有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
编号:2056-9890

N个-(5-硝基-1,3-噻唑-2-基)-4-(三氟甲基)苯甲酰胺

甘肃省动物新药项目重点实验室、农业部兽药开发重点实验室、中国农业科学院兰州动物科学与兽药研究所,兰州730050,中华人民共和国
*通信电子邮件:lijy1971@163.com

(2013年4月16日收到; 2013年4月25日接受; 2013年5月22日在线)

有两种独立且构象不同的分子(A类B类)在非对称单元标题化合物的C11H(H)6F类N个O(运行)S;苯环和噻唑环之间的二面角为33.8(2)°inA类和59.7(2)°英寸B类酰胺基中C-N键长度的相似性[1.379(5)和1.358(5)A类、1.365(5)和1.363(5)B类]表示两个环之间存在共轭。在晶体中,分子通过N-H…N氢键连接,形成沿[010]延伸的链;弱N-H­O酰胺结构中也存在相互作用。

相关文献

有关硝唑烷的抗寄生虫活性,请参见:Fox&Saravoliz(2005)【Fox,L.M.和Saravolitz,L.D.(2005)。临床感染疾病40,1173-1180。】)关于噻唑烷的抗菌活性,请参见:Gargala等。(2010【Gargala,G.、Le Goff,L.、Ballet,J.J.、Favennec,L.,Stachulski,A.V.和Rossignol,J.F.(2010)。抗菌剂化学。54,1315-1318。】); 斯泰丘尔斯基等。(2011【Stachulski,A.V.、Pidathala,C.、Row,E.C.、Sharma,R.、Berry,N.G.、Iqbal,M.、Bentley,J.、Allman,S.A.、Edwards,G.、Helm,A.、Hellier,J.,Korba,B.E.、Semple,J.E.和Rossignol,J.F.(2011),《医学化学杂志》第54期,第4119-4132页。】). 有关标题化合物的合成和抗菌活性,请参见:Ballard等。(2011【巴拉德·T·E、王·X、奥列克诺维奇·I、科尔纳·T、西摩·C、萨拉穆恩·J、瓦尔坦·M、霍夫曼·P·S和麦克唐纳·T·L(2011)。化学药物化学,6,362-377。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C11H(H)6F类N个O(运行)S公司

  • M(M)第页= 317.26

  • 单诊所,21/c

  • = 12.362 (4) Å

  • b条= 8.946 (3) Å

  • c= 23.261 (8) Å

  • β= 100.762 (4)°

  • V(V)= 2527.2 (15) Å

  • Z轴= 8

  • K(K)α辐射

  • μ=0.31毫米−1

  • T型=296千

  • 0.34×0.32×0.25毫米

数据收集
  • 布鲁克APEXII CCD衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])T型最小值= 0.903,T型最大值= 0.927

  • 11671次测量反射

  • 4588个独立反射

  • 3183次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.039

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.069

  • 加权平均值(F类2) = 0.175

  • S公司= 1.06

  • 4588次反射

  • 379个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.50埃−3

  • Δρ最小值=−0.48埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N1-H1至N5 0.86 2.32 3.044 (5) 142
N1-H1酸 0.86 2.57 3.023 (5) 115
N4-H4和N2ii(ii) 0.86 2.18 2.939 (5) 147
N4-H4氧气 0.86 2.62 3.146 (5) 121
对称代码:(i)[-x,y-{\script{1\over2}},-z+{\script}1\over 2}}]; (ii)[-x,y+{\script{1\over2}},-z+{\sscript{1\ower2}}].

