研究交流\(第5em段)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

晶体结构双(2-甲基-1H(H)-咪唑-3-碘)四氯钴酸盐(II)

交叉标记_颜色_正方形_no_text.svg

塞内加尔达喀尔Cheikh Anta Diop大学Chimie Minérale et Analytique实验室、Chimie Départitement de Chimie科学与技术学院b条加拿大魁北克省蒙特雷亚尔市埃杜阿尔-蒙特佩蒂大道2900号蒙特雷亚大学奇米分校H3C 3J7
*通信电子邮件:mouhamadoubdiop@gmail.com

奥地利维也纳理工大学M.Weil编辑(2015年7月17日收到; 2015年7月27日接受; 在线2015年8月22日)

这个非对称单元标题化合物,(C4H(H)7N个2)2[氯化钴4]由两个2-甲基咪唑阳离子和一个四面体[CoCl4]2−阴离子。阴离子和阳离子通过N-H…Cl氢键相互作用,定义沿[100]堆积方向的层。除此之外范德瓦尔斯部队,这些层之间微弱的C-H…Cl相互作用稳定了晶体堆积。

1.化学背景

2-甲基咪唑作为配体的行为研究产生了标题化合物(C4H(H)7N个2)2[氯化钴4](图1[链接]),属于基于阴离子金属卤化物的盐。这一有机-无机杂化化合物家族因其结构、热学、光谱和磁学性质而受到深入研究(Issaoui等。, 2015【Issaoui,F.,Baklouti,Y.,Dharhi,E.,Zouari,F.&Valente,M.A.(2015),《联邦公报》,11月28日,doi:10.1007/s10948-015-3057-Y.】). Zhang报道了相关的双(咪唑)四氯钴(II)盐的结构等。(2005【张浩、方磊、袁荣(2005).《晶体学报》E61,m677-m678.】)(100 K数据)和Adams等。(2008年【Adams,C.J.,Kurawa,M.A.,Lusi,M.&Orpen,A.G.(2008),《CrystEngComm》,第10期,1790-1795页。】)(298 K数据)。

【方案一】
[图1]
图1
标题化合物结构中的分子成分,在50%概率水平上绘制位移椭球。N-H…Cl型氢键绘制为黑色虚线。

2.结构注释

Co-Cl距离[2.2506(8)-2.2907(84]2−在剑桥结构数据库(CSD,5.36版,三次更新;Groom&Allen,2014)中搜索后检索到的一组314个结构中的阴离子【Groom,C.R.&Allen,F.H.(2014),Angew.Chem.Int.Ed.53,662-671.】). 标题结构中观察到Cl4原子的最长Co-Cl距离,Cl4是两个氢键的受体原子(Mghandef&Boughzala,2015【Mghandef,M.&Boughzala,H.(2015),《结晶学报》E71,555-557。】). Cl-Co-Cl角的范围[106.55(3)-111.89(3)°]表明理想的四面体几何形状有轻微变形。阳离子的咪唑啉环是平面的,最大偏差为±0.007(2)Au,并且几乎彼此平行,它们之间的二面角为0.9(2)°。对于阳离子,涉及携带甲基的C原子(分别为C2-N1/C2-N2和C6-N3/C6-N4)的N-C距离实际上是相同的(表1[链接]). CSD中对2-甲基咪唑阳离子的搜索从53个不同结构中返回了66个条目。其中74%的人,这两个距离相差不超过0.01度。

表1
选定的键长(λ)

编号3-C6 1.336 (4) 二氧化碳-Cl1 2.2799 (9)
N4-C6号 1.336(4) Co1-Cl2 2.2803 (9)
N1-C2型 1.332 (5) 二氧化碳-Cl3 2.2506 (8)
N2-C2气体 1.330 (5) 二氧化碳-Cl4 2.2907 (8)

3.超分子特征

[CoCl4]2−阴离子是相连的通过N-H­Cl氢键与四个阳离子相连,每个阳离子与两个阴离子相连(表2[链接]). 这些相互作用定义了平行于(100)的层和交替的[CoCl4]2−阴离子和阳离子(图2[链接]). 在这些层中,2-甲基咪唑阳离子参与ππ叠加相互作用,质心到质心的距离为3.615(2)Ω,这些环的平均平面之间的距离为3.340(3)Ω。除此之外范德瓦尔斯部队,层内和层间弱的C-H…Cl相互作用巩固了晶体堆积。层的堆叠方向是沿着[100]。

