有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

迪-第三种-1-[2-羟基-3-(甲基磺胺基)丙基]肼-1,2-二羧酸丁酯

中国医学科学院医药生物技术研究所和中国协和医科大学,北京100050,中华人民共和国,以及b条杭德新(北京)药业科技有限公司。中华人民共和国北京市丰台区股份有限公司,邮编:100050
*通信电子邮件:imbjxwang@gmail.com

(2014年6月10日收到; 2014年6月26日接受; 在线2014年7月2日)

标题化合物C14H(H)28N个2O(运行)5S、 由2-[(甲基氨基磺酰基)甲基]环氧乙烷与二甲基二硫醚反应合成-第三种-水合肼中的草酸丁酯。在晶体中,摩尔通过N-H…O和O-H…O氢键连接成沿着b条-轴方向。

关键词: 晶体结构.

相关文献

关于标题化合物的合成,参见:Budavari等。(1989[Budavari,S.、O'Neil,M.J.和Smith,A.(1989)。默克指数,第11版,S.Budavary编辑,第6442页。新泽西州拉威:默克公司]); 修补等。(2002【Mendling,W.,Poli,A.&Magnani,P.(2002)。Arzneimittelforschung,52,725-729。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类14H(H)28N个2O(运行)5S公司

  • M(M)第页= 336.44

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 14.0172 (3) Å

  • b条= 7.83649 (15) Å

  • c(c)= 17.2076 (3) Å

  • β= 103.772 (2)°

  • V(V)= 1835.84 (7) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=1.77毫米−1

  • =293千

  • 0.28×0.24×0.24毫米

数据收集
  • 安捷伦Xcalibur(Atlas,Gemini ultra)衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(CrysAlis专业,安捷伦,2013【安捷伦(2013),CrysAlis PRO.安捷伦科技,英国牛津郡雅顿。】)最小值= 0.551,最大值= 0.680

  • 16825次测量反射

  • 3247次独立反射

  • 2903次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.028

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.063

  • 水风险(F类2) = 0.187

  • S公司= 1.00

  • 3247次反射

  • 207个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=1.02埃−3

  • Δρ最小值=−0.66埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
O5-H5…氧气 0.82 2.03 2.842(3) 168
N2-H2和O5 0.93 2.07 2.996 (3) 172
对称代码:(i)[-x+1,y-{\script{1\over2}},-z+{\script}1\over 2}}].

数据收集:CrysAlis专业(安捷伦,2013【安捷伦(2013),CrysAlis PRO.安捷伦科技,英国牛津郡雅顿。】); 细胞精细化: CrysAlis专业; 数据缩减:CrysAlis专业; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:货架xl97(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL/PC公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL/PC公司.

支持信息


注释顶部

Nifuratel是一种用于妇科的药物(Budavari等。, 1989; 修补等。,2002年)。它是一种局部抗原虫和抗真菌药物,也可以口服。瓷砖化合物是硝呋太尔的关键中间体,在此我们报道了其合成方法和晶体结构标题化合物的名称。在标题化合物的分子中,所有键长和角度都具有正常值,C-C键长在1.510(4)至1.514(4)Au之间,C-N距离稍短,如预期的那样,为1.367(3)至1.460(3)Au(图1)。分子由N5-H5···O2连接和N2-H2··O5(i=-x个+ 1,- 1/2, -z+1/2)氢键涉及亚氨基N原子、酯基O原子和羟基O原子,形成平行于b条轴(图2)。

相关文献顶部

标题化合物的合成参见:Budavari等。(1989); 修补等。(2002).

