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六水合硝酸镍(II)与质子转移化合物哌嗪二亚胺4-羟基-2,6-二羧酸吡啶(pipzH)的反应2)(hypydc),其中pipz是哌嗪和hypydcH2是4-羟基吡啶-2,6-二羧酸,在水溶液中形成标题络合物[Ni(C7H(H)5)(H)2O)]·1.5小时2O。镍(II)由三齿二离子配体的三个供体原子和三个水分子以略微扭曲的八面体几何结构配位。H的范围...A和D...A距离和D-H...角度表示该复合物中存在强氢键,该复合物涉及协调和不协调的水分子(其中一个位于双重旋转轴上),形成三维网络。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536807028115/bq2021sup1.cif
包含全局数据块I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536807028115/bq2021Sup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:654770

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=150 K
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.006º
  • 系数=0.057
  • 水风险系数=0.161
  • 数据与参数之比=11.9

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别B 铭牌417_标签2_B短间隔D-H.H-D H6B。。H10A。。1.46角度。铭牌417_标签2_B短Inter D-H..H-D H8B。。H10B。。2.03角度。
警报级别C RINTA01_ALERT_3_CRint值大于0.10铃数0.121PLAT020_警报_3_CRint值大于0.10。。。。。。。。。0.12板041_警报_1_C计算和重复求和公式字符串不同?平台042_警报_1_C计算和代表MoietyFormula字符串不同?PLAT045_ALERT_1_C板计算和报告的Z差值。。。。。。。。。。。。0.50比率PLAT094_警报_2_C最大/最小残余密度比。。。。2.05PLAT369_铭牌_2_C长C(sp2)-C(sp2”)键C1-C2。。。1.53角度。铭牌790_铭牌_4_C重心不在单元单元内:研究编号2氢气O
警报级别GPLAT794_ALERT_5_G检查Ni1(2)1.94的预测键价
0A级警报=一般情况:严重问题2B级警报=潜在的严重问题8C级警报=检查并解释1G级警报=一般警报;检查3警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失4警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器2警报类型3结构质量可能较低的指示器1警报类型4改进、方法、查询或建议1警报类型5信息性消息,检查

注释顶部

化学式和ORTEP公司图表表明阳离子碎片(pipzH2)2+在络合过程中被忽略,只有起始质子转移化合物的阴离子物种对综合体。这与其他一些仅包含其起始质子转移化合物的阴离子碎片。这个N(1)-Ni(1)-O(7)角显示八面体轴与理想的线性,所以O(1)、O(4)、0(6)和O(8)是赤道位置扭曲的八面体。D··A的弱氢键和强氢键晶体中的距离为2.649(5)到3.142(6)Ω。4-羟基吡啶-2,6-二羧酸盐、羧酸盐OH基团的存在晶体结构中的水分子导致氢键由于氢键具有晶格碎片之间的重要连接作用。还有两半单位[Ni(hypydc)(H2O)],通过氢气保持在一起水分子和羧酸根的氧原子之间的键合。数字1和2显示了该络合物的分子结构和堆积图,分别是。

相关文献顶部

近年来,我们一直对质子转移的合成感兴趣并研究了它们与金属离子的行为。我们专注于二羧酸的质子传递被认为是非常好的捐赠者。选择并使用了几个质子受体。结果是几种阴离子型质子转移化合物的制备二元酸作为供体。这些化合物在制备还研究了金属-有机结构。其中一些金属配合物显示了阳离子和阴离子碎片的贡献起始质子转移化合物,而其他仅包含其中一种物种作为配体(Aghabozorg等。, 2006; 阿加博佐格等。,2006,b;莫吉米等。, 2005; 舍什曼尼语等。, 2006).

实验顶部

加入20 ml(pipzH)水溶液2)添加(hypydc)(584 mg,2 mmol)10 ml六水合硝酸镍(II)水溶液(290 mg,1 mmol)。静置20天后,晶体沉淀。纯粹的结晶络合物[Ni(hypydc)(H2O)]. 2小时2O、 在>400时分解摄氏度。

