有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

2-(7-甲基-1H(H)-吲哚-3-基)乙腈

东南大学化学化工学院有序物质科学研究中心,南京210096
*通信电子邮件:peluoyh@sina.com

(收到日期:2011年12月1日; 2011年12月12日接受; 在线2011年12月17日)

在标题化合物中,C11H(H)10N个2,碳腈基团被扭离吲哚平面[C塞浦路斯-C类-C类应收账-C类应收账= 66.6 (2)°; cy=氰化物,me=亚甲基,ar=芳香族]。在晶体中,N-H…N氢键将分子连接成C类(7) 沿[001]方向传播的链。

相关文献

有关吲哚衍生物作为药物的背景信息,请参见:Kunzer&Wendt(2011)【Kunzer,A.R.和Wendt,M.D.(2011)。四面体,52,1815-1818。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类11H(H)10N个2

  • M(M)第页= 170.21

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 6.9962 (14) Å

  • b条= 8.9445 (18) Å

  • c(c)= 15.406 (3) Å

  • β= 97.97 (3)°

  • V(V)= 954.7 (3) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.07毫米−1

  • T型=293千

  • 0.26×0.24×0.15毫米

数据收集
  • Rigaku SCXmini CCD衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(CrystalClear公司; 里加库,2005年[Rigaku.(2005).CrystalClear.Rigaku Corporation,日本东京])T型最小值= 0.981,T型最大值= 0.989

  • 9402次测量反射

  • 2160次独立反射

  • 1418次反射> 2σ()

  • 整数= 0.058

精炼
  • [F类2> 2σ(F类2)] = 0.055

  • 水风险(F类2) = 0.154

  • S公司= 1.05

  • 2160次反射

  • 118个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.16埃−3

  • Δρ最小值=-0.17埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月 D类-H(H) H月 D类 D类-H月
N1-H1型●氮气 0.86 2.24 3.022 (2) 151
对称代码:(i)[x,-y+{\script{3\over2}},z-{\script}1\over2{}].

数据收集:CrystalClear公司(里加库,2005年[Rigaku.(2005).CrystalClear.Rigaku Corporation,日本东京]); 细胞精细化: CrystalClear公司; 数据缩减:CrystalClear公司; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:钻石(Brandenburg&Putz,2005)【Brandenburg,K.和Putz,H.(2005)。钻石。水晶冲击GbR,德国波恩。】); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.

支持信息


相关文献顶部

有关吲哚衍生物作为药物的背景信息,请参见:Kunzer&Wendt(2011)。

实验顶部

通过缓慢蒸发商用样品的甲醇溶液,获得无色的(I)块。

精炼顶部

所有附着在C原子和O原子上的H原子都被几何固定,并被视为骑在C-H=0.93º(CH),C-H=0.97º(CH)上2),C-H=0.96º(CH)且N-H=0.86ºU型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(瑞士、瑞士2和NH)和U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(瑞士).