实验顶部

在配备机械搅拌器的500 ml四颈圆底烧瓶中,小心地将2-((甲基磺胺基)甲基)环氧乙烷(55.8 g)溶解在80%水合肼(17.5 g)中。将溶液在95°C下加热6 h,然后在85°C下通过减压蒸馏去除水合肼。125毫升甲醇和Boc2O逐组添加到剩余水相中。反应在2小时后完成,得到粗产物。粗产品通过柱色谱法从200 ml甲醇和丙酮混合物中再结晶得到44.3 g(78.8%)的产品(v(v)/v(v)=1/2),得到25.3g(57%)透明无色块状晶体。

精炼顶部

将H原子放置在计算位置,并对其进行优化约束,使其骑在其母原子上,C-H=0.96-0.97 Au,N-H=0.93 Au,O-H=0.82,U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式甲基和羟基H原子的(C,O)和1.2U型等式(C,N)表示其他。

计算详细信息顶部

数据收集:CrysAlis专业(安捷伦,2013);细胞精细化: CrysAlis专业(安捷伦,2013);数据缩减:CrysAlis专业(安捷伦,2013);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:货架xl97(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL/PC公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL/PC公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构,以30%的概率水平绘制置换椭球。
[图2] 图2。标题化合物沿b条轴。为了清楚起见,除了氢键以外,所有的氢原子都被省略了。氢键显示为虚线。
迪-第三种-1-[2-羟基-3-(甲基磺胺基)丙基]肼-1,2-二羧酸丁酯顶部
水晶数据 顶部
C类14H(H)28N个2O(运行)5S公司F类(000) = 728
M(M)第页= 336.44D类x个=1.217毫克负极
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ= 1.54184 Å
大厅符号:-P 2ybc7294次反射的单元参数
= 14.0172 (3) Åθ= 5.3–66.4°
b条= 7.83649 (15) ŵ=1.77毫米负极1
c(c)= 17.2076 (3) Å=293千
β= 103.772 (2)°块,无色
V(V)= 1835.84 (7) Å0.28×0.24×0.24毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
安捷伦Xcalibur(阿特拉斯,双子座超级)
衍射仪
3247次独立反射
辐射源:细焦点密封管2903次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.028
ω扫描θ最大值= 66.6°,θ最小值= 3.3°
吸收校正:多扫描
(CrysAlis专业,安捷伦,2013)
小时=负极1616
最小值= 0.551,最大值= 0.680k个=负极97
16825次测量反射=负极2020
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.063氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2)=0.187受约束的氢原子参数
S公司= 1.00 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.1098P(P))2+1.6106P(P)]
哪里P(P)========================================================(F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
3247次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
207个参数Δρ最大值=1.02埃负极
0个约束Δρ最小值=负极0.66埃负极
水晶数据 顶部
C类14H(H)28N个2O(运行)5S公司V(V)= 1835.84 (7) Å
M(M)第页= 336.44Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 14.0172 (3) ŵ=1.77毫米负极1
b条= 7.83649 (15) Å=293千
c(c)= 17.2076 (3) Å0.28×0.24×0.24毫米
β= 103.772 (2)°
数据收集 顶部
安捷伦Xcalibur(阿特拉斯,双子座超级)
衍射仪
3247次独立反射
吸收校正:多扫描
(CrysAlis专业,安捷伦,2013)
2903次反射> 2σ()
最小值= 0.551,最大值= 0.680R(右)整数= 0.028
16825次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0630个约束
水风险(F类2) = 0.187受约束的氢原子参数
S公司= 1.00Δρ最大值=1.02埃负极
3247次反射Δρ最小值=负极0.66埃负极
