有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

S公司-苯并硫代甲酸酯

约翰内斯堡大学化学系合成与催化研究中心(APK校区),邮政信箱524,奥克兰公园,约翰内斯堡,2006年,南非
*通信电子邮件:mullera@uj.ac.za

(收到日期:2012年8月22日; 2012年8月28日接受; 2012年9月1日在线)

在标题化合物中,C13H(H)10OS,苯环彼此倾斜51.12(8)°。分子中有一个短的C-H…S接触。在晶体中,分子相互连接通过C-H­O氢键沿轴。分子也通过C-H连接π和虚弱ππ相互作用[质心-质心距离=3.9543(10)Au]。

相关文献

标题化合物是在碱性介质中由硫酚亚酯和苯甲酰氯反应得到的。有关标题化合物的背景,请参见:Reddy等。(2010【Reddy,M.V.R.、Pallela,V.R..、Cosenza,S.C.、Mallireddigari,M.R.,Patti,R.、Bonagura,M.、Truongcao,M.,Akula,B.、Jatiani,S.S.和Reddy,E.P.(2010),生物有机医学化学18,第6期,2317-2326。】); 卡特里茨基等。(2007【Katritzky,A.R.,Shestopalov,A.A.&Suzuki,K.(2007),《合成》,第11期,1806-1813页。】). 有关剑桥结构数据库的详细信息,请参见:Allen(2002【Allen,F.H.(2002),《水晶学报》,B58,380-388。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类13H(H)10操作系统

  • M(M)第页= 214.27

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 5.7203 (1) Å

  • b条= 15.1315 (3) Å

  • c(c)=12.0606(3)Å

  • β= 96.867 (1)°

  • V(V)= 1036.44 (4) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=2.49毫米−1

  • T型=100 K

  • 0.25×0.12×0.12毫米

数据收集
  • Bruker APEX DUO 4K-CCD衍射仪

  • 吸收校正:多次扫描(SADABS公司; 布鲁克,2008[Bruker(2008)。SADABS、SAINT和XPREP。BrukerAXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.575,T型最大值=0.754

  • 9164次测量反射

  • 1759独立反射

  • 1702次反射> 2σ()

  • 整数= 0.022

精炼
  • [F类2> 2σ(F类2)] = 0.032

  • 水风险(F类2) = 0.082

  • S公司= 1.04

  • 1759次反射

  • 136个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.35埃−3

  • Δρ最小值=−0.26埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

Cg公司1和Cg公司2分别是C2–C7和C8–C13环的质心。

D类-H月A类 D类-小时 H月A类 D类A类 D类-H月A类
C7-H7和S1 0.95 2.52 2.9592 (16) 109
C13-H13乙醇O1 0.95 2.56 3.4889 (18) 167
C10-H10秒Cg公司1ii(ii) 0.95 2.97 3.506 (2) 117
C5-H5秒Cg公司2 0.95 2.73 3.5915 (19) 152
对称代码:(i)x个-1,,z(z); (ii)-x个+2, -+1, -z(z); (iii)[-x+2,y+{\script{1\over 2}},-z+{\script{1\over 2}}].

数据收集:4月2日(布鲁克,2011年[Bruker(2011),APEX2。BrukerAXS公司,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2008年[Bruker(2008)。SADABS、SAINT和XPREP。BrukerAXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗XPREP公司(布鲁克,2008年[Bruker(2008)。SADABS、SAINT和XPREP。BrukerAXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 用于求解结构的程序:SIR97型(阿尔托马雷等。, 1999【Altomare,A.,Burla,M.C.,Camalli,M.,Cascarano,G.L.,Giacovazzo,C.,Guagliardi,A.,Moliterni,A.G.,Polidori,G.&Spagna,R.(1999),《应用结晶杂志》,第32期,第115-119页。】); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:钻石(Brandenburg&Putz,2005)【Brandenburg,K.&Putz,H.(2005)。钻石。Crystal Impact GbR,德国波恩。】); 用于准备出版材料的软件:WinGX公司(Farrugia,1999年【Farrugia,L.J.(1999),《应用结晶杂志》,第32期,第837-838页。】).

