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金属有机化合物\（\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\）

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号：2056-9890
第67卷| 第11部分| 2011年11月| 第m1626页
doi:10.1107/S1600536811044023

（2,3-二-2-吡啶基-吡嗪-κ2N个2,N个三)二碘钯（II）

广厦一*

一韩国光州500-757全南国立大学催化研究所应用化学工程学院
*通信电子邮件：hakwang@chonnam.ac.kr

(收到日期：2011年10月22日； 2011年10月23日接受； 在线2011年10月29日)

Pd公司二标题复合体中的离子，[PdI2（C）14H（H）10N个4)]，在稍微扭曲的方形平面环境中由螯合2,3-二-2-吡啶基-吡嗪（dpp）配体的两个吡啶N原子和两个碘阴离子四配位。在晶体中，吡啶环相当倾向于PdI的最小二乘平面2N个2单位[最大偏差=0.090（2）Ω]，使二面角为65.0（2）和66.6（2）°。吡嗪环垂直于单位平面，二面角为89.9（2）°。这些复杂分子通过C-H…I氢键连接，沿b条轴。

相关文献

对于晶体结构黄色形式的[PtBr2（dpp）]，与标题复合物相同，参见：Ha（2011【Ha，K.（2011），《晶体学报》，E67，m1307。】).

【方案一】

实验

水晶数据

  • 【PdI】2（C）14H（H）10N个4)]

  • M（M）第页= 594.46

  • 单诊所，P（P）21/n个

  • 一= 8.7936 (12) Å

  • b条= 15.528 (2) Å

  • c（c）= 12.3351 (17) Å

  • β= 102.118 (3)°

  • V（V）= 1646.8 (4) Å三

  • Z轴= 4

  • 钼K（K）α辐射

  • μ=4.87毫米−1

  • T型=200 K

  • 0.42×0.31×0.29毫米
数据收集

  • Bruker SMART 1000 CCD衍射仪

  • 吸收校正：多扫描(SADABS公司; 布鲁克，2000[Bruker（2000）。SADABS、SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.，美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.183,T型最大值= 0.243

  • 10659次测量反射

  • 3513个独立反射

  • 2968次反射我> 2σ(我)

  • R（右）整数= 0.022
精炼

  • R（右）[F类2> 2σ(F类2)] = 0.035

  • 加权平均值(F类2) = 0.103

  • S公司= 1.05

  • 3513次反射

  • 190个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=1.28埃−3

  • Δρ最小值=−1.42埃−3

表1
选定的键长（λ）

钯-N3 2.050 (5)
第1-N4页 2.056 (5)
第1页-I1 2.5761 (7)
第1页至第2页 2.5898 (6)

表2
氢键几何形状（λ，°）

D类-H月A类 D类-H（H） H月A类 D类⋯A类 D类-H月A类
C11-H11和I1我 0.95 2.99 3.776 (7) 141
对称代码：（i）[-x+{\script{1\over 2}}，y+{\sscript{1\ over 2{}，-z+{\script{3\over 2neneneep}].

数据收集：智能（布鲁克，2000年[Bruker（2000）。SADABS、SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.，美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化： 圣保罗（布鲁克，2000年[Bruker（2000）。SADABS、SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.，美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减：圣保罗; 用于求解结构的程序：SHELXS97标准（谢尔德里克，2008年[Sheldrick，G.M.（2008），《水晶学报》，A64112-122。]); 用于优化结构的程序：SHELXL97型（谢尔德里克，2008年[Sheldrick，G.M.（2008），《水晶学报》，A64112-122。]); 分子图形：ORTEP-3公司（Farrugia，1997年【Farrugia，L.J.（1997），《应用结晶杂志》，第30卷，第565页。】)和铂（斯佩克，2009年[Spek，A.L.（2009），《结晶学报》，D65148-155。]); 用于准备出版材料的软件：SHELXL97型.

