Numbat是单细胞和空间转录组学数据中的一个单倍型CNV呼叫者。它整合来自基因表达、等位基因比率和群体衍生单倍型信息的信号，以准确推断单个细胞中的等位基因特异性CNV并重建其谱系关系。
Numbat可用于：1。根据scRNA-seq和空间转录组学2检测等位基因特异性拷贝数变异。在肿瘤微环境中区分肿瘤与正常细胞3。推断异型肿瘤的克隆结构和进化史。
Numbat不需要成对的DNA或基因型数据，只对供体scRNA-seq数据进行操作（例如，10x Cell Ranger输出）。有关方法的详细信息，请查看我们的论文：
滕高（Teng Gao）、鲁斯兰·索尔达托夫（Ruslan Soldatov）、希拉克·萨尔卡（Hirak Sarkar）、亚当·库基维奇（Adam Kurkiewicz）、埃文·比德斯泰特（Evan Biederstedt）、波罗·洛（Po-Ru Loh）、彼得·哈尔琴科。单细胞转录体体细胞拷贝数变异的单体型软件分析。《自然生物技术》（2022）。
有关完整指南，请参阅Numbat用户指南.
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