支持信息


注释顶部

Reddy先前描述了硫酚亚酯和苯甲酰氯在碱性介质中的反应等。, 2010. 我们已经重复了这种化合物的制备过程,以便在我们的一些研究中用作起始材料。硫代苯酚的苯甲酰化生成标题化合物的无色晶体(见图1),适用于单晶X射线分析,其结构如本文所述。标题化合物的分子在P(P)21/c(c)(Z轴=4)空间组。所有键长都在正常范围内(Allen,2002)。在晶体填料中有几个C-H··O/S/π相互作用(参见表1、图2)以及π-π观察到堆叠(质心到质心距离=3.9543(10)欧,环滑移=1.366欧)。

相关文献顶部

有关标题化合物的背景,请参见:Reddy等。(2010); 卡特里茨基等。(2007年)。有关剑桥结构数据库的详细信息,请参阅:Allen(2002)。

实验顶部

将氢氧化钠(344 mg,8.61 mmol)和硫酚(0.9 ml,8.61 mm ol)的混合物溶解在甲醇(22 ml)中约10分钟。向其中添加苯甲酰氯(1 ml)。将反应混合物搅拌过夜,然后倒入冰水中。然后过滤并干燥,以63%的产率得到白色晶体的标题化合物。

精炼顶部

所有氢原子都被定位在几何理想化的位置,C-H=0.95Å,并被允许骑在它们的母体原子上U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式.在细化的最后阶段,消除了不一致的反射(1 3 2)

结构描述顶部

Reddy先前描述了硫酚亚酯和苯甲酰氯在碱性介质中的反应等。, 2010. 我们已经重复了这种化合物的制备过程,以便在我们的一些研究中用作起始材料。硫代苯酚的苯甲酰化生成标题化合物的无色晶体(见图1),适用于单晶X射线分析,其结构如本文所述。标题化合物的分子在P(P)21/c(c)(Z轴=4)空间组。所有的键长都在其正常范围内(Allen,2002)。在晶体填料中有几个C-H··O/S/π相互作用(参见表1、图2)以及π-π观察到堆叠(质心到质心距离=3.9543(10)欧,环滑移=1.366欧)。

有关标题化合物的背景信息,请参见:Reddy等。(2010); 卡特里茨基等。(2007). 有关剑桥结构数据库的详细信息,请参阅:Allen(2002)。

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2011);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2008);数据缩减:圣保罗XPREP公司(布鲁克,2008);用于求解结构的程序:97新加坡元(阿尔托马雷等。, 1999); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:钻石(Brandenburg&Putz,2005);用于准备出版材料的软件:WinGX公司(Farrugia,1999年)。

数字顶部
[图1] 图1。(1)的视图。位移椭球是在50%的概率水平上绘制的。
[图2] 图2。显示C-H··O/S的包装图(1)/π互动以及π-π堆叠。
S公司-苯并硫代苯甲酸酯顶部
水晶数据 顶部
C类13H(H)10操作系统F类(000) = 448
M(M)第页= 214.27D类x个=1.373毫克
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ=1.54178Å
大厅符号:-P 2ybc6683次反射的单元参数
= 5.7203 (1) Åθ= 4.7–65.8°
b条=15.1315(3)ŵ=2.49毫米1
c(c)= 12.0606 (3) ÅT型=100 K
β= 96.867 (1)°矩形,无色
V(V)= 1036.44 (4) Å0.25×0.12×0.12毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
布鲁克APEX DUO 4K-CCD
衍射仪
1759个独立反射
辐射源:Incatec IµS微焦点X射线源1702次反射> 2σ()
Incatec Quazar多层镜单色仪整数= 0.022
探测器分辨率:8.4像素mm-1θ最大值= 66.4°,θ最小值= 4.7°
φω扫描小时=26
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2008年)
k个=1717
T型最小值= 0.575,T型最大值= 0.754=1413
9164次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.032氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.082受约束的氢原子参数
S公司= 1.04 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0364P(P))2+ 0.7558P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
1759次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
136个参数Δρ最大值=0.35埃
0个约束Δρ最小值=0.26埃
水晶数据 顶部
C类13H(H)10操作系统V(V)= 1036.44 (4) Å
M(M)第页= 214.27Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 5.7203 (1) ŵ=2.49毫米1
b条= 15.1315 (3) ÅT型=100 K
c(c)=12.0606(3)Å0.25×0.12×0.12毫米
β= 96.867 (1)°
数据收集 顶部
布鲁克APEX DUO 4K-CCD
衍射仪
1759独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2008年)
1702次反射> 2σ()
T型最小值= 0.575,T型最大值= 0.754整数= 0.022
9164次测量反射
精炼 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0320个约束
水风险(F类2) = 0.082受约束的氢原子参数
S公司= 1.04Δρ最大值=0.35埃
1759次反射Δρ最小值=0.26埃
136个参数
特殊细节 顶部