支持信息

晶体结构：包含全局数据块，I.DOI：10.1107/S1600536811044023/is2795sup1.cif

结构因素：包含数据块I。DOI：10.1107/S1600536811044023/is2795Isup2.hkl

checkCIF报告


注释顶部

标题复合体，[PdI2（dpp）]（dpp是2,3-二-2-吡啶基吡嗪，C14H（H）10N个4)，与黄色形式的[PtBr同晶2（dpp）]（Ha，2011）。Pd公司二螯合dpp配体的两个吡啶基N原子和两个碘阴离子在稍微扭曲的方形平面环境中对离子进行四配位（图1）。对畸变的贡献是87.17（19）°的N3-Pd1-N4螯合角和I-I排斥，因此反式轴线轻微弯曲[<I1-Pd1-N4=173.87（13）°和<I2-Pd1-N2=176.70（13））°]。Pd-N和Pd-I键长分别几乎相等（表1）。在晶体中，两个吡啶环相当倾向于PdI的最小二乘平面2N个2单位[最大偏差=0.090（2）Ω]，二面角分别为65.0（2）和66.6（2）°。近平面吡嗪环[最大偏差=0.014（4）Ye]垂直于单位平面，二面角为89.9（2）°。两个吡啶环之间的二面角为78.6（2）°。配合物通过C-H···I氢键连接，形成沿b条轴（图2和表2），并沿一轴。向下查看时b条轴上，连续复合体以相反的方向堆叠。在色谱柱中，有许多分子间和分子内π–π六元环之间存在相互作用，最短环中心距为3.969（4）欧。

相关文献顶部

对于晶体结构黄色形式的[PtBr2（dpp）]，与标题复合体是同型的，参见：Ha（2011）。

实验顶部

至Na溶液2氯化铅4添加2,3-二-2-吡啶基吡嗪（0.1183 g，0.505 mmol）并在室温下搅拌3 h。通过过滤分离形成的沉淀物，用甲醇和丙酮洗涤，并在50°C下干燥，得到红棕色粉末（0.2537 g）。适用于X射线分析的晶体是通过从CH缓慢蒸发获得的三CN解决方案。

精炼顶部

H原子被几何定位，并允许骑在其各自的母原子上[C-H=0.95 Au和U型国际标准化组织（H） =1.2U型当量（C） ]。最高峰值（1.27 eÅ-3)和最深的洞（-1.41 eÅ-3)在差分傅里叶变换图中，原子I2和I1的位置分别为0.72？和0.59。

计算详细信息顶部

数据收集：智能（布鲁克，2000年）；细胞精细化： 圣保罗（布鲁克，2000年）；数据缩减：圣保罗（布鲁克，2000年）；用于求解结构的程序：SHELXS97标准（谢尔德里克，2008）；用于优化结构的程序：SHELXL97型（谢尔德里克，2008）；分子图形：ORTEP-3公司（Farrugia，1997）和铂（斯佩克，2009）；用于准备出版材料的软件：SHELXL97型（谢尔德里克，2008）。

