有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学的
通信
国际标准编号:2056-9890

晶体结构乙基4-[(1)H(H)-吡唑-1-基)甲基]苯甲酸酯

中国医学科学院医药生物技术研究所和中国协和医科大学,北京100050,中华人民共和国,以及b条东南大学化学与化工学院,南京210096,中华人民共和国
*通信电子邮件:fchg042@163.com

编辑:W.T.A.Harrison,苏格兰阿伯丁大学(2014年11月15日收到; 2014年11月16日接受; 在线2014年11月26日)

在标题分子中,C13H(H)14N个2O(运行)2吡唑和苯环平均平面之间的二面角为76.06(11)°,乙基侧链的构象为反对的[C-O-C-C=-175.4(3)°]。在晶体中,唯一的定向相互作用是非常弱的C-Hπ吡唑环和苯环的相互作用导致了三维网络的形成。

1.相关文献

有关相关结构,请参见:Dong等。(2011[Dong,G.-Y.,Liu,T.-F.,Jiao,C.-H.,Deng,X.C.&Shi,X.-G.(2011).《结晶学报》E67,o1685.]). 有关吡唑衍生物性质的背景,请参见:Adnan和Tarek(2004)【Adnan,A.B.&Tarek,A.Z.(2004),《生物有机医学化学》,第12期,1935-1945年。】); 阿什拉夫等。(2003【Ashraf,H.A.、Amal,A.H.E.和Ghaneya,S.H.(2003),《化学药学公告》,第51期,第838-844页。】).

【方案一】

2.实验

2.1. 水晶数据

  • C类13H(H)14N个2O(运行)2

  • M(M)第页= 230.26

  • 三联诊所,[P\上一行]

  • = 8.1338 (12) Å

  • b条= 8.1961 (9) Å

  • c(c)= 10.7933 (11) Å

  • α= 74.013 (9)°

  • β= 83.308 (10)°

  • γ= 64.734 (13)°

  • V(V)= 625.54 (13) Å

  • Z轴= 2

  • K(K)α辐射

  • μ=0.08毫米−1

  • T型=293千

  • 0.22×0.20×0.18毫米

2.2. 数据收集

  • 安捷伦SuperNova(单光源偏移,Eos)衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(CrysAlis红色; 安捷伦,2012【安捷伦(2012),《CrysAlisRED》,安捷伦科技有限公司,英国雅顿。】)T型最小值= 0.982,T型最大值= 0.985

  • 4295次测量反射

  • 2197次独立反射

  • 1639次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.032

2.3. 精炼

  • R(右)[如果2> 2σ(如果2)] = 0.067

  • 水风险(如果2) = 0.201

  • S公司= 1.15

  • 2197次反射

  • 155个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.18埃−3

  • Δρ最小值=-0.23埃−3

表1
氢键几何结构(Å,°)

Cg公司1和Cg公司2分别是N1/N2/C1–C3和C5–C10环的质心。

-H月A类 -H(H) H月A类 ·A类 -H月A类
C2-H2(乙二醇)Cg公司2 0.93 2.94 3.670 (4) 137
C4-H4型A类Cg公司1ii(ii) 0.97 3 3.600 (3) 122
C12-H12型A类Cg公司2 0.97 2.82 3.689 (4) 150
对称代码:(i)x个-1,,z(z); (ii)-x个, -, -z(z); (iii)-x个, -+1, -z(z)+1

数据收集:弗兰博(布鲁克,2004年[Bruker(2004)。FRAMBO和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞细化: 圣保罗(布鲁克,2004年[Bruker(2004)。FRAMBO和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXTL公司; 分子图形:SHELXTL公司; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司

支持信息


注释顶部

吡唑及其衍生物是一类重要的N个-杂环化合物,因为它们具有广泛的药理活性,如抗真菌(Adnan&Tarek,2004)、抗肿瘤和抗血管生成活性(Ashraf等。, 2003). 作为吡唑衍生物的一部分晶体结构第1页,第4页之二[(1)H(H)-吡唑-1-基)甲基]苯已被测定(Dong等。,2011年)。作为正在进行的新吡唑化合物搜索的一部分,合成了标题化合物,并将其晶体结构本文对此进行了报道。在标题化合物(图1)中,键的长度和角度在正常范围内。吡唑环(N1/N2/C1-C3)和苯基环(C5-C10)之间的二面角为76.06(11)°。在晶体中,存在弱C–H···π联络。

相关文献顶部

有关相关结构,请参见:Dong等。(2011). 有关吡唑衍生物性质的背景,请参见:Adnan&Tarek(2004);阿什拉夫等。(2003).

