逆转录病毒蛋白酶(RP)因其在逆转录病毒颗粒成熟过程中的关键作用而备受关注。RP是强制性的同源二聚体,在两个天冬氨酸(在DTG三联体中)周围建立了胃蛋白酶样活性位点,在两个瓣环下激活作为亲核试剂的水分子。梅森-辉瑞猴病毒(M-PMV)是逆转录病毒中唯一的病毒,因为其蛋白酶在单体形式下也稳定,这一点已由13kDa蛋白变体(M-PMV-PR)的现有晶体结构及其先前的生化特征证实。在本研究中,M-PMV PR的两个突变体D26N和C7A/D26N/C106A与肽模拟抑制剂在复合体中结晶,一个突变体(D26N)在没有抑制剂的情况下结晶。晶体结构的分辨率分别为1.6、1.9和2.0Ω。与之前的研究不同,所有新结构都具有典型的二聚体形式的逆转录病毒蛋白酶。二聚体内的原生质体主要在瓣环区不同,在载脂蛋白结构中观察到最极端的情况,其中一个瓣环定义明确,而另一个瓣圈不由电子密度定义。抑制剂分子在复杂结构中的存在已通过圩区图进行评估,但其构象的一些细节仍不明确。在所有呈现的结构中,活性位点包含一个水分子,它深深地埋藏在Asn26-Thr27-Gly28三元原聚体之间。这种水分子不仅在反胃蛋白酶中是完全独特的,而且在一般天冬氨酸蛋白酶中也是如此。C7A和C106A突变不影响蛋白质的构象。Cys106残基正确地放置在二硫键交联的同二聚体界面区域,但结晶实验的还原条件阻止了S-S键的形成。Proteopedia网站上提供了动画交互式3D补体(I3DC)http://proteoppedia.org/w/期刊:Acta_Cryst_D:S205979831901355.