数字顶部
[图1] 图1。标题复合体的结构，以40%的概率水平绘制位移椭球体；氢原子显示为任意半径的小圆。
[图2] 图2。标题复合物的氢键相互作用视图。氢键用虚线表示。
（2,3-二-2-吡啶基吡嗪-κ2N个2,N个三)二碘钯（II）顶部
水晶数据 顶部
【PdI】2（C）14H（H）10N个4)]F类(000) = 1096
M（M）第页= 594.46D类x个=2.398毫克−三
单诊所，P（P）21/n个钼K（K）α辐射，λ= 0.71073 Å
大厅符号：-P 2yn7148次反射的细胞参数
一= 8.7936 (12) Åθ= 2.4–27.0°
b条= 15.528 (2) ŵ=4.87毫米−1
c（c）= 12.3351 (17) ÅT型=200 K
β= 102.118 (3)°块，红棕色
V（V）= 1646.8 (4) Å三0.42×0.31×0.29毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
布鲁克SMART 1000 CCD
衍射仪		3513个独立反射
辐射源：细焦点密封管2968次反射我> 2σ(我)
石墨单色仪R（右）整数= 0.022
ϕ和ω扫描θ最大值= 27.0°,θ最小值= 2.1°
吸收校正：多扫描
(SADABS公司; 布鲁克，2000年）		小时=−11→10
T型最小值= 0.183,T型最大值= 0.243k个=−19→19
10659次测量反射我=−11→15
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位：结构-变量直接方法
最小二乘矩阵：完整二次原子位置：差分傅里叶映射
R（右）[F类2> 2σ(F类2)] = 0.035氢站点位置：从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.103受约束的氢原子参数
S公司= 1.05 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0477P（P）)2+ 7.4036P（P）]
哪里P（P）= (F类o个2+ 2F类c（c）2)/3
3513次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
190个参数Δρ最大值=1.28埃−三
0个约束Δρ最小值=−1.42埃−三
水晶数据 顶部
【PdI】2（C）14H（H）10N个4)]V（V）= 1646.8 (4) Å三
M（M）第页= 594.46Z轴= 4
单诊所，P（P）21/n个钼K（K）α辐射
一= 8.7936 (12) ŵ=4.87毫米−1
b条= 15.528 (2) ÅT型=200 K
c（c）= 12.3351 (17) Å0.42×0.31×0.29毫米
β= 102.118 (3)°
数据收集 顶部
布鲁克SMART 1000 CCD
衍射仪		3513个独立反射
吸收校正：多扫描
(SADABS公司; 布鲁克，2000年）		2968次反射我> 2σ(我)
T型最小值= 0.183,T型最大值= 0.243R（右）整数= 0.022
10659次测量反射
精炼 顶部
R（右）[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0350个约束
水风险(F类2) = 0.103受约束的氢原子参数
S公司= 1.05Δρ最大值=1.28埃−三
3513次反射Δρ最小值=−1.42埃−三
190个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.（除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.）均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时，单独考虑单元e.s.d；只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时，才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似（各向同性）处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R（右）-因子水风险和贴合度S公司基于F类2，常规R（右）-因素R（右）基于F类，使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R（右）-因子（gt）等.与选择反射进行细化无关。R（右）-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R（右）-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个年z（z）U型国际标准化组织*/U型当量
第1页0.46673 (5)0.06358 (3)0.67952 (3)0.03147 (13)
I1类0.61860 (5)−0.07875 (3)0.68473 (4)0.04827 (15)
I2类0.71972 (6)0.15314 (3)0.73389 (4)0.05207 (16)
N1型0.1852 (6)0.0054 (3)0.9114 (4)0.0419 (12)
氮气0.2351 (7)0.1813 (4)0.9159 (5)0.0473 (13)
N3号机组0.2628 (5)−0.0048 (3)0.6446 (4)0.0314 (10)
4号机组0.3330 (6)0.1733 (3)0.6587 (4)0.0375 (11)
C1类0.2007 (6)0.0473 (4)0.8187 (5)0.0332 (12)