数据收集:4月2日(布鲁克,2008年[Bruker(2008),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2008年[Bruker(2008),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

寄生虫和细菌感染是全球发病率和死亡率的重要原因(Fox&Saravolitz,2005)。硝唑烷是一种新型抗寄生虫化合物,可用于人类和动物,是一类名为噻唑烷类药物的母体化合物。最近,合成了一些噻唑烷,并对其生物活性进行了评估(Gargala., 2010); 斯塔丘尔斯基等。, 2011). 标题化合物C11H(H)6F类N个O(运行)S是一种新的噻唑烷,其抗菌活性高于硝唑烷(Ballard等。2011年)和晶体结构此处报告。

在这种结构中,在非对称单元(图1)[苯和噻唑环之间的二面角:33.8(2)和59.7(2)°]。在晶体中,分子通过分子间N-H··N氢键连接(表2),形成沿[010]延伸的一维链。结构中还存在分子内和分子间N-H··O酰胺链内的相互作用。

酰胺基团中C-N键长度[N1-C8,1.379(5)Au和N1-C9,1.358(5)Ye]的相似性表明两个环之间存在共轭,这证实了噻唑烷的假设机理,即氨基阴离子可能与目标PFOR酶相互作用。

相关文献顶部

关于硝唑烷的抗寄生虫活性,请参见:Fox&Saravoliz(2005);关于噻唑烷的抗菌活性,请参阅:Gargala等。(2010); 斯塔丘尔斯基等。(2011). 有关标题化合物的合成和抗菌活性,请参见:Ballard等。(2011).

实验顶部

向蒸馏吡啶中的5-硝基噻唑-2-胺(1 mmol)溶液中添加等摩尔量的4-三氟苯甲酰氯,并进行搅拌。添加完成后,让反应混合物静置过夜。通过TLC分析判断反应完全。将稀释后分离的粗产品过滤,用10%碳酸氢钠溶液清洗,然后用水冲洗数次。干燥固体通过色谱法为了得到纯标题化合物,通过甲醇重结晶获得了适合单晶X射线分析的晶体。

精炼顶部

所有H原子的位置都是用几何方法确定的,并使用C-H=0.93Å和N-H=0.86Å以及U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C,N)。

