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在标题化合物的晶体结构中,C17H(H)23N个O(运行),分子间N-H...O和C-H...存在O氢键。平面杂环与苯环形成64.4(1)°的二面角。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536807058473/at2473sup1.cif
包含全局数据块I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536807058473/at2473Isup2.hkl
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CCDC参考:672985

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=292千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.005Å
  • R(右)系数=0.069
  • 水风险系数=0.195
  • 数据与参数之比=14.7

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别B PLAT220_警报_2_B大型非溶剂C Ueq(最大)/Ueq。。。3.94比率
作者回复:这是由于无序,例如在i-丁基部分。
铭牌222_ALERT_3_B大非溶剂H Ueq(最大)/Ueq。。。4.25比率
作者回复:这是由于无序,例如在i-丁基部分。
板242_警报_2_B检查C11的低Ueq与相邻值的比较
作者回复:这是由于无序,例如在异丁基部分。

警报级别C RINTA01_ALERT_3_CRint值大于0.10给出的铃数0.101PLAT020_警报_3_CRint值大于0.10。。。。。。。。。0.10PLAT066_警报_1_C预测和报告的传输相同?平台242_警报_2_C检查C15的低Ueq与相邻值的比较
作者回复:这是由于无序,例如在i-丁基部分。
铭牌340_警报_3_CC-C键的低键精度(x1000)Ang。。。5
警报级别G 铭牌793_铭牌_1_G检查C8=…的绝对配置。。。S公司板860_ LERT_3_G注:租赁平方限制数量。。。。。。。1
0A级警报=一般情况:严重问题B级警报=潜在的严重问题5C级警报=检查并解释2G级警报=一般警报;检查2警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失3警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器5警报类型3结构质量可能较低的指示器0警报类型4改进、方法、查询或建议0警报类型5信息性消息,检查
checkCIF发布错误
警报级别G 发布2013年警报1_G_publ_section_comment(研究讨论)是缺少。这是提交完整论文所必需的(但电子纸可选)。
0A级警报=缺少重要数据或数据格式错误1G级警报=一般警报。可能需要的数据丢失

相关文献顶部

Lacroix描述了相关的制备和生物活性et(等)阿尔。(2000,b条). 相关文献见:Li&Hu(2006)。

精炼顶部

所有氢原子都位于差分图中,并被视为骑原子,除了N1时,具有以下距离限制:C-H=0.93Ω,U型国际标准化组织=1.2U型等式(C) 对于C服务提供商2,C-H=0.98º,U型国际标准化组织= 1.2U型等式(C) 对于CH,C-H=0.97º,U型国际标准化组织=1.2U型等式(C) 对于CH2,N-H=0.86º,U型国际标准化组织=1.2U型等式(N) 对于NH,C-H=0.96º,U型国际标准化组织= 1.5U型等式(C) 对于CH.

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2001);单元格细化:圣普卢斯(布鲁克,2001);数据缩减:圣普卢斯(布鲁克,2001);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:(斯佩克,2003);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(Sheldrick,2001)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构,显示原子标记方案。
[图2] 图2。晶体结构中的填料,显示N-H··O和C-H··O以虚线表示的氢键。
[图3] 图3。标题化合物的制备。
乙基2-[(Z轴)-4-异丁基-5-氧代-2-(苯基亚氨基)咪唑烷-1-基]乙酸盐顶部
水晶数据 顶部
C类17H(H)23N个O(运行)F类(000) = 1360
M(M)第页= 317.38D类x个=1.194毫克
正交各向异性,P(P)b条c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2ac 2ab3517次反射的细胞参数
= 16.059 (2) Åθ= 2.3–21.8°
b条= 10.6310 (16) ŵ=0.08毫米1
c(c)= 20.690 (3) ÅT型=292千
V(V)= 3532.2 (9) Å块状,无色
Z轴= 80.20×0.20×0.10毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART 4K CCD区域探测器
衍射仪
3097个独立反射
辐射源:细焦点密封管2154次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.101
ϕω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 2.0°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,2003年)
小时=1919
T型最小值= 0.984,T型最大值= 0.992k个=1212
26346次测量反射=2424
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.069氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.195受约束的氢原子参数
S公司= 1.06 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0923P(P))2+ 1.1347P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
3097次反射(Δ/σ)最大值= 0.002
211参数Δρ最大值=0.34埃
1个约束Δρ最小值=0.18埃
水晶数据 顶部
C类17H(H)23N个O(运行)V(V)= 3532.2 (9) Å
M(M)第页= 317.38Z轴= 8
正交各向异性,P(P)b条c(c)K(K)α辐射
= 16.059 (2) ŵ=0.08毫米1
b条= 10.6310 (16) ÅT型=292千
c(c)= 20.690 (3) Å0.20×0.20×0.10毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART 4K CCD区域探测器
衍射仪
3097个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,2003年)
2154次反射> 2σ()
T型最小值= 0.984,T型最大值= 0.992R(右)整数= 0.101
26346次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0691个约束
水风险(F类2) = 0.195受约束的氢原子参数
S公司= 1.06Δρ最大值=0.34埃
3097次反射Δρ最小值=0.18埃
211参数
特殊细节 顶部

