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标题化合物C18H(H)12英国2N个2,由合成N个-3-氯甲基吡啶与3,6-二溴-9的烷基化反应H(H)-咔唑。咔唑环体系基本上是平面的,平均偏差为0.0138º,与吡啶环平面形成96.7(8)°的二面角。在晶体结构中,π-π相互作用和弱C-H...观察到Br相互作用。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536805040535/bd6019sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536805040535/bd6019Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:296518

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • =294千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.005º
  • R(右)系数=0.034
  • 水风险系数=0.078
  • 数据与参数之比=16.0

检查CIF/PLATON结果

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注释顶部

咔唑衍生物被取代N个-烷基化具有宝贵的药物特性(Buu-Hoí&Royer,1950;Harfenist&Joyner,1983;Caulfield等。, 2002; 哈珀等。, 2002). 标题化合物3,6-二溴-9-(3-吡啶甲基)-9H(H)-咔唑(I)(图1)由N个-3-氯甲基吡啶与3,6-二溴-9的烷基化反应H(H)-咔唑。

咔唑环基本上是平面的,平均偏差为0.0138º。这些值与之前报告的值一致(黄等。, 2005; 段,韩等。2005年或Duan,Huang等。, 2005). 咔唑环和吡啶环平面之间形成的二面角为96.7(su?)°。C-Br距离在1.905(3)至1.907(3)Å的范围内,与文献值一致(Allen等。, 1987). 在晶体结构中,ππ观察到相互作用;最短的3.519Ω位于N1和,C?–C12和C7–与(1−x个, −, 2 −z(z)). 此外,还有C-H··Br相互作用,如图2所示,详见表1。

实验顶部

标题化合物按照Duan,Han的程序制备等。(2005)或段黄等。(2005). 在室温下将氢氧化钾(7.0 g)存于二甲基甲酰胺(50 ml)中的溶液搅拌20分钟。3,6-二溴咔唑(6.5 g,20 mmol),根据Smith制备等。添加(1992),并将混合物再搅拌40 min。搅拌下逐滴添加3-(氯甲基)吡啶(3.825 g,30 mmol)存于二甲基甲酰胺(50 ml)中的溶液。然后将所得混合物在室温下搅拌10 h,并倒入水中(500 ml),产生白色沉淀。通过过滤收集固体产物(I),用冷水洗涤并从EtOH中重结晶(产率:7.11 g(85.5%);m.p.488 K)。将化合物(I)(40 mg)溶解在氯仿(5 ml)和乙醇(5 ml。

精炼顶部

将所有H原子放置在计算位置,并使用骑行模型进行细化,C-H=0.93(芳香族)和0.97(亚甲基)ÅU型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。

计算详细信息顶部

数据收集:聪明的(布鲁克,1997);单元格细化:圣保罗(布鲁克,1997);数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:架子97(谢尔德里克,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:SHELXTL公司(布鲁克,1997);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