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2008);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2008);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2008);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物不对称单元中两个独立分子的分子构象和原子编号方案,在30%概率水平上绘制位移椭球。
N个-(5-硝基-1,3-噻唑-2-基)-4-(三氟甲基)苯甲酰胺顶部
水晶数据 顶部
C11H(H)6F类N个O(运行)S公司F类(000) = 1280
M(M)第页= 317.26D类x=1.668毫克
单诊所,21/c熔点=487–489 K
大厅符号:-P 2ybcK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 12.362 (4) Å2723次反射的细胞参数
b条= 8.946 (3) Åθ= 2.4–24.6°
c= 23.261 (8) ŵ=0.31毫米1
β= 100.762 (4)°T型=296千
V(V)= 2527.2 (15) Å块,无色
Z轴= 80.34×0.32×0.25毫米
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
4588个独立反射
辐射源:细焦点密封管3183次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.039
ϕω扫描θ最大值= 25.5°,θ最小值= 2.2°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
小时=1414
T型最小值= 0.903,T型最大值= 0.927k个=910
11671次测量反射=2826
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.069氢站点位置:从邻近站点推断
加权平均值(F类2) = 0.175受约束的氢原子参数
S公司= 1.06 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0692)2+ 3.2322]
哪里= (F类o(o)2+ 2F类c2)/3
4588次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
379个参数Δρ最大值=0.50埃
0个约束Δρ最小值=0.48埃
水晶数据 顶部
C11H(H)6F类N个O(运行)S公司V(V)= 2527.2 (15) Å
M(M)第页= 317.26Z轴= 8
单斜的,21/cK(K)α辐射
= 12.362 (4) ŵ=0.31毫米1
b条= 8.946 (3) ÅT型=296千
c= 23.261 (8) Å0.34×0.32×0.25毫米
β= 100.762 (4)°
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
4588个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
3183次反射> 2σ()
T型最小值= 0.903,T型最大值= 0.927R(右)整数= 0.039
11671次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0690个约束
加权平均值(F类2) = 0.175受约束的氢原子参数
S公司= 1.06Δρ最大值=0.50埃
4588次反射Δρ最小值=0.48埃
379个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子加权平均值和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-基于的因素F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.2871 (3)0.2306 (5)0.10652 (16)0.0387 (10)
指挥与控制0.2390 (3)0.1247 (5)0.06679 (17)0.0448 (11)
氢气0.17990.06870.07430.054*
C3级0.2787 (4)0.1018 (5)0.01590 (18)0.0483 (11)
H3级0.24670.02960.01070.058*
补体第四成份0.3654 (3)0.1855 (5)0.00447 (18)0.0471 (11)
C5级0.4138 (4)0.2911 (6)0.0439 (2)0.0549 (13)
H5型0.47210.34810.03600.066*
C6级0.3758 (3)0.3125 (5)0.09514 (19)0.0498 (12)
H6型0.40980.38210.12230.060*
抄送70.4053 (5)0.1639 (8)0.0515 (2)0.0687 (16)
抄送80.2493 (3)0.2599 (5)0.16232 (17)0.0391 (10)
C9级0.0895 (3)0.2764 (5)0.20673 (16)0.0357 (9)
C10号机组0.0463 (4)0.3137 (5)0.25281 (17)0.0459 (11)
H10型0.11900.31520.25830.055*
C11号机组0.0372 (3)0.3595 (5)0.29379 (16)0.0388 (10)
第12项0.3086 (3)0.8380 (5)0.34839 (17)0.0401 (10)
第13页0.3064 (4)0.7008 (5)0.32116 (18)0.0461 (11)
H13型0.28200.61660.33840.055*
第14项0.3405 (4)0.6892 (5)0.26822 (19)0.0490 (11)
H14型0.34040.59650.25020.059*
第15项0.3746 (3)0.8129 (5)0.24206 (18)0.0436 (10)
第16号0.3762 (4)0.9502 (6)0.2691 (2)0.0554 (12)
H16型0.39841.03480.25120.066*
第17页0.3448 (4)0.9620 (6)0.32261 (19)0.0545 (12)
第17页0.34811.05410.34140.065*
第18页0.4075 (4)0.8034 (7)0.1841 (2)0.0587 (13)