实验顶部

在配备有机械搅拌器的250 ml四颈圆底烧瓶中,小心地将吡唑(0.680 g 10 mmol)、碳酸钾(2.073 g 15 mmol)和1-(4-(溴甲基)苯基)-1-羟基戊烷-2-酮(2.712 g,10 mm ol)溶解在丙酮(100 ml)中。将溶液在65°C下加热6 h,然后在35°C下通过旋转蒸发器过滤掉混合物,得到1.815 g(66.1%)的粗产品。标题化合物的无色区块是通过缓慢蒸发从乙醇中获得的。

精炼顶部

将氢原子放置在计算位置,并对其进行优化约束,使其骑在其母原子上,C-H=0.93–0.97º,U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(C) 对于甲基和1.2U型等式(C) 对于亚甲基。

计算详细信息顶部

数据收集:弗兰博(布鲁克,2004);细胞细化: 圣保罗(布鲁克,2004);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2004);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
标题化合物的分子结构,以30%的概率水平绘制置换椭球。

标题化合物沿b条轴。
乙基4-[(1H(H)-吡唑-1-基)甲基]苯甲酸酯顶部
水晶数据 顶部
C类13H(H)14N个2O(运行)2Z轴= 2
M(M)第页= 230.26如果(000) = 244
三联诊所,P(P)1x个=1.222毫克负极
大厅符号:-P 1K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 8.1338 (12) Å1485次反射的单元参数
b条= 8.1961 (9) Åθ= 4.3–28.2°
c(c)= 10.7933 (11) ŵ=0.08毫米负极1
α= 74.013 (9)°T型=293千
β= 83.308 (10)°块,无色
γ= 64.734 (13)°0.22×0.20×0.18毫米
V(V)=625.54(13)Å
数据收集 顶部
安捷伦SuperNova(单震源偏移,Eos)
衍射仪
2197个独立反射
辐射源:细焦点密封管1639次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.032
phi和ω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 3.0°
吸收校正:多扫描
(CrysAlis红色; 安捷伦,2012)
小时=负极99
T型最小值= 0.982,T型最大值= 0.985k个=负极99
4295次测量反射=负极128
精炼 顶部
优化于如果2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[如果2> 2σ(如果2)] = 0.067氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(如果2) = 0.201受约束的氢原子参数
S公司= 1.15 w个=1/[σ2(如果o个2) + (0.079P(P))2+ 0.2197P(P)]
哪里P(P)= (如果o个2+ 2如果c(c)2)/3
2197次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
155个参数Δρ最大值=0.18埃负极
0个约束Δρ最小值=负极0.23埃负极
水晶数据 顶部
C类13H(H)14N个2O(运行)2γ= 64.734 (13)°
M(M)第页= 230.26V(V)= 625.54 (13) Å
三联诊所,P(P)1Z轴= 2
= 8.1338 (12) ÅK(K)α辐射
b条= 8.1961 (9) ŵ=0.08毫米负极1
c(c)= 10.7933 (11) ÅT型=293千
α= 74.013 (9)°0.22×0.20×0.18毫米
β= 83.308 (10)°
数据收集 顶部
安捷伦SuperNova(单震源偏移,Eos)
衍射仪
2197次独立反射
吸收校正:多扫描
(CrysAlis红色; 安捷伦,2012)
1639次反射> 2σ()
T型最小值= 0.982,T型最大值= 0.985R(右)整数= 0.032
4295次测量反射
精炼 顶部
R(右)[如果2> 2σ(如果2)]=0.0670个约束
水风险(如果2) = 0.201受约束的氢原子参数
S公司=1.15Δρ最大值=0.18埃负极
2197次反射Δρ最小值=负极0.23埃负极
155个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单元e.s.d.单独考虑;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进如果2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于如果2,常规R(右)-因素R(右)基于如果,使用如果负值设置为零如果2。的阈值表达式如果2>σ(如果2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于如果2在统计上大约是基于如果、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类负极0.3321 (5)0.2354 (4)0.0922 (3)0.0772 (9)
上半年负极0.44120.32190.05160.093*
指挥与控制负极0.3185 (4)0.0903 (5)0.1964 (3)0.0787 (9)
氢气负极0.41190.06060.23940.094*
C3类负极0.1386 (4)负极0.0001 (4)0.2228 (3)0.0718 (9)
H3级负极0.0841负极0.10680.28850.086*
补体第四成份0.1384 (4)0.0519 (4)0.1369 (3)0.0653 (8)
