金属有机化合物\(第5em段)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

反式-双(吖啶-κN个)二氯钯(II)

韩国光州国立大学催化研究所应用化学工程学院,邮编:500-757
*通信电子邮件:hakwang@chonnam.ac.kr

(收到日期:2011年12月9日; 2011年12月11日接受; 在线2011年12月17日)

在标题复合体中,[PdCl2(C)13H(H)9否)2],Pd离子在基本上呈方形的平面环境中由来自两个吖啶配体的两个N原子和两个Cl原子四配位阴离子。钯原子位于反转中心,因此非对称单元包含一半的络合物和PdN22这个单位完全是平面的。PdN之间的二面角22吖啶配体为84.66(6)°。在晶体中,复合分子沿着轴由C-H…Cl氢键连接,沿[110]形成链。在色谱柱中,有许多分子间的相互作用ππ六元环之间存在相互作用,最短环形心-质心距离为3.722(4)°。

相关文献

有关晶体结构[PdX(X)2(acr)2] (X(X)=Br,I),参见:Ha(2010【Ha,K.(2010a).Z.Kristallogr.新晶体结构.225,663-664.】,b条【Ha,K.(2010b).Z.Kristallogr.新晶体结构.225,693-694.】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [氯化钯2(C)13H(H)9N)2]

  • M(M)第页= 535.72

  • 三联诊所,[P\上一行]

  • = 8.2114 (16) Å

  • b条= 8.8910 (18) Å

  • c(c)= 9.0105 (18) Å

  • α= 66.188 (4)°

  • β= 77.230 (4)°

  • γ= 66.885 (4)°

  • V(V)= 551.99 (19) Å

  • Z轴= 1

  • K(K)α辐射

  • μ=1.10毫米−1

  • T型=200 K

  • 0.20×0.12×0.09毫米

数据收集
  • Bruker SMART 1000 CCD衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 布鲁克,2000[Bruker(2000)。SADABS、SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.679,T型最大值= 1.000

  • 3488次测量反射

  • 2124个独立反射

  • 1626次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.056

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.059

  • 水风险(F类2) = 0.107

  • S公司= 0.98

  • 2124次反射

  • 142个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.83埃−3

  • Δρ最小值=−0.66埃−3

表1
选定的几何参数(λ,°)

Pd1-N1型 2.055 (4)
第1页-Cl1 2.2975 (15)
N1-Pd1-Cl1型 89.75 (12)

表2
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
C5-H5乙酰氯 0.95 2.74 3.589 (6) 149
对称代码:(i)-x个, -+2, -z(z).

数据收集:智能(布鲁克,2000年[Bruker(2000)。SADABS、SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2000年[Bruker(2000)。SADABS、SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《晶体学报》A64,112-122。]); 用于细化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:ORTEP-3公司(Farrugia,1997年【Farrugia,L.J.(1997),《应用结晶杂志》,第30卷,第565页。】)和(斯佩克,2009年[Spek,A.L.(2009),《结晶学报》,D65148-155。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.

支持信息


注释顶部

在标题复合体中,[PdCl2(acr)2](acr=吖啶,C13H(H)9N) ,Pd离子在基本上呈方形的平面环境中由来自两个吖啶(acr)配体和两个Cl的两个N原子四配位-阴离子(图1和表1)。络合物和碘类似物2(acr)2]在三斜晶系中结晶空间组 P(P)1,而类似的溴-钯(II)络合物[PdBr2(英亩)2]在单斜晶系中结晶空间组 C类2/c(c)(哈,2010年,b条).

钯原子位于反转中心,因此非对称单元包含一半的络合物和PdN22单位就是平面。近平面吖啶配体与最小二乘平面的最大偏差为0.033(4)Au,是平行的。PdN之间的二面角22单位和吖啶配体为84.66(6)°。Cl原子在反式构象彼此相对且几乎垂直于吖啶平面,键角N1-Pd1-Cl1=89.75(12)°。在晶体中,复合分子沿着并通过C-H··Cl氢键连接,沿[110]形成链。在柱中,许多分子间π-π六元环之间存在相互作用,最短环中心距为3.722(4)欧。

相关文献顶部

有关晶体结构[PdX(X)2(acr)2] (X(X)=Br,I),参见:Ha(2010,b条).