第19号0.2738 (3)0.8557 (5)0.40602 (17)0.0426 (10)
C20个0.1252 (3)0.8112 (5)0.45709 (16)0.0377 (9)
C21型0.0747 (4)0.8551 (5)0.54822 (17)0.0417 (10)
C22型0.0063 (4)0.7988 (5)0.50768 (17)0.0454 (11)
H22(H22)0.07630.77930.51510.054*
一层楼0.4126 (4)0.0182 (5)0.06394 (15)0.1155 (15)
地上二层0.3376 (3)0.2148 (5)0.09695 (13)0.0960 (12)
第三层0.5002 (3)0.2196 (7)0.05158 (16)0.158 (2)
四层0.4257 (4)0.6685 (5)0.16786 (16)0.1311 (18)
五楼0.3324 (4)0.8501 (5)0.14227 (14)0.1252 (17)
六楼0.4934 (4)0.8772 (8)0.18052 (17)0.184 (3)
N1型0.1382 (3)0.2403 (4)0.16086 (13)0.0382 (8)
上半年0.09820.20390.12980.046*
氮气0.0176 (3)0.2646 (4)0.20246 (14)0.0445 (9)
第3页0.0305 (3)0.4175 (4)0.34971 (15)0.0446 (9)
4号机组0.1728 (3)0.7979 (4)0.40900 (13)0.0416 (9)
H4型0.13750.75070.37910.050*
5号机组0.0219 (3)0.7725 (4)0.45493 (14)0.0437 (9)
N6号0.0665 (4)0.8983 (4)0.60621 (15)0.0503 (10)
O1公司0.3090 (2)0.3016 (4)0.20642 (12)0.0560 (9)
氧气0.1160 (3)0.4596 (4)0.38111 (13)0.0638 (9)
臭氧0.0597 (3)0.4226 (4)0.36369 (13)0.0587 (9)
O4号机组0.3288 (2)0.9184 (4)0.44772 (13)0.0632 (10)
O5公司0.1513 (3)0.9334 (4)0.63961 (14)0.0713 (11)
O6公司0.0250 (3)0.8991 (4)0.61955 (13)0.0647 (10)
S1(第一阶段)0.16224 (9)0.34362 (13)0.27209 (4)0.0429 (3)
S2系列0.19504 (9)0.88052 (14)0.52279 (4)0.0469 (3)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.037 (2)0.045 (3)0.035 (2)0.0080 (19)0.0076 (17)0.0032 (19)
指挥与控制0.046 (3)0.046 (3)0.045 (2)0.001 (2)0.014 (2)0.002 (2)
C3级0.051 (3)0.051 (3)0.044 (2)0.002 (2)0.012 (2)0.006 (2)
补体第四成份0.041 (2)0.062 (3)0.039 (2)0.012 (2)0.0087 (19)0.004 (2)
C5级0.041 (3)0.072 (4)0.056 (3)0.003 (2)0.020 (2)0.000 (3)
C6级0.041 (2)0.061 (3)0.048 (3)0.008 (2)0.010 (2)0.011 (2)
抄送70.063 (3)0.103 (5)0.046 (3)0.000 (3)0.024 (3)0.009 (3)
抄送80.041 (2)0.041 (3)0.036 (2)0.0028 (19)0.0087 (18)0.0055 (19)
C9级0.043 (2)0.034 (2)0.0299 (19)0.0021 (18)0.0073 (17)0.0037 (17)
C10号机组0.044 (2)0.058 (3)0.037 (2)0.001 (2)0.0133 (19)0.001 (2)
C11号机组0.048 (2)0.040 (3)0.030 (2)0.0028 (19)0.0099 (18)0.0008 (17)
第12项0.030 (2)0.049 (3)0.041 (2)0.0009 (19)0.0060 (17)0.004 (2)
第13页0.051 (3)0.044 (3)0.045 (2)0.000 (2)0.016 (2)0.002 (2)
第14项0.051 (3)0.048 (3)0.050 (3)0.004 (2)0.016 (2)0.006 (2)
第15项0.038 (2)0.053 (3)0.040 (2)0.004 (2)0.0078 (18)0.003 (2)
第16号0.064 (3)0.049 (3)0.056 (3)0.007 (2)0.018 (2)0.005 (2)
第17页0.068 (3)0.047 (3)0.053 (3)0.005 (2)0.023 (2)0.008 (2)
第18页0.059 (3)0.074 (4)0.045 (3)0.003 (3)0.016 (2)0.005 (3)
第19号0.039 (2)0.050 (3)0.037 (2)0.002 (2)0.0039 (18)0.003 (2)
C20个0.039 (2)0.042 (3)0.031 (2)0.0013 (19)0.0056 (17)0.0026 (18)
C21型0.056 (3)0.037 (3)0.033 (2)0.001 (2)0.0115 (19)0.0004 (18)
C22型0.050 (3)0.051 (3)0.039 (2)0.000 (2)0.0152 (19)0.003 (2)
一层楼0.169 (4)0.117 (3)0.075 (2)0.048 (3)0.059 (2)0.008 (2)
地上二层0.112 (3)0.133 (3)0.0448 (17)0.011 (2)0.0194 (17)0.0211 (19)
第三层0.090 (3)0.313 (7)0.089 (3)0.080 (4)0.064 (2)0.076 (3)
四层0.226 (5)0.101 (3)0.092 (3)0.061 (3)0.098 (3)0.013 (2)
五楼0.147 (4)0.181 (4)0.0498 (19)0.073 (3)0.024 (2)0.027 (2)
六楼0.158 (4)0.329 (8)0.090 (3)0.157 (5)0.085 (3)0.081 (4)
