有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

(E类)-N个′-(2-氯苄叉)-3,5-二羟基苯甲酰肼二水合物

宁夏医科大学药学院,宁夏银川750004,中华人民共和国,b条宁夏医科大学中医学院,宁夏省,750004,中华人民共和国c中国民族大学少数民族传统医学中心,北京100081,中华人民共和国
*通信电子邮件:南药林10@126.com

(收到日期:2011年10月10日; 2011年10月14日接受; 在线2011年10月22日)

标题化合物的希夫碱分子量C14H(H)11氯离子2O(运行)·2小时2O、 苯环形成20.6(1)°的二面角。结晶的水分子参与了三维氢键网络的形成通过O-H…O和N-H…O氢键。

相关文献

有关希夫碱化合物的一般背景,请参见:Brückner等。(2000【Brückner,C.、Rettig,S.J.和Dolphin,D.(2000)。无机化学。39,6100-6106。】); 哈罗普等。(2003【Harrop,T.C.,Olmstead,M.M.&Mascharak,P.K.(2003),《化学通讯》,第410-411页。】); 等。(2008[张海清、李建中、张永和张德良(2008).中国无机化学杂志24,990-993.]). 相关结构见:刁等。(2007【Diao,Y.-P.,Zhang,J.-K.,Xie,S.-Q.&Kang,T.-G.(2007),《结晶学报》E63,o4908。】); 等。(2008[姜庆华,徐永华,建立英&赵立明(2008).《结晶学报》E64,o338.]); 等。(2008[黄,S.-S.,刁,Y.-P.&康,T.G.(2008).Z.Kristallogr.-新晶体结构.223,167-168.]); 等。(2009[Deng,S.,Han,L.,Huang,S.,Zhang,H.,Diao,Y.&Liu,K.(2009)。晶体学报E65,o721。]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类14H(H)11氯离子2O(运行)·2小时2O(运行)

  • M(M)第页= 326.73

  • 单诊所,P(P)21/c

  • = 8.023 (2) Å

  • b条= 11.852 (4) Å

  • c= 16.318 (5) Å

  • β= 100.387 (4)°

  • V(V)= 1526.1 (8) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.28毫米−1

  • T型=296千

  • 0.44×0.12×0.07毫米

数据收集
  • 布鲁克APEXII CCD衍射仪

  • 12729次测量反射

  • 3522独立反射

  • 2286次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.040

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.051

  • 水风险(F类2) = 0.140

  • S公司= 1.03

  • 3522次反射

  • 199个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.32埃−3

  • Δρ最小值=-0.33埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
氧气-氢气B类05年1月 0.82 1.87 2.674 (3) 168
臭氧-H3A类2010年1月 0.82 1.85 2.665 (2) 169
N2-H2气体A类●氧气ii(ii) 0.86 2.36 3.196 (3) 164
O4-H4型B类2010年1月 0.85 2.12 2.960 (4) 171
O5-H5型A类●O4 0.85 1.99 2.816 (4) 163
O5-H5型B类●臭氧iv(四) 0.85 2.14 2.902 (3) 150
对称码:(i)[x,-y+{\script{1\over2}},z-{\script}1\over 2}}]; (ii)[-x+1,y+{\script{1\over2}},-z+{\sscript{1\ower2}}]; (iii)x个+1,,z(z); (iv)[-x+1,y-{\script{1\over2}},-z+{\script}1\over 2}}].

数据收集:4月2日(布鲁克,2005年[Bruker(2005),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞细化: 4月2日; 数据缩减:圣保罗(布鲁克,2005年[Bruker(2005),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.

支持信息


注释顶部

已知希夫碱化合物具有抗菌和抗肿瘤特性(布吕克纳等。, 2000; 哈洛普等。, 2003; 等。, 2008). 为了扩大这一领域,我们在此报告标题化合物(I)的结构。

在(I)(图1)中,所有键的长度和角度都是正常的,并且与相关化合物(Diao等。, 2007; 等。, 2009; 等。2008年,江等。, 2008). 在Shiff碱分子中,两个苯环形成20.6(1)°的二面角。

晶体结构,分子间O-H··O和N-H··O氢键(表1)巩固了晶体堆积。

相关文献顶部

有关希夫碱化合物的一般背景,请参见:Brückner等。(2000); 哈洛普等。(2003); 等。(2008). 相关结构见:刁等。(2007); 等。(2008); 等。(2008); 等。(2009).