几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)使用全协方差矩阵进行估计在估计距离、角度的e.s.d.时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险以及贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类、和R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.09982 (18)0.7576 (3)0.08787 (13)0.0458 (7)
指挥与控制0.0456 (2)0.6621 (3)0.06955 (14)0.0551 (8)
0.00460.68220.04960.066*
C3类0.0655 (2)0.5376 (3)0.08081 (17)0.0659 (9)
H3级0.02900.47450.06790.079*
补体第四成份0.1392 (2)0.5062 (3)0.11101 (15)0.0603 (9)
H4型0.15250.42230.11840.072*
C5级0.19213 (19)0.5989 (3)0.12982 (15)0.0591 (9)
H5型0.24150.57820.15080.071*
C6级0.17313 (18)0.7238 (3)0.11799 (14)0.0547 (8)
人60.21050.78610.13060.066*
抄送70.11827 (17)0.9583 (3)0.04646 (12)0.0424 (7)
C9级0.15621 (18)1.1546 (3)0.00999 (13)0.0479 (7)
C10号机组0.2068 (2)1.0674 (3)0.09344 (15)0.0645 (9)
H10A型0.14981.04860.10560.077*
H10B型0.21821.15340.10650.077*
C11号机组0.2631 (3)0.9824 (5)0.13001 (18)0.0954 (14)
H11型0.25250.89620.11530.114*
第12项0.3534 (3)1.0105 (7)0.1188 (3)0.162 (3)
H12A型0.36431.09710.12870.244*
H12B型0.38680.95770.14620.244*
H12C型0.36710.99440.07440.244*
第13页0.2439 (4)0.9881 (8)0.2014 (2)0.167 (3)
H13A型0.18640.96710.20840.251*
H13B型0.27860.92930.22410.251*
H13C型0.25441.07160.21720.251*
第14项0.02954 (18)1.1411 (3)0.07902 (14)0.0508 (8)
H14A型0.01831.08580.07560.061*
第14页0.01471.22100.05950.061*
第15项0.04940 (19)1.1616 (3)0.14927 (14)0.0503 (7)
第16号0.0116 (3)1.2182 (4)0.24988 (18)0.0879 (13)
H16A型0.06351.19800.27140.106*
H16B型0.03181.16640.26870.106*
第17页0.0080 (4)1.3489 (5)0.2607 (2)0.1209 (18)
H17A型0.06051.36840.24090.181*
H17B型0.01121.36480.30630.181*
H17C型0.03471.40050.24200.181*
N1型0.07527 (15)0.8841 (2)0.08053 (12)0.0518 (6)
氮气20.18427 (15)0.9414 (2)0.00589 (11)0.0501 (6)
过氧化氢0.22080.88380.01190.060*
抄送80.21386 (19)1.0593 (3)0.02093 (13)0.0492 (7)
H8型0.27151.07480.00740.059*
N3号机组0.09884 (14)1.0867 (2)0.04362 (11)0.0444 (6)
O1公司0.15797 (13)1.2674 (2)0.00413 (11)0.0635 (6)
氧气0.11634 (16)1.1560 (3)0.17248 (12)0.0920 (9)
臭氧0.01909 (14)1.1890 (2)0.18119 (10)0.0732 (7)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0515 (17)0.0453 (17)0.0406 (15)0.0024 (14)0.0101 (13)0.0044 (12)
指挥与控制0.0557 (18)0.054 (2)0.0560 (19)0.0059 (15)0.0061 (14)0.0081 (14)
C3类0.068 (2)0.049 (2)0.081 (2)0.0111 (17)0.0014 (18)0.0035 (17)
补体第四成份0.066 (2)0.049 (2)0.066 (2)0.0048 (16)0.0110 (17)0.0138 (15)
C5级0.0473 (18)0.067 (2)0.064 (2)0.0020 (16)0.0024 (15)0.0149 (16)
C6级0.0526 (18)0.058 (2)0.0531 (18)0.0125 (15)0.0022 (14)0.0054 (14)
抄送70.0502 (16)0.0414 (17)0.0357 (14)0.0016 (13)0.0013 (12)0.0010 (12)
C9级0.0526 (17)0.0422 (18)0.0489 (16)0.0031 (14)0.0012 (13)0.0044 (13)
