有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

N个-(4-氟苯基)-2,2-二甲基丙酰胺

南京理工大学药物科学学院,地址:中国南京市浦东南路30号,邮编:210009b条南京理工大学生命科学与制药工程学院,地址:中国南京市浦东南路30号,邮编:210009
*通信电子邮件:kaiguo@njut.edu.cn

(收到日期:2012年4月13日; 2012年5月7日接受; 2012年5月16日在线)

标题化合物C中的晶体填充11H(H)14FNO具有N-H…O氢键,导致分子链平行于c(c)轴。环和酰胺基团之间的二面角为39.1(3)°.

相关文献

标题化合物是合成依泽替米贝的中间产物,它抑制胆固醇从肠道的吸收,参见:Rosenblum等。(1998【Rosenblum,S.B.,Huynh,T.,Afonso,A.,Davis,H.R.,Yumibe,N.,Clader,J.W.&Burnett,D.A.(1998),《医学化学杂志》第41期,973-980页。】). 合成见:Wang等。(2008[王,Y.,张,H.,黄,W.,孔,J.,周,J.&张,B.(2008).欧洲医学化学杂志441638-1643.]). 有关相关结构,请参见:Gowda等。(2007【Gowda,B.T.,Foro,S.&Fuess,H.(2007),《结晶学报》E63,o2329-o2330。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C11H(H)14

  • M(M)第页= 195.23

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 9.5750 (19) Å

  • b条= 13.027 (3) Å

  • c(c)=8.8340(18)Å

  • β= 92.07 (3)°

  • V(V)= 1101.2 (4) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.09毫米−1

  • T型=293千

  • 0.30×0.20×0.10毫米

数据收集
  • Enraf–Nonius CAD-4衍射仪

  • 吸收校正:ψ扫描(北方等。, 1968【North,A.C.T.,Phillips,D.C.&Mathews,F.S.(1968),《结晶学报》A24,351-359。】)T型最小值= 0.974,T型最大值= 0.991

  • 4219次测量反射

  • 2025年独立思考

  • 1091次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.082

  • 每200次反射强度衰减3次标准反射:1%

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.062

  • 水风险(F类2) = 0.155

  • S公司= 1.00

  • 2025年的反思

  • 128个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.20埃−3

  • Δρ最小值=-0.20埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N-H0型A类年O 0.86 2.17 2.990 (3) 159
对称代码:(i)[x,-y+{\script{3\over2}},z-{\script}1\over2{}].

数据收集:CAD-4软件(恩拉夫·诺尼乌斯,1989年[Enraf-Nonius(1989)。CAD-4软件。荷兰代尔夫特Enraf-Nius。]); 细胞精细化: CAD-4软件; 数据缩减:XCAD4公司(Harms&Wocadlo,1995年[Harms,K.和Wocadlo,S.(1995),XCAD4。德国马尔堡大学); 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:(斯佩克,2009年[Spek,A.L.(2009),《结晶学报》,D65148-155。]).

支持信息


注释顶部

Ezetimibe是一种生物活性分子,研究表明它具有抑制胆固醇从肠道吸收的有用特性(Rosenblum等。, 1998). 作为我们对Ezetimibe合成研究的一部分,合成了标题化合物(fIG.1),它是一种中间体的衍生物之一晶体结构本文对此进行了报道。这个晶体结构标题化合物的N-H0A··O氢键稳定,导致分子链平行于c(c)-轴(图1和表1)。标题分子中的键距离和角度与其氯类似物(Gowda等。, 2007).

相关文献顶部

标题化合物是合成依泽替米贝的中间体,它抑制胆固醇从肠道的吸收,参见:Rosenblum等。(1998). 合成见:Wang等。(2008年)。有关相关结构,请参见:Gowda等。(2007).