实验强度数据是在Bruker Apex DUO 4 K CCD衍射仪上采集的,曝光时间为5 s/帧。总共收集了2274个框架,框架宽度为1°,覆盖范围达θ=66.38°,完成96.3%。

分析数据:mp:53–55°C(Lit.54–55°C;Katritzky等。, 2007);1核磁共振氢谱(CDCl,400 MHz):d 8.03(d,J型=0.8 Hz,1H),8.01(d,J型=1.2 Hz,1H),7.62–7.58(m,1H,7.52–7.44(m,7H),13核磁共振(CDCl,400兆赫):d 190.1、136.6、135.1、133.6、129.5、129.2、128.7、127.5、127.3。

几何形状.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt).与选择反射进行细化无关。-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
S1(第一阶段)0.66521 (7)0.44609 (2)0.09450 (3)0.02499 (16)
O1公司1.05856 (19)0.36323 (7)0.17500 (9)0.0242 (3)
C1类0.9304 (3)0.42516 (10)0.18525 (12)0.0180 (3)
指挥与控制0.9751 (3)0.49420 (10)0.27395(12)0.0174 (3)
C3类1.1950 (3)0.49605 (10)0.33797 (13)0.0210(3)
H3级1.31060.45310.32620.025*
补体第四成份1.2443 (3)0.56059 (11)0.41871 (14)0.0237 (4)
H4型1.39430.56190.4620.028*
C5级1.0767 (3)0.62332 (11)0.43703 (13)0.0234 (3)
H5型1.11170.66730.49280.028*
C6级0.8580 (3)0.62174 (11)0.37383 (13)0.0239 (4)
H6型0.74290.66470.38630.029*
抄送70.8067 (3)0.55781 (11)0.29258 (13)0.0214 (3)
H7型0.65660.55710.24930.026美元*
抄送80.6486 (3)0.35922 (10)0.00504 (12)0.0182 (3)
C9级0.8130(3)0.35150 (10)0.08087 (13)0.0211 (3)
H9型0.94970.38770.07370.025*
C10号机组0.7749 (3)0.29047(11)0.16688 (13)0.0231 (4)
H10型0.88710.28430.21840.028*
C11号机组0.5735 (3)0.23835 (10)0.17811 (13)0.0221 (3)
H11型0.54720.19720.23780.027*
第12条0.4107 (3)0.24634 (10)0.10217 (13)0.0210 (3)
H12型0.27340.21050.10970.025*
第13页0.4483 (3)0.30674 (10)0.01499 (12)0.0192(3)
H13型0.33760.3120.03740.023*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
S1(第一阶段)0.0287(3)0.0191 (2)0.0243 (2)0.00622 (15)0.00893 (16)0.00571(15)
O1公司0.0236 (6)0.0242 (6)0.0242 (6)0.0056(5)0.0007 (4)0.0028 (5)
C1类0.0190 (7)0.0164 (7)0.0181 (8)0.0014 (6)0.0004 (6)0.0032 (6)
指挥与控制0.0203 (7)0.0174 (8)0.0146 (7)0.0018 (6)0.0027 (6)0.0027 (6)
C3类0.0211 (8)0.0189 (8)0.0224 (8)0.0007 (6)0.0002 (6)0.0032 (6)
补体第四成份0.0235 (8)0.0246 (8)0.0215 (8)0.0034 (6)0.0043(6)0.0024 (6)
C5级0.0298 (8)0.0226 (8)0.0174 (7)0.0044 (6)0.0015(6)0.0019 (6)
C6级0.0245 (8)0.0247 (8)0.0233 (8)0.0008 (6)0.0055 (6)0.0040 (7)
抄送70.0188 (8)0.0259 (9)0.0191 (8)0.0003 (6)0.0010(6)0.0019 (6)
抄送80.0223 (8)0.0148 (7)0.0161 (7)0.0031(6)0.0030 (6)0.0010 (6)
C9级0.0203 (8)0.0205 (8)0.0220 (8)0.0013 (6)0.0006 (6)0.0060 (6)
C10号机组0.0248 (8)0.0272 (9)0.0181 (8)0.0047 (6)0.0054 (6)0.0048 (6)
C11号机组0.0285(8)0.0196 (8)0.0171 (8)0.0045 (6)0.0021 (6)0.0021 (6)
第12条0.0195(7)0.0187 (8)0.0242 (8)0.0010 (6)0.0005 (6)0.0006(6)
第13页0.0202 (8)0.0191 (8)0.0184 (7)0.0030 (6)0.0024 (6)0.0010 (6)
几何参数(λ,º) 顶部
S1-C8号机组1.7751 (15)C6-H6型0.95
S1-C1号机组1.7894 (15)C7-H7型0.95
