金属有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

四水双[5-(吡啶-3-基)四唑烷-κN个5]四水合锰

上海大学理学院化学系,上海,200444,中华人民共和国b条上海大学微结构实验室,上海200444,中华人民共和国
*通信电子邮件:mx_li@mail.shu.edu.cn

(收到日期:2012年5月27日; 2012年6月1日接受; 2012年6月13日在线)

标题化合物[Mn(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4]·4小时2O、 通过MnCl溶液反应得到2和3-(2H(H)-四唑-5-基)吡啶。Mn公司原子位于反转中心,显示出略微扭曲的八面体几何结构,由来自两个5-(吡啶-3-基)四唑啉配体的两个吡啶N原子配位反式位置和四个水分子。在晶体中,单核复合物分子和溶剂水分子通过O-H…N和O-H…O氢键连接成三维框架。

相关文献

对于合成和晶体结构同型锌(II)络合物[Zn(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4]·4小时2O、 参见:Mu等。(2010[Mu,Y.-Q.,Zhao,J.&Li,C.(2010).《晶体学报》E66,m1667.]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [锰(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4]·4小时2O(运行)

  • M(M)第页= 491.35

  • 三联诊所,[P\上一行]

  • = 8.137 (8) Å

  • b条= 8.629 (8) Å

  • c(c)= 8.761 (8) Å

  • α= 84.878 (10)°

  • β= 65.347 (8)°

  • γ= 72.571 (10)°

  • V(V)= 533.0 (9) Å

  • Z轴= 1

  • K(K)α辐射

  • μ=0.68毫米−1

  • T型=293千

  • 0.15×0.10×0.10毫米

数据收集
  • 布鲁克APEXII CCD衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; Sheldrick,2007年[Sheldrick,G.M.(2007)。SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.922,T型最大值= 0.934

  • 2785次测量反射

  • 1850次独立反射

  • 1712次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.026

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.032

  • 水风险(F类2) = 0.080

  • S公司= 1.05

  • 1850次反射

  • 143个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.23埃−3

  • Δρ最小值=-0.32埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
O1-H1型B类●O4 0.85 1.94 2.783 (3) 172
O1-H1型A类●N5ii(ii) 0.85 1.91 2.731 (3) 163
氧气-氢气A类●臭氧 0.85 1.99 2.836 (3) 171
氧气-氢气B类●臭氧iv(四) 0.85 1.96 2.800 (3) 169
臭氧层-3B类●O4 0.85 1.96 2.803 (3) 171
臭氧层-3A类·N2 0.85 1.96 2.797 (3) 170
O4-H4型B类●N3v(v) 0.85 2.03 2.878 (3) 177
O4-H4型A类●N4不及物动词 0.85 2 2.849 (3) 176
对称代码:(i)x个,+1,z(z); (ii)-x个+1, -+2, -z(z); (iii)x个+1,,z(z); (iv)-x个+1, -+2, -z(z)+1; (五)-x个, -+1, -z(z)+1; (vi)x个,,z(z)+1.

数据收集:4月2日(布鲁克,2000年[Bruker(2000),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2000年[Bruker(2000),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.

支持信息


注释顶部

3-(2H(H)-四唑-5-基吡啶(3-Ptz)是一种具有五个潜在配位氮原子的多功能配体。最近Mu等。(2010)报告了Zn(OAc)的水热反应2用3-Ptz生成单核锌络合物[Zn(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4].4小时2O.我们能够制备类似物锰(II)化合物[Mn(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4].4小时2O、 通过MnCl的溶液反应2基本H中有3-Ptz2O/乙醇溶液。该化合物与Mu报道的锌络合物紧密同构等。(2010)

相关文献顶部

对于合成和晶体结构同种型锌(II)配合物[Zn(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4].4小时2O、 参见:Mu等。(2010).

实验顶部

MnCl混合物2(0.1毫摩尔),3-Ptz(0.1毫摩尔),1毫升NaOH溶液(0.1摩尔L(左)-1)加入10 ml H2O/乙醇混合溶剂(1:1)。搅拌20分钟后,混合物被过滤。滤液静置两天,得到黄色块状晶体,基于3-Ptz,产率为35%。分析。C的calcd12H(H)24锰(MnN)10O(运行)8(%):C,29.33;H、 4.92条;N、 28.51页。发现:C,29.24;H、 4.83;N、 28.66。IR(KBr颗粒,cm-1): 3400, 1613, 1588, 1464公元1426年、1372年、1153、1019、787、750、696、642, 463.

