研究论文\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

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同步加速器
辐射
国际标准编号:1600-5775

核共振振动光谱中的能量校准问题:观察小的光谱位移和快速校准

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加利福尼亚大学化学系,地址:1 Shields Avenue,Davis,CA 95616,USA,b条美国加利福尼亚州伯克利市回旋加速器路1号劳伦斯伯克利国家实验室,邮编94720,c(c)JASRI,SPring-8,1-1-1 Kouto,Sayo cho,Sayo gun,兵库县679-5198,d日辽宁师范大学辽宁省生物技术与药物发现重点实验室,中国大连116081e(电子)美国俄亥俄州肯特市肯特州立大学化学与生物化学系,邮编:44242
*通信电子邮件:hxwang2@lbl.gov

(2013年1月18日收到; 2013年7月30日接受)

核共振振动光谱(NRVS)的常规能量校准通常很长。同时,从低温恒温器中取出NRVS样品会增加样品损坏的可能性,这使得在一次NRVS测量期间无法进行能量校准。在本研究中,通过在不移出NRVS样品的情况下通过主测量室操纵14.4keV光束,提出并建立了两种替代校准程序:(i)就地校准程序,该程序同时测量阶段A的主要NRVS样品和阶段B的校准样品,并校准用于观察极小光谱偏移的能量;例如,0.3meV的能量在100%-57富铁[Fe4S公司44]=和10%-57铁和90%-54Fe标记[Fe4S公司44]=已得到很好的解决;(ii)快速开关能量校准程序,将每次校准时间从3-4小时减少到约30分钟。尽管快速开关校准不是就地,适用于正常NRVS测量。

1.简介

核共振振动光谱(NRVS)通过核共振扫描极单色(~1 meV)X射线束(例如 5714.4 keV的Fe)并测量相应声子的产生或湮灭(Seto等。, 1995【Seto,M.、Yoda,Y.、Kikuta,S.、Zhang,X.W.和Ando,M..(1995),《物理评论稿》第74期,第3828-3831页。】, 2009【Seto,M.、Masuda,R.、Higashitaniguchi,S.、Kitao,S.,Kobayashi,Y.、Inaba,C.、Mitsui,T.和Yoda,Y.(2009),《物理评论稿》102、217602。】; 斯图尔罕等。, 1995【Sturahn,W.,Toellner,T.S.,Alp,E.E.,Zhang,X.,Ando,M.,Yoda,Y.,Kikuta,S.,Seto,M..,Kimball,C.W.&Dabrowski,B.(1995),《物理评论稿》第74期,第3832-3835页。】; 尤达等。, 2001【Yoda,Y.,Yabashi,M.,Izumi,K.,Zhang,X.W.,Kishimoto,S.,Kitao,S.、Seto,M.、Mitsui,T.,Harami,T.、Imai,Y.和Kikuta,S.(2001年)。《物理研究方法汇编》A,467,715-718。】, 2012【Yoda,Y.、Imai,Y.,Kobayashi,H.、Goto,S.、Takeshita,K.和Seto,M.(2012)。超精细。交互。206,83-86。】). 这是一个相对较新的X射线光谱学由于第三代同步辐射源、插入装置和先进的X射线光学技术的发展,这一技术成为可能。与传统的红外(IR)和共振拉曼(RR)光谱相比,它有几个显著的优点(史密斯等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】)近年来,它已成为研究铁特定无机和生物无机化学的一种极好的针尖工具。例如,它揭示并解析了各种化学或酶分子中的Fe-S/P/Cl和Fe-CO/CN/NO振动模式(Smith等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】; 等。, 2005【肖扬(Xiao,Y.)、王(Wang,H.)、乔治(George,S.J.)、史密斯(Smith,M.C.)、亚当斯(Adams,M.W.)、詹尼(Jenney,F.E.)、斯图尔罕(Sturahn,W, 2006【肖扬(Xiao,Y.)、费舍尔(Fisher,K.)、史密斯(Smith,M.C.)、牛顿(Newton,W.E.)、凯斯(Case,D.A.)、乔治(George,S.J.)、王(Wang,H.)、斯图尔罕(Sturahn,W.)、阿尔普(Alp,E.E.)、赵(Zhao,J.),尤达(Y.)和克莱默(Cramer,S.P.); 丁伯格等。, 2010【Tinberg,C.E.,Tonzetich,Z.J.,Wang,H.,Do,L.H.,Yoda,Y.,Cramer,S.P.&Lippard,S.J.(2010),《美国化学学会杂志》132,18168-18176。】; 等。, 2011【Do,L.,Wang,H.,Tinberg,C.E.,Dowty,E.,Yoda,Y.,Cramer,S.P.&Lippard,S.J.(2011),《化学通讯》第47卷,第10945页。】; 卡马利等。, 2013【Kamali,S.、Wang,H.、Mitra,D.、Ogata,H.,Lubitz,W.、Manor,B.C.、Rauchfuss,T.B.、Byrne,D.、Bonnefoy,V.、Jenney,F.E.、Adams,M.W.、Y.、Alp,E.、Zhao,J.&Cramer,S.P.(2013)。Angew.Chem.Int.Ed.52,724-728。】).