实验顶部

至Na溶液2氯化铅4(0.2014克,0.685毫摩尔)(单位:H)2添加O(20 ml)吖啶(0.2561 g,1.429 mmol),将混合物回流7 h。然后通过过滤分离沉淀物,用丙酮和戊烷洗涤,并在50°C下干燥,得到黄色粉末(0.3369 g)。适用于X射线分析的晶体是通过从CH缓慢蒸发获得的CN解决方案。

精炼顶部

H原子被几何定位,并允许骑在其各自的母原子上[C-H=0.95 Au和U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ]。最高峰值(0.83 e Au-3)和最深的洞(-0.66 e Au-3)在差分傅里叶图中,Pd1原子的位置分别为1.17和0.85º。

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,2000年);细胞精细化: 圣保罗(Bruker,2000年);数据缩减:圣保罗(Bruker,2000年);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:ORTEP-3公司(Farrugia,1997)和(斯佩克,2009);用于准备出版材料的软件:SHELXL97型(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题复合体的结构,非H原子的位移椭球以50%的概率水平绘制。未标记原子与参考原子通过(1)关联-x个, 1 -, -z(z))对称变换。
[图2] 图2。标题复合体单元间内容的视图。氢键相互作用用虚线表示。
反式-双(吖啶-κN个)二氯钯(II)顶部
水晶数据 顶部
[氯化钯2(C)13H(H)9否)2]Z轴= 1
M(M)第页= 535.72F类(000) = 268
三联诊所,P(P)1D类x个=1.612毫克米
大厅符号:-P 1K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 8.2114 (16) Å940次反射的单元参数
b条= 8.8910 (18) Åθ= 2.7–22.5°
c(c)= 9.0105 (18) ŵ=1.10毫米1
α= 66.188 (4)°T型=200 K
β= 77.230 (4)°块,黄色
γ= 66.885 (4)°0.20×0.12×0.09毫米
V(V)= 551.99 (19) Å
数据收集 顶部
布鲁克SMART 1000 CCD
衍射仪
2124个独立反射
辐射源:细焦点密封管1626次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.056
ϕω扫描θ最大值= 26.0°,θ最小值= 2.5°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2000年)
小时=1010
T型最小值= 0.679,T型最大值= 1.000k个=910
3488次测量反射=1011
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.059氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.107受约束的氢原子参数
S公司= 0.98 = 1/[σ2(F类o个2) + (0.0328P(P))2]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2124次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
142个参数Δρ最大值=0.83埃
0个约束Δρ最小值=0.66埃
水晶数据 顶部
[氯化钯2(C)13H(H)9否)2]γ= 66.885 (4)°
M(M)第页= 535.72V(V)= 551.99 (19) Å
三联诊所,P(P)1Z轴= 1
= 8.2114 (16) ÅK(K)α辐射
b条= 8.8910 (18) ŵ=1.10毫米1
c(c)= 9.0105 (18) ÅT型=200 K
α= 66.188 (4)°0.20×0.12×0.09毫米
β= 77.230 (4)°
数据收集 顶部
布鲁克SMART 1000 CCD
衍射仪
2124个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2000年)
1626次反射> 2σ()
T型最小值= 0.679,T型最大值= 1.000R(右)整数= 0.056
3488次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0590个约束
水风险(F类2) = 0.107H原子参数受约束
S公司= 0.98Δρ最大值=0.83埃
2124次反射Δρ最小值=0.66埃
142个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
第1页0.50000.500000.0284 (2)
第1类0.27624 (19)0.42136 (19)0.1805 (2)0.0413 (4)
N1型0.3976 (5)0.7417 (5)0.0224 (5)0.0239 (10)
C1类0.2822 (7)0.8767 (7)0.0814 (7)0.0287 (13)
指挥与控制0.2416 (7)0.8596 (8)0.2178 (7)0.0343 (15)
氢气0.29550.75130.23500.041*
C3类0.1271 (7)0.9955 (8)0.3232 (8)0.0399 (16)
H3级0.10170.98060.41320.048*
补体第四成份0.0448 (7)1.1580 (8)0.3032 (8)0.0438 (17)
H4型0.03631.25120.37850.053*
C5级0.0810 (7)1.1817 (8)0.1766 (8)0.0407 (16)
H5型0.02461.29200.16340.049*
C6级0.2011 (7)1.0455 (7)0.0640 (7)0.0302 (14)
