Crystal structure of ammonium (3,5-di­chloro­phen­oxy)acetate hemihydrate

Smith, G.

doi:10.1107/S2056989015016345

有机化合物

晶体学
通信

国际标准编号：2056-9890

第71卷| 第10部分| 2015年10月| 第o717-o718页

doi:10.1107/S2056989015016345

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晶体结构乙酸（3,5-二氯苯酚氧基）铵半水合物

格雷厄姆·史密斯 ^一 ^*

^一昆士兰理工大学科学与工程学院，澳大利亚昆士兰4001布里斯班GPO Box 2434
^*通信电子邮件：g.smith@qut.edu.au

苏格兰爱丁堡大学G.S.Nichol编辑(2015年7月22日收到； 2015年9月2日接受；在线2015年9月12日)

在标题水合盐的结构中，NH₄⁺·C类₈H（H）₅氯₂O（运行）_三⁻·0.5小时₂O、当阴离子来自（3,5-二氯-苯氧基）乙酸时，铵阳离子与羧酸和醚O原子受体发生广泛的N-H…O氢键，形成平行于（100）的片状结构。溶剂化的水分子位于晶体的双重旋转轴上，与片内O-H…O有关_羧酸盐氢键相互作用。在阴离子中，氧乙酸侧链假定反平面符合定义的C-O-C-C扭转角=−171.33（15）°。

关键词：晶体结构;苯氧乙酸类除草剂;色胺盐;（3,5-二氯-苯氧基）乙酸;水合盐;氢键.

CCDC参考：1421868

1.相关文献

有关苯氧乙酸除草剂的背景信息，请参见：Zumdahl（2010）). 有关色氨酸盐和与（3,5-二氯苯酚氧基）乙酸的共晶加合物的结构示例，请参见：Smith&Lynch（2015）); 林奇等。(2003 ). 其他苯氧乙酸铵盐的结构见：Liu等。(2009 ); 史密斯（2014 ).

2.实验

2.1. 水晶数据

全日空航空公司₄⁺·C类₈H（H）₅氯₂O（运行）_三⁻·0.5小时₂O（运行）
M（M）_第页= 247.07
单诊所，C类2/c（c）
一= 39.818 (3) Å
b= 4.3440 (4) Å
c（c）= 12.7211 (8) Å
β= 98.098 (5)°
V（V）= 2178.4 (3) Å^三
Z轴= 8
钼K（K）α辐射
μ=0.58毫米⁻¹
T型=200 K
0.40×0.12×0.05毫米

2.2. 数据收集

牛津衍射Gemini-S CCD探测器衍射仪
吸收校正：多扫描(CrysAlis专业; 安捷伦，2013 )T型_最小值= 0.948,T型_最大值= 0.980
6680次测量反射
2146个独立反射
1832次反射我> 2σ(我)
R（右）_整数= 0.026

2.3. 精炼

R（右）[F类²> 2σ(F类²)] = 0.034
加权平均值(F类²) = 0.084
S公司= 1.08
2146次反射
147个参数
5个约束
用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ_最大值=0.21埃⁻³
Δρ_最小值=-0.28埃⁻³

表1
氢键几何形状（λ，°）

D类-H月A类	D类-H（H）	H月A类	D类⋯A类	D类-H月A类
O1公司W公司-上半年W公司2014年1月	0.85 (2)	1.99 (2)	2.822 (2)	166 (2)
N1-H11和O11	0.89 (2)	2.50 (2)	3.137 (2)	129 (2)
N1-H11和O13	0.89 (2)	1.99 (2)	2.811 (2)	153 (2)
N1-H12和O13^我	0.88 (2)	2.00 (2)	2.862 (2)	164 (2)
第1页至第13页……第14页^ii（ii）	0.85 (2)	2.03 (2)	2.840 (2)	161 (2)
N1-H14乙醚^三	0.90 (2)	2.03 (2)	2.894 (2)	161 (2)
对称代码：（i）-x+1, -年+1, -z（z）+1; （ii） $[x，-y+1，z-{\script{1\over 2}}]$ ; （iii）x,年+1,z（z）.

数据收集：CrysAlis专业（安捷伦，2013); 细胞精细化： CrysAlis专业; 数据缩减：CrysAlis专业; 用于求解结构的程序：SIR92型（阿尔托马雷等。, 1993 ); 用于优化结构的程序：SHELXL97型（谢尔德里克，2008年 )在WinGX公司（Farrugia，2012年 ); 分子图形：铂（斯佩克，2009年 ); 用于准备出版材料的软件：铂.