用于NRVS的高分辨率单色器(HRM)的能量可以通过以下方式进行扫描(或非自愿改变):(i)HRM晶体之间的相对散射角;和/或(ii)一个后向反射晶体的温度(Zhao&Sturahn,2012)【Zhao,J.Y.和Sturahn,W.(2012),J.Synchrotron Rad.19,602-608.】). 因此,能量标度的准确性取决于对HRM晶体的角度、温度以及热梯度的高精度测量(和控制)。误差通常约为HRM能量的百分之几。为了获得更高的精度,需要额外的校准(Zhao&Sturahn,2012【Zhao,J.Y.和Sturahn,W.(2012),J.Synchrotron Rad.19,602-608.】). NRVS,尤其是生物样品上的NRVS信号水平很弱,需要约24–48小时(Kamali等。, 2013【Kamali,S.、Wang,H.、Mitra,D.、Ogata,H.,Lubitz,W.、Manor,B.C.、Rauchfuss,T.B.、Byrne,D.、Bonnefoy,V.、Jenney,F.E.、Adams,M.W.、Y.、Alp,E.、Zhao,J.&Cramer,S.P.(2013)。Angew.Chem.Int.Ed.52,724-728。】)以获得稀释样品的质量光谱。在如此长的时间内,能量位置/标度成为获取目标弱光谱峰良好统计数据的一个特殊问题,应经常进行校准。此外,仔细的逐扫描校准对于观察不同NRVS光谱之间的小位移是绝对必要的。

常规NRVS校准是通过在主NRVS室中测量标准校准样品(CS)来进行的。该程序包括:(i)将低温恒温器底座加热至140–200 K(Wang等。, 2012【Wang,H.,Yoda,Y.,Kamali,S.,Zhou,Z.-H.&Cramer,S.P.(2012),《同步加速器辐射杂志》第19期,第257-263页。】); (ii)从试验箱(低温恒温器)中取出现有NRVS样品;(iii)CS中的装载;(iv)冷却CS(例如至10 K;传感器读数);以及(v)测量CS。实际上,前两个NRVS光谱的峰值位置有点不可重复,这可能是由于实际样品温度的逐渐转变(Wang等。, 2012【Wang,H.,Yoda,Y.,Kamali,S.,Zhou,Z.-H.&Cramer,S.P.(2012),《同步加速器辐射杂志》第19期,第257-263页。】). 整个过程通常需要3-4小时。这种耗时的特性使得频繁的能量校准不切实际。

同时,X射线照射下的样品可能在分子内储存能量。“辐射损伤”可能在低温下“冻结”(Garman&Nave,2009【Garman,E.F.和Nave,C.(2009),《同步加速器辐射》第16卷第129-132页。】). 从低温恒温器底座上取下样品意味着要加热样品并增加辐射损伤的可能性,如果可能的话,应该避免这种情况。这使得不可能在一次NRVS测量期间进行能量校准,对于稀释样品,可能长达48小时[例如关于NiFe氢化酶(Kamali等。, 2013【Kamali,S.、Wang,H.、Mitra,D.、Ogata,H.,Lubitz,W.、Manor,B.C.、Rauchfuss,T.B.、Byrne,D.、Bonnefoy,V.、Jenney,F.E.、Adams,M.W.、Y.、Alp,E.、Zhao,J.&Cramer,S.P.(2013)。Angew.Chem.Int.Ed.52,724-728。】)]. 因此,对于生物NRVS测量,必须探索不将NRVS样品移出低温恒温器的替代校准程序。

在最近的一份出版物中,Zhao&Sturahn(2012【Zhao,J.Y.和Sturahn,W.(2012),J.Synchrotron Rad.19,602-608.】)报道了一种成功的校准HRM能量的程序,该程序使用了铁箔(或任何样品)中声子湮灭和声子产生之间的详细平衡,NRVS测量装置发生了微小变化。这是一种样本独立方法,不需要指定的标准样本。它还为感兴趣的HRM提供了准确的能量标尺(包括高阶修正)。然而,其过程大约需要4小时(Zhao&Sturahn,2012【Zhao,J.Y.和Sturhahn,W.(2012)。J.同步辐射.19602-608。】)这仍然限制了其作为常规NRVS测量期间的频繁能量检查的应用。

在本研究中,通过主测量室操纵14.4keV光束[图1()和1(b条)[链接]]在不将主样品移出低温恒温器的情况下,测试并开发了两种替代校准程序:(i)就地校准程序,同时测量主NRVS样品和校准样品;(ii)快速切换能量校准程序,大大缩短每次校准时间,并使频繁的能量校准成为可能。

[图1]
图1
()SPring-8 BL09XU光束线示意图,其主测量室位于A级低温下,校准装置位于B级室温下(b条)BL09XU处NRVS测量柜的照片,显示阶段A和B。黄色粗箭头表示E类=14.4 keV和ΔE类≃1 meV X射线束。(c(c))原理图和横截面A级主测量室的视图(相对于光束方向)。红色条表示相对于NRVS样品的光束位置Z扫描(c(c)1、和c(c)2展开视图)和X(X)扫描(c(c)).