指挥与控制0.2265 (7)0.1360 (4)0.8211 (5)0.0347 (12)
C3类0.2229 (9)0.1385 (5)1.0064 (6)0.0516 (17)
H3级0.23040.16901.07400.062*
补体第四成份0.1993 (9)0.0498 (4)1.0047 (6)0.0495 (16)
H4型0.19320.02071.07140.059*
C5级0.1683 (6)−0.0075 (3)0.7174 (5)0.0309 (11)
C6级0.0425 (7)−0.0623 (4)0.7030 (6)0.0430 (15)
人6−0.0216−0.06420.75610.052*
抄送70.0103 (7)−0.1154 (4)0.6092 (6)0.0485 (16)
H7型−0.0753−0.15410.59810.058*
抄送80.1045 (7)−0.1106 (4)0.5334 (5)0.0418 (14)
H8型0.0844−0.14520.46840.050*
C9级0.2272 (7)−0.0552 (4)0.5534 (5)0.0385 (13)
H9型0.2913−0.05170.50040.046*
C10号机组0.2329 (7)0.1913 (4)0.7239 (5)0.0374 (13)
C11号机组0.1398 (8)0.2639 (4)0.7055 (6)0.0470 (16)
H11型0.07110.27680.75330.056*
第12项0.1467 (10)0.3171 (4)0.6187 (6)0.0558 (19)
H12型0.08200.36650.60500.067*
第13页0.2478 (10)0.2984 (4)0.5515 (6)0.0554 (19)
H13型0.25430.33480.49070.067*
第14项0.3406 (9)0.2259 (4)0.5733 (5)0.0497 (16)
H14型0.41130.21300.52700.060*
原子位移参数（2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
第1页0.0364 (2)0.0300 (2)0.0295 (2)−0.00616 (17)0.01056 (17)−0.00251 (16)
I1类0.0419 (3)0.0503 (3)0.0548 (3)0.00162 (18)0.01512 (19)0.00031 (19)
I2类0.0562 (3)0.0592 (3)0.0431 (3)−0.0268 (2)0.0154 (2)−0.0105 (2)
N1型0.053 (3)0.037 (3)0.036 (3)−0.003 (2)0.013 (2)−0.002 (2)
氮气0.062 (4)0.039 (3)0.041 (3)0.002 (3)0.012 (3)−0.011 (2)
N3号机组0.034 (2)0.026 (2)0.034 (2)−0.0009 (18)0.0070 (19)0.0001 (19)
4号机组0.054 (3)0.027 (2)0.031 (2)−0.004 (2)0.007 (2)−0.0016 (19)
C1类0.032 (3)0.034 (3)0.034 (3)0.001 (2)0.007 (2)−0.006 (2)
指挥与控制0.038 (3)0.030 (3)0.037 (3)−0.001 (2)0.010 (2)−0.004 (2)
C3类0.072 (5)0.048 (4)0.038 (4)−0.002 (3)0.018 (3)−0.009 (3)
补体第四成份0.068 (5)0.044 (4)0.040 (4)−0.001 (3)0.019 (3)−0.004 (3)
C5级0.034 (3)0.026 (3)0.034 (3)0.001 (2)0.010 (2)−0.003 (2)
C6级0.034 (3)0.055 (4)0.044 (4)−0.009 (3)0.017 (3)−0.009 (3)
抄送70.037 (3)0.046 (4)0.062 (4)−0.012 (3)0.008 (3)−0.014 (3)
抄送80.047 (4)0.038 (3)0.039 (3)−0.005 (3)0.004 (3)−0.014 (3)
C9级0.048 (3)0.037 (3)0.031 (3)0.000 (3)0.008 (2)−0.007 (2)
C10号机组0.050 (3)0.026 (3)0.033 (3)−0.004 (2)−0.001 (3)−0.003 (2)
C11号机组0.053 (4)0.033 (3)0.052 (4)0.003 (3)0.003 (3)−0.004 (3)
第12项0.069 (5)0.029 (3)0.060 (4)0.000 (3)−0.008 (4)0.004 (3)
第13页0.092 (6)0.032 (3)0.036 (3)−0.007 (3)0.001 (4)0.004 (3)
第14项0.071 (5)0.041 (3)0.036 (3)−0.011 (3)0.008 (3)−0.001 (3)
几何参数（λ，º） 顶部
钯-N32.050 (5)C4-H4型0.9500
第1-N4页2.056 (5)C5-C6型1.378 (8)
第1页-I12.5761 (7)C6至C71.400 (9)
第1页至第2页2.5898 (6)C6-H6型0.9500
N1-C4型1.326 (8)C7-C8号机组1.375 (10)
N1-C1型1.347 (8)C7-H7型0.9500
N2至C31.321 (9)C8-C9型1.362 (9)