数字顶部
[图1] 图1。(I)的位移椭球(30%)图。
[图2] 图2。(I)包装图,沿[001]查看。虚线表示C-H··Br相互作用。
3,6-二溴-9-(3-吡啶甲基)-9H(H)-咔唑顶部
水晶数据 顶部
C类18H(H)12英国2N个2F类(000) = 816
M(M)第页= 416.12D类x个=1.769毫克
单诊所,P(P)21/c熔点:488 K
大厅符号:-p 2ybcK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 10.469 (3) Å2796次反射的单元参数
b条= 16.405 (5) Åθ= 2.5–26.4°
c= 9.866 (3) ŵ=5.19毫米1
β= 112.761 (4)°=294千
V(V)= 1562.6 (8) Å无色杆
Z轴= 40.26×0.22×0.14毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
3194独立反射
辐射源:细焦点密封管2238次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.046
ϕω扫描θ最大值= 26.5°,θ最小值= 2.1°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1997年)
小时=1213
最小值= 0.258,最大值= 0.484k个=1620
8670次测量反射=1012
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.034H原子参数受约束
水风险(F类2) = 0.078 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0276P(P))2+ 0.8633P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c2)/3
S公司= 1.00(Δ/σ)最大值= 0.001
3194次反射Δρ最大值=0.48埃
200个参数Δρ最小值=0.52埃
0个约束消光校正:SHELXL97型,Fc(预测值)*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
初级原子位点定位:结构不变的直接方法消光系数:0.0233(8)
水晶数据 顶部
C类18H(H)12英国2N个2V(V)= 1562.6 (8) Å
M(M)第页= 416.12Z轴= 4
单诊所,P(P)21/cK(K)α辐射
= 10.469 (3) ŵ=5.19毫米1
b条= 16.405 (5) Å=294千
c= 9.866 (3) Å0.26×0.22×0.14毫米
β= 112.761 (4)°
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
3194独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1997年)
2238次反射> 2σ()
最小值= 0.258,最大值= 0.484R(右)整数= 0.046
8670次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0340个约束
水风险(F类2) = 0.078H原子参数受约束
S公司= 1.00Δρ最大值=0.48埃
3194次反射Δρ最小值=0.52埃
200个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
溴10.00354 (4)0.11991 (3)0.40210 (4)0.06161 (17)
溴化氢0.80862 (4)0.09086 (2)0.85957 (5)0.06183 (17)
N1型0.4620(2)0.16487 (15)0.9894 (3)0.0355 (6)
氮气0.6579 (3)0.39737 (19)1.0202(4)0.0605 (9)
C1类0.3459 (3)0.16398 (18)0.8594 (3)0.0314 (7)
C20.2245 (3)2013年10月20日(19)0.8188 (4)0.0409 (8)
氢气0.21240.24770.88190.049*
C3类0.1226 (3)0.1950 (2)0.6824 (4)0.0426 (8)
H3级0.04010.22410.65250.051*
补体第四成份0.1423 (3)0.1373 (2)0.5888 (3)0.0383 (8)
C5级0.2617 (3)0.09198 (19)0.6256 (3)0.0353 (7)
H5型0.27290.05390.56130.042*
C6级0.3652 (3)0.10598 (17)0.7640 (3)0.0307 (7)
抄送70.5001(3)0.07045 (17)0.8407 (3)0.0305 (7)
抄送80.5739 (3)0.01016 (18)0.8028(3)0.0352 (7)
H8型0.53820.01560.71170.042*
C9级0.7025 (3)0.00941 (19)0.9068 (4)0.0393 (8)
C10号机组0.7577(3)0.0265 (2)1.0449 (4)0.0438 (8)
H10型0.84390.01011.11230.053*
C11号机组0.6855 (3)0.0861 (2)1.0820 (4)0.0428 (8)
H11型0.72210.11121.17360.051*
第12项0.5557 (3)0.10815 (18)0.9788 (3)0.0332 (7)
第13页0.4866 (3)0.2169 (2)1.1169 (3)0.0415 (8)
第13页0.51900.18371.20510.050*
H13B型0.40010.24221.10850.050*
第14页0.5693 (4)0.3393(2)1.0215 (4)0.0482 (9)
第14页0.48480.33700.94160.058*
第15项0.5922(3)0.28248 (19)1.1308 (3)0.0356 (7)
第16号0.7160(3)0.2878 (2)1.2504 (4)0.0480 (9)
