（IUCr）IUCrJ第7卷第5部分，2020年9月

材料|计算

IUCrJ大学(2020)7,778-779
https://doi.org/10.107/S2052252520011793

作为结构科学工具的计算建模

C.R.A.卡特洛

这篇社论简要讨论了计算建模作为一种结构科学技术的现状和作用。

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用电子事件表示法对电子进行单独处理

R.丹涅夫

电子事件表示以最高的精度保存了每个电子的空间和时间坐标。通过最大信号提取，可以提高电子冷冻显微镜的性能。

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冥王星的结晶学

C.G.萨尔茨曼和A.罗苏·芬森

梅纳德·凯斯利及其同事[IUCrJ大学(2020).7, 844–851.]用中子衍射研究冥王星最丰富的两种矿物。新的结果将是了解我们这个遥远邻国地质情况的关键，并代表着小分子地质学这一新兴领域的重大进展。

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高分子晶体学衍射数据金标准

H.J.伯恩斯坦,A.Förster先生,A.博米克,A.S.布鲁斯特,S.布罗克豪斯,L.Gelisio公司,D.R.霍尔,F.莱昂纳斯基,V.玛丽亚尼,G.桑托尼,C.冯海恩和G.冬季

大部分与高数据率大分子晶体学有关的研究团体同意更新光源衍射图像的数据和元数据规范，以便于数据集的处理，并根据FAIR原则实现数据存档。这里给出了最终标准。

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完整微血管的敏感成像体内同步辐射

F.王,P.Zhou（周）,李凯（K.Li）,M.Mamtilahun先生,Y.唐,G.杜,B.邓,谢浩（H.Xie）,G.杨和T.肖

本文研制了基于高亮度同步辐射的移动对比度X射线成像（MCXI）。活体啮齿动物实验证明了MCXI方法对微血管的敏感完整成像的实用性体内.

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多铁金属有机化合物[NH的自旋密度研究₂（瑞士_三)₂][铁^三铁^二（HCOO）₆]

L.Cañadillas-德尔加多,奥·法贝洛,J.A.Rodríguez-Velamazán,A.斯图诺,J.-P.赵,X.-H.卜和J.罗德里格斯-卡瓦贾

利用翻转比技术的极化中子衍射测定了多铁化合物[NH的自旋密度图₂（瑞士_三)₂][铁^三铁^二（HCOO）₆]. 所提出的模型为该化合物的多铁性行为的起源提供了另一种解释。

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严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型ADP核糖磷酸酶的晶体结构：从apo形式到配体复合物

K.米查尔斯卡,Y.Kim先生,R.杰德泽扎克,N.I.马尔塞瓦,L.斯托尔斯,M.恩德斯和A.约阿奇米亚克

来自SARS-CoV-2的ADP-核糖磷酸酶结构域（ADRP；也称为宏结构域）的高分辨率晶体结构具有多个配体，说明了蛋白质如何发生构象变化以适应配体，就像观察到其他病毒的同源物一样。

PDB参考:SARS-CoV-2 ADP-核糖磷酸酶，载脂蛋白，6vxs;6文;与ADP核糖的复合物，6w02;与AMP复合，6w6y;带有MES的综合体，6wcf

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硫键对辐射损伤的敏感性可以用S…O相互作用来解释

R.巴塔查里亚,J·达尔,S.Ghosh Dastidar公司,P.查克拉巴蒂和M.S.Weiss先生

用强X射线辐射蛋白质会产生特定的结构和化学变化，如金属离子还原、二硫键还原和脱羧反应。对已知结构中的一组二硫键的分析表明，最易受影响的二硫键具有一个羰基O原子，该原子位于S-S键矢量的延伸方向，形成稳定的S-O相互作用，在辐照后导致二硫键极化并最终还原。

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钾选择性离子通道的结构揭示了调节离子渗透的疏水门

P.S.Langan先生,V.G.Vandavasi（瓦达瓦西）,W.Kopec公司,B.沙利文,P.V.阿冯,K·L·维斯,B.L.德·格罗特和L.科茨

钾选择性离子通道的原子分辨率结构揭示了调节离子渗透的疏水门。

PDB参考:NaK2K，6ufe的开放形式

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重新检查氮和甲烷的晶体结构行为

H.E.梅纳德-凯斯利,J.R.海丝特和H.E.A.品牌

为了更好地理解普鲁顿冰川学，使用中子粉末衍射法测定了固体甲烷和氮的热膨胀。其他结果包括解决了关于α-氮晶体结构的长期争议，以及观察到β-氮织构随温度的变化。

CCDC参考:2007945

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胆碱能突触后膜的蛋白质-脂质结构

N.安文

本机的低温电磁重建鱼雷膜显示胆固醇优先围绕烟碱型乙酰胆碱受体分离，与特定的跨膜位点强烈相互作用，形成桥接微域网络。微结构域可以促进相邻受体之间的合作，从而增强突触后反应。

EMDB参考:ACh受体，EMD-11239

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电子事件表示数据可以实现高效的低温电磁文件存储，并完全保持空间和时间分辨率