精炼顶部

所有H原子均以几何方式定位(C-H=0.93 Au,O-H=0.85 Au),并允许骑在其母原子上U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) 或1.5Ueq(O)。

结构描述顶部

这个非对称单元标题化合物由一个单核[Mn(C6H4N5)2(H2O)4]单元和四个晶格水分子组成(图1)。Mn(II)原子位于反转中心,由两个吡啶基团和四个H2O分子以反八面体几何构型六配位。两个3-Ptz配体在轴向位置与Mn(II)配位,Mn–N键长为2.290º。四个配位水分子占据赤道面,平均Mn-O键长为2.178º。O(1)#1-Mn(1)-N(1),O(2)#1-Mn(1)-N(1),O(1)-Mn(1)-O(2)的键角分别为84.98(7)°,92.50(6)°,91.41(7)°。3-(2H-四唑-5-基)吡啶脱质子。吡啶环和四唑基基本共面,二面角为9.72(7)°。如图2所示,通过连接四唑基团、配位和晶格水分子的氢键相互作用,单核配合物进一步扩展为三维超分子网络

图1

图2

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2000年);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2000年);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2000年);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题复合体的不对称单位。位移椭球是在30%的概率水平上绘制的。[对称代码:(A)-x个, -, -z(z)].
[图2] 图2。具有氢键的标题化合物的晶体堆积图如虚线所示。为了清楚起见,省略了与氢键无关的氢原子。
四水双[5-(吡啶-3-基)四氮唑-κN个5]四水合锰顶部
水晶数据 顶部
[锰(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4]·4小时2O(运行)Z轴= 1
M(M)第页= 491.35F类(000) = 255
三联诊所,P(P)1D类x个=1.531毫克米
大厅符号:-P 1K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 8.137 (8) Å1565次反射的单元参数
b条= 8.629 (8) Åθ= 2.5–27.3°
c(c)= 8.761 (8) ŵ=0.68毫米1
α= 84.878 (10)°T型=293千
β= 65.347 (8)°块,黄色
γ= 72.571 (10)°0.15×0.10×0.10毫米
V(V)= 533.0 (9) Å
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
1850次独立反射
辐射源:细焦点密封管1712次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.026
φ和ω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 2.5°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,2007年)
小时=79
T型最小值= 0.922,T型最大值= 0.934k个=610
2785次测量反射=1010
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.032受约束的氢原子参数
水风险(F类2) = 0.080 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0343P(P))2+ 0.2064P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.05(Δ/σ)最大值< 0.001
1850次反射Δρ最大值=0.23埃
143个参数Δρ最小值=0.32埃
0个约束消光校正:SHELXL公司,Fc(预测值)*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.063(6)
水晶数据 顶部
[锰(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4]·4小时2O(运行)γ= 72.571 (10)°
M(M)第页= 491.35V(V)= 533.0 (9) Å
三联诊所,P(P)1Z轴= 1
= 8.137 (8) ÅK(K)α辐射
b条= 8.629 (8) ŵ=0.68毫米1
c(c)= 8.761 (8) ÅT型=293千
α= 84.878 (10)°0.15×0.10×0.10毫米
β= 65.347 (8)°
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
1850次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,2007年)
1712次反射> 2σ()
T型最小值= 0.922,T型最大值= 0.934R(右)整数= 0.026
2785次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0320个约束
水风险(F类2) = 0.080受约束的氢原子参数
S公司= 1.05Δρ最大值=0.23埃
1850次反射Δρ最小值=0.32埃
143个参数
特殊细节 顶部