实验顶部

至4-氟苯胺(13.32 g,0.12 mol)在CH中的溶液22(20 ml)添加4-二甲氨基吡啶(1.2 g,0.01 mol)和EtN(42.3 ml,0.31 mol)并将反应混合物冷却至273 K。新戊酰氯(14.4 g,0.12 mol)在CH中的溶液22在1小时内滴加(150毫升),将混合物加热回流。12小时后,h2O和H2SO公司4添加(2 N,75 ml),分离各层并依次用NaOH(10%)、NaCl(饱和)和水清洗有机层。有机层在MgSO上干燥4并按照之前报告的程序进行浓缩,以获得纯黄色固体产品形式的标题化合物(Wang等。, 2008). 标题化合物的晶体适合于X射线衍射,是通过缓慢蒸发乙醇溶液获得的。

精炼顶部

所有氢原子均采用骑马模型进行几何定位和精细化,其中芳基和甲基氢原子的N-H分别为0.86 Au和C-H分别为0.93和0.96 Au。这个U型国际标准化组织(H) 允许1.2U型等式(N/C)。

计算详细信息顶部

数据收集:CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989);细胞精细化: CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989);数据缩减:XCAD4公司(Harms&Wocadlo,1995);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:(斯佩克,2009)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构和原子编号方案。位移椭球是在50%的概率水平上绘制的。氢原子被表示为任意半径的小球。
[图2] 图2。标题化合物晶体结构中的N-H··O氢键(虚线)视图。为了清楚起见,省略了未参与氢键的氢原子。
N个-(4-氟苯基)-2,2-二甲基丙酰胺顶部
水晶数据 顶部
C11H(H)14FNO公司F类(000) = 416
M(M)第页= 195.23D类x个=1.178毫克
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2ybc25次反射的细胞参数
= 9.5750 (19) Åθ= 10–13°
b条= 13.027 (3) ŵ=0.09毫米1
c(c)= 8.8340 (18) ÅT型=293千
β= 92.07 (3)°块,黄色
V(V)= 1101.2 (4) Å0.30×0.20×0.10毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Enraf–Nonius CAD-4型
衍射仪
1091次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管R(右)整数= 0.082
石墨单色仪θ最大值= 25.4°,θ最小值= 2.1°
ω/2θ扫描小时=1111
吸收校正:ψ扫描
(北部等。, 1968)
k=1515
T型最小值= 0.974,T型最大值= 0.991=010
4219次测量反射每200次反射中有3次标准反射
2025独立反思强度衰减:1%
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:满氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.062受约束的氢原子参数
水风险(F类2) = 0.155 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.065P(P))2]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.00(Δ/σ)最大值< 0.001
2025年的反思Δρ最大值=0.20埃
128个参数Δρ最小值=0.20埃
0个约束消光校正:SHELXL97型(谢尔德里克,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.020(5)
水晶数据 顶部
C11H(H)14FNO公司V(V)= 1101.2 (4) Å
M(M)第页=195.23Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 9.5750 (19) ŵ=0.09毫米1
b条= 13.027 (3) ÅT型=293千
c(c)= 8.8340 (18) Å0.30×0.20×0.10毫米
β=92.07(3)°
数据收集 顶部
Enraf–Nonius CAD-4型
衍射仪
1091次反射> 2σ()
吸收校正:ψ扫描
(北部等。, 1968)
R(右)整数= 0.082
T型最小值= 0.974,T型最大值= 0.991每200次反射中有3次标准反射
4219次测量反射强度衰减:1%
2025年独立思考
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0620个约束
水风险(F类2) = 0.155受约束的氢原子参数
S公司= 1.00Δρ最大值=0.20埃
2025年的反思Δρ最小值=0.20埃
128个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。细胞e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,带有F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O(运行)0.55665 (18)0.65320 (14)0.18951 (19)0.0619 (6)