C10号机组0.065 (2)0.075 (2)0.0532 (19)0.0010 (18)0.0023 (16)0.0055 (16)
C11号机组0.104 (3)0.123 (4)0.059 (2)0.020 (3)0.009 (2)0.007 (2)
第12项0.090 (4)0.305 (10)0.091 (3)0.043 (5)0.022 (3)0.007 (4)
第13页0.157 (5)0.282 (9)0.063 (3)0.058 (5)0.006 (3)0.046 (4)
第14项0.0510 (17)0.0511 (18)0.0502 (17)0.0098 (14)0.0016 (14)0.0031 (13)
第15项0.0499 (18)0.0472 (18)0.0538 (18)0.0065 (14)0.0047 (15)0.0007 (13)
第16号0.097 (3)0.110 (3)0.057 (2)0.003 (2)0.026 (2)0.010 (2)
第17页0.191 (5)0.101 (4)0.071 (3)0.014 (4)0.018 (3)0.024 (2)
N1型0.0576 (15)0.0453 (15)0.0525 (14)0.0005 (12)0.0111 (12)0.0061 (11)
氮气20.0576 (15)0.0439 (14)0.0488 (14)0.0064 (11)0.0124 (11)0.0031 (11)
抄送80.0517 (17)0.0482 (18)0.0477 (16)0.0010 (14)0.0101 (13)0.0053 (13)
N3号机组0.0521 (14)0.0361 (13)0.0449 (13)0.0010 (11)0.0068 (11)0.0007 (10)
O1公司0.0723 (15)0.0399 (14)0.0782 (15)0.0001 (10)0.0046 (12)0.0065 (11)
氧气0.0664 (16)0.145 (3)0.0649 (16)0.0304 (17)0.0104 (13)0.0237 (15)
臭氧0.0633 (15)0.0986 (19)0.0576 (14)0.0068 (13)0.0157 (11)0.0164 (12)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C6号机组1.380 (4)C11-H11型0.9800
C1-C2类1.391 (4)C12-H12A型0.9600
C1-N1型1.410 (4)C12-H12B型0.9600
C2-C3型1.381 (5)C12-H12C型0.9600
C2-H2型0.9300C13-H13A型0.9600
C3至C41.378 (5)C13-H13B型0.9600
C3至H30.9300C13-H13C型0.9600
C4-C5型1.358 (5)C14-N3型1.453 (3)
C4-H4型0.9300C14-C15号1.504 (4)
C5至C61.385 (4)C14-H14A型0.9700
C5-H5型0.9300C14-H14B型0.9700
C6-H6型0.9300C15-O21.179 (3)
C7-N1型1.263 (3)C15-O3型1.316 (3)
C7-N2型1.364 (3)C16-C17号1.441 (6)
C7-N3号机组1.401 (3)C16-O3型1.460 (4)
C9-O1型1.205 (3)C16-H16A型0.9700
C9-N31.362 (4)C16-H16B型0.9700
C9-C81.514 (4)C17-H17A型0.9600
C10-C11号机组1.485 (5)C17-H17B型0.9600
C10-C8号机组1.507 (4)C17-H17C型0.9600
C10-H10A型0.9700N2-C8气体1.451 (4)
C10-H10B型0.9700N2-H2A气体0.8573
C11-C12号机组1.499 (7)C8-H8型0.9800
C11-C13号机组1.511 (6)
C6-C1-C2型117.8 (3)C11-C13-H13A型109.5
C6-C1-N1型122.4 (3)C11-C13-H13B109.5
C2-C1-N1型119.5 (3)H13A-C13-H13B型109.5
C3-C2-C1120.6 (3)C11-C13-H13C109.5
C3-C2-H2119.7H13A-C13-H13C型109.5
C1-C2-H2119.7H13B-C13-H13C型109.5
C4-C3-C2型120.5 (3)N3-C14-C15型112.5 (2)
C4-C3-H3型119.8N3-C14-H14A型109.1
C2-C3-H3型119.8C15-C14-H14A109.1
C5-C4-C3119.4 (3)N3-C14-H14B109.1
C5-C4-H4120.3C15-C14-H14B109.1
C3-C4-H4型120.3H14A-C14-H14B107.8
C4-C5-C6120.5 (3)氧气-C15-O3124.7 (3)
C4-C5-H5型119.8氧气-C15-C14125.4 (3)
C6-C5-H5型119.8O3-C15-C14型109.9 (3)
C1-C6-C5型121.2 (3)C17-C16-O3型111.9 (3)
C1-C6-H6型119.4C17-C16-H16A型109.2
C5-C6-H6119.4O3-C16-H16A型109.2
N1-C7-N2型133.3 (3)C17-C16-H16B型109.2
N1-C7-N3号机组120.6 (2)O3-C16-H16B型109.2
N2-C7-N3型106.0 (2)H16A-C16-H16B型107.9
O1-C9-N3126.5 (3)C16-C17-H17A型109.5
O1-C9-C8127.5 (3)C16-C17-H17B型109.5
N3-C9-C8105.9 (2)H17A-C17-H17B型109.5