H4A型0.17660.08610.04860.078*
H4B型0.2091负极0.08050.17120.078*
C5级0.1753(3)0.1603 (4)0.2163 (2)0.0543(7)
C6级0.2157 (4)0.0834 (4)0.3464 (3)0.0610 (7)
H6型0.2269负极0.03740.38420.073*
抄送70.2396 (4)0.1856 (4)0.4205 (2)0.0584 (7)
H7型0.26710.13260.50770.070*
C80.2227 (3)0.3657 (3)0.3656 (2)0.0505 (6)
C9级0.1870 (4)0.4413 (4)0.2343 (3)0.0573 (7)
H9型0.17840.56110.19590.069*
C10号机组0.1643 (4)0.3379 (4)0.1609 (3)0.0588 (7)
10小时0.14130.38880.07310.071*
第11条0.2393(4)0.4838 (4)0.4420(3)0.0561 (7)
第12项0.2906 (4)0.5017(5)0.6500 (3)0.0726 (9)
H12A型0.17470.60500.65520.087*
H12B型0.38050.55120.61640.087*
第13页0.3460 (6)0.3720 (6)0.7790 (4)0.1028 (13)
H13A型0.25740.32190.81030.154*
H13B型0.35440.43780.83740.154*
H13C型0.46220.27220.77290.154*
N1型负极0.0526 (3)0.0895 (3)0.13866 (19)0.0554 (6)
氮气负极0.1716(4)0.2383 (3)0.0558(2)0.0741 (8)
O1公司0.2758(3)0.3958 (3)0.56635 (18)0.0672 (6)
氧气0.2213 (3)0.6418 (3)0.3986 (2)0.0823 (7)
原子位移参数(Å2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.075 (2)0.072 (2)0.083 (2)负极0.0205 (17)负极0.0233 (17)负极0.0225 (17)
指挥与控制0.070 (2)0.088 (2)0.079 (2)负极0.0365 (18)0.0043 (16)负极0.0178 (18)
C3类0.078 (2)0.075 (2)0.0547 (17)负极0.0352 (17)负极0.0020 (14)0.0029 (15)
补体第四成份0.0684 (18)0.083 (2)0.0557 (17)负极0.0358 (16)0.0119 (13)负极0.0318 (15)
C5级0.0541 (15)0.0664 (17)0.0469 (15)负极0.0276 (13)0.0101 (11)负极0.0209 (12)
C6级0.0804 (19)0.0549 (16)0.0506 (16)负极0.0330 (14)0.0032(13)负极0.0109 (12)
抄送70.0788(19)0.0601 (16)0.0391 (14)负极0.0336 (14)0.0003(12)负极0.0086 (12)
C80.0534 (14)0.0530 (14)0.0456 (14)负极0.0235 (12)0.0016 (11)负极0.0114 (11)
C9级0.0660 (17)0.0557 (15)0.0489 (15)负极0.0289 (13)负极0.0030 (12)负极0.0035 (12)
C10号机组0.0630 (17)0.0721 (18)0.0404 (14)负极0.0305 (14)0.0011(11)负极0.0090 (13)
第11条0.0593 (16)0.0558 (16)0.0552 (16)负极0.0262 (13)负极0.0016 (12)负极0.0124 (13)
第12项0.079 (2)0.082 (2)0.072 (2)负极0.0358 (17)负极0.0023 (15)负极0.0388 (17)
第13页0.131 (3)0.105(3)0.070 (2)负极0.031 (2)负极0.027 (2)负极0.039 (2)
N1型0.0692 (14)0.0607 (13)0.0401 (12)负极0.0296 (11)负极0.0015(10)负极0.0136 (10)
氮气0.100(2)0.0673 (16)0.0533(14)负极0.0374(14)负极0.0200 (13)负极0.0007 (12)
O1公司0.0917(15)0.0665 (12)0.0502 (12)负极0.0353 (11)负极0.0060 (10)负极0.0181 (9)
氧气0.1173 (19)0.0621 (13)0.0756 (15)负极0.0452 (13)负极0.0147 (13)负极0.0102 (11)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-N2型1.327 (4)C7-H7型0.9300
C1-C2类1.367 (5)C8-C91.391 (3)
C1-H1型0.9300C8-C11号机组1.487 (4)
C2-C3型1.351 (4)C9-C10型1.385 (4)
C2-H2型0.9300C9-H90.9300
C3-N1型1.333 (4)C10-H10型0.9300
C3-H3型0.9300C11-O21.200 (3)
C4-N1型1.448 (3)C11-O1型1.336 (3)
C4-C5型1.524 (4)C12-O1型1.460 (3)
C4-H4A型0.9700C12-C13型1.481 (5)
C4-H4B型0.9700C12-H12A型0.9700
C5至C101.381 (4)C12-H12B型0.9700
C5至C61.385 (4)C13-H13A型0.9600