计算详细信息顶部

数据收集:CrystalClear公司(里加库,2005年);细胞精细化: CrystalClear公司(里加库,2005年);数据缩减:CrystalClear公司(里加库,2005年);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(Sheldrick,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(Sheldrick,2008);分子图形:钻石(勃兰登堡和普茨,2005年);用于准备出版材料的软件:SHELXL97型(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构,以30%的概率水平绘制置换椭球。
[图2] 图2。下面的打包视图带氢键的轴显示为虚线。
2-(7-甲基-1H(H)-吲哚-3-基)乙腈顶部
水晶数据 顶部
C类11H(H)10N个2F类(000) = 360
M(M)第页= 170.21D类x个=1.184毫克
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
霍尔符号:-P 2ybc2175次反射的单元参数
= 6.9962 (14) Åθ= 2.7–27.5°
b条= 8.9445 (18) ŵ=0.07毫米1
c(c)= 15.406 (3) ÅT型=293千
β= 97.97 (3)°块,无色
V(V)= 954.7 (3) Å0.26×0.24×0.15毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Rigaku SCXmini CCD
衍射仪
2160次独立反射
辐射源:细焦点密封管1418次反射> 2σ()
石墨单色仪整数= 0.058
ω扫描θ最大值= 27.5°,θ最小值= 3.5°
吸收校正:多扫描
(CrystalClear公司; 里加库,2005年)
小时=99
T型最小值= 0.981,T型最大值= 0.989k个=1111
9402次测量反射=1919
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.055氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.154受约束的氢原子参数
S公司= 1.05 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0708P(P))2+ 0.0707P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2160次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
118个参数Δρ最大值=0.16埃
0个约束Δρ最小值=0.17埃
水晶数据 顶部
C类11H(H)10N个2V(V)= 954.7 (3) Å
M(M)第页= 170.21Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 6.9962 (14) ŵ=0.07毫米1
b条= 8.9445 (18) ÅT型=293千
c(c)= 15.406 (3) Å0.26×0.24×0.15毫米
β= 97.97 (3)°
数据收集 顶部
Rigaku SCXmini CCD
衍射仪
2160次独立反射
吸收校正:多扫描
(CrystalClear公司; 里加库,2005年)
1418次反射> 2σ()
T型最小值= 0.981,T型最大值= 0.989整数= 0.058
9402次测量反射
精炼 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0550个约束
水风险(F类2) = 0.154受约束的氢原子参数
S公司= 1.05Δρ最大值=0.16埃
2160次反射Δρ最小值=0.17埃
118个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt).与选择反射进行细化无关。-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.0179 (3)0.6121 (2)0.21424 (12)0.0587 (5)
H1B型0.12780.66420.19030.070*
指挥与控制0.0270 (2)0.57655 (18)0.30000 (11)0.0511 (4)
C3类0.2072 (2)0.49843 (17)0.30912 (10)0.0473 (4)
补体第四成份0.3276 (3)0.43296 (19)0.37953 (12)0.0613 (5)
H4A型0.29550.43690.43610.074*
C5级0.4936 (3)0.3631 (2)0.36311 (16)0.0758 (6)
H5A型0.57360.31870.40920.091*
C6级0.5451 (3)0.3571 (2)0.27861 (17)0.0768 (6)
H6A型0.65880.30880.27030.092*
抄送70.4334 (3)0.4204 (2)0.20730 (13)0.0644 (5)
抄送80.2629 (2)0.48979 (17)0.22467 (10)0.0506 (4)
C9级0.4896 (4)0.4170 (3)0.11583 (16)0.0958 (8)
H9A型0.60910.36390.11680.144*
H9B型0.50470.51750.09590.144*
H9C型0.39050.36760.07680.144*
C10号机组0.0948 (3)0.6089 (2)0.37116 (13)0.0678 (5)
H10A型0.21710.65090.34490.081*
H10B型0.12160.51580.39940.081*
C11号机组0.0021 (3)0.7128 (2)0.43771 (12)0.0621 (5)
N1型0.1212 (2)0.56067 (16)0.16799 (9)0.0600 (4)
甲型H1A0.12070.57070.11240.072*
氮气0.0698 (3)0.7913 (2)0.48993 (11)0.0856 (6)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0586 (10)0.0557 (10)0.0580 (11)0.0065 (8)0.0048 (9)0.0008 (8)
指挥与控制0.0529 (9)0.0500 (9)0.0495 (10)0.0010 (7)0.0040 (7)0.0038 (7)
C3类0.0537 (9)0.0413 (8)0.0454 (9)0.0049 (7)0.0021 (7)0.0014 (6)
补体第四成份0.0659 (11)0.0584 (11)0.0562 (10)0.0058 (9)0.0030 (9)0.0094 (8)
C5级0.0656 (12)0.0597 (12)0.0951 (16)0.0036 (10)0.0131 (11)0.0164 (11)
