GenBank（基因银行）使用NCBI提交门户流感病毒有一个专用的提交过程（不需要注释文件），提交通常在数小时内处理。
如果您计划向GenBank提交大量序列，并且希望使用命令行选项提交，请通过电子邮件联系GenBank团队gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov有关通过FTP帐户创建和提交的说明。
如果您对向SRA提交数据有任何疑问或疑虑，请通过电子邮件联系我们的SRA团队sra@ncbi.nlm.nih.gov.
了解更多信息
有关HN51禽流感的更多信息，访问CDC网站.
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