表2
氢键几何形状(λ,°)

D类-小时A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-小时A类
N1-H1和Cl4 0.76 (5) 2.46 (5) 3.220 (3) 177 (5)
N2-H2和Cl4 0.77 (5) 2.54 (5) 3.282 (3) 163 (4)
N3-H3第二氯 0.79 (4) 2.39 (4) 3.166 (3) 165 (4)
N4-H4和Cl2 0.78 (4) 2.42(5) 3.198(3) 175 (4)
C4-H4型A类氯乙烷 0.94 (4) 2.73 (4) 3.428 (4) 132 (3)
C3-H3型A类氯乙烷 0.93 (5) 2.70(5) 3.535 (4) 151 (4)
C8-H8氯 0.96 (5) 2.65 (5) 3.575 (4) 160 (3)
C7-H7氯v(v) 0.94 (4) 2.69 (4) 3.617 (4) 168 (3)
对称代码:(i)x个,-1,z; (ii)[x,-y+1,z-{\script{1\over 2}}]; (iii)[x,-y,z-{\script{1\over 2}}]; (iv)[x,-y+2,z-{\script{1\over 2}}]; (v)x个,+1中,z.
[图2]
图2
标题结构的部分包装图大致沿[010]查看,显示两层。N-H…Cl型氢键绘制为黑色虚线。

4.合成和结晶

所有起始材料都是在未经进一步纯化的情况下使用的。甲基-2-咪唑和甲基氯化铵在水中与氯化钴混合2·6小时2O,比例为1:2:1。在室温下缓慢蒸发溶剂后,获得了适用于单晶X射线衍射研究的蓝色晶体。

5.精炼

晶体数据、数据采集和结构精炼表3总结了详细信息[链接]所有H原子均根据不同的傅里叶变换图进行定位,并进行了完全细化,但2-甲基咪唑阳离子甲基的一部分除外,该部分位于计算位置[C-H=0.98º和U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(C) ]。

表3
实验细节

水晶数据
化学配方 (C)4H(H)7N个2)2[氯化钴4]
M(M)第页 366.96
晶体系统,空间组 单诊所,C类2/c(c)
温度(K) 100
,b条,c(c)(Å) 26.847(3)、7.9029(8)、15.0938(14)
β(°) 111.184 (6)
) 2986.0 (5)
Z轴 8
辐射类型 K(K)α,λ= 1.34139 Å
μ(毫米−1) 10.45
晶体尺寸(mm) 0.23 × 0.12 × 0.06
 
数据收集
衍射仪 Bruker Venture Metaljet公司
吸收校正 多扫描(SADABS公司; 克劳斯等。, 2015【Krause,L.、Herbst-Irmer,R.、Sheldrick,G.M.和Stalke,D.(2015),《应用结晶杂志》第48期,第3-10页。】)
T型最小值,T型最大值 0.392, 0.752
测量、独立和观察的数量[>2个σ()]反射 27212, 3435, 3037
R(右)整数 0.063
(罪θ/λ)最大值−1) 0.652
 
精炼
R(右)[F类2>2个σ(F类2)],水风险(F类2),S公司 0.042, 0.102, 1.10
反射次数 3435
参数数量 188
氢原子处理 用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值,Δρ最小值(eó)−3) 0.61, −0.54
计算机程序:APEX2型圣保罗(布鲁克,2014年[Bruker(2014),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]),SHELXT公司(Sheldrick,2015年【谢尔德里克·G·M(Sheldrick,G.M.)(2015a),《结晶学报》A71,3-8。】),SHELXL2014标准(Sheldrick,2015年b条[Sheldrick,G.M.(2015b),《结晶学报》,C71,3-8。]),有机发光二极管2(多洛曼诺夫等。, 2009[Dolomanov,O.V.,Bourhis,L.J.,Gildea,R.J.,Howard,J.A.K.和Puschmann,H.(2009),《应用晶体》杂志,第42333-341页。]),水银(麦克雷等。, 2008【Macrae,C.F.,Bruno,I.J.,Chisholm,J.A.,Edgington,P.R.,McCabe,P.,Pidcock,E.,Rodriguez-Monge,L.,Taylor,R.,van de Streek,J.&Wood,P.A.(2008),J.Appl.Cryst.41,466-470.】)和公共CIF(Westrip,2010年【Westrip,S.P.(2010),《应用结晶杂志》,第43期,第920-925页。】).

