有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

3,4-二氢-1H(H)-苯并[c(c)]铬-1,6(2H(H))-二酮

中华人民共和国河南省453007河南师范大学化学与化工学院
*通信电子邮件:xuesen.fan@htu.cn

(收到日期:2013年4月9日; 2013年4月14日接受; 2013年4月20日在线)

在标题化合物中,C13H(H)10O(运行)吡喃酮和苯环几乎共面,形成1.9(1)°的二面角。环己烯酮环采用包络构造,一个亚甲基C原子位于襟翼上,与其他五个原子的平均平面偏移0.639(3)度。在晶体中,弱C-H­对π反转相关分子之间发生相互作用。

相关文献

用于苯并[c(c)]铬-6-酮,参见:施密特等。(2003【Schmidt,J.M.,Tremblay,G.B.,Pagé,M.,Mercure,J.,Feher,M..,Dunn-Dufult,R.,Peter,M.G.&Redden,P.R.(2003),《医学化学杂志》第46期,第1289-1292页。】); 潘迪等。(2004【Pandey,J.、Jha,A.K.和Hajela,K.(2004),生物组织医学化学,第12期,2239-2249页。】); 松本和哈那瓦尔特(2000【Matsumoto,A.&Hanawalt,P.C.(2000)。癌症研究60,3921-3926。】); 太阳等。(2006【Sun,W.,Cama,L.D.,Birzin,E.T.,Warrier,S.,Locco,L.,Mosley,R.,Hammond,M.L.&Rohrer,S.P.(2006),生物有机医学化学快报,第16期,1468-1472页。】). 合成见:风扇等。(2012[范晓山、何毅、崔丽英、郭春华、王建杰和张晓云(2012)。《欧洲组织化学杂志》,第673-677页。]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类13H(H)10O(运行)

  • M(M)第页= 214.21

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 8.234 (3) Å

  • b条= 10.199 (3) Å

  • c(c)= 11.927 (4) Å

  • β=97.439(4)°

  • V(V)= 993.1 (6) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.10毫米−1

  • T型=296千

  • 0.47×0.41×0.31毫米

数据收集
  • Bruker SMART 1000 CCD面阵探测器衍射仪

  • 6998次测量反射

  • 1843独立反射

  • 1517次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.027

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.077

  • 水风险(F类2) = 0.229

  • S公司= 1.18

  • 1843次反射

  • 145个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.33埃−3

  • Δρ最小值=-0.29埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

Cg公司是C1–C6苯环的质心。

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
C11-H11型B类Cg公司 0.97 2.91 3.723 (5) 142
对称代码:(i)-x个+1, -+1, -z(z)+1.

数据收集:智能(布鲁克,2007年[Bruker(2007)。SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2007年[Bruker(2007)。SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于细化结构的程序:SHELXTL公司; 分子图形:SHELXTL公司; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

本佐[c(c)]色氨酸-6-酮是与药理相关的天然产物的主要类别之一,具有广泛的生物活性(施密特等。, 2003; 潘迪等。, 2004; 松本等。, 2000; 太阳等。, 2006). 作为我们研究的一部分(Fan等。2012年),我们合成了标题化合物(I),并报告了其晶体结构在这里。

标题化合物C13H(H)10O(运行)由三个熔融的六元环、苯、吡喃酮和环己酮环组成。吡喃环位于中间。所有键长和键角都在正常范围内。吡喃环和苯环几乎共面,二面角为1.9(1)°。环己烯酮环采用包络构造,位于襟翼上的亚甲基C原子,与其他五个环原子(C8-C11/C13)的平均平面偏移0.639(3)°。

在晶体中,弱分子间C-H···π苯环与相邻分子的亚甲基发生相互作用,苯环质心与亚甲基H原子的分离度为2.91℃。

相关文献顶部

用于苯并[c(c)]铬-6-酮,参见:施密特等。(2003); 潘迪等。(2004); 松本和哈那瓦尔特(2000);太阳等。(2006). 合成见:风扇等。(2012).