2.实验细节

2.1. 阶段A的NRVS测量

SPring-8 BL09XU处的NRVS波束线已在其他地方详细描述(Seto等。, 2009【Seto,M.、Masuda,R.、Higashitaniguchi,S.、Kitao,S.,Kobayashi,Y.、Inaba,C.、Mitsui,T.和Yoda,Y.(2009),《物理评论稿》102、217602。】; 尤达等。, 2012【Yoda,Y.、Imai,Y.,Kobayashi,H.、Goto,S.、Takeshita,K.和Seto,M.(2012)。超精细。交互。206,83-86。】)如图1所示()[链接]。同步电子辐射产生的X射线首先被转换成带有E类=14.4 keV和ΔE类=1 eV(通过高热负荷单色仪);然后进一步将其转换为梁E类=14.4 keV和ΔE类≃1 meV由HRM提供光子通量在14.4千电子伏时,当时为~1.4×109光子−10.8 meV能量带宽,或~2.5×109光子−1能量分辨率为1.1 meV。光束尺寸约为0.6 mm(高)×1 mm(宽)。阶段A用于NRVS测量,阶段B用于能量校准测量。阶段A和阶段B的测量柜如图1所示(b条)[链接].

在A阶段,使用标准实验程序在带有液氦(LHe)流动低温恒温器(Smith)的标准装置上记录NRVS光谱等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】; 等。, 2005【肖扬(Xiao,Y.)、王(Wang,H.)、乔治(George,S.J.)、史密斯(Smith,M.C.)、亚当斯(Adams,M.W.)、詹尼(Jenney,F.E.)、斯图尔罕(Sturahn,W). 光谱的测量范围通常为−30 meV至70–100 meV,具体取决于样品。延迟核荧光和铁K(K)α荧光记录采用2×2雪崩光电二极管(APD)探测器阵列,并用数据采集电子设备进行处理。不同样品的最大共振峰不同(例如100–2000计数s−1). NRVS光谱分析使用凤凰软件包(Sturahn等。, 1995【Sturahn,W.,Toellner,T.S.,Alp,E.E.,Zhang,X.,Ando,M.,Yoda,Y.,Kikuta,S.,Seto,M..,Kimball,C.W.&Dabrowski,B.(1995),《物理评论稿》第74期,第3832-3835页。】),其中校准了观察到的原始NRVS光谱(至核共振峰),并将其归一化(至0变化),求和并转换为57Fe部分振动态密度(PVDOS)。下文中的NRVS或PVDOS实际上是指PVDOS光谱,除非使用原始NRVS指定。

2.2. 通过A级的近光

在阶段A,样品的上表面和主室的铍窗口之间有一个~1毫米的空间(Wang等。, 2012【Wang,H.,Yoda,Y.,Kamali,S.,Zhou,Z.-H.&Cramer,S.P.(2012),《同步加速器辐射杂志》第19期,第257-263页。】),如图1所示(c(c)1)和1(c(c)2)[链接]14.4keV光束的一部分可以通过阶段A的样品,另一部分可以穿过~1mm的空间到达阶段B的样品。在A和B的样品上同时进行的NRVS测量构成了一个就地校准。

图2()和2(b条)[链接]显示信号电平(计数s−1)对于在几种情况下在B处测量的Fe NRVS:(i)当空的低温恒温器底座位于a级主室中时,束流通道大约有2.7 mm的空间(位置之间的黑色曲线ZZd日); (ii)约有1.8 mm的空间,带有一个空的Lucite样品架(蓝色,介于Zb条Zd日); (iii)空间减小至~0.4 mm,信号水平下降至~50%,实际[Fe4S公司44]=A处的样品(红色,介于Zc(c)Zd日). 这些尺寸通常与实际结构尺寸一致。职位Z,Zb条,Zc(c)Zd日与图1相同(c(c)2)[链接].绿色曲线显示[Fe的NRVS信号4S公司44]=在A。

[图2]
图2
()B处的Fe NRVS信号(黑色、蓝色和红色)相对光束位置(Z):黑色曲线适用于空的低温恒温器底座;蓝色代表空样品架;红色代表真实样品([Fe4S公司44]=)在A.LettersZ,Zb条,Zc(c)Zd日分别标明低温恒温器底座、样品架内底、样品顶面和真空室顶部窗口的截止线。(b条)放大(). 酒吧Z1,Z2,ZZ4对于就地校准。绿线表示[Fe4S公司44]=A处的NRVS信号。

