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IUCrJ大学
第8卷
|
第6部分
国际标准编号:2052-2525
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2021年11月发布
科学评论
物理学
|
FELS公司
IUCrJ大学
(2021)
8
,
853-854
https://doi.org/10.107/S2052252521010794
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SFX中显示的粉色光束晶体学
T.纳卡内
纳斯
等。
[
IUCrJ大学
(2021),
8
, 905–920
]应用宽带宽光束(粉色光束)在X射线自由电子激光器上进行连续飞秒晶体学。
这种方法将在更短的时间内从更少的晶体获得更好的数据集。
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材料
|
计算
IUCrJ大学
(2021)
8
,
855-856
https://doi.org/10.107/S2052252521011106
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映射完整性
M.Kunz先生
乔恩·马卡尔[
IUCrJ大学
(2021),
8
, 1006–1017
]使用数值模拟来探索高压衍射实验中数据完整性与晶体取向、X射线能量和金刚石顶砧室几何形状的关系。
它们对于不同劳厄类别的完整热图可用于指导高压单晶衍射实验的优化。
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生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
857-859
https://doi.org/10.107/S2052252521011350
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virusMED:你的病毒世界旅行指南
F.库利巴利
当我们应对病毒流行并加速发现新病毒时,筛选大量结构性病毒学数据可能很快成为一项不可能完成的任务。
病毒MED是病毒蛋白结构中金属/药物结合和免疫热点的精心策划的图谱,为结构-功能分析和抗病毒策略的开发提供了导航指南。
阅读文章
研究信件
化学
|
CRYSTENG公司
IUCrJ大学
(2021)
8
,
860-866
https://doi.org/10.107/S2052252521010101
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用低温透射电镜和三维电子衍射揭示卡马西平结晶的早期阶段
E.T.Broadhurst公司
,
H.Xu先生
,
S.帕森斯
和
F.努德尔曼
通过低温TEM对早期卡马西平结晶的时间分辨结晶研究揭示了两种结晶途径,一种是经典结晶途径,另一种是非经典结晶途径。
通过单一结晶的三维电子衍射,还鉴定出四种形式的卡马西平。
CCDC参考
:
2085759
;
2085760
;
2085761
阅读文章
研究论文
CRYO公司
|
电磁阀
IUCrJ大学
(2021)
8
,
867-877年
https://doi.org/10.107/S2052252521008095
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沸腾氮玻璃化样品的高分辨率单粒子冷冻电镜
T.Engstrom公司
,
J.A.克林格
,
K.A.Spoth公司
,
O.B.克拉克
,
D.S.Closs公司
,
R.杰恩
,
B.A.阿普克
和
R.E.索恩
用于单粒子冷冻电子显微镜的样品可以在其沸腾温度下仅使用液态氮进行常规玻璃化,从而简化了样品处理工作流程,并减少了有助于束流诱导运动的样品应力。
阅读文章
生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
878-895
https://doi.org/10.107/S2052252521008125
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用高重复率混注连续晶体学观察酶晶体中的底物扩散和配体结合
S.潘迪
,
G.卡维
,
A.M.卡茨
,
T.N.马勒
,
F.H.M.库亚
,
J.M.马丁·加西亚
,
I.Poudyal公司
,
J.-H.杨
,
M.瓦基利
,
O.叶凡诺夫
,
K.A.齐林斯基
,
S.Bajt公司
,
S.锥
,
K.Doerner公司
,
和弗兰克
,
L.Gelisio公司
,
R.杰尼根
,
H.柯克伍德
,
M.Kloos先生
,
J.科利亚杜
,
V.玛丽亚尼
,
M.D.米勒
,
G.磨机
,
G.纳尔逊
,
小J·L·奥尔莫斯
,
A.萨德里
,
佐藤(T.Sato)
,
A.托尔斯蒂科娃
,
W.Xu先生
,
A.乌尔马兹德
,
J.H.C.斯彭斯
,
P.施瓦德
,
A.巴蒂
,
H.N.查普曼
,
P.弗洛姆
,
A.P.Mancuso先生
,
小G.N.菲利普斯
,
R.Bean公司
,
L.波拉克
和
M.施密特
在具有高X射线重复率的欧洲自由电子激光器上进行了配体与酶结合的单毫秒混合注射实验。
PDB参考
:
BlaC,未混合,7k8l
;
与头孢曲松混合,5
毫秒,7k8e
;
10
毫秒,7k8f
;
50
毫秒,7k8小时
;
与舒巴坦混合,66
毫秒,7k8k
阅读文章
生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