N2-C2气体1.353 (8)C8-H8型0.9500
N3-C5号1.346 (7)C9-H90.9500
N3-C9型1.352 (7)C10-C11号机组1.384 (9)
N4-C10型1.340 (8)C11-C12号机组1.363 (10)
编号4-C141.346 (8)C11-H11型0.9500
C1-C2类1.395 (8)C12-C13型1.367 (12)
C1-C5号机组1.489 (7)C12-H12型0.9500
C2-C10型1.486 (8)C13至C141.383 (11)
C3-C4型1.393 (10)C13-H13型0.9500
C3-H3型0.9500C14-H14型0.9500
N3-Pd1-N4号87.17 (19)C6-C5-C1117.9 (5)
N3-Pd1-I1号机组89.26 (13)C5-C6-C7119.2 (6)
N4-Pd1-I1型173.87 (13)C5-C6-H6120.4
N3-Pd1-I2号机组176.70 (13)C7-C6-H6型120.4
N4-Pd1-I2号91.43 (14)C8-C7-C6118.9 (6)
I1-Pd1-I292.38 (2)C8-C7-H7型120.5
C4-N1-C1118.5 (5)C6-C7-H7型120.5
C3-N2-C2型118.0 (6)C9-C8-C7118.6 (6)
C5-N3-C9118.0 (5)C9-C8-H8120.7
C5-N3-Pd1120.7 (4)C7-C8-H8型120.7
C9-N3-Pd1120.9 (4)N3-C9-C8123.6 (6)
C10-N4-C14型119.3 (6)N3-C9-H9型118.2
C10-N4-第1页121.9 (4)C8-C9-H9型118.2
C14-N4-Pd1型118.7 (5)编号4-C10-C11120.8 (6)
N1-C1-C2型120.3 (5)编号4-C10-C2120.3 (5)
N1-C1-C5型113.6 (5)C11-C10-C2型118.9 (6)
C2-C1-C5型125.7 (5)C12-C11-C10120.0 (7)
N2-C2-C1120.7 (6)C12-C11-H11120
N2-C2-C10气体113.1 (5)C10-C11-H11号机组120
C1-C2-C10型126.0 (5)C11-C12-C13型119.3 (7)
N2-C3-C4气体121.5 (6)C11-C12-H12型120.4
N2-C3-H3型119.2C13-C12-H12型120.4
C4-C3-H3型119.2C12-C13-C14型119.2 (7)
N1-C4-C3型120.9 (6)C12-C13-H13型120.4
N1-C4-H4型119.5C14-C13-H13型120.4
C3-C4-H4型119.5编号4-C14-C13121.4 (7)
编号3-C5-C6121.6 (5)N4-C14-H14型119.3
编号3-C5-C1120.4 (5)C13-C14-H14119.3
N4-Pd1-N3-C5−70.8 (4)N1-C1-C5-C642.3 (7)
I1-Pd1-N3-C5114.2 (4)C2-C1-C5-C6−130.1 (7)
N4-Pd1-N3-C9116.0 (4)编号3-C5-C6-C7−1.3 (10)
I1-Pd1-N3-C9−59.1 (4)C1-C5-C6-C7−179.2 (6)
N3-Pd1-N4-C1062.2 (5)C5-C6-C7-C8−0.6 (11)
I2-Pd1-N4-C10−114.8 (4)C6-C7-C8-C91.0 (10)
N3-Pd1-N4-C14号−114.1 (5)C5-N3-C9-C8−2.4 (9)
I2-Pd1-N4-C14型68.9 (5)Pd1-N3-C9-C8171.0 (5)
C4-N1-C1-C2型−1.8 (9)C7-C8-C9-N30.6 (10)
C4-N1-C1-C5型−174.7 (6)C14-N4-C10-C11型−1.2 (9)
C3-N2-C2-C12.0 (10)第1-N4-C10-C11页−177.5 (4)
C3-N2-C2-C10176.8 (6)C14-N4-C10-C2−177.7 (5)
N1-C1-C2-N2−0.6 (9)第1-N4-C10-C2页6.0 (7)
C5-C1-C2-N2171.4 (6)N2-C2-C10-N4129.4 (6)
N1-C1-C2-C10型−174.7 (6)C1-C2-C10-N4−56.1 (8)
C5-C1-C2-C10−2.7 (10)N2-C2-C10-C11型−47.2 (8)
C2-N2-C3-C4型−1.1 (11)C1-C2-C10-C11127.3 (7)
C1-N1-C4-C3型2.7 (10)N4-C10-C11-C12号1.6 (10)
N2-C3-C4-N1型−1.3 (12)C2-C10-C11-C12型178.1 (6)
C9-N3-C5-C62.8 (8)C10-C11-C12-C13−1.0 (10)
第1-N3-C5-C6页−170.7 (5)C11-C12-C13-C140.1 (11)
C9-N3-C5-C1−179.4 (5)C10-N4-C14-C130.3 (9)
Pd1-N3-C5-C1型7.2 (7)第1-N4-C14-C13页176.7 (5)
N1-C1-C5-N3−135.7 (6)C12-C13-C14-N4型0.3 (11)
C2-C1-C5-N3型51.9 (8)
氢键几何形状（λ，º） 顶部
D类-H（H）···A类D类-H（H）H（H）···A类D类···A类D类-H（H）···A类
C11-H11···I1我0.952.993.776 (7)141
对称代码：（i）−x个+1/2,年+1/2,−z（z）+3/2.