如图1所示,A处主样本的左侧和右侧也有空格(c(c))[链接](位置1或3)。这些空间也可用于允许X射线束通过。在我们的实践中,将A级向右移动可获得最佳结果X(X)=4 mm[图1(c(c))[链接],位置1]。阶段A的高度(Z)和倾斜角度(θ)还需要对完整的光束通道进行较小的优化。NRVS测量(A处)和能量校准(B处)的位置可以来回切换[(X(X)1,Z1,θ1)[\longleftrightarrow](X(X)2,Z2,θ2)]在1或2分钟内,而不是在样品更换过程中的1小时内。因此,第二个程序称为快速切换校准程序。

2.3. B级NRVS测量

在A级后面约1m处,B级被设置为使用穿过A的光束[图1()和1(b条)[链接]]用于能量校准测量。B处的NRVS测量程序与A处的相同,但使用的是单元素APD。粉末57Fe或57富铁Fe2O(运行)被用作我们新的校准测量的校准样品。B处的校准测量是在室温(RT)下进行的。

2.4. 样品

粉末样品[Et4否][57氯化铁4]([氯化铁4](简称史密斯)等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】)在密歇根大学合成,并在a阶段的常规能量校准程序中用作标准样品(史密斯等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】; 等。, 2005【肖扬(Xiao,Y.)、王(Wang,H.)、乔治(George,S.J.)、史密斯(Smith,M.C.)、亚当斯(Adams,M.W.)、詹尼(Jenney,F.E.)、斯图尔罕(Sturahn,W, 2006【肖扬(Xiao,Y.)、费舍尔(Fisher,K.)、史密斯(Smith,M.C.)、牛顿(Newton,W.E.)、凯斯(Case,D.A.)、乔治(George,S.J.)、王(Wang,H.)、斯图尔罕(Sturahn,W.)、阿尔普(Alp,E.E.)、赵(Zhao,J.),尤达(Y.)和克莱默(Cramer,S.P.)). 粉末57Fe或57Fe标记的Fe2O(运行)从Isoflex(旧金山,加利福尼亚州,美国)购买,并在B阶段用于我们的新校准程序。对于相关实验,57铁(edt)(CO)2(项目经理)2(郭等。, 2008[Guo,Y.,Wang,H.,Xiao,Y.],Vogt,S.,Thauer,R.K.,Shima,S.、Volkers,P.I.,Rauchfuss,T.B.,Pelmenschikov,V.,Case,D.A.,Alp,E.E.,Sturahn,W.,Yoda,Y.&Cramer,S.P.(2008),《无机化学》第47期,第3969-3977页。])在伊利诺伊大学香槟分校合成;(NH4)257(中国)6{或[MgFe(CN)6]=}(Chumakov&Rüffer,1998年[Chumakov,A.&Rüffer,R.(1998)。超精细交互。113,59-79。])在ESRF BL18测量并引用。以上所有样品均为57铁标记。天然丰度KGdFe(中国)6和KEuFe(中国)6{或[EuFe(CN)6]和[GdFe(CN)6]}(Shokouhimehr公司等。, 2010【Shokouhimehr,M.、Soehnlen,E.S.、Hao,J.、Griswold,M.,Flask,C.、Fan,X.、Basilion,J.P.、Basu,S.和Huang,S.D.(2010),《材料化学杂志》,第20期,第5251页。】; 等。, 2010【Huang,S.D.,Li,Y.&Shokouhimehr,M.(2010),美国2010/0215587A1。】)在肯特州立大学合成。100%-57铁和10%-57铁/90%-54Fe标记[Fe4S公司44](哲学博士4P)2样品([Fe4S公司44]=和[X(X)4S公司44]=以下简称)由加州大学戴维斯分校编写。

省略了在阶段A测量的非校准样品的详细信息。

3.结果和讨论

3.1. 常规校准

忽略高阶修正(Zhao&Sturahn,2012【Zhao,J.Y.和Sturahn,W.(2012),J.Synchrotron Rad.19,602-608.】),实际能量位置可以用E类真实的= (K(K)E类光突发事件+ΔE类),其中E类真实的代表真正的能量,E类光突发事件代表观测到的能量,ΔE类是能量位置漂移K(K)是能量刻度。因此,能量校准包括:(i)将核共振峰对准E类=0以更正ΔE类; (ii)重新缩放能量轴以获得正确的K(K)值。第(i)部分通常在PHOENIX分析过程中自动获得。在BL09XU上,扫描软件还包括自动重新校准E类=每次扫描前的0位置。对于(ii),K(K)通过比较观测值和发布的[FeCl4]NRVS光谱(史密斯等。, 2005[Smith,M.C.、Xiao,Y.、Wang,H.、George,S.J.、Coucouvanis,D.、Koutmos,M.、Sturhahn,W.、Alp,E.E.、Zhao,J.和Cramer,S.P.(2005)。国际化学杂志,第44期,5562-5570页。]). 公布的标准光谱在其红外光谱中具有相同的峰值(史密斯等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】). 上述程序如图S1所示()和S1(b条)在补充信息中,而一系列[FeCl4]校准过的K(K)值也如图S2所示。1获得的K(K)数值似乎介于0.938和0.976之间,跨度约为4%,这对于人力资源管理来说并不意外(Zhao和Sturahn,2012【Zhao,J.Y.和Sturahn,W.(2012),J.Synchrotron Rad.19,602-608.】).