支持信息

CCDC参考：1421868

晶体结构：包含全局数据块，I.DOI：10.1107/S2056989015016345/nk2232sup1.cif

结构因素：包含数据块I。DOI：10.1107/S2056989015016345/nk2232支持2.hkl

支持信息文件。内政部：10.1107/S2056989015016345/nk2232发行3.cml

checkCIF报告

注释顶部

苯氧基酸（3,5-二氯苯氧基）乙酸（3,5-D）是除草活性（2,4-二氯苯氧化）乙酸（2,4-D）的异构体（Zumdahl，2010）。然而，与2,4-D不同，3,5-D的晶体学文献非常稀少，仅包含剑桥结构数据库中的两个条目，即与4,4'-联吡啶（Lynch等。（Smith&Lynch，2015）。3,5-D，NH的铵盐₄⁺C类₈H（H）₅氯₂O（运行）_三·0.5（高₂O），并在此报告其结构。

在标题盐（图1）中，铵阳离子参与了与羧基和醚O原子受体的广泛N-H··O氢键（表1），给出了平行于（100）的二维片状结构。（图2）。这些相互作用中有一个中心对称的R（右）⁴₄（8）图案与R（右）⁴₄（12）和R（右）²₁（5）基序，最后一个三中心不对称，涉及羧基和醚O-原子受体。溶剂化水分子（O1W公司)位于晶体的双重旋转轴上，与片内有关O（运行）—H（H）···O（运行）_羧基氢键相互作用。在这方面，其结构类似于同分异构体2,4-D（Liu等。（4-氯-2-甲基苯氧基）乙酸（除草剂MCPA）（Smith，2014）（均为半水化合物）。

3,5-DCPA阴离子本质上是平面的，其扭转角C2-C1-O11-C12、C1-O11-C12-C13和O11-C13-O14为-175.05（16）、-171.33（15）和-172.65（15）°(反平面)，其中定义角度是第二个值（大约O11-C12）。虽然母体酸（3,5-D）的结构未知，但标题盐的值与色氨酸盐[-165.5（3）°]（Smith&Lynch，2015）和2,4-D[171.61（8）°]铵盐（Liu等。和MCPA【-173.34（14）°】（史密斯，2014）。然而，它与3,5-D与4,4'-联吡啶的2:1加合物（Lynch等。, 2003) [71.6 (3)°] (向斜).

相关文献顶部

有关苯氧乙酸类除草剂的背景信息，请参见：Zumdahl（2010）。有关色氨酸盐和与（3,5-二氯苯氧基）乙酸的共晶加合物的结构示例，请参见：Smith&Lynch（2015）；林奇等。(2003). 其他苯氧乙酸铵盐的结构见：刘等。(2009); 史密斯（2014）。

实验顶部

通过添加1合成标题化合物M（M）氨水溶液滴入含有100 mg（3,5-二氯苯氧基）乙酸的50%乙醇/水中的10 ml溶液中。室温下蒸发溶液得到无色的标题盐晶体板，从中切下样品进行X射线分析。

计算详细信息顶部

数据收集：CrysAlis专业（安捷伦，2013）；细胞精细化： CrysAlis专业（安捷伦，2013）；数据缩减：CrysAlis专业（安捷伦，2013）；用于求解结构的程序：92新加坡元（阿尔托马雷等。, 1993); 用于优化结构的程序：SHELXL97型（谢尔德里克，2008）WinGX公司（Farrugia，2012）；分子图形：铂（斯佩克，2009）；用于准备出版材料的软件：铂（斯佩克，2009）。

数字顶部

	图1。标题为半水盐的分子结构和原子编号方案，非H原子显示为40%概率椭球。水分子位于双旋转轴上，谱间氢键显示为虚线。
	图2。沿b轴，分子内氢键显示为虚线。对称代码见表1。

乙酸铵（3,5-二氯苯氧基）半水合物顶部

水晶数据顶部

全日空航空公司₄⁺·C类₈H（H）₅氯₂O（运行）_三⁻·0.5小时₂O（运行）	F类(000) = 1016
M（M）_第页= 247.07	D类_x=1.507毫克米⁻^三
单诊所，C类2/c（c）	钼K（K）α辐射，λ= 0.71073 Å
大厅符号：-C 2yc	2066次反射的细胞参数
一= 39.818 (3) Å	θ= 4.1–28.7°
b= 4.3440 (4) Å	µ=0.58毫米⁻¹
c（c）= 12.7211 (8) Å	T型=200 K
β= 98.098 (5)°	无色棱镜
V（V）= 2178.4 (3) Å^三	0.40×0.12×0.05毫米
Z轴= 8

