金属有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

{4,4′,6,6′-四碘-2,2′-[(2,2-二甲基丙烷-1,3-二基)双(腈-甲酰基亚基)]二烯醇}镍(II)

伊朗首都德黑兰Payame Noor大学化学系,邮政信箱19395-3697,b条伊朗德黑兰伊斯兰阿扎德大学化学、科学与研究系,c(c)(生物)化学系统的结构动力学,马克斯·普朗克生物物理化学研究所,Am Fassberg 11,37077,德国哥廷根d日巴基斯坦旁遮普省萨戈达大学物理系
*通信电子邮件:h.kargar@pnu.ac.ir,dmntahir_uos@yahoo.com

(收到日期:2012年5月29日; 2012年5月31日接受; 2012年6月16日在线)

这个非对称单元标题化合物[Ni(C19H(H)164N个2O(运行)2)]由一半希夫碱复合物组成。原子位于一个双重旋转轴上,该轴也与配体的2,2-二甲基丙烷基团的中心C原子相连接。镍周围的几何形状原子是扭曲的方形平面,对称相关的N/Ni/O配位面之间的二面角为21.7(3)°。对称相关苯环之间的二面角为27.9(3)°。在晶体中,存在短分子间I…I[3.8178(9)和3.9013(10)Ye]相互作用。

相关文献

适用于希夫碱在配位化学中,参见:Granovski等。(1993【Granovski,A.D.、Nivorozkin,A.L.和Minkin,V.I.(1993)。化学协调修订版126,1-69。】); 鼓风机等。(1998【Blower,P.J.(1998),《过渡金属化学》23,109-112。】). 关于我们小组研究的相关结构,请参见:Kargar等。(2012【Kargar,H.、Kia,R.、Abbasian,S.和Tahir,M.N.(2012a)。晶体学报E68,m193。】,b条【Kargar,H.、Kia,R.、Sharafi,Z.和Tahir,M.N.(2012b),《水晶学报》E68,m82。】,c(c)【Kargar,H.,Kia,R.,Shakarami,T.&Tahir,M.N.(2012c),《结晶学报》E68,o564。】). 有关标准粘结长度,请参见:艾伦等。(1987【Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987)。《化学与社会杂志》珀金分卷2,第S1-19页。】). 范德瓦尔斯半径见:邦迪(1964)【Bondi,A.(1964),《物理化学杂志》,第68期,第441-452页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [镍(C19H(H)164N个2O(运行)2)]

  • M(M)第页= 870.65

  • 正交各向异性,P(P) b条 c(c) n个

  • = 16.682 (2) Å

  • b条= 15.9978 (19) Å

  • c(c)= 8.7920 (9) Å

  • V(V)= 2346.4 (5) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=6.11毫米−1

  • T型=291千

  • 0.21×0.15×0.11毫米

数据收集
  • Bruker SMART APEXII CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 布鲁克,2005年[Bruker(2005)。APEX2,SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.360,T型最大值= 0.553

  • 10345次测量反射

  • 2582次独立反射

  • 1615次反射> 2σ()

  • 整数= 0.078

精炼
  • [F类2> 2σ(F类2)] = 0.043

  • 水风险(F类2) = 0.096

  • S公司= 0.96

  • 2582次反射

  • 129个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=1.07埃−3

  • Δρ最小值=-0.73埃−3

数据收集:4月2日(布鲁克,2005年[Bruker(2005)。APEX2,SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2005年[Bruker(2005)。APEX2,SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔柏拉图式的(斯佩克,2009年[Spek,A.L.(2009),《结晶学报》,D65148-155。]).

支持信息


注释顶部

希夫碱配合物是过渡金属配位化学中最重要的立体化学模型之一,易于制备和结构变化(格拉诺夫斯基等。, 1993; 鼓风机等。, (1998). 在继续我们关于晶体结构希夫碱金属络合物(Kargar等。, 2012,b条),我们在此报告晶体结构标题化合物的Schiff碱配体6,6'-(((2,2-二甲基丙烷-1,3-二基)双(氮杂亚基))双(亚甲酰基))二(2,4-二碘苯酚)的镍(II)络合物。我们已经报道了这种配体的两性离子形式的结构(卡加等。, 2012c(c)).