由于传统校准需要时间,实际校准间隔约为72小时。对于更频繁的能量校准,必须制定替代程序。

3.2. 一个就地校准

通常有两种类型的能量校准程序:(i)逐个扫描校准和(ii)在一个光束时间内进行多次校准。一个就地校准是一种逐扫描校准,以很好地跟踪能量位置/标度。如图3所示()[链接],似乎不可能区分能量标度相差0.1%的光谱。另一方面,很明显可以用0.3%的差异来区分光谱(图3b条[链接]). 虽然它不是刚性的,但0.2–0.3%可以用作明确识别光谱偏移的实用指南。图3中的扩展光谱(c(c))和3(d日)[链接]更好地说明了这一实际限制。

[图3]
图3
Fe(红色)和[FeCl的校准NRVS4](橙色)他们的副本占99.9%()和99.7%(b条)标度能量轴(蓝色和绿色)。原始NRVS与标度NRVS之间没有明显差异(),虽然在(b条). (c(c))和(d日)是的扩展版本()和(b条)分别是。

我们的首要任务就地校准是为了建立新的(Fe或Fe)之间的相关性2O(运行))和旧的([FeCl4])标准光谱。结果如图4所示()和4(b条)[链接].选定用于B阶段校准的样品需要具有以下几个特性:(i)在室温下,它必须在空气中具有化学稳定性;(ii)其在RT下的NRVS或PVDOS光谱需要具有鲜明的特征;和(iii)它必须具有高信号电平(计数s−1). 在原始NRVS和转化PVDOS中,铁粉的峰值均为35.6 meV。粉末Fe2O(运行)有多个峰值,包括PVDOS中35.7、41.0、46.9、50.1 meV的峰值。在目前的实验条件下,Fe的计数约为10000 s−1而铁2O(运行)约15000次计数−1.计数越高−1对于Fe2O(运行)这可能是由于较宽的吸收宽度(在厚样品的情况下,磁分裂较大)。因此,这两个样品都适用于新的校准程序。RT时,[FeCl4]没有尖峰,只有800秒−1.

[图4]
图4
在阶段A和阶段B同时测量PVDOS:()观察到的[FeCl4]A处(×0.5,黑色虚线)B处观察到的Fe(固体红色);(b条)观察到的[FeCl4]A处(×0.5,黑色虚线)观察到的Fe2O(运行)B(×2,纯蓝色)。实心紫色曲线是[FeCl的标准PVDOS4](史密斯等。, 2005【Smith,M.C.,Xiao,Y.,Wang,H.,George,S.J.,Coucouvanis,D.,Koutmos,M.,Sturahn,W.,Alp,E.E.,Zhao,J.&Cramer,S.P.(2005).无机化学.44,5562-5570.】).

第二项任务是观察极小的能量转移。由于谨慎就地校准,如图5所示()[链接]观察到[Fe的小同位素位移为47.5→47.8 meV(0.3 meV,或0.63%)4S公司44]=[X(X)4S公司44]=(图5b条[链接]). 扩展的NRVS光谱如图5所示(c(c))[链接]以更好地说明这种0.3 meV的变化。如补充信息中详细讨论的[X(X)4S公司44]=综合体具有以下组合57铁和54Fe位点和来自[572542S公司44]=(25%)和[5754S公司44]=(75%)种。一个简单的Fe-S拉伸估计表明[Fe4S公司44]=和[X(X)4S公司44]=与观测到的0.3 meV一致。

[图5]
图5
()[Fe的PVDOS4S公司44]=A(纯蓝色)B处的铁粉(黑色虚线)。(b条)[Fe的Fe校准PVDOS4S公司44]=(蓝色)[X(X)4S公司44]=(红色)。(c(c))的扩展光谱(b条).

小同位素位移通常有助于识别金属相关振动。例如,(i)在RR实验(Mascarenhas等。, 1989【Mascarenhas,A.,Katayama Yoshida,H.,Pankove,J.和Deb,S.(1989)。Phys.Rev.B,39469-4700。】),1.8厘米−1148.6厘米时降档−1通过替换65Cu用于64Cu得出结论,峰值是YBa中Cu卷入的振动22O(运行)7–X(X),而不变的112.5厘米−1峰值完全不涉及铜;(ii)与IR(Zhou等。, 2013[周,Z.H.,王,H.,余,P.,Olmstead,M.M.&Cramer,S.P.(2013).无机生物化学杂志.118,100-106.]),2至3厘米−1之间的能量差100莫/92钼标记的柠檬酸钼配合物鉴定了配合物中的Mo=O和Mo-O带;以及(iii)在NRVS中57铁/54[Fe之间的Fe同位素位移4S公司44]=和[X(X)4S公司44]=也可以帮助精确定位Fe-S振动(Mitra等。, 2011[Mitra,D.,Pelmenschikov,V.,Guo,Y.,Case,D.A.,Wang,H.,Dong,W.,Tan,M.L.,Ichiye,T.,Jenney,F.E.,Adams,M.W.,Yoda,Y.。Zhao,J.&Cramer,S.P.(2011)。生物化学,50,5220-5235。]).