精炼顶部

氢原子被几何定位,并通过骑行模型进行细化(包括甲基的扭转自由度),C-H=0.95–0.98Ω,U(H)限制为1.2倍(甲基为1.5倍)U型等式载流子原子。

结构描述顶部

化学式和ORTEP公司图表显示阳离子碎片(pipzH2)2+在络合过程中被忽略,只有起始质子转移化合物的阴离子物种有助于综合体。这与其他一些仅包含其起始质子转移化合物的阴离子碎片。这个N(1)-Ni(1)-O(7)角显示八面体轴与理想的线性,所以O(1)、O(4)、0(6)和O(8)是赤道位置扭曲的八面体。D··A的弱氢键和强氢键晶体中的距离为2.649(5)到3.142(6)Ω。4-羟基吡啶-2,6-二羧酸盐、羧酸盐OH基团的存在晶体结构中的水分子导致氢键由于氢键具有晶格碎片之间的重要连接作用。还有两半单位[Ni(hypydc)(H2O)],通过氢气保持在一起水分子和羧酸氧原子之间的键。数字1和2显示了该络合物的分子结构和堆积图,分别是。

近年来,我们一直对质子转移的合成感兴趣化合物,并研究了它们与金属离子的行为。我们专注于二羧酸的质子传递被认为是非常好的捐赠者。选择并使用了几个质子受体。结果是几种阴离子型质子转移化合物的制备二元酸作为供体。这些化合物在制备还研究了金属-有机结构。其中一些金属配合物显示了阳离子和阴离子碎片的贡献起始质子转移化合物,而其他仅包含其中一种物种作为配体(Aghabozorg等。, 2006; 阿加博佐格等。,2006,b;莫吉米等。, 2005; 谢什马尼等。, 2006).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1998);单元格细化:智能; 数据缩减:圣保罗(布鲁克,1998);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(Sheldrick,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(Sheldrick,1997);分子图形:谢尔克斯特尔(布鲁克,1998);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.