H.郭,E.弗兰肯,Y.邓,S.Benlekbir公司,G.辛格拉·莱兹卡诺,B.詹森,L.Yu先生,Z.A.里普斯坦,Y.Z.谭和J.L.鲁宾斯坦

电子事件表示是低温EM的一种新的数据格式，它保留了直接探测器设备相机拍摄的电影的全部时间和空间分辨率。

EMDB参考:无超采样的超分辨率实验中的去铁蛋白，EMD-22346;来自随机亚像素值的超分辨率实验，EMD-22347;基于EER亚像素值的超分辨率实验，EMD-22348;在不进行超采样的情况下，从每像素1.06º数据集，EMD-22349;来自无B样条插值的片段内运动校正实验，EMD-22350;来自使用B样条插值进行的片段内运动校正实验，EMD-22351

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机器学习破译溶液X射线散射测量的RNA双链结构特征

Y.-L.Chen先生和L.波拉克

应用监督机器学习方法将分子动力学模拟与双链核糖核酸（dsRNA）结构的溶液X射线散射相结合，重点提取广角区中隐藏的关键结构信息。

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深度学习可以从低温EM中确定范科尼贫血核心复合物的原子结构

D.P.法雷尔,一、阿尼什琴科,S.沙克尔,A.劳科,洛杉矶帕斯莫尔,D.贝克和F.迪迈奥

本文描述了一种使用中分辨率低温EM数据和深度学习的距离预测来确定蛋白质复合体的原子模型的方法。

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散射数据中子亚微米层析成像

B.希科,D.萨雷纳克,D.G.科里,M.G.Huber先生,J.P.W.麦克林,H.苗,H.温和D.A.Pushin博士

中子散射数据被传递到相位恢复的计算机层析算法中，生成周期性样品的真实空间重建。重建的空间分辨率远小于使用其他形式的中子计算机断层扫描所能达到的分辨率。

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厌氧固定靶系列晶体学

P.拉贝,J.H.比尔,A.布特林,P.阿勒,A.Dirr公司,P.A.朗,D.N.阿克斯福德,S.B.卡尔,T.M.休闲,M.A.McDonough先生,B.戴维,A.易卜拉欣,J.奥兰斯,S.L.S.风暴,A.M.奥维尔,C.J.斯科菲尔德和R.L.欧文

描述了一种有效且易于实现的厌氧室温数据采集方法，并将其应用于含氧酶。

PDB参考:VioC:Fe:SIN:（3S）-OH-Arg，6y12;IPNS:Fe:ACV，6年;碱性硼：铁：2OG，6ypv;紫外：铁：2OG:精氨酸，6y0n;碱性硼：铁：2OG:T-1-meA-T，6y0q

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剥离单分子膜2H-TaS中的电荷密度波和简并模₂

D.张,吴彦祖（Y.Wu）,Y.-H.Su先生,M.-C.Hsu先生,C.奥斯·科伊兰,J.Cho（周杰伦）,M.Choi先生,B.S.Chun先生,Y.Guo先生,C.-R.Chang公司和H.-C.Wu先生

利用温度相关的拉曼散射，首次证明了剥离单层2H-TaS中可以存在电荷密度波₂相变温度远高于体相。

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X射线和中子衍射结果的精确度与分辨率和电子密度模型的关系

W.F.桑胡安·斯克拉茨,M.温斯卡,S.Domagała公司,P.M.多米尼克,S.格拉博夫斯基,D.贾亚蒂拉卡,M.Gutmann先生和K.Woźniak公司

非球面模型（MM、TAAM、HAR）给出的单晶X射线结果比IAM精确得多，有时与中子衍射的结果相同，分辨率较低。因此，非球面方法为改进上个世纪收集的所有现有结构信息开辟了新的途径。