实验细节

水晶数据
化学配方【PdI】2（C）14H（H）10N个4)]
M（M）第页594.46
晶体系统，空间组单诊所，P（P）21/n个
温度（K）200
一,b条,c（c）(Å)8.7936 (12), 15.528 (2), 12.3351 (17)
β(°)102.118 (3)
V（V）(Å三)1646.8 (4)
Z轴4
辐射类型钼K（K）α
µ（毫米−1)4.87
晶体尺寸（mm）0.42 × 0.31 × 0.29
数据收集
衍射仪布吕克智能1000 CCD
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克，2000年）
T型最小值,T型最大值0.183, 0.243
测量、独立和
观察到的[我> 2σ(我)]反射		10659, 3513, 2968
R（右）整数0.022
（罪θ/λ)最大值(Å−1)0.639
精炼
R（右）[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.035, 0.103, 1.05
反射次数3513
参数数量190
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值（eó）−三)1.28,−1.42

计算机程序：智能（Bruker，2000），圣保罗（Bruker，2000），SHELXS97标准（谢尔德里克，2008），SHELXL97型（谢尔德里克，2008），ORTEP-3公司（Farrugia，1997）和铂（斯佩克，2009）。

选定的键长（λ） 顶部
钯-N32.050 (5)Pd1-I1型2.5761 (7)
第1-N4页2.056 (5)第1页至第2页2.5898 (6)
氢键几何形状（λ，º） 顶部
D类-H（H）···A类D类-H（H）H（H）···A类D类···A类D类-H（H）···A类
C11-H11···I1我0.952.993.776 (7)141.1
对称代码：（i）−x个+1/2,年+1/2,−z（z）+3/2.
 

致谢

这项工作得到了教育、科学和技术部资助的韩国国家研究基金会（NRF）优先研究中心项目的支持（2010-0029626）。作者感谢全州中心KBSI对X射线数据的收集。

工具书类

第一次引用布鲁克（2000）。SADABS公司,智能和圣保罗布鲁克AXS公司，美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
 第一次引用Farrugia，L.J.（1997）。J.应用。克里斯特。 30, 565. 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
 第一次引用Ha，K.（2011）。《水晶学报》。E类67，m1307科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
 第一次引用Sheldrick，G.M.（2008）。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
 第一次引用Spek，A.L.（2009）。《水晶学报》。D类65, 148–155. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号：2056-9890
第67卷| 第11部分| 2011年11月| 第m1626页
doi:10.1107/S1600536811044023