数字顶部
[图1] 图1。具有原子标记和50%概率的(I)的分子结构位移椭球体。
[图2] 图2。(I)的填充,显示由O–H··O氢连接的分子债券(虚线)。
三(4-羟基吡啶-2,6-二羧基)镍(II)倍半水合物顶部
水晶数据 顶部
[镍(C7H(H)5)(H)2O)]·1.5小时2O(运行)F类(000) = 1320
M(M)第页= 320.89D类x个=1.859毫克
单诊所,C类2/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-C2yc4075次反射的细胞参数
= 14.881 (12) Åθ= 2.7–27.3°
b条= 6.878 (6) ŵ=1.74毫米1
c(c)= 22.409 (19) ÅT型=150 K
β= 90.049 (15)°块,蓝色
V(V)= 2294 (3) Å0.43×0.34×0.07毫米
Z轴= 8
数据收集 顶部
布鲁克SMART 1000
衍射仪
2019年独立反思
辐射源:细焦点密封管1567次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.121
探测器分辨率:100像素mm-1θ最大值= 25.0°,θ最小值= 1.8°
ω扫描小时=1717
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1998年)
k个=88
T型最小值= 0.522,T型最大值= 0.888=2626
10569次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.057氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.161受约束的氢原子参数
S公司= 1.06 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.1044P(P))2+ 2.0879P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
2019年的反思(Δ/σ)最大值= 0.001
169个参数Δρ最大值=2.09埃
0个约束Δρ最小值=1.02埃
水晶数据 顶部
[镍(C7H(H)5)(H)2O)]·1.5小时2O(运行)V(V)= 2294 (3) Å
M(M)第页= 320.89Z轴= 8
单诊所,C类2/c(c)K(K)α辐射
= 14.881 (12) ŵ=1.74毫米1
b条= 6.878 (6) ÅT型=150 K
c(c)= 22.409 (19) Å0.43×0.34×0.07毫米
β= 90.049 (15)°
数据收集 顶部
布鲁克SMART 1000
衍射仪
2019年独立思考
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1998年)
1567次反射> 2σ()
T型最小值= 0.522,T型最大值= 0.888整数= 0.121
10569次测量反射
精炼 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0570个约束
水风险(F类2) = 0.161受约束的氢原子参数
S公司= 1.06Δρ最大值=2.09埃
2019年反思Δρ最小值=1.02埃
169个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;单元格参数中e.s.d.之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.完善F类2对抗所有反射。加权-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt).并且与用于细化的反射的选择无关。-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类,以及-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
镍10.52210 (4)0.24829 (8)0.63815 (2)0.0155 (3)
N1型0.6177 (2)0.1265 (5)0.58918 (16)0.0139 (8)
O1公司0.4739 (2)0.2898 (4)0.54619 (14)0.0164 (7)
氧气0.5152 (2)0.2401 (4)0.45093 (14)0.0186 (8)
臭氧0.7282 (2)0.0631 (5)0.71543 (14)0.0266 (8)
O4号机组0.6134 (2)0.1517 (5)0.70553 (13)0.0201 (7)
O5公司0.83039 (19)0.0744 (5)0.48988 (13)0.0177 (7)
H5型0.87370.10620.51190.021*
O6公司0.4476 (2)0.0092 (5)0.64449 (15)0.0242 (8)
H6A型0.44280.06820.60630.029*
H6B型0.38630.02170.63730.029*
O7公司0.4278 (2)0.3656 (5)0.69271 (14)0.0238 (8)
H7A型0.43930.48310.71370.029*
H7B型0.39920.28430.72130.029*
O8号机组0.5778 (2)0.5276 (5)0.63456 (14)0.0214 (7)
H8A型0.56010.59380.59920.026*
H8B型0.64060.53240.64180.026*
O90.50000.2882 (9)0.75000.073 (3)
H9A型0.50600.21330.71460.088*
O10号机组0.7368 (2)0.0525 (5)0.83145 (15)0.0283 (8)
H10A型0.68050.01470.81520.034*
H10B型0.75870.16790.81330.034*
C1类0.5283 (3)0.2279 (6)0.5061 (2)0.0183 (11)
指挥与控制0.6146 (3)0.1338 (6)0.52935 (19)0.0137 (9)
C3类0.6850 (3)0.0626 (6)0.49478 (19)0.0137 (9)
H3级0.68180.06630.45240.016*
补体第四成份0.7612 (3)0.0153 (6)0.5238 (2)0.0146 (9)
C5级0.7629 (3)0.0255 (6)0.5870 (2)0.0172 (10)
H5A型0.81290.07860.60770.021*
C6级0.6881 (3)0.0456 (6)0.6176 (2)0.0159 (9)
抄送70.6769 (3)0.0447 (7)0.6852 (2)0.0173 (10)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
镍10.0124 (4)0.0218 (4)0.0122 (4)0.0028 (2)0.0006 (3)0.0001 (2)
N1型0.0115 (17)0.0175 (19)0.0128 (19)0.0013 (14)0.0006 (14)0.0005 (15)
O1公司0.0119 (16)0.0214 (17)0.0158 (17)0.0039 (12)0.0018 (13)0.0003 (13)
氧气0.0207 (19)0.0224 (18)0.0125 (19)0.0041 (12)0.0068 (14)0.0010 (12)
臭氧0.0264 (18)0.040 (2)0.0137 (17)0.0100 (15)0.0024 (14)0.0013 (15)
O4号机组0.0208 (16)0.0279 (19)0.0118 (16)0.0080 (14)0.0007 (12)0.0003 (14)
O5公司0.0127 (15)0.0247 (18)0.0156 (16)0.0069 (12)0.0026 (12)0.0001 (14)
O6公司0.0220 (17)0.0281 (18)0.0226 (18)0.0020 (13)0.0033 (14)0.0038 (15)