N1型0.0384 (19)0.046 (2)0.0310 (17)0.0039 (16)0.0083 (14)0.0060 (15)
氮气0.038 (2)0.062 (3)0.0349 (18)0.0076 (18)0.0106 (15)0.0049 (17)
第3页0.065 (3)0.036 (2)0.0355 (19)0.0040 (18)0.0157 (19)0.0006 (16)
4号机组0.0377 (19)0.055 (2)0.0325 (17)0.0058 (16)0.0077 (14)0.0091 (16)
5号机组0.044 (2)0.053 (2)0.0353 (18)0.0043 (18)0.0119 (15)0.0030 (16)
N6号0.081 (3)0.034 (2)0.037 (2)0.002 (2)0.014 (2)0.0004 (17)
O1公司0.0428 (17)0.088 (3)0.0343 (16)0.0002 (17)0.0013 (13)0.0087 (16)
氧气0.078 (2)0.073 (3)0.0379 (17)0.006 (2)0.0045 (17)0.0150 (17)
臭氧0.073 (2)0.056 (2)0.0556 (19)0.0123 (17)0.0336 (17)0.0024 (16)
O4号机组0.0457 (18)0.097 (3)0.0468 (18)0.0171 (18)0.0080 (15)0.0243 (18)
O5公司0.101 (3)0.070 (3)0.0410 (18)0.009 (2)0.0067 (19)0.0184 (17)
O6公司0.092 (3)0.058 (2)0.054 (2)0.0106 (19)0.0380 (19)0.0038 (16)
S1(第一阶段)0.0430 (6)0.0545 (8)0.0309 (5)0.0044 (5)0.0063 (4)0.0053 (5)
S2系列0.0490 (7)0.0570 (8)0.0335 (5)0.0026 (6)0.0046 (5)0.0070 (5)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类1.379 (6)C13至C141.378 (6)
C1-C61.385 (6)C13-H13型0.9300
C1-C8号机组1.483 (5)C14-C15号1.367 (6)
C2-C3型1.378 (6)C14-H14型0.9300
C2-H2型0.9300C15至C161.379 (6)
C3-C4型1.374 (6)C15至C181.482 (6)
C3至H30.9300C16-C17号1.374 (6)
C4-C5型1.375 (6)C16-H16型0.9300
C4至C71.488 (6)C17-H17型0.9300
C5至C61.372 (6)C18-F6型1.266 (6)
C5-H5型0.9300C18-F5型1.283 (6)
C6-H6型0.9300C18-F4类1.297 (6)
C7-F3型1.275 (6)C19-O4年1.213 (5)
C7-F2型1.303 (6)C19-N4号1.365 (5)
C7-F1号1.342 (7)C20-N5型1.314 (5)
C8-O1型1.205 (5)C20-N4型1.363 (5)
C8-N1型1.379 (5)C20-S2型1.724 (4)
C9-N21.314 (5)C21-C221.339 (6)
C9-N1型1.358 (5)C21-N6型1.425 (5)
C9-S1型1.723 (4)C21-S2型1.716 (4)
C10-C11号机组1.333 (6)C22-N5型1.358 (5)
C10-N2号1.359 (5)C22-H22型0.9300
C10-H10型0.9300N1-H1型0.8600
C11-N3号机组1.417 (5)N3-O3型1.220 (4)
C11-S1型1.719 (4)N3-O21.227 (5)
C12-C17号1.375 (6)N4-H4型0.8600
C12-C13型1.379 (6)N6-O5型1.224 (5)
C12-C19号1.491 (5)N6-O6型1.227 (5)
C2-C1-C6119.5 (4)C13-C14-H14型119.7
C2-C1-C8型122.8 (4)C14-C15-C16119.8 (4)
C6-C1-C8型117.7 (4)C14-C15-C18型121.3 (4)
C3-C2-C1120.0 (4)C16-C15-C18型118.9 (4)
C3-C2-H2120C17-C16-C15型120.0 (4)
C1-C2-羟基120C17-C16-H16型120
C2-C3-C4型120.1 (4)C15-C16-H16型120
C2-C3-H3型120C16-C17-C12型120.2 (4)
C4-C3-H3型120C16-C17-H17型119.9
C5-C4-C3120.2 (4)C12-C17-H17型119.9
C5-C4-C7120.0 (4)F6-C18-F5层106.1 (5)
C3-C4-C7型119.8 (4)F6-C18-F4层105.9 (5)
C6-C5-C4119.9 (4)F5-C18-F4层102.8 (5)
C6-C5-H5型120F6-C18-C15型114.0 (4)
C4-C5-H5型120F5-C18-C15型112.9 (4)
C5-C6-C1120.2 (4)F4-C18-C15型114.2 (4)
C5-C6-H6119.9O4-C19-N4型121.1 (4)
C1-C6-H6型119.9O4-C19-C12型123.8 (4)
F3-C7-F2层108.3 (5)编号4-C19-C12115.2 (3)
F3-C7-F1层106.3 (5)N5-C20-N4号120.7 (3)
F2至C7-F1102.9 (5)N5-C20-S2号116.8 (3)
F3-C7-C4型114.0 (5)N4-C20-S2号122.5 (3)
F2-C7-C4层113.4 (4)C22-C21-N6型126.4 (4)
F1-C7-C4型111.2 (5)C22-C21-S2型112.9 (3)
O1-C8-N1型120.6 (4)N6-C21-S2型120.6 (3)
O1-C8-C1123.9 (4)C21-C22-N5型114.7 (4)
N1-C8-C1115.6 (3)C21-C22-H22122.7
N2-C9-N1型120.6 (3)N5-C22-H22型122.7
N2-C9-S1型116.6 (3)C9-N1-C8122.4 (3)
N1-C9-S1型122.8 (3)C9-N1-H1118.8