几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)都是使用全协方差矩阵估计的。在估计距离、角度和扭转角中的e.s.d.时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险以及贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类,以及R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.4972 (3)0.8406 (3)0.1955 (2)0.0309 (5)
上半年0.38630.83300.28440.037*
指挥与控制0.5378 (3)0.7784 (2)0.0396 (2)0.0250 (4)
C3类0.7038 (3)0.7881 (3)0.0919 (2)0.0312 (4)
H3级0.73690.74850.19930.037*
补体第四成份0.8196 (3)0.8579 (3)0.0606 (3)0.0367 (5)
H4型0.93260.86470.14680.044*
C5级0.7665 (3)0.9175 (2)0.0990 (3)0.0313 (4)
H5型0.84570.96430.11800.038*
C6级0.4027 (3)0.7086 (2)0.0214 (2)0.0253 (4)
锰10.500010.50000.02565 (17)
N1型0.6059 (2)0.9108 (2)0.22757 (19)0.0291 (4)
氮气0.2536 (2)0.6822 (2)0.1516 (2)0.0316 (4)
N3号机组0.1654 (2)0.6214 (2)0.0825 (2)0.0345 (4)
4号机组0.2572 (2)0.6120 (2)0.0813 (2)0.0335 (4)
5号机组0.4088 (2)0.6669 (2)0.12397 (19)0.0293 (4)
O1公司0.4248 (2)1.25174 (18)0.44974 (18)0.0465 (4)
H1B型0.34861.32880.52130.056*
甲型H1A0.45871.29500.35480.056*
氧气0.79389 (19)0.99831 (18)0.44105 (18)0.0364 (4)
过氧化氢0.87300.91730.45890.044*
过氧化氢0.82291.08200.45260.044*
臭氧0.0823 (2)0.75323 (18)0.49811 (18)0.0372 (4)
H3B型0.09420.66960.55620.045*
H3A型0.13460.71960.39580.045*
O4号机组0.1519 (2)0.48719 (18)0.69383 (17)0.0359 (4)
H4B型0.06080.45190.75980.043*
H4A型0.18550.52710.75750.043*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0302 (10)0.0403 (11)0.0217 (10)0.0155 (9)0.0058 (8)0.0023 (8)
指挥与控制0.0279 (10)0.0230 (9)0.0239 (10)0.0064 (8)0.0108 (8)0.0002 (7)
C3类0.0317 (10)0.0378 (11)0.0216 (10)0.0100 (9)0.0071 (8)0.0061 (8)
补体第四成份0.0286 (10)0.0506 (13)0.0277 (11)0.0162 (10)0.0043 (8)0.0034 (9)
C5级0.0277 (10)0.0374 (11)0.0320 (11)0.0116 (8)0.0134 (8)0.0010 (9)
C6级0.0292 (10)0.0226 (9)0.0234 (10)0.0065 (8)0.0104 (8)0.0011 (7)
锰10.0264 (2)0.0299 (3)0.0210 (2)0.00911 (17)0.00862 (17)0.00332 (16)
N1型0.0311 (9)0.0351 (9)0.0230 (8)0.0125 (7)0.0105 (7)0.0017 (7)
氮气0.0307 (9)0.0386 (10)0.0264 (9)0.0142 (7)0.0091 (7)0.0018 (7)
N3号机组0.0341 (9)0.0405 (10)0.0320 (9)0.0165 (8)0.0122 (7)0.0018 (8)
4号机组0.0370 (9)0.0370 (10)0.0314 (9)0.0153 (8)0.0152 (8)0.0008 (7)
5号机组0.0348 (9)0.0320 (9)0.0237 (9)0.0141 (7)0.0109 (7)0.0014 (7)
O1公司0.0623 (10)0.0321 (8)0.0252 (8)0.0059 (7)0.0044 (7)0.0003 (6)
氧气0.0302 (7)0.0385 (8)0.0429 (9)0.0084 (6)0.0166 (6)0.0071 (6)
臭氧0.0407 (8)0.0377 (8)0.0292 (8)0.0113 (7)0.0100 (6)0.0011 (6)
O4号机组0.0401 (8)0.0413 (8)0.0273 (8)0.0177 (7)0.0094 (6)0.0044 (6)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-N1型1.337 (3)二氧化锰2.222 (3)
C1-C2类1.382 (3)二氧化锰2.222 (3)
C1-H1型0.9300锰1-N12.290 (3)
C2-C3型1.383 (3)锰1-N12.290 (3)
C2-C6型1.468 (3)N2-N3气体1.342 (2)
C3至C41.382 (3)N3-N4号机组1.309 (3)
C3至H30.9300编号4-N51.349 (3)
C4-C5型1.377 (3)O1至H1B0.8500
C4-H4型0.9300O1-H1A型0.8500
C5-N1型1.336 (3)氧气-H2A0.8500
C5-H5型0.9300O2-2b小时0.8501
C6-N5型1.331 (3)臭氧-H3B0.8500
C6-N2型1.338 (3)臭氧-H3A0.8501
锰氧化物2.132 (2)O4-H4B型0.8500
锰1-O12.132 (2)O4-H4A型0.8501
N1-C1-C2型124.70 (17)O1-Mn1-N1型95.02 (7)
N1-C1-H1117.6O1公司-锰1-N184.98 (7)
C2-C1-H1型117.6氧气-锰1-N192.50 (6)
C1-C2-C3117.48 (18)O2-Mn1-N1型87.50 (6)
C1-C2-C6型118.90 (17)O1-Mn1-N1型84.98 (7)
C3-C2-C6123.61 (18)O1公司-锰1-N195.02 (7)
C4-C3-C2型118.66 (19)氧气-锰1-N187.50 (5)
C4-C3-H3型120.7O2-Mn1-N1型92.50 (6)
C2-C3-H3型120.7N1-Mn1-N1型179.999 (1)
C5-C4-C3119.62 (19)C5-N1-C1116.74 (18)
C5-C4-H4120.2C5-N1-Mn1127.06 (13)
C3-C4-H4型120.2C1-N1-Mn1型116.17 (13)
N1-C5-C4122.78 (19)C6-N2-N3型104.94 (17)
N1-C5-H5型118.6N4-N3-N2109.54 (17)
C4-C5-H5型118.6N3-N4-N5型109.28 (15)
N5-C6-N2型111.27 (17)C6-N5-N4型104.97 (15)
编号5-C6-C2125.30 (17)锰-O1-H1B126.3
N2-C6-C2型123.42 (17)锰-O1-H1A127.6
O1-Mn1-O1型180H1B-O1-H1A型106.1
O1-Mn1-O288.59 (7)Mn1-O2-H2A122.5
O1公司-二氧化锰91.41 (7)Mn1-O2-H2B123.2
O1-Mn1-O291.41 (7)H2A-O2-H2B106.1
O1公司-二氧化锰88.59 (7)H3B-O3-H3A型106.7
氧气-二氧化锰180.000 (1)H4B-O4-H4A型105.2
对称代码:(i)x个+1,+2,z(z)+1.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1型B类···O4号机组ii(ii)0.851.942.783 (3)172
O1-H1型A类···5号机组0.851.912.731 (3)163
氧气-氢气A类···臭氧iv(四)0.851.992.836 (3)171
氧气-氢气B类···臭氧0.851.962.800 (3)169
臭氧层-3B类···O4号机组0.851.962.803 (3)171
臭氧层-3A类···氮气0.851.962.797 (3)170
O4-H4型B类···第3页v(v)0.852.032.878 (3)177
O4-H4型A类···4号机组不及物动词0.8522.849 (3)176
对称代码:(i)x个+1,+2,z(z)+1; (ii)x个,+1,z(z); (iii)x个+1,+2,z(z); (iv)x个+1,,z(z); (五)x个,+1,z(z)+1; (vi)x个,,z(z)+1.