F类0.01604 (17)0.92797 (16)0.1759 (2)0.1032 (7)
N个0.4924 (2)0.74067 (17)0.0211 (2)0.0588(7)
H0A型0.51360.75470.11260.071*
C1类0.2795 (3)0.7359 (2)0.1236 (3)0.0638 (8)
甲型H1A0.29820.66830.15140.077*
C20.1603 (3)0.7837 (3)0.1726 (4)0.0728(9)
过氧化氢0.09950.74930.23490.087*
C3类0.1340 (3)0.8806 (3)0.1284 (3)0.0693 (9)
补体第四成份0.2195 (3)0.9346 (2)0.0395 (3)0.0731 (9)
H4A型0.19811.00160.01100.088*
C5型0.3409 (3)0.8869 (2)0.0081 (3)0.0640 (8)
H5A型0.40190.92250.06870.077*
C6级0.3705 (3)0.7878 (2)0.0339 (3)0.0507(7)
抄送70.5775 (3)0.6763 (2)0.0568 (3)0.0496 (7)
抄送80.7023 (3)0.6356 (2)0.0266 (3)0.0560 (7)
C9级0.8029 (3)0.7255 (3)0.0500(4)0.0864 (11)
H9A型0.83160.75370.04650.130*
H9B型0.75650.77750.11020.130*
H9C型0.88340.70140.10110.130*
第10条0.7752 (4)0.5529 (3)0.0688 (4)0.1008 (13)
上午10点0.71210.49670.08290.151*
H10B型0.80360.58090.16570.151*
H10C型0.85600.52890.01810.151*
C11号机组0.6568 (3)0.5904 (2)0.1808 (3)0.0759 (10)
H11A型0.59450.53380.16620.114*
H11B型0.73750.56690.23210.114*
H11C型0.60970.64220.24080.114*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O(运行)0.0662 (12)0.0774 (14)0.0430 (11)0.0127 (10)0.0146 (9)0.0049 (10)
F类0.0656 (12)0.1364 (17)0.1092 (15)0.0362 (11)0.0246 (11)0.0114 (13)
N个0.0603 (14)0.0756 (15)0.0418 (12)0.0164 (13)0.0204 (11)0.0052 (12)
C1类0.0579 (17)0.071 (2)0.0637 (18)0.0048(15)0.0160 (15)0.0065 (15)
C20.0509 (17)0.099 (3)0.070 (2)0.0022 (18)0.0194 (15)0.0051 (19)
C3类0.0507 (17)0.095 (2)0.0631 (18)0.0197 (18)0.0119 (15)0.0072 (18)
补体第四成份0.073 (2)0.073 (2)0.073 (2)0.0218 (18)0.0069(17)0.0059 (17)
C5型0.0660 (19)0.071 (2)0.0564(17)0.0073 (16)0.0177 (14)0.0078 (15)
C6级0.0519 (15)0.0640 (18)0.0370 (13)0.0053 (14)0.0113 (12)0.0002(13)
抄送70.0537 (16)0.0574 (17)0.0384 (14)0.0016 (13)0.0114 (12)0.0005(13)
抄送80.0548 (16)0.0679 (19)0.0461 (15)0.0087 (14)0.0119 (12)0.0050 (14)
C9级0.0548 (18)0.112 (3)0.093 (3)0.0102 (18)0.0193 (18)0.023 (2)
第10条0.097 (2)0.125 (3)0.082 (2)0.059 (2)0.022 (2)0.014 (2)
C11号机组0.080 (2)0.082 (2)0.067 (2)0.0074(18)0.0224 (16)0.0181 (17)
几何参数(λ,º) 顶部
O-C7型1.233 (3)C5-H5A型0.9300
F-C31.366(3)C7-C81.522 (3)
N-C7号机组1.342 (3)C8-C10型1.522 (4)
N-C6型1.420 (3)C8-C11号机组1.533(4)
N-H0A型0.8600C8-C9型1.535 (4)
C1-C6号机组1.376(4)C9-H9A型0.9600
C1-C2类1.383 (4)C9-H9B基因0.9600
C1-H1A型0.9300C9-H9C型0.9600
C2-C3型1.343 (4)C10-H10A型0.9600
C2-H2A型0.9300C10-H10B型0.9600
C3-C4型1.352 (4)C10-H10摄氏度0.9600
C4-C5型1.397 (4)C11-H11A型0.9600
C4-H4A型0.9300C11-H11B型0.9600