实验顶部

将2-氯苯甲醛(0.1 mmol,14.1 mg)和3,5-二羟基苯甲酰肼(0.1 mmov,16.8 mg)溶解在甲醇溶液(10 ml)中。在室温下将混合物搅拌1 h并过滤。将滤液在空气中保持三天后,形成黄色晶体。

精炼顶部

H原子被放置在计算位置(C-H 0.93 Au;N-H 0.86 Au;O-H 0.82 Au),并包含在精炼在骑乘模型近似中U型国际标准化组织(H) =)=1.2-1.5U型等式父原子的。

计算详细信息顶部

数据收集:智能[或4月2日?] (布鲁克,2001);细胞细化: 圣普卢斯(布鲁克,2003);数据缩减:圣普卢斯(布鲁克,2003);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXL97型(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)的分子结构显示原子编号和30%概率位移椭球。
(E类)-N个'-(2-氯亚苄基)-3,5-二羟基苯甲酰肼二水合物顶部
水晶数据 顶部
C类14H(H)11氯离子2O(运行)·2小时2O(运行)F类(000) = 680
M(M)第页= 326.73D类x个=1.422毫克
单诊所,P(P)21/cK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P2ybc4061次反射的单元参数
= 8.023 (2) Åθ= 2.5–27.1°
b条= 11.852 (4) ŵ=0.28毫米1
c= 16.318 (5) ÅT型=296千
β= 100.387 (4)°棍子,黄色
V(V)= 1526.1 (8) Å0.44×0.12×0.07毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
2286次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管R(右)整数= 0.040
石墨单色仪θ最大值= 27.6°,θ最小值= 2.1°
ϕω扫描小时=1010
12729次测量反射k个=1515
3522独立反射=2021
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.051氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.140受约束的氢原子参数
S公司= 1.03 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.044P(P))2+ 1.2P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c2)/3
3522次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
199个参数Δρ最大值=0.32埃
0个约束Δρ最小值=0.33埃
水晶数据 顶部
C类14H(H)11氯离子2O(运行)·2小时2O(运行)V(V)= 1526.1 (8) Å
M(M)第页= 326.73Z轴= 4
单诊所,P(P)21/cK(K)α辐射
= 8.023 (2) ŵ=0.28毫米1
b条= 11.852 (4) ÅT型=296千
c= 16.318 (5) Å0.44×0.12×0.07毫米
β= 100.387 (4)°
数据收集 顶部
布鲁克APEXII CCD
衍射仪
2286次反射> 2σ()
12729次测量反射R(右)整数= 0.040
3522独立反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0510个约束
水风险(F类2) = 0.140H原子参数受约束
S公司= 1.03Δρ最大值=0.32埃
3522次反射Δρ最小值=0.33埃
199个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2针对所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-基于的因素F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
第1类0.07549 (13)0.73732 (7)0.46696 (6)0.0836 (3)
O1公司0.4482 (3)0.20583 (16)0.45642 (10)0.0555 (5)
氧气0.7564 (2)0.07180 (15)0.22642 (10)0.0508 (5)
过氧化氢0.79320.04260.27160.076*
臭氧0.3480 (3)0.33745 (18)0.10033 (10)0.0615 (6)
H3A型0.38640.31770.05930.092*
N1型0.3161 (2)0.41028 (17)0.48357 (10)0.0374 (4)
氮气0.3589 (2)0.37857 (17)0.40850 (10)0.0368 (4)
过氧化氢0.34500.42520.36740.044*
C10.1081 (3)0.6554 (2)0.55602 (17)0.0472 (6)
指挥与控制0.0554 (4)0.6968 (3)0.6271 (2)0.0621 (8)
氢气0.00220.76660.62570.074*
C3类0.0818 (4)0.6351 (3)0.6986 (2)0.0678 (9)
H3级0.04830.66350.74620.081*
补体第四成份0.1571 (4)0.5318 (3)0.70062 (18)0.0687 (9)
H4型0.17380.48970.74950.082*
C5级0.2090 (4)0.4891 (3)0.63044 (16)0.0550 (7)
H5型0.25960.41840.63260.066*
C6级0.1866 (3)0.5505 (2)0.55659 (14)0.0382 (5)
抄送70.2396 (3)0.5047 (2)0.48164 (14)0.0371 (5)
H7型0.21710.54530.43210.044*