H16型0.73580.25161.32840.058*
第17页0.8103 (4)0.3470 (2)1.2535 (4)0.0573 (10)
H17型0.89430.35161.33350.069*
第18号0.7776 (4)0.3992 (2)1.1358 (5)0.0590 (10)
H18型0.84290.43791.13710.071*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
溴10.0346 (2)0.0907 (3)0.0459 (2)0.00194 (19)0.00059 (15)0.0041 (2)
溴化氢0.0535 (3)0.0609 (3)0.0743 (3)0.02057(19)0.0283 (2)0.0020 (2)
N1型0.0361 (14)0.0378 (15)0.0310 (14)0.0023 (12)0.0112 (11)0.0048(11)
氮气0.065 (2)0.060 (2)0.058 (2)0.0096 (17)0.0262 (18)0.0038 (16)
C1类0.0302 (15)0.0313(16)0.0338 (16)0.0012 (13)0.0137 (13)0.0008 (13)
C20.0435 (19)0.0385 (19)0.044 (2)0.0040 (15)0.0206 (16)0.0037 (15)
C3类0.0310 (17)0.047 (2)0.048 (2)0.0062 (15)0.0128 (15)0.0071 (16)
补体第四成份0.0305 (16)0.046 (2)0.0331 (17)0.0059 (15)0.0063 (13)0.0015 (14)
C5级0.0330 (16)0.0377 (17)0.0343 (17)0.0020 (14)0.0120(13)0.0023 (13)
C6级0.0292 (15)0.0318 (17)0.0322 (16)0.0006 (12)0.0129 (13)0.0024 (13)
抄送70.0291 (15)0.0298 (17)0.0329 (16)0.0020(13)0.0122 (13)0.0016 (13)
抄送80.0373 (17)0.0355 (18)0.0347 (17)0.0002 (14)0.0161 (14)0.0003(13)
C9级0.0359 (17)0.0379 (18)0.049 (2)0.0048 (14)0.0224 (16)0.0026 (15)
C10号机组0.0321 (17)0.047 (2)0.046 (2)0.0054 (15)0.0074(15)0.0050 (16)
C11号机组0.0379 (18)0.051 (2)0.0327 (17)0.0030 (16)0.0067 (14)0.0022 (15)
第12项0.0346 (16)0.0315 (17)0.0333 (17)0.0008 (13)0.0128 (13)0.0002 (13)
第13页0.0502 (19)0.046 (2)0.0307 (17)0.0016 (16)0.0187 (15)0.0077 (14)
第14页0.051 (2)0.056 (2)0.0341 (19)0.0037 (18)0.0128 (16)0.0026 (17)
第15项0.0388 (17)0.0418(18)0.0290 (16)0.0038 (15)0.0161 (14)0.0096 (14)
第16号0.046 (2)0.050(2)0.040 (2)0.0093 (17)0.0080 (16)0.0032(16)
第17页0.0337 (19)0.062 (3)0.064 (3)0.0006 (18)0.0062 (17)0.017 (2)
第18号0.056 (2)0.055 (2)0.075 (3)0.0084 (19)0.035 (2)0.011 (2)
几何参数(λ,º) 顶部
溴1-C41.905 (3)C8-C9型1.378(4)
溴化氢-C91.907 (3)C8-H8型0.9300
N1-C1型1.384 (4)C9-C10型1.388 (5)
N1-C12号机组1.385 (4)C10-C11号机组1.369 (4)
N1-C13号机组1.459(4)C10-H10型0.9300
N2-C18型1.329 (5)C11-C12号机组1.395 (4)
N2-C14型1.333 (4)C11-H11型0.9300
C1-C2类1.389 (4)C13-C15型1.510 (4)
C1-C6号机组1.407 (4)C13-H13A型0.9700
C2-C3型1.375 (4)C13-H13B型0.9700
C2-H2型0.9300C14-C15号1.375 (5)
C3-C4型1.392 (5)C14-H14型0.9300
C3-H3型0.9300C15至C161.377 (4)
C4-C5型1.376 (4)C16-C17号1.377 (5)
C5至C61.395 (4)C16-H16型0.9300
C5-H5型0.9300C17-C18型1.375 (6)
C6至C71.443 (4)C17-H17型0.9300
C7-C8号机组1.393 (4)C18-H18型0.9300
C7-C12号机组1.401 (4)
C1-N1-C12108.5 (2)C11-C10-C9120.2 (3)
C1-N1-C13型127.2 (3)C11-C10-H10型119.9
C12-N1-C13型124.3 (2)C9-C10-H10119.9
C18-N2-C14型115.8 (3)C10-C11-C12号机组118.2 (3)
N1-C1-C2型129.7 (3)C10-C11-H11号机组120.9
N1-C1-C6109.0 (2)C12-C11-H11型120.9
C2-C1-C6型121.3(3)N1-C12-C11号129.6 (3)
C3-C2-C1117.9 (3)N1-C12-C7型109.3 (3)
C3-C2-H2121C11-C12-C7型121.1 (3)
C1-C2-H2121N1-C13-C15型111.9 (3)
C2-C3-C4型120.4(3)N1-C13-H13A型109.2
C2-C3-H3型119.8C15-C13-H13A109.2