O7公司0.0232 (17)0.032 (2)0.0161 (17)0.0059 (14)0.0043 (13)0.0009 (15)
O8号机组0.0210 (16)0.0252 (18)0.0180 (17)0.0002 (13)0.0010 (13)0.0020 (14)
O9号机组0.145 (8)0.038 (4)0.036 (4)00.035 (5)0
O10号机组0.0250 (18)0.037 (2)0.0226 (19)0.0041 (15)0.0039 (14)0.0024 (16)
C1类0.022 (3)0.013 (2)0.021 (3)0.0016 (17)0.004 (2)0.0016 (18)
指挥与控制0.012 (2)0.016 (2)0.013 (2)0.0011 (17)0.0020 (16)0.0009 (18)
C3类0.016 (2)0.015 (2)0.010 (2)0.0022 (16)0.0007 (17)0.0002 (17)
补体第四成份0.014 (2)0.015 (2)0.015 (2)0.0005 (16)0.0013 (17)0.0010 (18)
C5级0.015 (2)0.020 (2)0.016 (2)0.0035 (17)0.0000 (18)0.0002 (19)
C6级0.013 (2)0.019 (2)0.015 (2)0.0005 (17)0.0027 (17)0.0020 (18)
抄送70.013 (2)0.025 (2)0.014 (2)0.0018 (18)0.0008 (18)0.0001 (19)
几何参数(λ,º) 顶部
Ni1-N1型1.983 (4)O7-H7A型0.9501
Ni1-O7合金2.029 (3)O7-H7B型0.9501
镍-O82.094 (4)早上8点至8点0.9500
Ni1-O6合金2.094 (4)O8-H8B型0.9501
镍-O42.136 (3)O9-H9A型0.9500
镍-O12.200 (4)O10-H10A型0.9500
N1-C2型1.342 (6)O10-H10B型0.9499
N1-C6型1.346 (6)C1-C2类1.529 (6)
O1-C1型1.283 (6)C2-C3型1.393 (6)
O2-C1型1.254 (6)C3至C41.412 (6)
臭氧-C71.261 (5)C3至H30.9500
O4-C7型1.282 (5)C4-C5型1.418 (7)
O5-C4型1.344 (5)C5至C61.395 (6)
O5-H5型0.8400C5-H5A型0.9500
O6-H6A型0.9499C6至C71.525 (6)
O6-H6B型0.9500
N1-Ni1-O7型176.51 (13)H7A-O7-H7B型104.3
N1-Ni1-O8型94.73 (14)镍-O8-H8A111.2
O7-Ni1-O8合金86.10 (14)镍-O8-H8B114.5
N1-Ni1-O6型93.45 (14)H8A-O8-H8B型113.5
O7-Ni1-O6合金85.93 (14)H10A-010-H10B型111.5
O8-Ni1-O6合金171.13 (13)氧气-C1-O1124.8 (4)
N1-Ni1-O4型78.67 (14)氧气-C1-C2119.6 (4)
O7-Ni1-O4合金97.90 (14)O1-C1-C2型115.6 (4)
O8-Ni1-O4合金93.50 (13)N1-C2-C3型121.1 (4)
O6-Ni1-O4型91.46 (14)N1-C2-C1型112.6 (4)
N1-Ni1-O1型76.72 (14)C3-C2-C1126.2 (4)
O7-Ni1-O1型106.71 (13)C2-C3-C4型118.8 (4)
O8-Ni1-O1型88.48 (12)C2-C3-H3型120.6
O6-Ni1-O1型90.07 (13)C4-C3-H3型120.6
O4-Ni1-O1型155.39 (12)O5-C4-C3型118.0 (4)
C2-N1-C6120.9 (4)O5-C4-C5型122.5 (4)
C2-N1-Ni1型120.8 (3)C3-C4-C5型119.5 (4)
C6-N1-Ni1型118.2 (3)C6-C5-C4117.3 (4)
C1-O1-Ni1型114.0 (3)C6-C5-H5A细胞121.3
C7-O4-Ni1型113.3 (3)C4-C5-H5A型121.3
C4-O5-H5型109.5N1-C6-C5122.3 (4)
镍-O6-H6A109.8N1-C6-C7号机组112.7 (4)
镍-O6-H6B107.9C5-C6-C7125.1 (4)
早上6点到早上6点82.7臭氧-C7-O4126.3 (4)
镍-O7-H7A120.8O3至C7至C6118.0 (4)
镍-O7-H7B118.8O4-C7-C6115.6 (4)
O8-Ni1-N1-C283.2 (3)镍-N1-C2-C14.7 (5)
O6-Ni1-N1-C293.4 (3)O2-C1-C2-N1型178.2 (4)
O4-Ni1-N1-C2175.8 (3)O1-C1-C2-N1型1.9 (5)
O1-Ni1-N1-C24.1 (3)O2-C1-C2-C32.4 (7)
O8-Ni1-N1-C693.3 (3)O1-C1-C2-C3177.5 (4)
O6-Ni1-N1-C690.1 (3)N1-C2-C3-C41.1 (6)
O4-Ni1-N1-C60.7 (3)C1-C2-C3-C4型178.3 (4)
O1-Ni1-N1-C6179.4 (3)C2-C3-C4-O5型176.7 (4)
N1-Ni1-O1-C12.8 (3)C2-C3-C4-C5型2.2 (6)
O7-Ni1-O1-C1177.9 (3)O5-C4-C5-C6178.1 (4)
O8-Ni1-O1-C192.4 (3)C3-C4-C5-C6型0.8 (6)
O6-Ni1-O1-C196.3 (3)C2-N1-C6-C5型3.2 (6)
O4-Ni1-O1-C12.7 (5)镍-N1-C6-C5173.3 (3)
N1-Ni1-O4-C7型8.3 (3)C2-N1-C6-C7177.7 (4)
O7-Ni1-O4-C7171.0 (3)镍-N1-C6-C75.8 (5)
O8-Ni1-O4-C7型102.4 (3)C4-C5-C6-N11.9 (7)
O6-Ni1-O4-C7型84.9 (3)C4-C5-C6-C7型179.1 (4)
O1-Ni1-O4-C78.4 (5)Ni1-O4-C7-O3164.3 (4)
Ni1-O1-C1-O2178.6 (3)镍-O4-C7-C613.6 (5)
Ni1-O1-C1-C21.3 (4)N1-C6-C7-O3164.9 (4)
C6-N1-C2-C31.6 (6)C5-C6-C7-O316.0 (7)
镍-N1-C2-C3174.7 (3)N1-C6-C7-O4型13.2 (6)
C6-N1-C2-C1179.0 (4)C5-C6-C7-O4165.8 (4)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O5-H5···O10.841.822.649 (5)167
O6-H6型A类···氧气ii(ii)0.951.852.720 (5)151
O6-H6型B类···O10号机组0.951.972.829 (5)149
7点至7点A类···O9号机组iv(四)0.951.992.911 (7)163
O7-H7型B类···O4号机组0.951.892.782 (5)156
O8-H8型A类···氧气v(v)0.951.962.852 (5)157
O8-H8型A类···O5公司不及物动词0.952.583.123 (5)116
O8-H8型B类···O10号机组vii(七)0.951.922.867 (5)172
O9-H9型A类···O6公司0.952.283.142 (6)151
O10-H10型A类···O6公司0.952.122.829 (5)131
O10-H10型B类···臭氧vii(七)0.951.972.893 (5)164
对称代码:(i)x个+1/2,1/2,z(z); (ii)x个+1,,z(z)+1; (iii)x个+1,,z(z)+3/2; (iv)x个,+1,z(z); (v)x个+1,+1,z(z)+1; (vi)x个+3/2,+1/2,z(z)+1; (vii)x个+3/2,+1/2,z(z)+3/2.