如§2.2所述[链接],无法同时优化A和B处的测量。a处NRVS测量的更多信号意味着B处和反之亦然因此,必须在两个样品之间达成平衡的妥协。测量[Fe4S公司44]=,其最大信号电平为2350计数s−1,A的信号([Fe4S公司44]=,绿色)和B(铁,红色)在位置上平衡良好Z如果能量校准是焦点,如图2所示(b条)[链接]在这个位置,两个样品都有~1400次计数−1,相当于[Fe的62%4S公司44]=峰值和铁最大值的31%(在就地校准)。在测量中[X(X)4S公司44]=(最大NRVS信号=255计数s−1),A处的样本计数为155秒−1而B处的Fe粉末仍有1400个计数−1.

3.3. A半成品就地校准

当NRVS测量而非能量校准成为焦点时,人们再也无法奢侈地牺牲38%的NRVS信号。在这些情况下,Z2(图2b条[链接])成为一个替代位置,它牺牲了~15%的NRVS信号,并且具有更弱的(350计数s−1或其最大电平的~7.5%)和噪声较大的校准信号。虽然单次扫描可能不适合跟踪逐次扫描的能量标度,但少量扫描平均光谱仍然适合能量校准。例如,如图6所示()[链接],(i)五扫描平均半就地校准光谱(红色虚线)与通过快速切换校准观察到的光谱(绿色实线)重叠良好;(ii)35.6 meV的尖峰仍然清晰。为了进一步改进统计数据,在校准过程中使用质心代替峰值位置。我们称此过程为半就地校准。

[图6]
图6
()原始57使用快速切换程序(实心绿色)和半自动开关测量铁粉NRVS就地程序(使用五次扫描平均光谱,红色虚线)。X(X)1和X(X)2表示Fe 35.6 meV峰值(32–39 meV)的积分范围。(b条)57铁粉监测半就地能量天平K(K) 时间。开放符号由单次铁扫描分析,红色实线由五次扫描平均光谱分析。

就地校准过的K(K)一束时间的时间如图6所示(b条)[链接].单次扫描计算K(K)值(黑色圆圈)看起来分散,可能不反映真实值K(K)从扫描到扫描的值。另一方面K(K)从五次扫描平均光谱(红线)获得的值似乎相当稳定。单次扫描得出的数据在大约110小时的时间内变化在0.955到0.975(2.0%)之间,而五次扫描探测的值在0.957到0.973(1.6%)之间。相邻之间的最大差异K(K)值为0.4%。

这个K(K)变化趋势似乎或多或少遵循一个24h的周期。这与环境温度循环周期一致。

3.4. 快速切换校准

如上所述就地校准会牺牲NRVS测量中A处的信号电平(§3.2[链接])或导致B处能量校准的信号电平不佳(§3.3[链接]). 因此,开发了一种快速切换校准程序,以在两个事件之间切换,而不改变NRVS样本。由于B处的校准样品始终处于一个温度(RT),因此从未观察到前两次扫描(使用传统校准)的系统不可再现峰值位置。因此,对于一次能量校准来说,一次扫描就足够了。通过该程序,NRVS测量和能量校准可以使用全光束通量或者。

虽然它不是就地校准方法、较少需要的校准扫描和快速切换时间将每个能量校准时间从3-4小时减少到约30分钟,因此校准间隔从72小时缩短到6小时2O(运行)校准过的K(K)一个特定光束时间内的值如图7所示()[链接](蓝色圆圈)。总体变化在0.951和0.965之间,相差约1.4%。另一系列铁校准K(K)单独光束时间的值如图7所示(b条)[链接](0.948–0.958或0.8%)。使用我们所有的快速开关校准,最大校准-校准差异为0.8%(只有一种情况),平均差异为0.4%K(K)值。

[图7]
图7
能量秤(K(K)值)用Fe获得2O(运行)PVDOS公司()和Fe-PVDOS(b条)使用用于两个不同波束时间的快速切换校准过程。

建议间隔6小时,因为:(i)我们注意到所有间隔6小时的校准都有0.6%(而不是0.8%)的最大校准-校准差异;(ii)它将涵盖K(K)假设24小时热循环。当无法进行6小时校准时,建议采用12–18–12–18小时的交替间隔。事件,如进入单色仪室或长时间光束中断,可能会使HMR晶体的温度改变0.1°以上,并使HRM的能量标度发生百分之几的变化(K(K)). 这种效果可能需要数小时才能恢复。在恢复期间,建议进行更频繁的校准,以监测实际HRM能量。