支持信息


计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2014);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2014);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2014);用于求解结构的程序:SHELXT公司(Sheldrick,2015年); 用于优化结构的程序:SHELXL2014标准(Sheldrick,2015年b条); 分子图形:有机发光二极管2(多洛曼诺夫等。2009年)和水银(麦克雷等。, 2008); 用于准备出版材料的软件:有机发光二极管2(多洛曼诺夫等。2009年)和公共CIF(Westrip,2010)。

双(2-甲基-1H(H)-咪唑-3-碘)四氯钴(II)顶部
水晶数据 顶部
(C)4H(H)7N个2)2[氯化钴4]F类(000) = 1480
M(M)第页= 366.96D类x个=1.633毫克
单诊所,C类2/c(c)K(K)α辐射,λ= 1.34139 Å
= 26.847 (3) Å9758次反射的细胞参数
b条= 7.9029 (8) Åθ= 5.1–61.0°
c(c)= 15.0938 (14) ŵ=10.45毫米1
β= 111.184 (6)°T型=100 K
= 2986.0 (5) Å块,透明浅蓝色
Z轴=80.23×0.12×0.06毫米
数据收集 顶部
Bruker Venture Metaljet公司
衍射仪
3435个独立反射
辐射源:金属射流、镓液体金属射流源3037次反射>2个σ()
Helios MX镜面光学单色仪R(右)整数= 0.063
探测器分辨率:10.24像素mm-1个θ最大值= 60.9°,θ最小值= 3.1°
ωφ扫描小时=3434
吸收校正:多扫描
(SADABS;克劳斯等。, 2015)
k个=910
T型最小值= 0.392,T型最大值= 0.752=1919
27212次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:混合
R(右)[F类2>2个σ(F类2)] = 0.042用独立和约束精化的混合物处理H原子
水风险(F类2)=0.102 = 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0316P(P))2+ 16.8591P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.10(Δ/σ)最大值= 0.001
3435次反射Δρ最大值=0.61埃
188个参数Δρ最小值=0.54埃
0个约束
特殊细节 顶部

实验从安装在环形光纤上的单晶样品中收集I的X射线晶体学数据。使用配备Photon 100 CMOS探测器、Helios MX光学元件和Kappa测角仪的Bruker Venture衍射仪收集数据。晶体到探测器的距离为4.0 cm,数据采集时间为1024x个1024像素模式。