这个非对称单元标题化合物的图1包含一半希夫碱络合物。原子位于2倍旋转轴上,该轴也将配体中2,2-二甲基丙烷基团的中心C原子C9一分为二。键长(艾伦等。和角度在正常范围内,与配体(卡加等。, 2012c(c))和相关结构(Kargar等。, 2012,b条). 原子Ni1周围的几何结构是扭曲的方形平面,由N支撑2O(运行)2配位希夫碱配体的供体原子。苯环(C1-C6和C1)之间的二面角-C6级; 对称码:(i)-x+1,y,-z+1/2)为27.9(3)°,而与对称相关的配位面N1,Ni1,O1和N1之间的对称码,镍1,O1为21.7(3)°。

在晶体中,短分子间I1··I2[3.8178(9)Ω;对称码:(i)-x+3/2,-y-1/2,z+1/2]和I2··I2ii(ii)[3.9013(10)Ω;对称码:(ii)-x+2,y,-z-1/2]存在相互作用(图2)。这些相互作用比I原子的范德瓦尔斯半径之和还要短[3.96 Au;Bondi,1964]。

相关文献顶部

适用于希夫碱在配位化学中,参见:Granovski等。(1993); 鼓风机等。(1998). 关于我们小组研究的相关结构,请参见:Kargar等。(2012,b条,c(c)). 有关标准粘结长度,请参见:艾伦等。(1987). 范德瓦尔斯半径见:邦迪(1964)。

实验顶部

通过向NiCl溶液中添加2mmol 6,6'-(((2,2-二甲基丙烷-1,3-二基)双(氮杂亚基))双(甲亚基)二(2,4-二碘苯酚)合成标题化合物2.6小时2乙醇(30 ml)中的O(2.1 mmol)。将混合物在搅拌下回流30分钟。过滤所得溶液。标题化合物的深红色块状晶体,适用于X(X)-射线结构分析,通过在室温下缓慢蒸发溶剂数天,从乙醇中再结晶。

精炼顶部

氢原子被包括在计算位置,并被视为骑原子:对于CH、CH,C-H=0.93、0.96和0.97和CH2H原子分别与U原子国际标准化组织(H) =k x U等式(C) ,其中对于CH,k=1.5H原子,其他H原子=1.2。

结构描述顶部

希夫碱配合物是过渡金属配位化学中最重要的立体化学模型之一,具有易于制备和结构变化的特点(Granovski等。, 1993; 鼓风机等。, (1998). 在继续我们关于晶体结构希夫碱金属配合物(卡加等。, 2012,b条),我们在此报告晶体结构标题化合物的Schiff碱配体6,6'-(((2,2-二甲基丙烷-1,3-二基)双(氮杂亚基))双(亚甲酰基))二(2,4-二碘苯酚)的镍(II)络合物。我们已经报道了这种配体的两性离子形式的结构(卡加等。, 2012c(c)).

这个非对称单元标题化合物的图1包含一半希夫碱络合物。原子位于2倍旋转轴上,该轴也将配体中2,2-二甲基丙烷基团的中心C原子C9一分为二。键长(艾伦等。和角度在正常范围内,与配体(卡加等。, 2012c(c))和相关结构(Kargar等。, 2012,b条). 原子Ni1周围的几何结构是扭曲的方形平面,由N支撑2O(运行)2配位希夫碱配体的供体原子。苯环(C1-C6和C1)之间的二面角-C6级; 对称码:(i)-x+1,y,-z+1/2)为27.9(3)°,而与对称相关的配位面N1,Ni1,O1和N1之间的对称码,镍1,O1为21.7(3)°。

在晶体中,短分子间I1··I2[3.8178(9)Ω;对称码:(i)-x+3/2,-y-1/2,z+1/2]和I2··I2ii(ii)[3.9013(10)Å;对称码:(ii)-x+2,y,-z-1/2]存在相互作用(图2)。这些相互作用比I原子的范德瓦尔斯半径之和还要短[3.96 Au;Bondi,1964]。