C5至C61.371 (4)C11-H11C型0.9600
C7-N-C6125.9 (2)C7-C8-C10型109.3 (2)
C7-N-H0A型117.1C7-C8-C11号机组111.2 (2)
C6-N-H0A型117.1C10-C8-C11号机组109.3 (2)
C6-C1-C2型120.4 (3)C7-C8-C9107.9 (2)
C6-C1-H1A型119.8C10-C8-C9109.7 (3)
C2-C1-H1A型119.8C11-C8-C9109.4 (2)
C3-C2-C1型118.7 (3)C8-C9-H9A型109.5
C3-C2-H2A120.6C8-C9-H9B型109.5
C1-C2-H2A120.6H9A-C9-H9B109.5
C2-C3-C4型123.1 (3)C8-C9-H9C型109.5
C2-C3-F型118.9 (3)H9A-C9-H9C109.5
C4-C3-F型117.9 (3)H9B-C9-H9C型109.5
C3-C4-C5型118.2 (3)C8-C10-H10A型109.5
C3-C4-H4A型120.9C8-C10-H10B109.5
C5-C4-H4A型120.9H10A-C10-H10B型109.5
C6-C5-C4120.2 (3)C8-C10-H10C型109.5
C6-C5-H5A型119.9H10A-C10-H10C109.5
C4-C5-H5A型119.9H10B-C10-H10C型109.5
C5-C6-C1119.3 (2)C8-C11-H11A型109.5
C5-C6-N型118.6 (2)C8-C11-H11B型109.5
C1-C6-N型122.0 (3)H11A-C11-H11B型109.5
O-C7-N型121.6 (2)C8-C11-H11C109.5
O-C7-C8型122.1 (2)H11A-C11-H11C型109.5
N-C7-C8号机组116.3 (2)H11B-C11-H11C型109.5
C6-C1-C2-C3型1.4 (5)C7-N-C6-C5型142.3 (3)
C1-C2-C3-C4型0.9 (5)C7-N-C6-C1型39.9 (4)
C1-C2-C3-F型179.7 (3)C6-N-C7-O型1.2 (4)
C2-C3-C4-C5型0.0 (5)C6-N-C7-C8179.9 (2)
F-C3-C4-C5179.4 (2)O-C7-C8-C10型9.3 (4)
C3-C4-C5-C6型0.5 (4)N-C7-C8-C10型172.0 (3)
C4-C5-C6-C1型0.0 (4)O-C7-C8-C11型130.1 (3)
C4-C5-C6-N177.8 (2)N-C7-C8-C11型51.3 (3)
C2-C1-C6-C5型0.9 (4)O-C7-C8-C9110.0 (3)
C2-C1-C6-N178.7 (2)N-C7-C8-C968.7 (3)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N-H0型A类···O(运行)0.862.172.990 (3)159
C1-H1型A类···O(运行)0.932.492.904 (3)107
对称代码:(i)x个,+3/2,z(z)1/2。

实验细节

水晶数据
化学配方C11H(H)14FNO公司
M(M)第页195.23
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)9.5750 (19), 13.027 (3), 8.8340 (18)
β(°)92.07 (3)
V(V))1101.2 (4)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.09
晶体尺寸(mm)0.30 × 0.20 × 0.10
数据收集
衍射仪Enraf–Nonius CAD-4型
衍射仪
吸收校正ψ扫描
(北部等。, 1968)
T型最小值,T型最大值0.974, 0.991
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
4219, 2025, 1091
R(右)整数0.082
(罪θ/λ)最大值1)0.603
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.062, 0.155, 1.00
反射次数2025
参数数量128
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.20,0.20

计算机程序:CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989),XCAD4公司(Harms&Wocadlo,1995),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008),(斯佩克,2009)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N-H0A··O0.862.172.990 (3)159
对称代码:(i)x个,+3/2,z(z)1/2。
 

致谢

本研究得到了南京理工大学生命科学与制药工程学院、973项目(2012CB725204)和国家重点基础研究计划的资助。

工具书类

第一次引用Enraf–Nonius(1989)。CAD-4软件Enraf–荷兰代尔夫特Nonius。 谷歌学者
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