实验顶部

标题化合物是按照先前报告的程序(Fan等。, 2012). 单晶,适用于X射线衍射分析,通过缓慢蒸发石油醚-乙酸乙酯(5:1)中的溶剂得到v(v)/v(v))标题化合物的溶液。

精炼顶部

H原子被几何定位,并使用骑马模型进行细化,C-H=0.93–0.97ΩU型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。

结构说明顶部

本佐[c(c)]色氨酸-6-酮是与药理相关的天然产物的主要类别之一,具有广泛的生物活性(施密特等。, 2003; 潘迪等。, 2004; 松本等。, 2000; 太阳等。,2006年)。作为我们研究的一部分(Fan等。2012年),我们合成了标题化合物(I),并报告了其晶体结构在这里。

标题化合物C13H(H)10O(运行)由三个熔融的六元环、苯、吡喃酮和环己酮环组成。吡喃环位于中间。所有键长和键角都在正常范围内。吡喃环和苯环几乎共面,二面角为1.9(1)°。环己烯环采用包络构造,位于襟翼上的亚甲基C原子,与其他五个环原子(C8-C11/C13)的平均平面偏移0.639(3)°。

在晶体中,弱分子间C-H···π苯环与相邻分子的亚甲基发生相互作用,苯环质心与亚甲基H原子的分离度为2.91℃。

用于苯并[c(c)]铬-6-酮,参见:施密特等。(2003); 潘迪等。(2004); Matsumoto和Hanawalt(2000);太阳等。(2006). 合成见:风扇等。(2012).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2007);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2007);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2007);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于细化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构,在30%概率水平上绘制位移椭球。
[图2] 图2。标题化合物的晶体结构以及沿b条轴。
3,4-二氢-1H(H)-苯并[c(c)]铬-1,6(2H(H))-酒神顶部
水晶数据 顶部
C类13H(H)10O(运行)F类(000) = 448
M(M)第页= 214.21D类x个=1.433毫克
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2ybc2699次反射的细胞参数
= 8.234 (3) Åθ= 2.5–27.2°
b条= 10.199 (3) ŵ=0.10毫米1
c(c)= 11.927 (4) ÅT型=296千
β= 97.439 (4)°块状,无色
V(V)= 993.1 (6) Å0.47×0.41×0.31毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Bruker SMART 1000 CCD区域探测器
衍射仪
1517次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管R(右)整数= 0.027
石墨单色仪θ最大值= 25.5°,θ最小值= 2.5°
φω扫描小时=99
6998次测量反射k个=1212
1843独立反射=1414
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅立叶图
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.077氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.229受约束的氢原子参数
S公司= 1.18 w个= 1/[σ2(F类2) + (0.0741P(P))2+ 2.0297P(P)]
哪里P(P)= (F类2+ 2F类c(c)2)/3
1843次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
145个参数Δρ最大值=0.33埃
0个约束Δρ最小值=0.29埃
水晶数据 顶部
C类13H(H)10O(运行)V(V)= 993.1 (6) Å
M(M)第页=214.21Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 8.234 (3) ŵ=0.10毫米1
b条= 10.199 (3) ÅT型=296千
c(c)= 11.927 (4) Å0.47×0.41×0.31毫米
β= 97.439 (4)°
数据收集 顶部
Bruker SMART 1000 CCD区域探测器
衍射仪
1517次反射> 2σ()
6998次测量反射R(右)整数= 0.027
1843独立反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.0770个约束
水风险(F类2) = 0.229受约束的氢原子参数
S公司= 1.18Δρ最大值=0.33埃
1843次反射Δρ最小值=0.29埃
145个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,带有F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.1515 (4)0.4254 (4)0.4108 (3)0.0372(8)
指挥与控制0.0900 (5)0.2983 (4)0.3970 (4)0.0462 (10)
氢气0.02940.27370.32900.055*
C3类0.1189 (5)0.2095 (4)0.4836 (4)0.0556 (11)