适用于希夫碱在配位化学中,参见:Granovski等。(1993); 鼓风机等。(1998). 关于我们小组研究的相关结构,请参见:Kargar等。(2012,b条,c(c)). 有关标准粘结长度,请参见:艾伦等。(1987). 范德瓦尔斯半径见:邦迪(1964)。

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2005);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2005);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2005);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:谢尔克斯特尔(Sheldrick,2008)';用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(Sheldrick,2008)和柏拉图式的(斯佩克,2009)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构视图,显示40%概率位移椭球体和原子编号[后缀A:-x+1,y,-z+1/2]。
[图2] 图2。标题化合物晶体堆积的c轴视图,显示分子间I··I相互作用(虚线)。
{4,4',6,6'-四碘-2,2'-[(2,2-二甲基丙烷-1,3-二基)双(亚硝化甲基亚基)]二烯醇}镍(II)顶部
水晶数据 顶部
[镍(C19H(H)164N个2O(运行)2)]F类(000) = 1600
M(M)第页= 870.65D类x个=2.465毫克
正交各向异性,P(P)b条c(c)n个K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2n 2ab2540次反射的细胞参数
= 16.682 (2) Åθ= 2.5–27.4°
b条= 15.9978 (19) ŵ=6.11毫米1
c(c)= 8.7920 (9) ÅT型=291千
V(V)= 2346.4 (5) Å块,深色
Z轴= 40.21×0.15×0.11毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART APEXII CCD区域探测器
衍射仪
2582次独立反射
辐射源:细焦点密封管1615次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.078
φω扫描θ最大值= 27.1°,θ最小值= 1.8°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2005年)
小时=2121
T型最小值= 0.360,T型最大值= 0.553k个=2018
10345次测量反射=119
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.043氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.096受约束的氢原子参数
S公司= 0.96 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0314P(P))2]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
2582次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
129个参数Δρ最大值=1.07埃
0个约束Δρ最小值=0.73埃
水晶数据 顶部
[镍(C19H(H)164N个2O(运行)2)]V(V)= 2346.4 (5) Å
M(M)第页= 870.65Z轴= 4
正交各向异性,P(P)b条c(c)n个K(K)α辐射
= 16.682 (2) ŵ=6.11毫米1
b条= 15.9978 (19) ÅT型=291千
c(c)= 8.7920 (9) Å0.21×0.15×0.11毫米
数据收集 顶部
Bruker SMART APEXII CCD区域探测器
衍射仪
2582次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2005年)
1615次反射> 2σ()
T型最小值= 0.360,T型最大值= 0.553整数= 0.078
10345次测量反射
精炼 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0430个约束
水风险(F类2) = 0.096受约束的氢原子参数
S公司= 0.96Δρ最大值=1.07埃
2582次反射Δρ最小值=0.73埃
129个参数
特殊细节 顶部