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式
N3号机组0.55652 (11)0.8138 (4)0.22412 (19)0.0239 (6)
4号机组0.55734 (11)0.8201 (4)0.08322 (19)0.0233 (6)
C5型0.55675 (14)0.5281 (4)0.1500 (3)0.0280 (7)
H5A型0.58910.48420.19930.042*
H5B型0.55550.48950.08760.042*
H5C型0.52520.48650.16140.042*
C6级0.55747 (12)0.7154 (4)0.1528 (2)0.0221 (6)
抄送70.55565 (14)0.9825 (5)0.1998 (2)0.0252 (7)
抄送80.55618(14)0.9864 (5)0.1105 (2)0.0263 (7)
N1型0.68727 (11)0.1769 (4)0.2752 (2)0.0250 (6)
氮气0.68983 (11)0.0922 (4)0.2666 (2)0.0247 (6)
C1类0.68961 (15)0.0217 (5)0.4219 (3)0.0331 (8)
甲型H1A0.69060.13530.44850.050*
H1B型0.72150.04150.46060.050*
H1C型0.65760.03760.42190.050*
指挥与控制0.68836(12)0.0349 (4)0.3234 (2)0.0246 (7)
C3类0.68876 (14)0.1398 (5)0.1869 (3)0.0282 (7)
补体第四成份0.69070 (14)0.0300 (5)0.1817 (3)0.0275 (7)
Co1公司0.62832 (2)0.50011 (6)0.45110 (3)0.01829 (13)
第1类0.57795 (3)0.73678 (10)0.44067 (5)0.02206 (17)
氯化二0.56998 (3)0.28410 (10)0.38769 (5)0.02368 (17)
氯离子0.67944 (3)0.43980 (10)0.60249 (5)0.02279 (17)
第4类0.68208 (3)0.54327 (10)0.36494 (5)0.02248 (17)
H8型0.5553 (17)1.078 (6)0.068 (3)0.039 (12)*
H4A型0.6916 (16)0.099 (6)0.132(3)0.036(11)*
H7型0.5553 (16)1.071 (5)0.241 (3)0.031 (10)*
H3A型0.6871 (17)0.228 (6)0.145 (3)0.043 (12)*
H3级0.5586 (16)0.778 (5)0.275 (3)0.029(11)*
H4型0.5609 (16)0.789 (5)0.037 (3)0.033 (11)*
氢气0.6908 (17)0.186 (6)0.281 (3)0.037 (13)*
上半年0.6852 (19)0.264 (6)0.295 (3)0.043 (14)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N3号机组0.0226 (13)0.0358 (17)0.0158 (12)0.0017 (12)0.0099 (10)0.0007 (12)
4号机组0.0237 (13)0.0321 (16)0.0172 (13)0.0005 (11)0.0110 (11)0.0005 (11)
C5型0.0249 (16)0.0278 (19)0.0326 (18)0.0001 (14)0.0119(14)0.0006 (14)
C6级0.0162(14)0.0306 (18)0.0204 (14)0.0001 (12)0.0075 (11)0.0014 (13)
抄送70.0256 (16)0.0278 (18)0.0238 (16)0.0006 (13)0.0107 (13)0.0034 (14)
C80.0245 (16)0.0314 (19)0.0240 (16)0.0008 (13)0.0100 (13)0.0030 (14)
N1型0.0223 (14)0.0212 (16)0.0307 (15)0.0002 (11)0.0086 (11)0.0024 (12)
氮气0.0255 (14)0.0171 (15)0.0333 (15)0.0001 (11)0.0129 (12)0.0035 (12)
C1类0.0303 (18)0.041 (2)0.0306 (19)0.0018 (16)0.0141 (15)0.0032 (16)
指挥与控制0.0164 (14)0.0280 (18)0.0293 (17)0.0002 (12)0.0082 (12)0.0008 (14)
C3类0.0257(17)0.0275(19)0.0316 (18)0.0033 (14)0.0106 (14)0.0015 (15)
补体第四成份0.0289 (17)0.0282 (19)0.0275 (17)0.0011 (14)0.0128 (14)0.0025 (14)
二氧化碳0.0212 (2)0.0198 (2)0.0161 (2)0.00038(17)0.00940 (17)0.00017 (16)
第1类0.0257 (4)0.0242 (4)0.0185 (3)0.0057 (3)0.0107 (3)0.0011 (3)
氯化二0.0286 (4)0.0248 (4)0.0202 (3)0.0047 (3)0.0118 (3)0.0035 (3)