896-904
https://doi.org/10.107/S2052252521008423
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高X射线能量对大分子晶体学益处的实验证据
S.L.S.风暴
,
D.阿克斯福德
和
R.L.欧文
实验证明,较高的X射线能量对大分子晶体学非常有益。
阅读文章
物理学
|
FELS公司
IUCrJ大学
(2021)
8
,
905-920
https://doi.org/10.107/S2052252521008046
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在X射线自由电子激光器上精确测定结构因子的粉束连续飞秒晶体学
K.Nass公司
,
C.杆菌
,
C.西雷利
,
F.德沃科夫斯基
,
Y.Gevorkov(耶沃科夫)
,
D.詹姆斯
,
P.J.M.约翰逊
,
D.凯基利
,
G.克诺普
,
I.马蒂尔
,
D.奥泽罗夫
,
A.托尔斯蒂科娃
,
L.维拉
,
T.韦内特
,
O.叶凡诺夫
,
J.斯坦弗斯
,
S.Reiche公司
和
C·J·米尔恩
在串行飞秒晶体学中,大带宽X射线自由电子激光脉冲显著减少了获得准确结构因子振幅所需的样品和光束时间量。
PDB参考
:
瑞士FEL使用5.99的本地SAD测定了索姆丁的结构
keV,光子能量BW为0.26%,7o44
;
瑞士FEL使用6.02的天然SAD测定了索马丁的结构
keV,光子能量BW为2.15%
pink索引器
有30个
000个索引图像,7o5k
;
瑞士FEL使用6.02的天然SAD测定了索马丁的结构
keV,光能BW为2.15%
XGANDALF公司
,51年7月
;
瑞士FEL使用6.02的天然SAD测定了索马丁的结构
keV,光能BW为2.15%
pink索引器
,5月7日
;
瑞士FEL使用6.02的天然SAD测定了索马丁的结构
keV,光能BW为2.15%
XGANDALF公司
用50
000个索引图像,7o53
阅读文章
生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
921-930
https://doi.org/10.107/S2052252521008666
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MltA晶体结构揭示了裂解转糖苷酶二聚化的分子基础
鲍曼不动杆菌
H.Jang先生
,
H.做
,
C.M.金
,
G.E.金
,
J.H.李
和
H.H.公园
人类病原体的MltA
鲍曼不动杆菌
对其进行了表征,并揭示了其二聚晶体结构,首次证明了MltA的域外介导二聚作用。
基于当前的结构和生化研究,模拟了MltA与细菌外膜上各种功能相关蛋白的作用机制。
PDB参考
:
MltA、7esj
阅读文章
生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
931-942
https://doi.org/10.107/S2052252521009076
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病毒MED:病毒蛋白热点图谱
H.张
,
P.陈
,
H.马
,
M.沃因斯卡
,
D.刘
,
D.R.库珀
,
G.彭
,
Y.彭
,
L.邓
,
W.小调
和
H.郑
virusMED(病毒金属结合位点、表位和药物结合位点)是一个基于7041个实验确定的病毒蛋白结构中热点周围原子相互作用数据库的丰富互联网应用程序。
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CRYO公司
|
电磁阀
IUCrJ大学
(2021)
8
,
943-953
https://doi.org/10.107/S2052252521008538
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非晶辐射敏感样品的多层波传播低温TEM模拟
B.希姆斯
和
格里戈里耶夫
本工作描述了使用多层波传播并通过引入“冻结等离子体”方法对非晶辐射敏感样品进行的低温TEM模拟。
结合粗粒度全原子溶剂模型,该模型准确地模拟了导致辐射损伤、溶剂运动和对比度损失的非弹性散射效应。
阅读文章
生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
954-962
https://doi.org/10.107/S2052252521009386
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通过测定结晶状态下单个亚单位的氧饱和度来阐明巨血红蛋白氧解离中间体的粗略快照
N.努莫托
,
Y.卡瓦诺
,
H.大村
,
S.Baba公司
,
Y.Fukumori(福森)
,
K.三木
和
N.伊藤
400的氧-脱氧中间体的晶体结构
kDa巨血红蛋白揭示了未修饰蛋白质的变构过渡中间体和无限制的氧饱和度,这是过去半个世纪以来血红蛋白变构行为研究中缺失的部分。
PDB参考
:
400的氧-脱氧中间体
69%氧饱和度下的kDa巨血红蛋白,7e96
;
21%氧饱和度,7e98
;
血氧饱和度为58%时,7e97
;
氧饱和度为13%时,7e99
阅读文章
中子
|
同步加速器
IUCrJ大学
(2021)
8
,
963-972
https://doi.org/10.107/S205225252100837X
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在钙矾石矿物变容褐铁矿[Cu(UO)中定位氢位置