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼F的细化2对抗所有反射。加权R系数wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.6358 (4)0.0602 (4)0.1174 (7)0.0299 (16)
指挥与控制0.6886 (4)0.1295 (4)0.1037 (7)0.0362 (17)
C3类0.7615 (4)0.1247 (5)0.0316 (7)0.0397 (18)
H3级0.79380.17190.02520.048*
补体第四成份0.7876 (5)0.0496 (4)0.0323 (8)0.0416 (18)
C5级0.7398 (5)0.0202 (5)0.0212 (8)0.0445 (19)
H5型0.75690.07060.06290.053*
C6级0.6647 (4)0.0157 (4)0.0534 (7)0.0319 (16)
抄送70.6152 (4)0.0890 (4)0.0576 (7)0.0356 (17)
H7型0.63200.13420.00090.043*
抄送80.5034 (5)0.1751 (4)0.1100 (7)0.0389 (17)
H8A型0.44930.15980.08130.047*
H8B型0.52650.20660.02650.047*
C9级0.50000.2309 (5)0.25000.038 (2)
C10号机组0.4250 (5)0.2865 (5)0.2380 (10)0.062 (2)
H10A型0.37780.25220.24120.093*
H10B型0.42630.31680.14380.093*
H10C型0.42400.32520.32140.093*
I1类0.65256 (3)0.24569 (3)0.19386 (5)0.04569 (18)
I2类0.89983 (4)0.04176 (4)0.13554 (7)0.0658 (2)
镍10.50000.01657 (7)0.25000.0310 (3)
N1型0.5506 (3)0.0986 (3)0.1332 (6)0.0339 (13)
O1公司0.5668 (3)0.0689 (3)0.1835 (5)0.0363 (11)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.031 (4)0.027 (4)0.032 (4)0.006 (3)0.002 (3)0.000 (3)
指挥与控制0.041 (4)0.028 (4)0.039 (4)0.007 (4)0.002 (3)0.002 (3)
C3类0.042 (5)0.035 (4)0.042 (4)0.009 (4)0.008 (4)0.006 (3)
补体第四成份0.044 (5)0.032 (4)0.049 (4)0.003 (4)0.006 (4)0.005 (3)
C5级0.053 (5)0.042 (5)0.039 (4)0.006 (4)0.005 (4)0.001 (3)
C6级0.035 (4)0.023 (4)0.038 (4)0.002 (3)0.001 (3)0.007 (3)
抄送70.043 (5)0.023 (4)0.041 (4)0.002 (4)0.004 (4)0.007 (3)
抄送80.046 (5)0.026 (4)0.045 (4)0.005 (4)0.000 (4)0.006 (3)
C9级0.054 (7)0.012 (5)0.049 (6)00.006 (5)0
C10号机组0.068 (6)0.053 (5)0.066 (5)0.019 (5)0.009 (5)0.004 (4)
I1类0.0588 (4)0.0285 (3)0.0498 (3)0.0072 (3)0.0027 (3)0.0056 (2)
I2类0.0448 (4)0.0558 (4)0.0967 (5)0.0031 (3)0.0273 (3)0.0059 (3)
镍10.0323 (7)0.0229 (7)0.0378 (7)00.0032 (6)0
N1型0.038 (4)0.021 (3)0.043 (3)0.008 (3)0.005 (3)0.001 (2)
O1公司0.035 (3)0.025 (2)0.049 (3)0.005 (2)0.013 (2)0.002 (2)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-O1型1.297 (8)C8-N1型1.469 (8)
C1-C2类1.422 (9)C8-C9型1.521 (8)
C1-C6号机组1.423 (8)C8-H8A型0.9700
C2-C3型1.374 (9)C8-H8B型0.9700
C2-I1型2.108 (7)C9-C81.521 (8)
C3至C41.396 (9)C9-C10型1.540 (9)
C3至H30.9300C9-C10型1.540 (9)
C4-C5型1.376 (10)C10-H10A型0.9600
C4-I2型2.085 (8)C10-H10B型0.9600
C5至C61.417 (10)C10-H10摄氏度0.9600
C5-H5型0.9300镍-O11.858 (4)
C6至C71.434 (9)镍-O11.858 (4)
C7-N1型1.275 (8)Ni1-N1型1.868 (5)
C7-H7型0.9300Ni1-N1型1.868 (5)
O1-C1-C2型120.3 (6)C9-C8-H8B108.9
O1-C1-C6型124.7 (6)H8A-C8-H8B107.7
C2-C1-C6型115.0 (6)抄送8-C9-C8108.2 (7)
C3-C2-C1123.0 (6)抄送8-C9-C10型108.3 (4)
C3-C2-I1型118.4 (5)C8-C9-C10型111.3 (4)
C1-C2-I1型118.6 (5)抄送8-C9-C10型111.3 (4)
C2-C3-C4型120.7 (7)C8-C9-C10型108.3 (4)