207个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单元e.s.d.单独考虑;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.完善F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.8328 (2)0.0844 (4)0.2221 (2)0.0607 (8)
甲型H1A0.80600.04940.26600.091*
H1B型0.88980.01690.22160.091*
H1C型0.78450.06880.17280.091*
指挥与控制0.86149 (18)0.2704(3)0.23178 (17)0.0442 (6)
C3类0.8960(3)0.3336 (4)0.1599 (2)0.0654 (9)
H3A型0.84450.31870.11250.098*
H3B型0.95270.26970.15510.098*
H3C公司0.91270.45230.16670.098*
补体第四成份0.9360 (2)0.3034 (4)0.3097 (2)0.0661 (8)
H4A型0.95050.42320.31470.099*
H4B型0.99510.24100.31020.099*
H4C型0.90970.26700.35360.099*
C5级0.75898 (17)0.5211 (3)0.24304 (13)0.0377 (5)
C6级0.8608 (3)0.5688 (5)0.4950 (2)0.0734 (10)
H6A型0.81610.47720.49730.110*
H6B型0.90310.58630.54710.110*
H6C型0.89960.54050.45780.110*
抄送70.8696 (3)0.8736 (6)0.4540 (2)0.0829 (12)
H7A型0.89770.84450.41000.124*
H7B型0.92120.89010.50130.124*
H7C型0.83220.97690.44180.124*
C80.7408 (3)0.7799 (5)0.52474 (19)0.0717 (9)
H8A型0.70310.87970.50500.107*
H8B型0.78240.80350.57660.107*
H8C型0.69720.68760.52880.107*
C9级0.8032 (2)0.7309 (4)0.46795 (15)0.0502 (7)
C10号机组0.68395 (18)0.7871 (3)0.34172 (15)0.0398 (6)
C11号机组0.59483 (19)0.8209 (3)0.20202(15)0.0420 (6)
H11A型0.64110.83570.16870.050*
H11B型0.58210.93270.22170.050*
第12项0.50032 (19)0.7509(3)0.15139 (15)0.0414 (6)
H12型0.51170.63710.13180.050*
第13页0.4655 (2)0.8726 (4)0.08046 (17)0.0540 (7)
H13A型0.52060.89620.05710.065*
H13B型0.44640.97970.10070.065*
第14项0.4265 (4)0.6873 (6)负极0.0605 (3)0.1003 (15)
H14A型0.43920.7640负极0.10040.150*
H14B型0.38610.5948负极0.08620.150*
H14C型0.48750.6430负极0.02940.150*
1个0.63988 (15)0.7134 (3)0.27015 (12)0.0406 (5)
氮气0.66615 (14)0.5497 (2)0.25167 (12)0.0384 (5)
氢气0.63170.46150.26860.046*
O1公司0.73806(14)0.6746 (2)0.39125(10)0.0453 (4)
氧气0.67196 (16)0.9354 (2)0.35674 (12)0.0576(5)
臭氧0.76770 (12)0.3515 (2)0.23478 (12)0.0450 (5)
O4号机组0.81944 (14)0.6293 (2)0.24135 (12)0.0512 (5)
O5公司0.43100 (14)0.7407 (2)0.19925 (12)0.0496 (5)
H5型0.39430.65930.18470.074*
S1(第一阶段)0.36497 (6)0.79803 (14)0.00276 (5)0.0743 (3)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0588 (17)0.0400 (15)0.087 (2)0.0079 (13)0.0240 (16)负极0.0047 (14)
指挥与控制0.0374 (13)0.0403(13)0.0560 (15)0.0054 (10)0.0135(11)负极0.0014(11)
C3类0.071 (2)0.0624 (19)0.074 (2)负极0.0013 (16)0.0392 (17)负极0.0057 (16)
补体第四成份0.0560 (18)0.0638 (19)0.070(2)0.0053 (15)负极0.0009 (15)负极0.0018 (16)