C11-C10-N2型115.0 (4)C8-N1-H1型118.8
C11-C10-H10型122.5C9-N2-C10109.3 (3)
N2-C10-H10型122.5O3-N3-O2124.0 (4)
C10-C11-N3号机组126.8 (4)臭氧-N3-C11118.1 (4)
C10-C11-S1号112.6 (3)氧气-N3-C11117.9 (4)
N3-C11-S1号120.6 (3)C19-N4-C20型123.2 (3)
C17-C12-C13型119.9 (4)C19-N4-H4型118.4
C17-C12-C19型118.6 (4)C20-N4-H4型118.4
C13-C12-C19型121.6 (4)C20-N5-C22型109.4 (3)
C14-C13-C12型119.6 (4)O5-N6-O6型124.0 (4)
C14-C13-H13型120.2O5-N6-C21型117.8 (4)
C12-C13-H13型120.2O6-N6-C21型118.2 (4)
C15-C14-C13型120.6 (4)C11-S1-C9型86.47 (19)
C15-C14-H14年119.7C21-S2-C20型86.26 (19)
C6-C1-C2-C3型0.6 (6)C16-C15-C18-F4166.3 (5)
C8-C1-C2-C3179.4 (4)C17-C12-C19-O4型50.0 (6)
C1-C2-C3-C4型0.6 (7)C13-C12-C19-O4129.2 (5)
C2-C3-C4-C5型0.7 (7)C17-C12-C19-N4型129.0 (4)
C2-C3-C4-C7型177.9 (4)C13-C12-C19-N451.8 (6)
C3-C4-C5-C6型0.4 (7)N6-C21-C22-N5型177.4 (4)
C7-C4-C5-C6179.1 (5)S2-C21-C22-N5型0.2 (5)
C4-C5-C6-C1型1.7 (7)N2-C9-N1-C8175.9 (4)
C2-C1-C6-C5型1.8 (7)S1-C9-N1-C8型2.5 (6)
C8-C1-C6-C5179.4 (4)O1-C8-N1-C94.8 (6)
C5-C4-C7-F317.1 (8)C1-C8-N1-C9173.6 (4)
C3-C4-C7-F3164.2 (5)N1-C9-N2-C10177.1 (4)
C5-C4-C7-F2107.4 (6)S1-C9-N2-C10型1.3 (5)
C3-C4-C7-F271.3 (7)C11-C10-N2-C90.6 (6)
C5-C4-C7-F1137.3 (5)C10-C11-N3-O3型2.6 (7)
C3-C4-C7-F144.1 (7)S1-C11-N3-O3型178.0 (3)
C2-C1-C8-O1型149.3 (4)C10-C11-N3-O2177.3 (4)
C6-C1-C8-O129.5 (6)S1-C11-N3-O22.1 (5)
C2-C1-C8-N1型32.4 (6)O4-C19-N4-C20型2.8 (7)
C6-C1-C8-N1148.8 (4)C12-C19-N4-C20176.2 (4)
N2-C10-C11-N3型179.1 (4)N5-C20-N4-C19型170.2 (4)
N2-C10-C11-S10.3 (5)S2-C20-N4-C19型9.0 (6)
C17-C12-C13-C140.0 (7)N4-C20-N5-C22号178.9 (4)
C19-C12-C13-C14179.2 (4)S2-C20-N5-C22型0.4 (5)
C12-C13-C14-C151.2 (7)C21-C22-N5-C200.3 (6)
C13-C14-C15-C160.8 (7)C22-C21-N6-O5型172.6 (4)
C13-C14-C15-C18177.6 (4)S2-C21-N6-O5型10.3 (6)
C14-C15-C16-C170.8 (7)C22-C21-N6-O6型7.9 (7)
C18-C15-C16-C17179.2 (4)S2-C21-N6-O6型169.2 (3)
C15-C16-C17-C122.0 (7)C10-C11-S1-C9号机组0.8 (4)
C13-C12-C17-C161.6 (7)编号3-C11-S1-C9178.7 (4)
C19-C12-C17-C16179.2 (4)N2-C9-S1-C111.2 (3)
C14-C15-C18-F6型137.1 (6)N1-C9-S1-C11177.2 (4)
C16-C15-C18-F644.5 (7)C22-C21-S2-C200.0 (4)
C14-C15-C18-F5101.7 (6)N6-C21-S2-C20177.4 (4)
C16-C15-C18-F576.7 (6)N5-C20-S2-C210.3 (4)
C14-C15-C18-F415.3 (7)N4-C20-S2-C21179.0 (4)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··N50.862.323.044 (5)142
N1-H1··O30.862.573.023 (5)115
N4-H4··N2ii(ii)0.862.182.939 (5)147
N4-H4··O20.862.623.146 (5)121
对称代码:(i)x,1/2,z(z)+1/2; (ii)x,+1/2,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C11H(H)6F类N个O(运行)S公司
M(M)第页317.26
晶体系统,空间组单诊所,21/c
温度(K)296
,b条,c(Å)12.362 (4), 8.946 (3), 23.261 (8)
β(°)100.762 (4)
V(V))2527.2 (15)
Z轴8
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.31
晶体尺寸(mm)0.34 × 0.32 × 0.25
数据收集
衍射仪布鲁克APEXII CCD
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
T型最小值,T型最大值0.903, 0.927
测量的、独立的和
观察到的[> 2σ()]反射
11671, 4588, 3183
R(右)整数0.039
(罪θ/λ)最大值1)0.606
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],加权平均值(F类2),S公司0.069, 0.175, 1.06
反射次数4588
参数数量379
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.50,0.48