对于普通NRVS测量,0.4-0.8%的校准精度好吗?让我们看几个例子。假设独立的铁-配体拉伸,表1[链接]总结了一些常见的同位素位移,例如57铁-12C类/13C(卡马利语等。, 2013【Kamali,S.、Wang,H.、Mitra,D.、Ogata,H.、Lubitz,W.、Manor,B.C.、Rauchfuss,T.B.、Byrne,D.、Bonnefoy,V.、Jenney,F.E.、Adams,M.W.W.、Yoda,Y.、Alp,E.、Zhao,J.和Cramer,S.P.(2013)。Angew.Chem.Int.Ed.52.724-728。】),14N个/15N(Tonzetich等。, 2010【Tonzetich,Z.J.,Wang,H.,Mitra,D.,Tinberg,C.E.,Do,L.H.,Jenney,F.E.,Adams,M.W.,Cramer,S.P.&Lippard,S.J.(2010),《美国化学学会杂志》132,6914-6916。】),16O(运行)/18O(执行等。, 2011【Do,L.,Wang,H.,Tinberg,C.E.,Dowty,E.,Yoda,Y.,Cramer,S.P.&Lippard,S.J.(2011),《化学通讯》第47卷,第10945页。】)和32S公司/36S(密特拉等。, 2011[Mitra,D.,Pelmenschikov,V.,Guo,Y.,Case,D.A.,Wang,H.,Dong,W.,Tan,M.L.,Ichiye,T.,Jenney,F.E.,Adams,M.W.,Yoda,Y.。Zhao,J.&Cramer,S.P.(2011)。生物化学,50,5220-5235。]). 图8()–8(c(c))[链接]还举例说明了几个观测到的同位素在14N个/15N、,16O(运行)/18O和32S公司/36这些理论和观测到的同位素位移约为振动峰位置的3-4%。图8(d日)[链接]说明了Fe-S中氧化还原转变的示例,即约4.6%。因此,快速开关校准非常适合观察上述光谱偏移。

表1
铁相关铁中一些常见同位素位移的大小-X(X)拉伸模式

57铁-N个X(X)伸展 57铁-碳 57铁-N 57铁-O 57铁硫合金
同位素(N个X(X)) 12C类/13C类 14N个/15N个 16O(运行)/18O(运行) 32S公司/36S公司
ΔE类(估计) 3.2% 2.7% 3.9% 3.6%
ΔE类(观察) 3.8% 2.2% 5.7% 3.8%
[图8]
图8
典型NRVS中的各种光谱偏移:()的14N个/15N移位(Et4N) [铁4S公司(否)7](Tonzetich)等。, 2010【Tonzetich,Z.J.,Wang,H.,Mitra,D.,Tinberg,C.E.,Do,L.H.,Jenney,F.E.,Adams,M.W.,Cramer,S.P.&Lippard,S.J.(2010),《美国化学学会杂志》132,6914-6916。】); (b条)的16O(运行)/18[Fe中的O位移(μ-O) (N-EtHPTB)(PhCO)]+(执行等。, 2011【Do,L.,Wang,H.,Tinberg,C.E.,Dowty,E.,Yoda,Y.,Cramer,S.P.&Lippard,S.J.(2011),《化学通讯》第47卷,第10945页。】); (c(c))的32S公司/36S移入糠秕菌 铁氧还蛋白(含铁4S公司4集群)(Mitra等。, 2011[Mitra,D.,Pelmenschikov,V.,Guo,Y.,Case,D.A.,Wang,H.,Dong,W.,Tan,M.L.,Ichiye,T.,Jenney,F.E.,Adams,M.W.,Yoda,Y.。Zhao,J.&Cramer,S.P.(2011)。生物化学,50,5220-5235。]); (d日)氧化还原转变糠秕菌 铁氧还蛋白(米特拉等。, 2011[Mitra,D.,Pelmenschikov,V.,Guo,Y.,Case,D.A.,Wang,H.,Dong,W.,Tan,M.L.,Ichiye,T.,Jenney,F.E.,Adams,M.W.,Yoda,Y.。Zhao,J.&Cramer,S.P.(2011)。生物化学,50,5220-5235。]).

3.5. 未来展望

较高的能量校准峰值将导致较低的校准误差栏。此外,断层扫描通常有助于解决关键但薄弱的特征,例如NiFe氢化酶中的Fe-CO/CN(Kamali等。, 2013【Kamali,S.、Wang,H.、Mitra,D.、Ogata,H.,Lubitz,W.、Manor,B.C.、Rauchfuss,T.B.、Byrne,D.、Bonnefoy,V.、Jenney,F.E.、Adams,M.W.、Y.、Alp,E.、Zhao,J.&Cramer,S.P.(2013)。Angew.Chem.Int.Ed.52,724-728。】). 校准截面扫描就地,同一能量段具有显著峰值的校准样品(例如60–80 meV)。复合物[MgFe(CN)6]=在~75 meV(或600 cm)处有一个尖峰−1)(图9[链接])可用于校准高能断层扫描。