2
)
2
(磅
4
)
2
·8小时
2
O] 利用中子粉末衍射和计算模型的组合方法
F.M.麦克弗·琼斯
,
P.苏特克利夫
,
M.C.格雷厄姆
,
C.A.莫里森
和
柯克
中子粉末衍射和
从头算
用随机结构搜索法确定了偏硼酸盐[Cu(UO)]晶体结构中的氢位置
2
)
2
(磅
4
)
2
·8小时
2
O] 是一种常见的autunite矿物,有望用于铀修复。
CCDC参考
:
2102876
阅读文章
生物学
|
医学
IUCrJ大学
(2021)
8
,
973-979
https://doi.org/10.107/S2052252521010113
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室温X射线晶体学显示SARS-CoV-2主蛋白酶的类迈克尔逊复合物
D.W.克奈勒
,
Q.张
,
L.科茨
,
J.M.路易斯
和
A.科瓦列夫斯基
了解SARS-CoV-2主要蛋白酶(M)的催化机制
赞成的意见
)可以帮助指导特定小分子抗病毒药物的药物设计。
A 2.0版
非活性C145A突变体M的光学分辨室温X射线晶体结构
赞成的意见
与八肽Ac-SAVLQSGF-CONH复合物
2
据报道,这类似于迈克利斯情结。
PDB参考
:
SARS-CoV-2主蛋白酶C145A突变体与底物Ac-SAVLQSGF-CONH复合物的室温X射线晶体结构
2
,第7n89页
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物理学
|
FELS公司
IUCrJ大学
(2021)
8
,
980-991
https://doi.org/10.107/S205225252100868X
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单粒子成像实验中衍射图像定向的EMC和CM方法比较
M.Tegze先生
和
G.博特尔
比较了两种定向方法:扩展最大化压缩(EMC)算法和相关最大化(CM)算法。
为了研究这些方法在不同X射线自由电子激光脉冲注量下的效率、可靠性和准确性,使用了生物分子的模拟衍射图样。
阅读文章
CRYO公司
|
电磁阀
IUCrJ大学
(2021)
8
,
992-1005
https://doi.org/10.107/S2052252521008903
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用三维Zernike多项式逼近变形场分析生物大分子的连续非均匀性
D.埃雷罗斯
,
R.R.莱德曼
,
J.克里格
,
A.吉梅内斯·莫雷诺
,
马丁内斯
,
D.米什卡
,
D.斯特雷拉克
,
J.菲利波维奇
,
I.巴哈
,
J.M.卡拉佐
和
C.O.S.桑切斯
提出了一种基于3D Zernike多项式的新工具,用于研究生物大分子的连续非均匀性,通过变形场近似揭示不同状态之间的结构关系。
阅读文章
材料
|
计算
IUCrJ大学
(2021)
8
,
1006-1017
https://doi.org/10.107/S2052252521009532
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单晶高压衍射实验中的最大完整性:2°AP中的相变
D.乔恩
和
A.马卡尔
系统地分析了金刚石压砧室(DAC)孔径、入射辐射波长和DAC样品取向对高压衍射数据完整性的影响。
样本定向对可实现数据完整性的重大影响已通过图形指南的形式确认并量化了所有劳厄类别。
这些指南已被应用于预测样品定向,以进行正交晶样品的结构分析
→
压力下的单斜相变,确保了90%以上的完整性。
CCDC参考
:
2096512
;
2096513
;
2096514
;
2096515
;
2096516
;
2096517
;
2096518
;
2096519
阅读文章
材料
|
计算
IUCrJ大学
(2021)
8
,
1018-1023
https://doi.org/10.107/S2052252521009118
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AA公司
小时
氮化硼晶体,氮化硼纳米管的基本结构
J.-K.李
,
J.-G.金
,
S.Yu(S.余)
,
S.-G.李
,
Y.Kim先生
和
D.J.月亮
第一次,
AA公司
小时
氮化硼(BN)晶体,属于正交空间群(编号31,
下午
2
1
),已报告。
BN纳米管的结构被重新解释为螺旋结构,这是由
AA公司
小时
使用BN晶体。
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2107341
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计算
IUCrJ大学
(2021)
8
,
1024-1034
https://doi.org/10.107/S2052252521010344
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牛心包生物组织胶原糖基化的时间尺度
L.De Caro公司
,
A.特尔齐
,
L.Fusaro公司
,
D.阿尔塔穆拉
,
F.博卡福斯基
,
O.舱房
和
C.贾尼尼
糖尿病和衰老的许多病理副作用与胶原蛋白的非酶糖化直接相关,胶原蛋白是人体内丰富的多用途组织。
我们基于SAXS和WAXS数据描述了一个模型,该模型将糖基化及其结构效应量化为糖水平(葡萄糖和核糖)和时间的函数。
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