H3级0.07970.12420.47410.067*
补体第四成份0.2063 (6)0.2472 (5)0.5847 (4)0.0577 (12)
H4型0.22390.18710.64370.069*
C5级0.2681 (5)0.3725 (4)0.6002 (3)0.0494 (10)
H5型0.32660.39580.66930.059*
C6级0.2435 (4)0.4652 (4)0.5127 (3)0.0361 (8)
抄送70.1173 (5)0.5166 (4)0.3171 (3)0.0409(9)
抄送80.2628 (4)0.6829 (4)0.4336 (3)0.0388 (9)
C9级0.3044 (4)0.6001 (4)0.5209 (3)0.0364 (8)
C10号机组0.4169 (5)0.6504 (4)0.6187 (3)0.0448 (10)
第11条0.4572 (6)0.7945 (5)0.6214 (4)0.0575(12)
H11A型0.46490.82490.69900.069*
H11B型0.56400.80610.59670.069*
第12项0.3362 (5)0.8789 (4)0.5496 (4)0.0522 (11)
H12A型0.37870.96750.54740.063*
H12B型0.23450.88230.58240.063*
第13页0.3036 (6)0.8247 (4)0.4302 (4)0.0517 (11)
H13A型0.21330.87190.38800.062*
H13B型0.39980.83660.39220.062*
O1公司0.0424 (4)0.4948 (3)0.2258 (2)0.0618 (9)
氧气0.1742 (3)0.6438 (3)0.3351 (2)0.0457 (7)
臭氧0.4831 (4)0.5785(3)0.6928 (2)0.0663 (10)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0344 (18)0.038 (2)0.0388 (19)0.0033 (15)0.0045 (14)0.0020 (15)
指挥与控制0.039 (2)0.043 (2)0.055 (2)0.0017 (17)0.0025 (17)0.0056 (18)
C3类0.050 (2)0.040 (2)0.078(3)0.0044 (19)0.010 (2)0.006 (2)
补体第四成份0.063 (3)0.051 (3)0.059 (3)0.002 (2)0.009 (2)0.018 (2)
C5级0.053 (2)0.052 (2)0.041 (2)0.001 (2)0.0006 (18)0.0082 (18)
C6级0.0314 (18)0.041 (2)0.0354 (18)0.0056(15)0.0039 (14)0.0009 (15)
抄送70.045 (2)0.041 (2)0.0347 (19)0.0033 (16)0.0020 (16)0.0043 (16)
抄送80.0409 (19)0.039 (2)0.0356 (18)0.0035 (16)0.0010 (15)0.0034 (15)
C9级0.0349 (18)0.040 (2)0.0346 (18)0.0041 (15)0.0049(14)0.0041 (15)
C10号机组0.042 (2)0.055 (2)0.037 (2)0.0001 (18)0.0021 (16)0.0071 (18)
第11条0.052 (2)0.064 (3)0.055 (3)0.011 (2)0.000 (2)0.016 (2)
第12项0.052 (2)0.041 (2)0.064 (3)0.0074 (19)0.009 (2)0.012 (2)
第13页0.061 (3)0.038 (2)0.055 (2)0.0033 (19)0.004 (2)0.0006 (19)
O1公司0.081 (2)0.0545(19)0.0429 (16)0.0025 (16)0.0182 (15)0.0078 (14)
氧气0.0594 (17)0.0378 (15)0.0365 (14)0.0017 (12)0.0069 (12)0.0001 (11)
臭氧0.074 (2)0.076(2)0.0433 (17)0.0031 (18)0.0168 (15)0.0024 (16)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类1.393 (5)C8-C9型1.349 (5)
C1-C6号机组1.406 (5)C8-O21.360 (4)
C1-C7号机组1.454 (5)C8-C13号机组1.486 (5)
C2-C3型1.372 (6)C9-C10型1.484 (5)
C2-H2型0.9300C10-O3型1.222(5)
C3-C4型1.376 (6)C10-C11号机组1.506 (6)
C3-H3型0.9300C11-C12号机组1.499 (6)
C4-C5型1.379 (6)C11-H11A型0.9700
C4-H4型0.9300C11-H11B型0.9700
C5至C61.403 (5)C12-C13型1.519 (6)
C5-H5型0.9300C12-小时12a0.9700
C6至C91.463 (5)C12-H12B型0.9700
C7-O1号机组1.201 (4)C13-H13A型0.9700
C7-O21.387 (5)C13-H13B型0.9700
C2-C1-C6型121.2 (3)C8-C9-C10117.4 (3)
C2-C1-C7型118.3 (3)C6-C9-C10型123.5 (3)
C6-C1-C7型120.6 (3)臭氧-C10-C9122.4 (4)