C6至C71.386 (4)第13页至第13页0.9600
C6-H6型0.9300C13-H13C型0.9600
C7-C8号机组1.384(4)N1-N2型1.348 (3)
N2-C1-C2型112.2(3)C10-C9-C8号机组119.9 (2)
N2-C1-H1型123.9C10-C9-H9型120.1
C2-C1-H1型123.9C8-C9-H9型120.1
C3-C2-C1104.4 (3)C5-C10-C9120.9 (2)
C3-C2-H2127.8C5-C10-H10119.5
C1-C2-H2127.8C9-C10-H10119.5
N1-C3-C2型108.4 (3)O2-C11-O1型122.7 (3)
N1-C3-H3型125.8氧气-C11-C8124.4 (3)
C2-C3-H3型125.8O1-C11-C8型112.9 (2)
N1-C4-C5型111.3 (2)O1-C12-C13型107.1 (3)
N1-C4-H4A型109.4O1-C12-H12A型110.3
C5-C4-H4A109.4C13-C12-H12A型110.3
N1-C4-H4B型109.4O1-C12-H12B型110.3
C5-C4-H4B109.4C13-C12-H12B型110.3
H4A-C4-H4B型108H12A-C12-H12B型108.5
C10-C5-C6119.0 (2)C12-C13-H13A型109.5
C10-C5-C4号机组120.7 (2)C12-C13-H13B109.5
C6-C5-C4120.3 (2)H13A-C13-H13B型109.5
C5-C6-C7120.4(2)C12-C13-H13C109.5
C5-C6-H6119.8H13A-C13-H13C型109.5
C7-C6-H6型119.8H13B-C13-H13C型109.5
C8-C7-C6120.4(2)C3-N1-N2110.7 (3)
C8-C7-H7型119.8C3-N1-C4127.7 (2)
C6-C7-H7型119.8N2-N1-C4121.4 (2)
C7-C8-C9119.2(2)C1-N2-N1型104.3 (2)
C7-C8-C11号机组122.5 (2)C11-O1-C12型117.0 (2)
C9-C8-C11型118.3 (2)
N2-C1-C2-C3型负极0.8 (4)C7-C8-C11-O2负极178.2 (3)
C1-C2-C3-N10.6 (4)C9-C8-C11-O21.1 (4)
N1-C4-C5-C10型负极88.7 (3)C7-C8-C11-O1型1.5 (4)
N1-C4-C5-C689.5 (3)C9-C8-C11-O1负极179.2 (2)
C10-C5-C6-C71.8 (4)C2-C3-N1-N2负极0.3 (4)
C4-C5-C6-C7型负极176.5 (2)C2-C3-N1-C4型174.4(3)
C5-C6-C7-C80.2 (4)C5-C4-N1-C3负极89.3(4)
C6-C7-C8-C9负极2.0(4)C5-C4-N1-N284.9 (3)
C6-C7-C8-C11型177.3 (2)C2-C1-N2-N10.6 (4)
C7-C8-C9-C101.6 (4)C3-N1-N2-C1负极0.2 (3)
C11-C8-C9-C10负极177.7 (2)C4-N1-N2-C1型负极175.3 (2)
C6-C5-C10-C9负极2.1 (4)O2-C11-O1-C121.0 (4)
C4-C5-C10-C9176.1 (2)C8-C11-O1-C12号机组负极178.7 (2)
C8-C9-C10-C50.4 (4)C13-C12-O1-C11负极175.4 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
Cg1和Cg2分别是N1/N2/C1-C3和C5-C10环的质心。
-小时···A类-H(H)H(H)···A类···A类-小时···A类
C2-H2型···Cg公司20.932.943.670 (4)137
C4-H4型A类···Cg公司1ii(ii)0.9733.600 (3)122
C12-H12型A类···Cg公司20.972.823.689 (4)150
对称代码:(i)x个负极1,,z(z); (ii)负极x个,负极,负极z(z); (iii)负极x个,负极+1,负极z(z)+1.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
Cg1和Cg2分别是N1/N2/C1-C3和C5-C10环的质心。
-小时···A类-H(H)H(H)···A类···A类-小时···A类
C2-H2··Cg20.932.943.670 (4)137
C4-H4A··Cg1ii(ii)0.9733.600(3)122
C12-H12A··Cg20.972.823.689 (4)150
对称代码:(i)x个负极1,,z(z); (ii)负极x个,负极,负极z(z); (iii)负极x个,负极+1,负极z(z)+1.
 

致谢

我们感谢国家自然科学基金(No.81302644)和江苏艾纳吉新能源科技有限公司(No.8507040091)的资助。

工具书类

第一次引用Adnan,A.B.和Tarek,A.Z.(2004年)。生物有机医药化学。 12, 1935–1945. 科学网 公共医学 谷歌学者
第一次引用安捷伦(2012)。CrysAlisRED公司安捷伦科技有限公司,英国雅顿。 谷歌学者
第一次引用Ashraf,H.A.、Amal,A.H.E.和Ghaneya,S.H.(2003)。化学。药学公牛。 51, 838–844. 科学网 公共医学 谷歌学者
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第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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