GROMACS 2023.4发行说明#

此版本于2024年1月24日发布。这些发行说明记录自之前的2023.3版本，以修复已知问题。它还包含所有在2022.6及更早版本中进行的修复，您可以找到描述在中发行说明.

修复了mdrun可能出现错误行为的地方#

多个步行者共享偏差的AWH模拟，并使用输出能量时，每个步行者的多个MPI等级将挂起，即，已经在步骤0中。

不会有任何错误的结果。

会发生这种情况，例如，当仅对LJ使用软核时库仑或去耦大分子时也需要。现在生成了正确的错误消息。

在邻居搜索步骤中，当未计算维里数时（即。，什么时候非甾体抗炎药列表不是的倍数nstp耦合器)和GPU更新如果使用，则GPU缓冲区清除和复制CPU上计算的力，导致缺少一些此步骤中的力贡献。

除非GPU很重，否则不应该发生这种情况使用了超额订阅或hipSYCL/AdaptiveCpp，即使在这些情况下，这个问题不太可能出现。

两条错误消息用于包含指向不再存在的内容的链接可在GROMACS网站上找到。这些链接已替换为指向当前文档中相关页面的链接。

通用管理系统 msd（msd）在内部将帧时间转换为皮秒。因此，如果时间不能表示为皮秒的整数（通常由于轨迹输出过于频繁），工具将崩溃或产生错误结果。

现在，在这种情况下会打印一个错误。

使用Parinello-Rahman压力联轴器时发出垫圈警告结合位置约束建议使用贝伦德森而不是。这一建议现已改为C-rescale。