数据收集顶部

牛津衍射Gemini-S CCD探测器衍射仪	2146个独立反射
辐射源：增强（Mo）X射线源	1832次反射我> 2σ(我)
石墨单色仪	R（右）_整数= 0.026
探测器分辨率：16.077像素mm^-1	θ_最大值= 26.0°,θ_最小值= 3.1°
ω扫描	小时=−48→39
吸收校正：多扫描 (CrysAlis专业; 安捷伦，2013）	k=−三→5
T型_最小值= 0.948,T型_最大值= 0.980	我=−15→15
6680次测量反射

精炼顶部

优化于F类²	主原子位置定位：结构-变量直接方法
最小二乘矩阵：完整	二次原子位置：差分傅里叶映射
R（右）[F类²> 2σ(F类²)] = 0.034	氢站点位置：从邻近站点推断
加权平均值(F类²) = 0.084	用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.08	w个= 1/[σ²(F类_o个²) + (0.034P（P）)²+ 1.220P（P）] 哪里P（P）= (F类_o个²+ 2F类_c（c）²)/3
2146次反射	(Δ/σ)_最大值= 0.002
147个参数	Δρ_最大值=0.21埃⁻^三
5个约束	Δρ_最小值=−0.28埃⁻^三

水晶数据顶部

全日空航空公司₄⁺·C类₈H（H）₅氯₂O（运行）_三⁻·0.5小时₂O（运行）	V（V）= 2178.4 (3) Å^三
M（M）_第页= 247.07	Z轴= 8
单诊所，C类2/c（c）	钼K（K）α辐射
一= 39.818 (3) Å	µ=0.58毫米⁻¹
b= 4.3440 (4) Å	T型=200 K
c（c）= 12.7211 (8) Å	0.40×0.12×0.05毫米
β= 98.098 (5)°

数据收集顶部

牛津衍射Gemini-S CCD探测器衍射仪	2146个独立反射
吸收校正：多扫描 (CrysAlis专业; 安捷伦，2013）	1832次反射我> 2σ(我)
T型_最小值= 0.948,T型_最大值= 0.980	R（右）_整数= 0.026
6680次测量反射

精炼顶部

R（右）[F类²> 2σ(F类²)] = 0.034	5个约束
加权平均值(F类²) = 0.084	用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.08	Δρ_最大值=0.21埃⁻^三
2146次反射	Δρ_最小值=−0.28埃⁻^三
147个参数

特殊细节顶部

几何图形粘合距离、角度等.已使用四舍五入的分数坐标进行计算。所有su都是根据（完全）方差-方差矩阵的方差估计的。在估计距离、角度和扭转角时考虑了单元e.s.d

精炼.改进F类²针对所有反射。加权R（右）-因子加权平均值和贴合度S公司基于F类²，常规R（右）-因素R（右）基于F类，使用F类负值设置为零F类²。的阈值表达式F类²>σ(F类²)仅用于计算R（右）-因子（gt）等.与选择反射进行细化无关。R（右）-因素基于F类²在统计上大约是基于F类、和R（右）-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数²) 顶部

	x	年	z（z）	U型_{国际标准化组织}*/U型_等式
氯离子	0.66552 (1)	1.11332 (13)	0.31644 (4)	0.0401 (2)
第5类	0.72836 (1)	0.45912 (16)	0.64617 (5)	0.0517 (2)
O11号机组	0.59904 (3)	0.5049 (3)	0.55326 (10)	0.0340 (4)
第13页	0.53963 (3)	0.2408 (3)	0.56560 (10)	0.0325 (4)
O14号机组	0.55624 (4)	0.0775 (3)	0.73120 (11)	0.0384 (5)
C1类	0.63101 (4)	0.5896 (4)	0.53513 (14)	0.0268 (5)
指挥与控制	0.63218 (5)	0.7850 (4)	0.44879 (14)	0.0282 (6)
C3类	0.66354 (5)	0.8742 (4)	0.42535 (14)	0.0288 (6)
补体第四成份	0.69369 (5)	0.7798 (5)	0.48405 (15)	0.0338 (6)
C5级	0.69140 (5)	0.5888 (5)	0.56904 (15)	0.0322 (6)
C6级	0.66063 (4)	0.4896 (5)	0.59619 (14)	0.0280 (6)
第12项	0.59684 (5)	0.3252 (5)	0.64620 (14)	0.0314 (6)
第13页	0.56109 (4)	0.2087 (4)	0.64708 (14)	0.0274 (6)
第1周	0.50000	−0.3034 (5)	0.75000	0.0456 (8)
N1型	0.53131 (4)	0.7283 (5)	0.41888 (14)	0.0332 (6)
氢气	0.61190	0.85480	0.40720	0.0340*
H4型	0.71500	0.84390	0.46650	0.0410*
H6型	0.65990	0.35670	0.65510	0.0340*
H121型	0.60370	0.45230	0.71020	0.0380*
2012年上半年	0.61260	0.14830	0.64820	0.0380*
高沸点	0.5153 (5)	−0.185 (5)	0.7335 (17)	0.0400*
第11页	0.5403 (5)	0.568 (4)	0.4560 (15)	0.0320*
H12型	0.5089 (4)	0.732 (5)	0.4100 (15)	0.0320*
H13型	0.5406 (5)	0.744 (5)	0.3632 (13)	0.0320*
H14型	0.5370 (5)	0.904 (4)	0.4539 (15)	0.0320*