O1-C1型1.2054 (19)C8-C13号机组1.387 (2)
C1-C2类1.495 (2)C8-C9型1.393 (2)
C2-C3型1.395 (2)C9-C10型1.386 (2)
C2-C7型1.399 (2)C9-H90.95
C3-C4型1.384 (2)C10-C11号机组1.390 (2)
C3-H3型0.95C10-H10型0.95
C4-C5型1.385 (2)C11-C12号机组1.387 (2)
C4-H4型0.95C11-H11型0.95
C5至C61.385 (2)C12-C13型1.390 (2)
C5-H5型0.95C12-H12型0.95
C6至C71.383 (2)C13-H130.95
C8-S1-C1号机组104.81 (7)C6-C7-H7型119.9
O1-C1-C2型124.23 (13)C2-C7-H7型119.9
O1-C1-S1型123.81 (12)C13-C8-C9120.70 (14)
C2-C1-S1型111.96 (10)C13-C8-S1型117.35 (12)
C3-C2-C7型119.34 (14)C9-C8-S1型121.36 (12)
C3-C2-C1118.40 (13)C10-C9-C8号机组119.29 (14)
C7-C2-C1号机组122.24 (13)C10-C9-H9型120.4
C4-C3-C2型119.85 (15)C8-C9-H9型120.4
C4-C3-H3型120.1C9-C10-C11120.34 (14)
C2-C3-H3型120.1C9-C10-H10119.8
C3-C4-C5型120.60 (15)C11-C10-H10型119.8
C3-C4-H4型119.7C12-C11-C10120.02 (15)
C5-C4-H4119.7C12-C11-H11型120
C6-C5-C4119.80 (15)C10-C11-H11号机组120
C6-C5-H5型120.1C11-C12-C13型120.09 (14)
C4-C5-H5型120.1C11-C12-H12型120
C7-C6-C5型120.21 (15)C13-C12-H12型120
C7-C6-H6型119.9C8-C13-C12号机组119.54(14)
C5-C6-H6119.9C8-C13-H13型120.2
C6-C7-C2型120.20 (14)C12-C13-H13型120.2
C8-S1-C1-O10.46 (15)C3-C2-C7-C60.1 (2)
C8-S1-C1-C2型178.75 (10)C1-C2-C7-C6178.42 (14)
O1-C1-C2-C310.8 (2)C1-S1-C8-C13122.78 (12)
S1-C1-C2-C3型168.42 (11)C1-S1-C8-C966.00 (14)
O1-C1-C2-C7170.86 (15)C13-C8-C9-C100.1 (2)
S1-C1-C2-C7型9.93 (18)S1-C8-C9-C10型171.00 (11)
C7-C2-C3-C40.1 (2)C8-C9-C10-C11号机组0.8 (2)
C1-C2-C3-C4型178.26 (14)C9-C10-C11-C120.9 (2)
C2-C3-C4-C5型0.3 (2)C10-C11-C12-C130.3 (2)
C3-C4-C5-C6型0.2 (2)C9-C8-C13-C120.5 (2)
C4-C5-C6-C7型0.0 (2)S1-C8-C13-C12型170.75 (11)
C5-C6-C7-C2型0.2 (2)C11-C12-C13-C80.4 (2)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
Cg公司1和Cg公司2分别是C2–C7和C8–C13环的质心。
D类-H(H)···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C7-H7··S10.952.522.9592 (16)109
C13-H13···O10.952.563.4889 (18)167
C10-H10型···Cg公司1ii(ii)0.952.973.506 (2)117
C5-H5型···Cg公司20.952.733.5915 (19)152
对称代码:(i)x个1,,z(z); (ii)x个+2,+1,z(z); (iii)x个+2,+1/2,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C类13H(H)10操作系统
M(M)第页214.27
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)100
,b条,c(c)(Å)5.7203 (1), 15.1315 (3), 12.0606 (3)
β(°)96.867 (1)
V(V))1036.44 (4)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)2.49
晶体尺寸(mm)0.25 × 0.12 × 0.12
数据收集
衍射仪布吕克DUO 4K-CCD
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2008年)
T型最小值,T型最大值0.575, 0.754
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
9164, 1759, 1702
整数0.022
(罪θ/λ)最大值1)0.594
精炼
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.032, 0.082, 1.04
反射次数1759
参数数量136
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.35,0.26