[图9]
图9
()[MgFe(CN)的PVDOS6]=RT时(红色)[氯化铁4]LT(绿色);(b条)未经浓缩的NRVS(a.u.)[X(X)铁(CN)6](X(X)=Gd或Eu);(c(c))Fe(edt)(CO)的PVDOS2(项目经理)2在LN下节省了六年2(红色,140 K时)新鲜样品(蓝色,100 K)。

也存在许多类似的复合物。例如,潜在的医学MRI或细胞成像剂[GdFe(CN)6]和[EuFe(中国)6](Shokouhimehr公司等。, 2010[Shokouhimiehr,M.、Soehnlen,E.S.、Hao,J.、Griswold,M.、Flask,C.、Fan,X.、Basilion,J.P.、Basu,S.和Huang,S.D.(2010)。《材料化学杂志》,第20卷,第5251页。]; 等。, 2010【Huang,S.D.,Li,Y.&Shokouhimehr,M.(2010),美国2010/0215587A1。】)Fe-CN峰值约为75 meV(图9b条[链接]). 这些光谱中没有弹性峰的小峰漂移反过来说明了需要在同一区域具有特征的标准样品来校准能量轴(图9b条[链接]).

LT环境也将扩大我们对校准样品的选择,因为许多配合物在RT下不稳定,但在LT下非常稳定。图9(c(c))[链接]说明了模型复合体Fe(edt)(CO)的PVDOS2(项目经理)2蓝色曲线显示了2006年测量的初始光谱(郭等。, 2008[Guo,Y.,Wang,H.,Xiao,Y.],Vogt,S.,Thauer,R.K.,Shima,S.、Volkers,P.I.,Rauchfuss,T.B.,Pelmenschikov,V.,Case,D.A.,Alp,E.E.,Sturahn,W.,Yoda,Y.&Cramer,S.P.(2008),《无机化学》第47期,第3969-3977页。])[传感器读数T型=10 K,实际值T型=100 K(王等。, 2012【Wang,H.,Yoda,Y.,Kamali,S.,Zhou,Z.-H.&Cramer,S.P.(2012),《同步加速器辐射杂志》第19期,第257-263页。】)]而红色曲线显示的是2012年测得的光谱(传感器读数T型=120 K,实际值T型=140 K)。比较表明,Fe(edt)(CO)2(PMe))2在LN中储存六年后保持稳定2如果B处有LT室,则该样品应是校准Fe-CO区域的良好样品。

由于校准精度也取决于信号电平,因此,令人欣慰的是,在a处的校准信号会进一步增加,而不会牺牲a处更多的NRVS信号。在当前的实验条件下,使用多元件APD阵列是一种直接的选择;低温环境,使用LHe低温恒温器(肖等。, 2005【肖扬(Xiao,Y.)、王(Wang,H.)、乔治(George,S.J.)、史密斯(Smith,M.C.)、亚当斯(Adams,M.W.)、詹尼(Jenney,F.E.)、斯图尔罕(Sturahn,W),一个LN2低温恒温器(77K)(Dong等。, 2013[Dong,W.,He,P.,Wang,J.,Zhou,Z.&Wang,H.(2013).红外物理技术.56,51-56.])或热电冷却装置(120 K)(门罗,2013[Monroe,D.(2013),《物理学》,第6、63页。]),也应该有助于使光谱峰值更清晰和背景更清洁。此外,更多光束通量由于同步辐射源、插入器件和光束线光学的不断发展,未来将可以使用。

4.总结

已成功建立了两个替代能源校准程序。这两种方法都不需要从低温恒温器中取出NRVS样品。一个就地校准程序跟踪逐个扫描的能量,最适合观察极小的光谱偏移,例如[Fe之间的0.3 meV差异4S公司44]=和[X(X)4S公司44]=.快速切换校准大大缩短了校准时间和校准间隔,并且适合于观察一般同位素或氧化还原位移,这大约是振动峰值能量的百分之几。

而铁和铁2O(运行)适用于校准常规振动模式(例如14–54 meV下的Fe-S),几个[X(X)铁(CN)6](X(X)=金属)络合物被发现有助于校准高能特征(例如Fe-CO(约70 meV)。

支持信息


脚注

1本文的补充数据可从IUCr电子档案中获得(参考:5055澳门元). 日志后面描述了访问这些数据的服务。

致谢

这项工作由美国国立卫生研究院拨款GM-65440、EB-001962和美国能源部生物与环境研究办公室资助(均授予加州大学戴维斯分校的Stephen P.Cramer教授)。肯特州立大学的工作得到了NIH-NCI(SDH的1R21CA143408-01A1)的支持。经JASRI批准,在SPring-8 BL09XU处测量了NRVS光谱(提案编号:2011A/B0032和2012A/B003)。我们还感谢Cramer教授(加州大学戴维斯分校)的全面支持,感谢Ilya Sergeev博士/Aleksandr Chumakov博士(ESRF/ID18)在获得[MgFe(CN)6]=NRVS和Jiyong Zhao博士(APS 03ID)讨论HRM校准。

工具书类

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