原子位移参数（²) 顶部

	U型¹¹	U型²²	U型³³	U型¹²	U型¹³	U型²³
氯离子	0.0507 (3)	0.0386 (3)	0.0329 (3)	−0.0105 (2)	0.0122 (2)	0.0034 (2)
第5类	0.0240 (3)	0.0735 (5)	0.0549 (4)	−0.0024 (3)	−0.0035 (2)	0.0113 (3)
O11号机组	0.0217 (7)	0.0486 (9)	0.0323 (7)	−0.0008 (6)	0.0055 (5)	0.0128 (6)
O13号机组	0.0252 (7)	0.0387 (8)	0.0330 (7)	−0.0004 (6)	0.0020 (6)	0.0037 (6)
O14号机组	0.0370 (8)	0.0504 (9)	0.0298 (7)	−0.0067 (7)	0.0112 (6)	0.0059 (7)
C1类	0.0240 (9)	0.0309 (10)	0.0264 (9)	−0.0031 (8)	0.0066 (7)	−0.0046 (8)
指挥与控制	0.0278 (10)	0.0319 (11)	0.0250 (9)	0.0002 (8)	0.0040 (7)	−0.0012 (8)
C3类	0.0361 (11)	0.0264 (10)	0.0253 (9)	−0.0054 (8)	0.0096 (8)	−0.0051 (8)
补体第四成份	0.0283 (10)	0.0386 (12)	0.0361 (11)	−0.0098 (9)	0.0098 (8)	−0.0058 (9)
C5级	0.0239 (10)	0.0391 (12)	0.0326 (11)	−0.0020 (9)	0.0002 (8)	−0.0054 (9)
C6级	0.0257 (10)	0.0334 (11)	0.0250 (9)	−0.0020 (8)	0.0035 (7)	−0.0001 (8)
第12项	0.0280 (10)	0.0420 (12)	0.0239 (9)	−0.0028 (9)	0.0024 (7)	0.0062 (8)
第13页	0.0265 (10)	0.0294 (10)	0.0277 (10)	0.0032 (8)	0.0088 (8)	−0.0016 (8)
第1周	0.0348 (12)	0.0361 (13)	0.0660 (15)	0	0.0073 (11)	0
N1型	0.0282 (9)	0.0392 (11)	0.0325 (10)	0.0027 (8)	0.0050 (7)	0.0076 (8)

几何参数（λ，º）顶部

氯化物-C3	1.7423 (18)	C1-C6号机组	1.387 (2)
Cl5-C5类	1.743 (2)	C1-C2类	1.394 (2)
O11-C1号机组	1.375 (2)	C2-C3型	1.380 (3)
O11-C12号机组	1.430 (2)	C3-C4型	1.384 (3)
O13-C13号机组	1.255 (2)	C4-C5型	1.376 (3)
O14-C13型	1.251 (2)	C5至C6	1.388 (3)
O1W-H1W型^我	0.85 (2)	C12-C13型	1.512 (3)
O1W-H1W型	0.85 (2)	C2-H2型	0.9500
N1-H13型	0.847 (18)	C4-H4型	0.9500
N1-H12型	0.884 (16)	C6-H6型	0.9500
N1-H11型	0.888 (18)	第122页	0.9900
N1-H14型	0.897 (18)	C12-H121号	0.9900