C6级0.0601 (12)0.0574 (12)0.1126 (18)0.0064 (9)0.0108 (12)0.0067 (12)
抄送70.0642 (11)0.0542 (11)0.0780 (13)0.0045 (9)0.0207 (10)0.0131 (9)
抄送80.0585 (10)0.0425 (9)0.0503 (9)0.0045 (7)0.0055 (8)0.0040 (7)
C9级0.0977 (17)0.0985 (17)0.1011 (18)0.0132 (14)0.0481 (14)0.0277 (13)
C10号机组0.0606 (11)0.0731 (12)0.0715 (12)0.0027 (9)0.0156 (10)0.0097 (10)
C11号机组0.0675 (11)0.0716 (12)0.0490 (10)0.0085 (10)0.0150 (9)0.0013 (9)
N1型0.0748 (10)0.0628 (9)0.0404 (8)0.0020 (8)0.0012 (7)0.0008 (6)
氮气0.1026 (14)0.0986 (14)0.0549 (10)0.0050 (11)0.0087 (9)0.0152 (9)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C2类1.353 (2)C6-H6A型0.9300
C1-N1型1.364 (2)C7-C8号机组1.403 (2)
C1-H1B型0.9300C7-C91.515 (3)
C2-C3型1.431 (2)C8-N1型1.381 (2)
C2-C10型1.507 (2)C9-H9A型0.9600
C3-C4型1.405 (2)C9-H9B型0.9600
C3-C8型1.411 (2)C9-H9C型0.9600
C4-C5型1.373 (3)C10-C11号机组1.467 (3)
C4-H4A型0.9300C10-H10A型0.9700
C5至C61.399 (3)C10-H10B型0.9700
C5-H5A型0.9300C11-N2型1.131 (2)
C6至C71.378 (3)N1-H1A型0.8600
C2-C1-N1型110.17 (15)C8-C7-C9121.5 (2)
C2-C1-H1B型124.9N1-C8-C7型129.60 (17)
N1-C1-H1B型124.9N1-C8-C3106.97 (15)
C1-C2-C3107.04 (15)C7-C8-C3123.43 (17)
C1-C2-C10型125.94 (16)C7-C9-H9A型109.5
C3-C2-C10型126.99 (15)C7-C9-H9B型109.5
C4-C3-C8型118.43 (16)H9A-C9-H9B109.5
C4-C3-C2型134.80 (16)C7-C9-H9C型109.5
C8-C3-C2型106.76 (14)H9A-C9-H9C109.5
C5-C4-C3118.63 (18)H9B-C9-H9C型109.5
C5-C4-H4A120.7C11-C10-C2型112.97 (15)
C3-C4-H4A120.7C11-C10-H10A型109
C4-C5-C6121.50 (19)C2-C10-H10A型109
C4-C5-H5A型119.2C11-C10-H10B型109
C6-C5-H5A型119.2C2-C10-H10B型109
C7-C6-C5型122.37 (19)H10A-C10-H10B型107.8
C7-C6-H6A型118.8N2-C11-C10型179.0 (2)
C5-C6-H6A118.8C1-N1-C8型109.06 (14)
C6-C7-C8型115.63 (18)C1-N1-H1A125.5
C6-C7-C9122.82 (19)C8-N1-H1A型125.5
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···D类-H(H)H(H)···D类···D类-H(H)···
N1-H1型···氮气0.862.243.022 (2)151
对称代码:(i)x个,+3/2,z(z)1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C类11H(H)10N个2
M(M)第页170.21
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)6.9962 (14), 8.9445 (18), 15.406 (3)
β(°)97.97 (3)
V(V))954.7 (3)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.07
晶体尺寸(mm)0.26 × 0.24 × 0.15
数据收集
衍射仪里加库SCXmini CCD
衍射仪
吸收校正多扫描
(CrystalClear公司; 里加库,2005年)
T型最小值,T型最大值0.981, 0.989
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
9402, 2160, 1418
整数0.058
(罪θ/λ)最大值1)0.649
精炼
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.055, 0.154, 1.05
反射次数2160
参数数量118
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.16,0.17

计算机程序:CrystalClear公司(里加库,2005年),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),钻石(Brandenburg&Putz,2005)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···D类-H(H)H(H)···D类···D类-H(H)···
N1-H1A···N20.862.243.022 (2)151
对称代码:(i)x个,+3/2,z(z)1/2.
 

致谢

我们感谢东南大学的支持。

工具书类

第一次引用Brandenburg,K.和Putz,H.(2005)。钻石。Crystal Impact GbR,德国波恩。 谷歌学者
第一次引用Kunzer,A.R.和Wendt,M.D.(2011年)。四面体,52, 1815–1818. 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用里加库。(2005).CrystalClear公司Rigaku Corporation,日本东京。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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期刊徽标晶体学
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国际标准编号:2056-9890