实验细节

水晶数据
化学配方[锰(C6H(H)4N个5)2(H)2O)4]·4小时2O(运行)
M(M)第页491.35
晶体系统,空间组三联诊所,P(P)1
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)8.137 (8), 8.629 (8), 8.761 (8)
α,β,γ(°)84.878 (10), 65.347 (8), 72.571 (10)
V(V))533.0 (9)
Z轴1
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.68
晶体尺寸(mm)0.15 × 0.10 × 0.10
数据收集
衍射仪布鲁克APEXII CCD
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,2007年)
T型最小值,T型最大值0.922, 0.934
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
2785, 1850, 1712
R(右)整数0.026
(罪θ/λ)最大值1)0.596
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.032, 0.080, 1.05
反射次数1850
参数数量143
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.23,0.32

计算机程序:4月2日(布鲁克,2000),圣保罗(布鲁克,2000),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1B···O40.851.942.783 (3)172
O1-H1A··N5ii(ii)0.851.912.731 (3)163
O2-2a···O30.851.992.836 (3)171
O2-H2B···O3iv(四)0.851.962.800 (3)169
O3-H3B···O40.851.962.803 (3)171
O3-H3A···N20.851.962.797 (3)170
O4-H4B···N3v(v)0.852.032.878 (3)177
O4-H4A···N4不及物动词0.8522.849 (3)176
对称代码:(i)x个,+1,z(z); (ii)x个+1,+2,z(z); (iii)x个+1,,z(z); (iv)x个+1,+2,z(z)+1; (五)x个,+1,z(z)+1; (vi)x个,,z(z)+1.
 

致谢

该项目得到了国家自然科学基金(21171115)、国家重点学科项目(J50102)和上海市教委创新计划(12ZZ089)的资助。

工具书类

第一次引用布鲁克(2000)。4月2日圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Mu,Y.-Q,Zhao,J.和Li,C.(2010年)。《水晶学报》。E类66,m1667科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2007年)。SADABS公司.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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