C1-O11-C12	116.79 (14)	C4至C5至C6	122.78 (18)
H1W-O1W-H1W型^我	105 (2)	C1-C6-C5型	118.31 (17)
H12-N1-H13型	116.4 (18)	O11-C12-C13型	110.87 (15)
H12-N1-H14型	103.2 (19)	O13-C13-C12型	119.27 (15)
H11-N1-H12小时	114.0 (19)	O13-C13-O14型	126.01 (16)
H11-N1-H13型	108.5 (19)	O14-C13-C12型	114.68 (16)
H13-N1-H14型	103.7 (19)	C3-C2-H2	121
H11-N1-H14型	110.4 (17)	C1-C2-H2	121
C2-C1-C6型	120.77 (16)	C5-C4-H4	121
O11-C1-C6型	123.80 (16)	C3-C4-H4型	122
O11-C1-C2型	115.43 (15)	C1-C6-H6型	121
C1-C2-C3	118.23 (17)	C5-C6-H6	121
氯化物-C3-C2	118.89 (14)	O11-C12-H121	109
氯化物-C3-C4	118.22 (15)	O11-C12-H122型	109
C2-C3-C4型	122.89 (17)	C13-C12-H121型	109
C3-C4-C5型	117.02 (18)	C13-C12-H122	110
氯-5-C5-C4	119.54 (16)	H121-C12-H122型	108
氯5-C5-C6	117.68 (15)

C12-O11-C1-C2	−175.05 (16)	氯-C3-C4-C5	−179.42 (15)
C12-O11-C1-C6	5.6 (3)	C2-C3-C4-C5型	0.0 (3)
C1-O11-C12-C13	−171.33 (15)	C3-C4-C5-Cl5型	179.67 (15)
O11-C1-C2-C3	−178.93 (15)	C3-C4-C5-C6型	0.5 (3)
C6-C1-C2-C3型	0.5 (3)	氯5-C5-C6-C1	−179.64 (15)
O11-C1-C6-C5	179.27 (17)	C4-C5-C6-C1型	−0.4 (3)
C2-C1-C6-C5型	−0.1 (3)	O11-C12-C13-O13	9.5 (2)
C1-C2-C3-Cl3型	178.97 (13)	O11-C12-C13-O14型	−172.65 (15)
C1-C2-C3-C4型	−0.4 (3)

对称代码：（i）−x+1,年,−z（z）+3/2.

氢键几何形状（λ，º）顶部

D类-H（H）···A类	D类-H（H）	H（H）···A类	D类···A类	D类-H（H）···A类
O1公司W公司-上半年W公司···O14号机组	0.85 (2)	1.99 (2)	2.822 (2)	166 (2)
N1-H11··O11	0.89 (2)	2.50 (2)	3.137 (2)	129 (2)
N1-H11··O13	0.89 (2)	1.99 (2)	2.811 (2)	153 (2)
N1-H12··O13^ii（ii）	0.88 (2)	2.00 (2)	2.862 (2)	164 (2)
N1-H13··O14^三	0.85 (2)	2.03 (2)	2.840 (2)	161 (2)
N1-H14··O13^iv（四）	0.90 (2)	2.03 (2)	2.894 (2)	161 (2)

对称代码：（ii）−x+1,−年+1,−z（z）+1; （iii）x,−年+1,z（z）−1/2; （iv）x,年+1,z（z）.

氢键几何形状（λ，º）顶部

D类-H（H）···A类	D类-H（H）	H（H）···A类	D类···A类	D类-H（H）···A类
O1W-H1W···O14	0.85 (2)	1.99 (2)	2.822 (2)	166 (2)
N1-H11··O11	0.888 (18)	2.50 (2)	3.137 (2)	128.9 (15)
N1-H11··O13	0.888 (18)	1.994 (18)	2.811 (2)	152.5 (18)
N1-H12··O13^我	0.884 (16)	2.003 (16)	2.862 (2)	163.7 (17)
N1-H13··O14^ii（ii）	0.847 (18)	2.026 (18)	2.840 (2)	161 (2)
N1-H14··O13^三	0.897 (18)	2.032 (18)	2.894 (2)	160.9 (18)

对称代码：（i）−x+1,−年+1,−z（z）+1; （ii）x,−年+1,z（z）−1/2; （iii）x,年+1,z（z）.

致谢

GS感谢昆士兰理工大学科学与工程学院和大学图书馆的支持。

工具书类

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 Farrugia，L.J.（2012）。J.应用。克里斯特。 45, 849–854. 科学网交叉参考中国科学院 IUCr日志谷歌学者
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