计算机程序:4月2日(Bruker,2011),圣保罗(布鲁克,2008),圣保罗XPREP公司(布鲁克,2008),97新加坡元(阿尔托马雷等。, 1999),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),钻石(Brandenburg和Putz,2005),WinGX公司(Farrugia,1999年)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
Cg公司1和Cg公司2分别是C2–C7和C8–C13环的质心。
D类-H(H)···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C7-H7··S10.952.522.9592 (16)108.6
C13-H13···O10.952.563.4889 (18)167.2
C10-H10··Cg1ii(ii)0.952.973.506 (2)117
C5-H5··Cg20.952.733.5915 (19)152
对称代码:(i)x个1,,z(z); (ii)x个+2,+1,z(z); (iii)x个+2,+1/2,z(z)+1/2.
 

致谢

感谢约翰内斯堡大学和合成与催化研究中心的研究资金。感谢Z.H.Phasha女士收集数据。

工具书类

第一次引用Allen,F.H.(2002)。《水晶学报》。B类58, 380–388. 科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Altomare,A.,Burla,M.C.,Camalli,M.,Cascarano,G.L.,Giacovazzo,C.,Guagliardi,A.,Moliterni,A.G.G.,Polidori,G.&Spagna,R.(1999)。J.应用。克里斯特。 32, 115–119. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Brandenburg,K.和Putz,H.(2005)。钻石Crystal Impact GbR,德国波恩。 谷歌学者
第一次引用布鲁克(2008)。SADABS公司,圣保罗XPREP公司.BrukerAXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用布鲁克(2011)。4月2日.BrukerAXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Farrugia,L.J.(1999)。J.应用。克里斯特。 32,837–838页交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Katritzky,A.R.、Shestopalov,A.A.和Suzuki,K.(2007年)。合成,11, 1806–1813. 谷歌学者
第一次引用Reddy,M.V.R.、Pallela,V.R..、Cosenza,S.C.、Mallireddigari,M.R.,Patti,R.、Bonagura,M.、Truongcao,M.,Akula,B.、Jatiani,S.S.和Reddy,E.P.(2010)。生物有机医药化学。 18,第6期,2317–2326谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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