CCDC参考:2007165;2007166;2007167;2007168;2007169;2007170;2007171;2007172;2007173;2007174;2007175;2007176;2007177;2007178;2007179;2007180;2007181;2007182;2007183;2007184;2007185;2007186;2007187;2007188;2007189;2007190;2007191;2007192;2007193;2007194;2007195;2007196;2007197;2007198;2007199;2007200;2007201;2007202;2007203;2007204;2007205;2007206;2007207;2007208;2007209;2007210;2007211;2007212;2007213;2007214;2007215;2007216;2007217;2007218;2007219;2007220;2007221;2007222;2007223;2007224;2007225;2007226;2007227;2007228;2007229;2007230;2007231;2007232;2007233;2007234;2007235;2007236;2007237;2007238;2007239;2007240;2007241;2007242;2007243;2007244;2007245;2007246;2007247;2007248;2007249;2007250;2007251;2007252;2007253;2007254;2007255;2007256;2007257;2007258;2007259;2007260;2007261;2007262;2007263;2007264;2007265;2007266;2007267;2007268;2007269;2007270;2007271;2007272;2007273;2007274;2007275;2007276;2007277;2007278;2007279;2007280;2007281;2007282;2007283;2007284;2007285;2007286;2007287;2007288;2007289;2007290;2007291;2007292;2007293;2007294;2007295;2007296;2007297;2007298;2007299;2007300;2007301;2007302;2007303;2007304;2007305;2007306;2007307;2007308;2007309;2007310;2007311;2007312;2007313;2007314;2007315;2007316;2007317;2007318;2007319;2007320;2007321;2007322;2007323;2007324;2007325;2007326;2007327;2007328;2007329;2007330;2007331;2007332;2007333;2007334;2007335;2007336;2007337;2007338;2007339;2007340;2007341;2007342;2007343;2007344;2007345;2007346;2007347;2007348;2007349;2007350;2007351;2007352;2007353;2007354;2007355;2007356;2007357;2007358;2007359;2007360;2007361;2007362;2007363;2007364;2007365;2007366;2007367;2007368;2007369;2007370;2007371;2007372;2007373;2007374;2007375;2007376;2007377;2007378;2007379;2007380;2007381;2007382;2007383;2007384;2007385;2007386;2007387;2007388;2007389;2007390;2007391;2007392;2007393;2007394;2007395;2007396;2007397;2007398;2007399;2007400;2007401;2007402;2007403;2007404;2007405;2007406;2007407;2007408;2007409;2007410;2007411;2007412;2007413;2007414;2007415;2007416;2007417;2007418;2007419;2007420;2007421;2007422;2007423;2007424;2007425;2007426;2007427;2007428;2007429;2007430;2007431;2007432;2007433;2007434;2007435;2007436;2007437;2007438;2007439;2007440;2007441;2007442;2007443;2007444;2007445;2007446;2007447;2007448;2007449;2007450;2007451;2007452;2007453;2007454;2007455;2007456;2007457;2007458;2007459;2007460;2007461;2007462;2007463;2007464;2007465;2007466;2007467;2007468;2007469;2007470;2007471;2007472;2007473;2007474;2007475;2007476;2007477;2007478;2007479;2007480;2007481;2007482;2007483;2007484;2007485;2007486;2007487;2007488;2007489;2007490;2007491;2007492;2007493;2007494;2007495;2007496;2007497;2007498;2007499;2007500;2007501;2007502;2007503;2007504;2007505;2007506;2007507;2007508;2007509;2007510;2007511;2007512;2007513;2007514;2007515;2007516;2007517;2007518;2007519;2007520;2007521;2007522;2007523;2007524;2007525;2007526;2007527;2007528;2007529;2007530;2007531;2007532;2007533;2007534;2007535;2007536;2007537;2007538;2007539;2007540;2007541;2007542;2007543;2007544;2007545;2007546;2007547;2007548;2007549;2007550;2007551;2007552;2007553;2007554;2007555;2007556;2007557;2007558;2007559;2007560;2007561;2007562;2007563;2007564;2007565;2007566;2007567;2007568;2007569;2007570;2007571;2007572;2007573;2007574;2007575;2007576;2007577;2007578;2007579;2007580;2007581

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对含有组氨酸的磷酸转移蛋白和传感器组氨酸激酶受体结构域的结构洞察表明铜绿假单胞菌

S.-K.陈,H.-H.关,P.-H.Wu先生,L.-T.林,吴先生,H.-Y Chang先生,N.-C.陈,C.-C.林,P.川卡扬,Y.-C.黄,P.-J.林和C.-J.Chen先生

双组分调控系统中含有组氨酸的磷酸转移蛋白（HptB）和混合传感器组氨酸激酶PA1611（PA1611REC）的受体结构域的两个晶体结构铜绿假单胞菌已确定。利用PA1611REC/HptB复合物的模型结构，阐明了HptB与PA1611RE C之间的相互作用和磷酸基团转移。

PDB参考:PA1611REC-毫克²⁺，7c1j;PA1611REC-Ca²⁺，7立方英尺/小时;WT-HptB，7c1i型

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2020年9月发布

社论

作为结构科学工具的计算建模

科学评论

用电子事件表示法对电子进行单独处理

冥王星的结晶学

研究论文

高分子晶体学衍射数据金标准

完整微血管的敏感成像体内同步辐射

多铁金属有机化合物[NH的自旋密度研究₂（瑞士_三)₂][铁^三铁^二（HCOO）₆]

严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2型ADP核糖磷酸酶的晶体结构：从apo形式到配体复合物

硫键对辐射损伤的敏感性可以用S…O相互作用来解释

钾选择性离子通道的结构揭示了调节离子渗透的疏水门

重新检查氮和甲烷的晶体结构行为

胆碱能突触后膜的蛋白质-脂质结构

电子事件表示数据可以实现高效的低温电磁文件存储，并完全保持空间和时间分辨率

机器学习破译溶液X射线散射测量的RNA双链结构特征

深度学习可以从低温EM中确定范科尼贫血核心复合物的原子结构

散射数据中子亚微米层析成像

厌氧固定靶系列晶体学

剥离单分子膜2H-TaS中的电荷密度波和简并模₂

X射线和中子衍射结果的精确度与分辨率和电子密度模型的关系

对含有组氨酸的磷酸转移蛋白和传感器组氨酸激酶受体结构域的结构洞察表明铜绿假单胞菌

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