计算机程序:4月2日(布鲁克,2008),圣保罗(布鲁克,2008),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··N50.862.323.044 (5)142
N1-H1··O30.862.573.023 (5)115
N4-H4··N2ii(ii)0.862.182.939 (5)147
N4-H4··O20.862.623.146 (5)121
对称代码:(i)x,1/2,z(z)+1/2; (ii)x,+1/2,z(z)+1/2.
 

致谢

本研究得到了中国农业研究系统专项资金(cars-38)和中央农业科研院所基础科研基金项目(1610322013005)的资助。

工具书类

第一次引用Ballard,T.E.、Wang,X.、Olekhnovich,I.、Koerner,T.、Seymour,C.、Salamoun,J.、Warthan,M.、Hoffman,P.S.和Macdonald,T.L.(2011)。化学医学化学,6, 362–377. 科学网 交叉参考 中国科学院 公共医学 谷歌学者
第一次引用布鲁克(2008)。4月2日圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Fox,L.M.和Saravoliz,L.D.(2005)。临床。感染。数字化信息系统。 40, 1173–1180. 科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Gargala,G.、Le Goff,L.、Ballet,J.J.、Favennec,L.,Stachulski,A.V.和Rossignol,J.F.(2010年)。抗微生物。代理Chemother。 54, 1315–1318. 科学网 交叉参考 中国科学院 公共医学 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(1996)。SADABS公司德国哥廷根大学。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Stachulski,A.V.、Pidathala,C.、Row,E.C.、Sharma,R.、Berry,N.G.、Iqbal,M.、Bentley,J.、Allman,S.A.、Edwards,G.、Helm,A.、Hellier,J.,Korba,B.E.、Semple,J.E.和Rossignol,J.F.(2011)。医学化学杂志。 54, 4119–4132. 科学网 交叉参考 中国科学院 公共医学 谷歌学者

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编号:2056-9890