C5级0.0417 (12)0.0355 (12)0.0348 (11)0.0021 (10)0.0067 (9)负极0.0013 (9)
C6级0.064 (2)0.090 (3)0.0553 (18)0.0143 (18)负极0.0082 (15)0.0067 (17)
抄送70.067 (2)0.107 (3)0.069 (2)负极0.031 (2)0.0045(17)0.004 (2)
C80.080 (2)0.091 (3)0.0456 (16)负极0.0027(19)0.0186 (16)负极0.0128 (16)
C9级0.0487 (15)0.0645(17)0.0341 (12)负极0.0049 (13)0.0035 (11)负极0.0017 (12)
C10号机组0.0408 (13)0.0408 (13)0.0373 (12)0.0047 (10)0.0082 (10)负极0.0009 (10)
C11号机组0.0430 (13)0.0410 (13)0.0401 (13)0.0039 (10)0.0061 (10)0.0035 (10)
第12项0.0443 (13)0.0371 (12)0.0403(13)0.0057 (10)0.0052 (10)负极0.0052 (10)
第13页0.0579 (16)0.0540 (16)0.0456 (15)0.0029 (13)0.0033 (12)0.0047 (12)
第14项0.117 (4)0.084 (3)0.086 (3)0.005(3)负极0.002 (3)负极0.030 (2)
1个0.0432 (11)0.0360 (10)0.0387 (11)0.0087 (9)0.0022 (9)负极0.0041 (8)
氮气0.0381 (10)0.0326 (10)0.0431 (11)0.0030 (8)0.0069 (8)负极0.0029 (8)
O1公司0.0509 (10)0.0440 (10)0.0360 (9)0.0060 (8)0.0003 (7)负极0.0027 (7)
氧气0.0774 (14)0.0407 (11)0.0497 (11)0.0110 (9)0.0048 (9)负极0.0083 (8)
臭氧0.0373 (9)0.0340 (9)0.0655 (11)负极0.0004 (7)0.0156 (8)负极0.0049 (8)
O4号机组0.0518 (11)0.0389 (10)0.0658 (12)负极0.0061 (8)0.0198 (9)负极0.0010 (8)
O5公司0.0466 (10)0.0450 (10)0.0570 (11)负极0.0068 (8)0.0119 (9)负极0.0017 (8)
S1(第一阶段)0.0590 (5)0.0937(7)0.0592 (5)0.0013 (4)负极0.0082 (4)0.0056(4)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类1.510 (4)C8-H8A型0.9600
C1-H1A型0.9600C8-H8B型0.9600
C1-H1B型0.9600C8-H8C型0.9600
C1-H1C型0.9600C9-O1型1.482 (3)
C2-O3型1.472 (3)C10-O2型1.210 (3)
C2-C4型1.513 (4)C10-O1号机组1.331 (3)
C2-C3型1.514 (4)C10-N1号机组1.367 (3)
C3-H3A型0.9600C11-N1型1.460 (3)
C3-H3B型0.9600C11-C12号机组1.505 (4)
C3-H3C型0.9600C11-H11A型0.9700
C4-H4A型0.9600C11-H11B型0.9700
C4-H4B型0.9600C12-O5型1.418 (3)
C4-H4C型0.9600C12-C13型1.534 (4)
C5-O4(碳五-O4)1.204 (3)2012年12月0.9800
C5-O3型1.345 (3)C13-S1型1.794 (3)
碳五氮1.363 (3)C13-H13A型0.9700
C6-C9型1.518 (5)C13-H13B型0.9700
C6-H6A型0.9600C14-S1型1.769 (5)
C6-H6B型0.9600C14-H14A型0.9600
C6-H6C型0.9600C14-H14B型0.9600
C7-C91.511 (5)2014年4月14日0.9600
C7-H7A型0.9600N1-N2型1.393 (3)
C7-H7B型0.9600N2-H2气体0.9282
C7-H7C型0.9600O5-H5型0.8200
C8-C9型1.508 (4)
C2-C1-H1A型109.5H8B-C8-H8C型109.5
C2-C1-H1B型109.5O1-C9-C8108.9 (2)
H1A-C1-H1B型109.5O1-C9-C7110.5 (2)
C2-C1-H1C型109.5C8-C9-C7112.9 (3)
H1A-C1-H1C型109.5O1-C9-C6型101.2 (2)
H1B-C1-H1C型109.5C8-C9-C6型111.3 (3)
臭氧-C2-C1101.8(2)C7-C9-C6型111.4(3)
臭氧-C2-C4109.2 (2)O2-C10-O1125.9 (2)
C1-C2-C4111.8 (3)氧气-C10-N1122.8 (2)
臭氧-C2-C3110.4 (2)O1-C10-N1型111.3(2)
C1-C2-C3110.7 (3)N1-C11-C12号机组114.0 (2)
