（IUCr）IUCrJ第11卷第2部分，2024年3月

动态诗歌：捕捉活动中的分子

E.N.贝克

长期以来，研究人员一直试图“观察”蛋白质和其他大分子的运动，以更好地了解其功能。技术的发展，尤其是串行晶体学的进步，正在使这些梦想成为现实，预示着动力学晶体学新时代的到来。

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磁性Janus纳米粒子自组装结构的表征

E.布莱克本

小角度X射线散射揭示了磁性Janus粒子如何在大小磁场中的溶液中配对。

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万古霉素与耐药决定簇结合的晶体结构D类-丙氨酸-D类-丝氨酸

J.H.公园,R.E.雷维略和P.J.Loll先生

万古霉素与耐药相关表位结合的结构D类-阿拉-D类-序列号。对该复合物的高分辨率观察表明，万古霉素对该表位的亲和力降低是由于配体和抗生素之间的微小尺寸不匹配，以及潜在的不利熵效应。

PDB参考:8g82，万古霉素结合D类-阿拉-D类-序号

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关于低温EM数据存档和验证的社区建议

本白皮书介绍了向wwPDB、EMDB和低温EM社区提供的有关单粒子结构和体积的存档和验证的建议。

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结合结构预测、分子替换和直接方法辅助模型完成求解蛋白质结构

Z.Li先生,H.风扇和W.丁

我们提出了一种基于直接方法的双空间迭代策略，用于使用预测模型完成分子替换（MR）的模型。直接方法已被证明是蛋白质晶体学中相位优化的有力工具，而双空间迭代策略特别适用于从一个小亚单位开始求解晶体学蛋白质复合体结构。这种组合方法为简化MR预测模型的预处理步骤和最终模型完成提供了捷径。

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丙二酸和4,4′-联吡啶共晶体中质子在压力下迁移的奇怪情况

E.Patyk-Kaźmierczak,F.伊兹基尔多·鲁伊斯,A.洛巴托,M.Kaźmierczak先生,I.莫兹琴斯卡,A.奥列尼扎克和J.M.雷西奥

在丙二酸和4,4′-双吡啶共晶体中，成功地利用压力诱导单、双质子转移反应。在与类似文献示例进行对比后，Δp之间的扩展相关性K（K）_一共形物的值和启动质子转移反应所需的压力被揭示出来。

CCDC参考:2279875;2279876;2279877;2279878;2279879;2279880;2279881;2279882;2279883;2279884;2279885;2279886;2279887;2279888;2279889;2279890;2279891;2279892;2279893

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基于深度学习的单分子磁体性能预测

Y.高口,D.纳卡内和T.阿基苏

这项工作涉及从剑桥结构数据库中提取salen金属络合物，以进行深入学习，检查允许此类络合物作为单分子磁体的3D结构特征。本研究试图将晶体结构数据库作为大数据与使用人工智能的纳米材料分子设计联系起来。该方法开创了未来类似晶体结构数据的二次使用。

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蛋白质序列晶体学中的数据简化

M.Galchenkova先生,A.托尔斯蒂科娃,B.科洛普罗格,J.斯普伦格,D.奥伯瑟,W.布雷姆,T.A.怀特,A.巴蒂,H.N.查普曼和O.叶凡诺夫

评估了无损和有损压缩的各种方法，并描述了用于串行晶体学数据的合适质量评估指标（与有损数据减少结合使用）。

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电子衍射与晶体倾斜相结合的对分布函数对纳米晶结构的分析

L·郭,吴圣美（S.Wu）,Z.Zhou先生和马云（Y.Ma）

为了提高电子对分布函数（ePDF）分析中电子衍射数据的连续性和信噪比，提出了一种新的方法。

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原子在分子中的持久性：电子密度之外还有空间

梅内德斯·埃雷罗先生和Á. 马丁·彭达斯

第三个N个-波函数平方的维数最大值，即所谓的玻恩最大值，毫无疑问地表明，原子的电子结构在分子中持续存在，无论是在其原始基态还是一些低激发态。电子密度只是这个更丰富景观的低维投影。