抄送70.2430 (7)1.0626 (7)0.0674 (7)0.0352 (15)
H7型0.18921.17140.08380.042*
抄送80.3604 (7)0.9262 (7)0.1749 (7)0.0254 (13)
C9级0.4058 (8)0.9384 (9)0.3117 (8)0.0411 (16)
H9型0.35191.04500.33210.049*
C10号机组0.5234 (9)0.8029 (9)0.4133 (8)0.0439 (17)
H10型0.55170.81420.50400.053*
C11号机组0.6047 (8)0.6432 (8)0.3845 (7)0.0407 (16)
H11型0.68860.54780.45570.049*
第12项0.5641 (8)0.6259 (7)0.2572 (7)0.0350 (15)
H12型0.62080.51790.23970.042*
第13页0.4400 (7)0.7629 (7)0.1489 (7)0.0269 (13)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
第1页0.0283 (4)0.0212 (4)0.0363 (4)0.0025 (3)0.0064 (3)0.0144 (3)
第1类0.0379 (9)0.0295 (9)0.0540 (11)0.0098 (7)0.0061 (8)0.0188 (8)
N1型0.024 (2)0.020 (2)0.028 (3)0.005 (2)0.001 (2)0.011 (2)
C1类0.023 (3)0.030 (3)0.029 (3)0.007 (3)0.001 (3)0.009 (3)
指挥与控制0.030 (3)0.028 (3)0.042 (4)0.001 (3)0.006 (3)0.017 (3)
C3类0.033 (3)0.046 (4)0.043 (4)0.011 (3)0.017 (3)0.013 (3)
补体第四成份0.025 (3)0.035 (4)0.054 (5)0.000 (3)0.012 (3)0.003 (3)
C5级0.029 (3)0.030 (4)0.059 (5)0.003 (3)0.002 (3)0.021 (3)
C6级0.026 (3)0.024 (3)0.041 (4)0.006 (3)0.000 (3)0.015 (3)
抄送70.031 (3)0.023 (3)0.051 (4)0.007 (3)0.010 (3)0.020 (3)
抄送80.025 (3)0.025 (3)0.029 (3)0.011 (3)0.008 (3)0.016 (3)
C9级0.045 (4)0.047 (4)0.043 (4)0.023 (4)0.013 (3)0.028 (4)
C10号机组0.061 (4)0.057 (5)0.033 (4)0.039 (4)0.000 (4)0.018 (3)
C11号机组0.057 (4)0.037 (4)0.032 (4)0.022 (3)0.010 (3)0.007 (3)
第12项0.050 (4)0.022 (3)0.035 (4)0.010 (3)0.008 (3)0.012 (3)
第13页0.029 (3)0.027 (3)0.029 (3)0.009 (3)0.002 (3)0.016 (3)
几何参数(λ,º) 顶部
Pd1-N1型2.055 (4)C5-H5型0.9500
Pd1-N1型2.055 (4)C6至C71.382 (8)
第1页-Cl12.2975 (15)C7-C8号机组1.373 (7)
第1页-Cl12.2975 (15)C7-H7型0.9500
N1-C1型1.344 (6)C8-C9型1.420 (7)
N1-C13号机组1.362 (6)C8-C13号机组1.432 (7)
C1-C2类1.420 (7)C9-C10型1.344 (8)
C1-C61.442 (7)C9-H9型0.9500
C2-C3型1.350 (7)C10-C11号机组1.416 (8)
C2-H2型0.9500C10-H10型0.9500
C3-C4型1.402 (8)C11-C12号机组1.344 (7)
C3-H3型0.9500C11-H11型0.9500
C4-C5型1.353 (8)C12-C13型1.406 (7)
C4-H4型0.9500C12-H12型0.9500
C5至C61.408 (8)
N1型-Pd1-N1型180C7-C6-C5型123.4 (5)
N1型-第1页-Cl189.75 (12)C7-C6-C1型117.3 (5)
N1-Pd1-Cl1型90.25 (12)C5-C6-C1型119.4 (5)
N1型-第1页-Cl190.25 (12)C8-C7-C6121.5 (5)
N1-Pd1-Cl1型89.75 (12)C8-C7-H7型119.2
第1类-第1页-Cl1180.00 (8)C6-C7-H7型119.2
C1-N1-C13型119.7 (4)C7-C8-C9123.2 (5)
C1-N1-Pd1120.7 (3)C7-C8-C13型118.6 (5)
C13-N1-Pd1型119.6 (3)C9-C8-C13型118.2 (5)
N1-C1-C2型120.6 (5)C10-C9-C8号机组121.6 (6)
N1-C1-C6122.0 (5)C10-C9-H9型119.2
C2-C1-C6型117.4 (5)C8-C9-H9119.2
C3-C2-C1120.7 (5)C9-C10-C11119.8 (6)
C3-C2-H2119.7C9-C10-H10120.1
C1-C2-H2119.7C11-C10-H10型120.1
C2-C3-C4型121.7 (6)C12-C11-C10120.4 (6)
C2-C3-H3型119.1C12-C11-H11型119.8
C4-C3-H3型119.1C10-C11-H11号机组119.8
C5-C4-C3119.8 (6)C11-C12-C13型122.0 (5)
C5-C4-H4120.1C11-C12-H12型119