C3-C2-C1120.1 (4)臭氧-C10-C11119.6 (4)
C3-C2-H2120C9-C10-C11117.9 (4)
C1-C2-H2120C12-C11-C10114.8 (3)
C2-C3-C4型119.7 (4)C12-C11-H11A型108.6
C2-C3-H3型120.2C10-C11-H11A型108.6
C4-C3-H3型120.2C12-C11-H11B型108.6
C3-C4-C5型121.2 (4)C10-C11-H11B型108.6
C3-C4-H4型119.4H11A-C11-H11B型107.5
C5-C4-H4119.4C11-C12-C13型110.5 (4)
C4-C5-C6120.6 (4)C11-C12-H12A109.6
C4-C5-H5型119.7C13-C12-H12A型109.6
C6-C5-H5型119.7C11-C12-H12B型109.6
C5-C6-C1117.2 (4)C13-C12-H12B型109.6
C5-C6-C9124.6 (3)H12A-C12-H12B型108.1
C1-C6-C9型118.1 (3)C8-C13-C12号机组110.0 (3)
O1-C7-O2115.9 (3)C8-C13-H13A型109.7
O1-C7-C1127.2 (4)C12-C13-H13A型109.7
O2-C7-C1116.9 (3)C8-C13-H13B109.7
C9-C8-O2122.5 (3)C12-C13-H13B109.7
C9-C8-C13型126.5 (3)H13A-C13-H13B型108.2
O2-C8-C13型111.0 (3)C8-O2-C7型122.7 (3)
C8-C9-C6型119.1 (3)
C6-C1-C2-C3型0.0 (6)C5-C6-C9-C8175.2 (4)
C7-C1-C2-C3179.7 (4)C1-C6-C9-C83.7 (5)
C1-C2-C3-C4型1.1 (6)C5-C6-C9-C107.6 (6)
C2-C3-C4-C5型1.1 (7)C1-C6-C9-C10173.5 (3)
C3-C4-C5-C6型0.1 (7)C8-C9-C10-O3167.7 (4)
C4-C5-C6-C11.2 (6)C6-C9-C10-O39.5 (6)
C4-C5-C6-C9型179.8 (4)C8-C9-C10-C11号机组8.5 (5)
C2-C1-C6-C5型1.1 (5)C6-C9-C10-C11174.2 (3)
C7-C1-C6-C5178.5 (3)臭氧-C10-C11-C12162.4 (4)
C2-C1-C6-C9型179.8 (3)C9-C10-C11-C1221.2 (6)
C7-C1-C6-C90.5 (5)C10-C11-C12-C1351.1(5)
C2-C1-C7-O1型1.2 (6)C9-C8-C13-C1223.3 (6)
C6-C1-C7-O1179.1 (4)O2-C8-C13-C12型156.4 (3)
C2-C1-C7-O2177.4 (3)C11-C12-C13-C850.7 (5)
C6-C1-C7-O22.3 (5)C9-C8-O2-C71.1 (6)
O2-C8-C9-C6型4.1 (5)C13-C8-O2-C7178.6 (3)
C13-C8-C9-C6型175.5 (4)O1-C7-O2-C8型179.1 (4)
氧气-C8-C9-C10173.2 (3)C1-C7-O2-C82.2 (5)
C13-C8-C9-C107.1(6)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
Cg是C1–C6苯环的质心。
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C11-H11型B类···Cg公司0.972.913.723 (5)142
对称代码:(i)x个+1,+1,z(z)+1.

实验细节

水晶数据
化学配方C类13H(H)10O(运行)
M(M)第页214.21
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)296
,b条,c(c)(Å)8.234 (3), 10.199 (3), 11.927 (4)
β(°)97.439 (4)
V(V))993.1 (6)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.10
晶体尺寸(mm)0.47 × 0.41 × 0.31
数据收集
衍射仪布吕克智能1000 CCD区域探测器
吸收校正——
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
6998, 1843, 1517
R(右)整数0.027
(罪θ/λ)最大值1)0.606
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.077, 0.229, 1.18
反射次数1843
参数数量145
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.33,0.29

计算机程序:智能(布鲁克,2007),圣保罗(布鲁克,2007),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
Cg是C1–C6苯环的质心。
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C11-H11B···Cg0.972.913.723 (5)142
对称代码:(i)x个+1,+1,z(z)+1.
 

致谢

本研究得到了国家自然科学基金(No.21272058)的资助。

参考文献

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