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香豆素衍生物的共晶：抗利什曼原虫共晶的有效方法热带利什曼原虫

沙巴兹先生,S.Farooq公司,M.I Choudhary先生和S.优素福

本研究证明了香豆素-3-羧氧酸的非细胞毒性活性候选物（共晶体）的合成，以及针对MIL抗性的各种共形物热带利什曼原虫这些有希望的抗利什曼病研究结果通过强调在固态中操纵超分子结构可以影响生物反应，表明了晶体工程的重要性。

CCDC参考:2156927;2156930;2156931;2156932;2233348

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用于时间分辨串行晶体学的液滴微流体

J.斯塔布斯,T.霍恩西,N.Hanrahan先生,L.B.埃斯特班,R.博尔顿,M.马尔,S.巴苏,J.奥兰斯,D.de Sanctis公司,J.U.垫片,肖·斯图尔特,A.M.奥维尔,I.图斯和J.韦斯特

微流体控制液滴体积和播种可用于精确控制晶体尺寸。液滴微流体技术还可以实现快速、毫秒级的微混合，以提高时间分辨串行晶体学。

PDB参考:溶菌酶控制，8s2u;溶菌酶液滴，8s2v;Pdx1控制，8s2w;Pdx1液滴，8s2x

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快速评估非球面原子形状因子的可转移Hirshfeld原子模型

M.Chodkiewicz先生,L.帕特里基夫,S.Pawlędzio公司和K.Woźniak公司

已经开发了使用Hirshfeld分区计算的原子密度数据库，该数据库允许以与Hirshfeld原子精化类似的精度进行精化，而无需耗时的波函数计算。

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船蛆共生体中两种氧化还原蛋白的结构解析特纳Teredinibacter

B.S.拉贾戈帕尔,N.Yates公司,史密斯先生,A.帕拉迪西,C.泰达-琼斯,W.G.T.威廉斯,S.马库斯,J.P.诺克斯,M.Firdaus-Raih先生,B.亨利赛特,G.J.戴维斯,P.H.沃尔顿,A.帕金和G.R.赫姆斯沃思

从两个大的细胞外氧化还原蛋白中提取的新氧化还原结构域的结构特纳Teredinibacter提出了电子转移蛋白在细胞外碳水化合物化学中潜在的新作用。

PDB参考:TtX122B，来自特纳特雷丁杆菌蛋白质TERTU_2913，8q2a;TtX183B，一个c（c）-类型细胞色素结构域T.特纳蛋白质TERTU_2913，8q1w;Se-Met标记为TtX122A，来自T.特纳蛋白质TERTU_3803，8q28;TtX183A，一个c（c）-型细胞色素结构域T.特纳蛋白质TERTU_2913，8q1v;TtX122A，来自T.特纳蛋白质TERTU_3803，8q29

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发行内容

2024年3月发布

社论

动态诗歌：捕捉活动中的分子

科学评论

磁性Janus纳米粒子自组装结构的表征

研究信件

万古霉素与耐药决定簇结合的晶体结构D类-丙氨酸-D类-丝氨酸

研究论文

关于低温EM数据存档和验证的社区建议

结合结构预测、分子替换和直接方法辅助模型完成求解蛋白质结构

丙二酸和4,4′-联吡啶共晶体中质子在压力下迁移的奇怪情况

基于深度学习的单分子磁体性能预测

蛋白质序列晶体学中的数据简化

电子衍射与晶体倾斜相结合的对分布函数对纳米晶结构的分析

原子在分子中的持久性：电子密度之外还有空间

香豆素衍生物的共晶：抗利什曼原虫共晶的有效方法热带利什曼原虫

用于时间分辨串行晶体学的液滴微流体

快速评估非球面原子形状因子的可转移Hirshfeld原子模型

船蛆共生体中两种氧化还原蛋白的结构解析特纳Teredinibacter

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