C3-C4-H4型120.1C13-C12-H12型119
C4至C5至C6121.0 (5)N1-C13-C12型121.2 (5)
C4-C5-H5型119.5N1-C13-C8型120.9 (5)
C6-C5-H5型119.5C12-C13-C8型118.0 (5)
第1类-Pd1-N1-C187.0 (4)C5-C6-C7-C8179.7 (5)
Cl1-Pd1-N1-C193.0 (4)C1-C6-C7-C8型1.6 (8)
第1类-Pd1-N1-C13型96.5 (4)C6-C7-C8-C9179.6 (5)
氯化物-Pd1-N1-C1383.5 (4)C6-C7-C8-C130.2 (8)
C13-N1-C1-C2型177.5 (5)C7-C8-C9-C10179.0 (6)
Pd1-N1-C1-C26.0 (7)C13-C8-C9-C101.5 (8)
C13-N1-C1-C60.2 (8)C8-C9-C10-C11号机组0.0 (9)
第1-N1-C1-C6页176.8 (4)C9-C10-C11-C120.6 (9)
N1-C1-C2-C3179.3 (5)C10-C11-C12-C130.4 (9)
C6-C1-C2-C3型2.0 (8)C1-N1-C13-C12178.2 (5)
C1-C2-C3-C4型0.3 (9)Pd1-N1-C13-C125.2 (7)
C2-C3-C4-C5型0.7 (10)C1-N1-C13-C81.3 (8)
C3-C4-C5-C6型0.2 (9)Pd1-N1-C13-C8175.2 (4)
C4-C5-C6-C7型180.0 (6)C11-C12-C13-N1178.6 (6)
C4-C5-C6-C1型2.0 (9)C11-C12-C13-C81.9 (9)
N1-C1-C6-C71.7 (8)C7-C8-C13-N11.4 (8)
C2-C1-C6-C7型179.0 (5)C9-C8-C13-N1178.1 (5)
N1-C1-C6-C5型179.9 (5)C7-C8-C13-C12178.1 (5)
C2-C1-C6-C5型2.8 (8)C9-C8-C13-C122.4 (8)
对称代码:(i)x个+1,+1,z(z).
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C5-H5···Cl1ii(ii)0.952.743.589 (6)149
对称代码:(ii)x个,+2,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方[氯化钯2(C)13H(H)9否)2]
M(M)第页535.72
晶体系统,空间组三联诊所,P(P)1
温度(K)200
,b条,c(c)(Å)8.2114 (16), 8.8910 (18), 9.0105 (18)
α,β,γ(°)66.188 (4), 77.230 (4), 66.885 (4)
V(V))551.99 (19)
Z轴1
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)1.10
晶体尺寸(mm)0.20 × 0.12 × 0.09
数据收集
衍射仪布吕克智能1000 CCD
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,2000年)
T型最小值,T型最大值0.679, 1.000
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
3488, 2124, 1626
R(右)整数0.056
(罪θ/λ)最大值1)0.617
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.059, 0.107, 0.98
反射次数2124
参数数量142
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.83,0.66

计算机程序:智能(Bruker,2000),圣保罗(布鲁克,2000),架子97(Sheldrick,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),ORTEP-3公司(Farrugia,1997)和(斯佩克,2009)。

选定的几何参数(λ,º) 顶部
Pd1-N1型2.055 (4)第1页-Cl12.2975 (15)
N1-Pd1-Cl1型89.75 (12)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C5-H5···Cl10.952.743.589 (6)148.5
对称代码:(i)x个,+2,z(z).
 

致谢

这项工作得到了教育、科学和技术部资助的韩国国家研究基金会(NRF)优先研究中心项目的支持(2010-0029626)。

工具书类

第一次引用布鲁克(2000)。SADABS公司,智能圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Farrugia,L.J.(1997)。J.应用。克里斯特。 30, 565. 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Ha,K.(2010年).Z.克里斯塔洛格。新克里斯特。结构。 225, 663–664. 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Ha,K.(2010年b条).Z·克里斯托勒。新水晶。结构。 225, 693–694. 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Spek,A.L.(2009)。《水晶学报》。D类65, 148–155. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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