实验细节

水晶数据
化学配方[Ni(C7H(H)5)(H)2O)]·1.5小时2O(运行)
M(M)第页320.89
晶体系统,空间组单诊所,C类2/c(c)
温度(K)150
,b条,c(c)(Å)14.881 (12), 6.878 (6), 22.409 (19)
β(°)90.049 (15)
V(V))2294 (3)
Z轴8
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)1.74
晶体尺寸(mm)0.43 × 0.34 × 0.07
数据收集
衍射仪布吕克智能1000
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1998年)
T型最小值,T型最大值0.522, 0.888
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
10569, 2019, 1567
整数0.121
(罪θ/λ)最大值1)0.595
精炼
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.057, 0.161, 1.06
反射次数2019
参数数量169
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))2.09,1.02

计算机程序:智能(布鲁克,1998),智能,圣保罗(布鲁克,1998),SHELXS97标准(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),谢尔克斯特尔(布鲁克,1998),谢尔克斯特尔.

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O5-H5···O10.841.822.649 (5)167.4
O6-H6A··O2ii(ii)0.951.852.720 (5)150.6
O6-H6B··O100.951.972.829 (5)148.9
O7-H7A···O9iv(四)0.951.992.911 (7)163.1
O7-H7B···O40.951.892.782 (5)156.2
O8-H8A··O2v(v)0.951.962.852 (5)156.5
O8-H8A··O5不及物动词0.952.583.123 (5)116.4
O8-H8B··O10vii(七)0.951.922.867 (5)171.5
O9-H9A··O60.952.283.142 (6)150.9
O10-H10A···O60.952.122.829 (5)130.6
O10-H10B···O3vii(七)0.951.972.893 (5)163.7
对称代码:(i)x个+1/2,1/2,z(z); (ii)x个+1,,z(z)+1; (iii)x个+1,,z(z)+3/2; (iv)x个,+1,z(z); (v)x个+1,+1,z(z)+1; (vi)x个+3/2,+1/2,z(z)+1; (vii)x个+3/2,+1/2,z(z)+3/2.
 

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