氯离子0.0228 (4)0.0257 (4)0.0190 (3)0.0007 (3)0.0066 (3)0.0031 (3)
第4类0.0280(4)0.0224 (4)0.0228 (3)0.0000 (3)0.0160 (3)0.0008 (3)
几何参数(λ,º) 顶部
N3-C6号1.336 (4)N1-H1型0.76 (5)
编号3-C71.381 (5)N2至C21.330(5)
编号3-H30.79 (4)N2-C4气体1.381 (4)
N4-C6号1.336 (4)N2-H2气体0.77 (5)
编号4-C81.381 (5)C1-H1A型0.9800
N4-H4型0.78 (4)C1-H1B型0.9800
C5-H5A型0.9800C1-H1C0.9800
C5-H5B型0.9800C1-C2类1.479 (5)
C5-H5C型0.9800C3-C4型1.346 (5)
C5至C61.481 (5)C3至H3A0.93 (5)
C7-C8号机组1.354 (5)C4-H4A型0.94 (4)
C7-H7型0.94 (4)二氧化碳-Cl12.2799 (9)
C8-H8型0.96 (5)二氧化碳-Cl22.2803 (9)
N1-C2型1.332 (5)二氧化碳-Cl32.2506 (8)
N1-C3型1.380 (5)二氧化碳-Cl42.2907(8)
C6-N3-C7型110.6 (3)C2-N2-C4110.1 (3)
C6-N3-H3124 (3)C2-N2-H2123 (3)
C7-N3-H3型126 (3)C4-N2-H2127(3)
C6-N4-C8型110.4 (3)H1A-C1-H1B型109.5
C6-N4-H4123 (3)H1A-C1-H1C型109.5
C8-N4-H4型126 (3)H1B-C1-H1C型109.5
H5A-C5-H5B型109.5C2-C1-H1A型109.5
H5A-C5-H5C型109.5C2-C1-H1B型109.5
H5B-C5-H5C型109.5C2-C1-H1C型109.5
C6-C5-H5A型109.5N1-C2-C1126.6 (3)
C6-C5-H5B型109.5N2-C2-N1型106.6 (3)
C6-C5-H5C型109.5N2-C2-C1126.8 (3)
编号3-C6-N4106.1 (3)N1-C3-H3A型119 (3)
编号3-C6-C5126.9 (3)C4-C3-N1型106.4 (3)
编号4-C6-C5126.9(3)C4-C3-H3A基因134 (3)
N3-C7-H7型123 (3)N2-C4-H4A气体124 (3)
C8-C7-N3号机组106.3 (3)C3-C4-N2型106.7 (3)
C8-C7-H7型130 (3)C3-C4-H4A型130 (3)
N4-C8-H8型121 (3)Cl1-Co1-Cl2106.55 (3)
C7-C8-N4号机组106.6 (3)氯化物-Co1-Cl4108.56 (3)
C7-C8-H8型132 (3)氯化物-Co1-Cl4110.57 (3)
C2-N1-C3110.2 (3)氯化物-Co1-Cl1111.89 (3)
C2-N1-H1型123(4)氯化物-Co1-Cl2110.00 (3)
C3-N1-H1127 (4)氯化物-Co1-Cl4109.25 (3)
N3-C7-C8-N4号0.0 (4)N1-C3-C4-N20.6 (4)
C6-N3-C7-C80.1 (4)C2-N1-C3-C4型0.1 (4)
C6-N4-C8-C70.1 (4)C2-N2-C4-C3型1.1 (4)
C7-N3-C6-N40.1 (4)C3-N1-C2-N20.8 (4)
C7-N3-C6-C5型177.8 (3)C3-N1-C2-C1177.3 (3)
C8-N4-C6-N30.1 (4)C4-N2-C2-N11.1 (4)
C8-N4-C6-C5型177.8 (3)C4-N2-C2-C1型176.9 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··Cl40.76 (5)2.46 (5)3.220 (3)177 (5)
N2-H2··Cl40.77 (5)2.54 (5)3.282 (3)163 (4)
N3-H3···Cl10.79 (4)2.39(4)3.166(3)165 (4)
N4-H4··Cl20.78 (4)2.42 (5)3.198 (3)175 (4)
C4-H4型A类···氯离子0.94 (4)2.73 (4)3.428(4)132 (3)
C3-H3型A类···氯离子0.93 (5)2.70 (5)3.535 (4)151 (4)
C8-H8···Cl10.96 (5)2.65 (5)3.575 (4)160 (3)
C7-H7···Cl2v(v)0.94 (4)2.69 (4)3.617 (4)168 (3)
C5-H5型A类···第4类0.982.863.738 (4)149
C5-H5型C类···二氧化氯不及物动词0.982.883.771 (4)152
C1-H1型B类···第4类vii(七)0.982.953.804 (4)146
C1-H1型C类···第1类0.982.873.840 (4)169
对称代码:(i)x个,1,z; (ii)x个,+1中,z1/2; (iii)x个,,z1/2; (iv)x个,+2,z1/2; (v)x个,+1中,z; (vi)x个+1中,,z+1/2; (vii)x个+3/2,+1/2,z+1.
 

致谢

作者感谢达喀尔谢赫·安塔·迪奥普大学(塞恩加尔)、加拿大创新基金会和蒙特勒大学提供的财政支持。

参考文献

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