C4-C3-H3型119.8N1-C13-H13B型109.2
C5-C4-C3型123.0 (3)C15-C13-H13B109.2
C5-C4-Br1118.7(2)H13A-C13-H13B型107.9
C3-C4-Br1型118.3 (2)N2-C14-C15型125.6 (3)
C4-C5-C6116.8 (3)N2-C14-H14型117.2
C4-C5-H5型121.6C15-C14-H14型117.2
C6-C5-H5型121.6C14-C15-C16116.7 (3)
C5-C6-C1120.5 (3)C14-C15-C13型120.9 (3)
C5-C6-C7132.8 (3)C16-C15-C13型122.4 (3)
C1-C6-C7型106.7 (2)C17-C16-C15型119.5 (3)
C8-C7-C12型120.7 (3)C17-C16-H16型120.2
C8-C7-C6132.7 (3)C15-C16-H16型120.2
C12-C7-C6106.6 (3)C18-C17-C16118.6 (3)
C9-C8-C7116.6 (3)C18-C17-H17型120.7
C9-C8-H8121.7C16-C17-H17型120.7
C7-C8-H8型121.7N2-C18-C17型123.7 (4)
C8-C9-C10型123.2 (3)N2-C18-H18型118.1
C8-C9-Br2号118.3 (2)C17-C18-H18型118.1
C10-C9-溴118.5(2)
C12-N1-C1-C2179.2 (3)C8-C9-C10-C11号机组1.8 (5)
C13-N1-C1-C2型2.0 (5)溴-2-C9-C10-C11179.0 (2)
C12-N1-C1-C60.1 (3)C9-C10-C11-C121.0 (5)
C13-N1-C1-C6178.8(3)C1-N1-C12-C11178.7 (3)
N1-C1-C2-C3178.6 (3)C13-N1-C12-C112.4 (5)
C6-C1-C2-C3型0.6 (5)C1-N1-C12-C70.3 (3)
C1-C2-C3-C4型0.3 (5)C13-N1-C12-C7178.6 (3)
C2-C3-C4-C5型0.1 (5)C10-C11-C12-N1178.9 (3)
C2-C3-C4-Br1型179.4 (2)C10-C11-C12-C70.0 (5)
C3-C4-C5-C6型0.2 (5)C8-C7-C12-N1179.5 (3)
溴1-C4-C5-C6179.3 (2)C6-C7-C12-N10.3 (3)
C4-C5-C6-C1型0.0 (4)C8-C7-C12-C11号机组0.4 (5)
C4-C5-C6-C7型178.8(3)C6-C7-C12-C11178.8(3)
N1-C1-C6-C5型178.9 (3)C1-N1-C13-C15107.0 (3)
C2-C1-C6-C5型0.4 (4)C12-N1-C13-C1571.7 (4)
N1-C1-C6-C70.1 (3)C18-N2-C14-C150.1 (5)
C2-C1-C6-C7型179.5 (3)N2-C14-C15-C161.7 (5)
C5-C6-C7-C80.4 (6)N2-C14-C15-C13型177.1 (3)
C1-C6-C7-C8型179.3 (3)N1-C13-C15-C1460.6 (4)
C5-C6-C7-C12178.6 (3)N1-C13-C15-C16118.1 (3)
C1-C6-C7-C120.3 (3)C14-C15-C16-C171.4 (5)
C12-C7-C8-C90.3(4)C13-C15-C16-C17177.3 (3)
C6-C7-C8-C9179.2 (3)C15-C16-C17-C180.3 (5)
C7-C8-C9-C101.4 (5)C14-N2-C18-C171.8 (6)
C7-C8-C9-Br2179.4 (2)C16-C17-C18-N22.1 (6)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C11-H11···Br10.932.893.595(3)134
对称代码:(i)x个+1,,z(z)+1。

实验细节

水晶数据
化学配方C类18H(H)12英国2N个2
M(M)第页416.12
水晶系统,太空组单诊所,P(P)21/c
温度(K)294
,b条,c(Å)10.469 (3), 16.405 (5), 9.866 (3)
β(°)112.761 (4)
V(V))1562.6 (8)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)5.19
晶体尺寸(mm)0.26 × 0.22 × 0.14
数据收集
衍射仪布吕克聪明的CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1997年)
最小值,最大值0.258, 0.484
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
8670, 3194, 2238
R(右)整数0.046
(罪θ/λ)最大值1)0.627
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.034, 0.078, 1.00
反射次数3194
参数数量200
氢原子处理H原子参数受约束
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.48,0.52

计算机程序:聪明的(布鲁克,1997),圣保罗(布鲁克,1997),圣保罗,架子97(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),SHELXTL公司(布鲁克,1997),SHELXTL公司.

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D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C11-H11···Br10.932.893.595 (3)134
对称代码:(i)x个+1,,z(z)+1。
 

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