一国家海洋局第三海洋研究所,中华人民共和国厦门361005b厦门大学医学院药学系,中华人民共和国厦门361005*通信电子邮件:fangmj@xmu.edu.cn
标题化合物C13H(H)12N个2哦2通过4-氨基吡啶和氯甲酸苄酯在四氢呋喃中的反应得到。这个晶体结构包含层内两个独特分子之间的N-H……N氢键和不对称单元两个分子之间的反平行C-O……O-C相互作用[O……O=3.06(3)Ye]。
合成标题化合物是为了研究其逆转河豚毒素诱导的心肺抑制的性质,参见:Chang等。(1997). 有关相关结构,请参见:Zheng等。(2005).
C类13H(H)12N个2哦2
M(M)第页= 228.25
单诊所,P(P)21/c(c)
一= 11.9439 (5) Å
b= 13.2120 (6) Å
c(c)= 14.6574 (7) Å
β= 98.418 (4)°
V(V)= 2288.06 (18) Å三
Z轴= 8
钼K(K)α辐射
μ=0.09毫米−1
T型=293千
0.30×0.22×0.18毫米
Bruker SMART APEX区域探测器衍射仪
吸收校正:多扫描(SADABS公司; 布鲁克,2001年)T型最小值= 0.973,T型最大值= 0.984
11332次测量反射
4028个独立反射
2831次反射我> 2σ(我)
R(右)整数= 0.039
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.036
加权平均值(F类2) = 0.070
S公司= 1.05
4028次反射
307个参数
受约束的氢原子参数
Δρ最大值=0.17埃−3
Δρ最小值=-0.17埃−3
表1氢键几何形状(λ,°)
数据收集:智能(布鲁克,2001年); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2001年); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年); 分子图形:ORTEP-3公司(Farrugia,1997年)和铂(斯佩克,2009年); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.
晶体结构:包含全局数据块I。DOI(操作界面):https://doi.org/10.107/S160053681000098X/jh2125sup1.cif
结构因素:包含数据块I。DOI:https://doi.org/10.1107.S160053681000098X/jh2125Isup2.hkl
checkCIF报告
合成了标题化合物(I),一种4-氨基吡啶类似物,用于研究其逆转河豚毒素诱导的心脏呼吸抑制(Chang等。, 1997). 晶体堆积通过层内分子之间更强的N-H··N氢键和两个分子之间的反平行C-O··O-C相互作用来稳定非对称单元,键长和键角与类似化合物(郑等。, 2005). 吩嗪环和吡啶环体系平面之间的二面角为66.2(3)°。
相关文献见:郑等。(2005); 张等。(1997).
将含有4-氨基吡啶(5 mmol,0.47 g)和三乙胺(0.70 ml)的干燥四氢呋喃(15 ml)溶液逐滴添加到含有氯甲酸苄酯(5 mmov,0.85 g)的四氢呋呋喃溶液中。将反应混合物在冰浴中搅拌6 h,然后在减压下去除溶剂,得到残渣,残渣用乙酸乙酯(3×15 ml)萃取。在无水MgSO上干燥溶液4并在真空下浓缩,得到浆液残渣,经硅胶纯化柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=2:1),得到无色无定形固体的产品I。通过缓慢蒸发石油醚/二氯甲烷溶液(1:1),获得适合X射线分析的(I)单晶v(v)/v(v)).
所有H原子被放置在几何理想位置,并被视为骑在其母原子上,C-H=0.93(芳香族),0.97(CH2),N-H=0.86º和U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(芳香族C,CH2和N)。
相关文献见:Zheng等。(2005); 张等。(1997).
数据收集:智能(布鲁克,2001);细胞精细化: 智能(布鲁克,2001);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2001年);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:ORTEP-3公司(Farrugia,1997)和铂(斯佩克,2009);用于准备出版材料的软件:SHELXL97型(谢尔德里克,2008)。
几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。
精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子加权平均值和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt)等.与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。
实验细节
计算机程序:智能(Bruker,2001),圣保罗(布鲁克,2001),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),ORTEP-3公司(Farrugia,1997)和铂(斯佩克,2009年)。
本研究得到厦门市海洋和渔业局科技计划(200911号)和福建省自然科学基金(2009 J05099号)的支持。
布鲁克(2001)。圣保罗,智能和SADABS公司.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者 Chang,F.T.C.、Spriggs,D.L.、Benton,B.J.、Keller,S.A.和Capacio,B.R.(1997)。芬丹。申请。毒物。 38, 75–88. 交叉参考 中国科学院 公共医学 科学网 谷歌学者 Farrugia,L.J.(1997年)。J.应用。克里斯特。 30, 565. 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者 Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者 Spek,A.L.(2009年)。《水晶学报》。D类65, 148–155. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者 Zheng,P.-W,Wang,W.和Duan,X.-M.(2005)。《水晶学报》。E类612970年至2971年科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
这是一篇根据知识共享署名(CC-BY)许可证它允许在任何介质中不受限制地使用、分发和复制,前提是引用了原始作者和来源。