C11-C10-C8型115.3 (3)C16-C17-H17C型109.5
C11-C10-H10A型108.5H17A-C17-H17C型109.5
C8-C10-H10A型108.5H17B-C17-H17C型109.5
C11-C10-H10B型108.5C7-N1-C1型120.2 (2)
C8-C10-H10B型108.5C7-N2-C8型112.1 (2)
H10A-C10-H10B型107.5C7-N2-H2A型122.5
C10-C11-C12号机组112.9 (4)C8-N2-H2A型116.7
C10-C11-C13号机组110.5 (4)N2-C8-C10型113.9 (3)
C12-C11-C13型109.9 (4)N2-C8-C9型102.5 (2)
C10-C11-H11107.8C10-C8-C9109.7 (2)
C12-C11-H11107.8N2-C8-H8型110.2
C13-C11-H11型107.8C10-C8-H8型110.2
C11-C12-H12A109.5C9-C8-H8110.2
C11-C12-H12B型109.5C9-N3-C7112.8 (2)
H12A-C12-H12B型109.5C9-N3-C14124.3 (2)
C11-C12-H12C型109.5C7-N3-C14号机组122.5 (2)
H12A-C12-H12C型109.5C15-O3-C16117.8 (3)
H12B-C12-H12C型109.5
C6-C1-C2-C30.7 (4)C11-C10-C8-N2型68.4 (4)
N1-C1-C2-C3175.0 (3)C11-C10-C8-C9177.5 (3)
C1-C2-C3-C4型0.7 (5)O1-C9-C8-N2177.5 (3)
C2-C3-C4-C5型0.1 (5)N3-C9-C8-N2型5.4 (3)
C3-C4-C5-C6型1.0 (5)O1-C9-C8-C1061.2 (4)
C2-C1-C6-C5型0.2 (4)N3-C9-C8-C10115.9 (3)
N1-C1-C6-C5型174.0 (3)O1-C9-N3-C7174.2 (3)
C4-C5-C6-C1型1.0 (5)C8-C9-N3-C78.6 (3)
C8-C10-C11-C12号机组62.8 (5)O1-C9-N3-C140.6 (5)
C8-C10-C11-C13号机组173.7 (4)C8-C9-N3-C14号机组177.7 (2)
N3-C14-C15-O212.5 (5)N1-C7-N3-C9173.8 (3)
N3-C14-C15-O3型168.6 (3)N2-C7-N3-C98.3 (3)
N2-C7-N1-C1型8.7 (5)N1-C7-N3-C14型0.1 (4)
N3-C7-N1-C1174.1 (2)N2-C7-N3-C14型177.9 (2)
C6-C1-N1-C763.9 (4)C15-C14-N3-C994.3 (3)
C2-C1-N1-C7型122.0 (3)C15-C14-N3-C7型78.7 (3)
N1-C7-N2-C8型178.2 (3)O2-C15-O3-C161.9 (5)
N3-C7-N2-C8型4.3 (3)C14-C15-O3-C16177.1 (3)
C7-N2-C8-C10117.7 (3)C17-C16-O3-C1585.4 (5)
C7-N2-C8-C90.6 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C5-H5···O20.932.473.257 (4)143
N2-H2气体A类···O1公司0.862.313.137 (3)162
对称代码:(i)x个+1/2,1/2,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方C类17H(H)23N个O(运行)
M(M)第页317.38
晶体系统,空间组正交各向异性,P(P)b条c(c)
温度(K)292
,b条,c(c)(Å)16.059 (2), 10.6310 (16), 20.690 (3)
V(V))3532.2 (9)
Z轴8
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.08
晶体尺寸(mm)0.20 × 0.20 × 0.10
数据收集
衍射仪布吕克智能4K CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,2003年)
T型最小值,T型最大值0.984, 0.992
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
26346, 3097, 2154
R(右)整数0.101
(罪θ/λ)最大值1)0.595
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.069, 0.195, 1.06
反射次数3097
参数数量211
约束装置数量1
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.34,0.18

计算机程序:智能(布鲁克,2001),圣普卢斯(布鲁克,2001),SHELXS97标准(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),(斯佩克,2003),谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2001年)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C5-H5···O20.932.473.257 (4)142.6
N2-H2A···O10.862.313.137 (3)161.5
对称代码:(i)x个+1/2,1/2,z(z).
 

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