C4-C2-C3112.3 (3)N1-C11-H11A型108.7
C2-C3-H3A型109.5C12-C11-H11A型108.7
C2-C3-H3B型109.5N1-C11-H11B型108.7
H3A-C3-H3B型109.5C12-C11-H11B型108.7
C2-C3-H3C型109.5H11A-C11-H11B型107.6
H3A-C3-H3C型109.5O5-C12-C11型108.3 (2)
H3B-C3-H3C型109.5O5-C12-C13型111.4 (2)
C2-C4-H4A型109.5C11-C12-C13107.6 (2)
C2-C4-H4B型109.5O5-C12-H12型109.8
H4A-C4-H4B型109.5C11-C12-H12型109.8
C2-C4-H4C型109.5C13-C12-H12型109.8
H4A-C4-H4C型109.5C12-C13-S1型115.8 (2)
H4B-C4-H4C型109.5C12-C13-H13A108.3
O4-C5-O3127.7 (2)S1-C13-H13A型108.3
O4-C5-N2125.6 (2)C12-C13-H13B108.3
臭氧-C5-N2106.7 (2)S1-C13-H13B型108.3
C9-C6-H6A109.5H13A-C13-H13B型107.4
C9-C6-H6B109.5S1-C14-H14A型109.5
H6A-C6-H6B型109.5S1-C14-H14B109.5
C9-C6-H6C109.5H14A-C14-H14B109.5
H6A-C6-H6C型109.5S1-C14-H14C109.5
H6B-C6-H6C型109.5H14A-C14-H14C109.5
C9-C7-H7A109.5H14B-C14-H14C型109.5
C9-C7-H7B109.5C10-N1-N2120.5 (2)
H7A-C7-H7B型109.5C10-N1至C11119.7 (2)
C9-C7-H7C109.5N2-N1-C11型115.85 (19)
H7A-C7-H7C型109.5C5-N2-N1119.2 (2)
H7B-C7-H7C型109.5C5-N2-H2119.6
C9-C8-H8A109.5N1-N2-H2115.4
C9-C8-H8B109.5C10-O1-C9120.6 (2)
H8A-C8-H8B109.5C5-O3-C2122.31 (19)
C9-C8-H8C109.5C12-O5-H5109.5
H8A-C8-H8C型109.5C14-S1-C13型101.96 (19)
N1-C11-C12-O562.4 (3)C11-N1-N2-C592.7 (3)
N1-C11-C12-C13负极177.0 (2)O2-C10-O1-C9负极9.8 (4)
O5-C12-C13-S1负极71.2 (3)N1-C10-O1-C9171.7 (2)
C11-C12-C13-S1170.10 (19)C8-C9-O1-C1072.2 (3)
O2-10-N1-N2171.3 (2)C7-C9-O1-C10负极52.4 (4)
O1-C10-N1-N2负极10.2 (3)C6-C9-O1-C10负极170.5 (2)
O2-C10-N1-C1114.5 (4)O4-C5-O3-C27.7 (4)
O1-C10-N1-C11负极167.0 (2)N2-C5-O3-C2负极174.0(2)
C12-C11-N1-C10负极141.4 (2)C1-C2-O3-C5负极179.9 (2)
C12-C11-N1-N260.8 (3)C4-C2-O3-C561.8 (3)
O4-C5-N2-N1负极8.6 (4)C3-C2-O3-C5负极62.3 (3)
O3-C5-N2-N1173.04 (19)C12-C13-S1-C14负极89.1 (3)
C10-N1-N2-C5负极65.0 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O5-H5··O20.822.032.842 (3)168
N2-H2··O50.932.072.996 (3)172
对称代码:(i)负极x个+1,负极1/2,负极z+1/2。
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O5-H5··O20.822.032.842 (3)168.2
N2-H2··O50.932.072.996 (3)171.5
对称代码:(i)负极x个+1,负极1/2,负极z+1/2。
 

致谢

我们感谢国家自然科学基金(No.81302644)的资助。

工具书类

第一次引用安捷伦(2013)。CrysAlis专业安捷伦科技公司,英国牛津郡亚恩顿。 谷歌学者
第一次引用Mendling,W.、Poli,A.和Magnani,P.(2002年)。Arzneimittelforschung公司,52, 725–729. 科学网 公共医学 中国科学院 谷歌学者
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第一次引用Budavari,S.、O'Neil,M.J.和Smith,A.(1989)。默克指数,第11版,S.Budavari编辑,第6442页。新泽西州拉威:默克公司谷歌学者

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