C2-C3-H3型119.7C10号机组-C9-C10型109.4 (9)
C4-C3-H3型119.7C9-C10-H10A109.5
C5-C4-C3119.4 (7)C9-C10-H10B109.5
C5-C4-I2型120.2 (5)H10A-C10-H10B型109.5
C3-C4-I2型120.4 (5)C9-C10-H10C109.5
C4-C5-C6120.3 (7)H10A-C10-H10C型109.5
C4-C5-H5型119.9H10B-C10-H10C型109.5
C6-C5-H5型119.9O1公司-镍-O185.2 (3)
C5-C6-C1型121.8 (6)O1公司-镍1-N1163.9 (2)
C5-C6-C7118.6 (6)O1-Ni1-N1型94.2 (2)
C1-C6-C7型119.5 (6)O1公司-镍1-N194.2 (2)
N1-C7-C6126.7 (6)O1-Ni1-N1型163.9 (2)
N1-C7-H7型116.6N1-Ni1-N1型90.7 (3)
C6-C7-H7型116.6C7-N1-C8型118.7 (6)
N1-C8-C9型113.3 (5)C7-N1-Ni1125.7 (5)
N1-C8-H8A型108.9C8-N1-Ni1型114.8 (4)
C9-C8-H8A108.9C1-O1-Ni1型126.5 (4)
N1-C8-H8B型108.9
O1-C1-C2-C3178.3 (6)N1-C8-C9-C836.1 (4)
C6-C1-C2-C31.2 (10)N1-C8-C9-C1082.8 (7)
O1-C1-C2-I1型0.4 (8)N1-C8-C9-C10157.0 (6)
C6-C1-C2-I1179.9 (5)C6-C7-N1-C8173.4 (6)
C1-C2-C3-C4型0.3 (11)C6-C7-N1-Ni14.0 (10)
I1-C2-C3-C4178.9 (5)C9-C8-N1-C7114.5 (7)
C2-C3-C4-C5型0.6 (11)C9-C8-N1-Ni175.0 (6)
C2-C3-C4-I2型178.1 (5)O1公司-镍-N1-C795.4 (9)
C3-C4-C5-C6型0.4 (11)O1-Ni1-N1-C78.0 (6)
I2-C4-C5-C6177.9 (5)N1型-镍1-N1-C7156.7 (7)
C4-C5-C6-C1型0.7 (11)O1公司-镍-N1-C874.4 (9)
C4-C5-C6-C7型177.7 (6)O1-Ni1-N1-C8161.7 (4)
O1-C1-C6-C5178.1 (6)N1型-镍-N1-C833.6 (3)
C2-C1-C6-C5型1.4 (9)C2-C1-O1-Ni1型165.6 (5)
O1-C1-C6-C71.1 (10)C6-C1-O1-Ni114.9 (9)
C2-C1-C6-C7型178.4 (6)O1公司-镍-O1-C1178.8 (6)
C5-C6-C7-N1171.8 (7)N1-Ni1-O1-C117.2 (6)
C1-C6-C7-N1型11.1 (11)N1型-镍-O1-C190.2 (9)
对称代码:(i)x个+1,,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方[镍(C19H(H)164N个2O(运行)2)]
M(M)第页870.65
晶体系统,空间组正交各向异性,P(P)b条c(c)n个
温度(K)291
,b条,c(c)(Å)16.682 (2), 15.9978 (19), 8.7920 (9)
V(V))2346.4 (5)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)6.11
晶体尺寸(mm)0.21 × 0.15 × 0.11
数据收集
衍射仪布吕克智能APEXII CCD区域探测器
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2005年)
T型最小值,T型最大值0.360, 0.553
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
10345, 2582, 1615
整数0.078
(罪θ/λ)最大值1)0.640
精炼
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.043, 0.096, 0.96
反射次数2582
参数数量129
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))1.07,0.73

计算机程序:4月2日(布鲁克,2005),圣保罗(布鲁克,2005),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),谢尔克斯特尔(Sheldrick,2008)',谢尔克斯特尔(Sheldrick,2008)和柏拉图式的(斯佩克,2009)。

 

致谢

香港和TS感谢PNU的财政支持。MNT感谢巴基斯坦萨戈达GC大学的研究设施。

工具书类

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第一次引用Kargar,H.、Kia,R.、Abbasian,S.和Tahir,M.N.(2012年)).《水晶学报》。E类68,m193科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
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第一次引用Kargar,H.、Kia,R.、Sharafi,Z.和Tahir,M.N.(2012年)b条).《水晶学报》。E类68,m82科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
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