抄送80.4220 (3)0.2757 (2)0.39941 (12)0.0353 (5)
C9级0.4635 (3)0.25014 (19)0.31552 (12)0.0326 (5)
C10号机组0.5859 (3)0.16929 (19)0.31167 (12)0.0347 (5)
H10型0.63570.13020.35920.042*
C11号机组0.6334 (3)0.14750 (19)0.23525 (13)0.0351 (5)
第12条0.5573 (3)0.2046 (2)0.16457 (12)0.0387 (5)
H12型0.59160.19100.11400.046*
第13页0.4305 (3)0.2818 (2)0.16880 (12)0.0387 (5)
第14项0.3828 (3)0.3059 (2)0.24457 (13)0.0393 (5)
H14型0.29810.35850.24770.047*
O4号机组0.2697 (4)0.0135 (3)0.4316 (2)0.1159 (11)
H4A型0.31770.06880.45950.174*
人4b0.32660.04730.43390.174*
O5公司0.9176 (3)0.00817 (18)0.37266 (13)0.0690 (6)
H5A型1.01820.00700.40010.104*
H5B型0.85540.04650.39930.104*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
第1类0.1051 (7)0.0521 (5)0.0969 (7)0.0157 (5)0.0274 (6)0.0134 (4)
O1公司0.0881 (14)0.0572 (11)0.0272 (8)0.0154 (10)0.0261 (9)0.0084 (8)
氧气0.0624 (12)0.0562 (11)0.0360 (9)0.0213 (9)0.0146 (8)0.0016 (8)
臭氧0.0820 (14)0.0817 (14)0.0224 (8)0.0345 (12)0.0139 (8)0.0076 (8)
N1型0.0404 (11)0.0505 (12)0.0244 (8)0.0010 (9)0.0141 (8)0.0046 (8)
氮气0.0438 (11)0.0479 (11)0.0217 (8)0.0006 (9)0.0140 (8)0.0011 (8)
C10.0379 (14)0.0438 (14)0.0619 (16)0.0085 (11)0.0146 (12)0.0153 (12)
指挥与控制0.0455 (16)0.0534 (17)0.093 (2)0.0089 (13)0.0284 (16)0.0352 (17)
C3类0.0585 (19)0.087 (2)0.067 (2)0.0154 (17)0.0349 (16)0.0362 (18)
补体第四成份0.071 (2)0.097 (3)0.0449 (15)0.0004 (19)0.0279 (14)0.0074 (16)
C5级0.0568 (17)0.0714 (19)0.0414 (14)0.0092 (14)0.0212 (12)0.0046 (13)
C6级0.0311 (12)0.0477 (13)0.0384 (12)0.0053 (10)0.0131 (9)0.0095 (10)
抄送70.0366 (12)0.0455 (13)0.0311 (11)0.0054 (11)0.0114 (9)0.0022 (9)
抄送80.0394 (12)0.0451 (13)0.0240 (10)0.0002 (10)0.0129 (9)0.0016 (9)
C9级0.0368 (12)0.0419 (12)0.0209 (9)0.0035 (10)0.0103 (8)0.0017 (8)
C10号机组0.0403 (13)0.0412 (12)0.0235 (9)0.0004 (10)0.0081 (9)0.0006 (9)
C11号机组0.0406 (13)0.0376 (12)0.0290 (10)0.0009 (10)0.0112 (9)0.0055 (9)
第12条0.0497 (14)0.0474 (13)0.0220 (9)0.0015 (11)0.0146 (9)0.0062 (9)
第13页0.0464 (13)0.0481 (13)0.0222 (10)0.0042 (11)0.0076 (9)0.0001 (9)
第14项0.0464 (14)0.0480 (13)0.0257 (10)0.0100 (11)0.0124 (9)0.0005 (9)
O4号机组0.099 (2)0.098 (2)0.138 (3)0.0265 (18)0.0111 (19)0.0009 (19)
O5公司0.0685 (14)0.0749 (14)0.0616 (12)0.0020 (11)0.0063 (10)0.0216 (11)
几何参数(λ,º) 顶部
氯-1-C11.728 (3)C5至C61.391 (4)
O1-C8型1.235 (3)C5-H5型0.9300
氧气-C111.361 (3)C6至C71.469 (3)
O2-2b小时0.8200C7-H7型0.9300
臭氧-C131.362 (3)C8-C9型1.497 (3)
臭氧-H3A0.8200C9-C10型1.382 (3)
N1-C7型1.274 (3)C9-C14型1.388 (3)
N1-N2型1.383 (2)C10-C11号机组1.392 (3)
N2-C8气体1.338 (3)C10-H10型0.9300
N2-H2A气体0.8600C11-C121.381 (3)
C1-C61.392 (4)C12-2013年1.379 (3)
C1-C2类1.393 (4)C12-H12型0.9300
C2-C3型1.361 (5)C13至C141.388 (3)
C2-H2型0.9300C14-H14型0.9300
C3-C4型1.363 (5)O4-H4A型0.8500
C3-H3型0.9300O4-H4B型0.8500
C4-C5型1.383 (4)O5-羟色胺5a0.8500
C4-H4型0.9300O5-H5B型0.8500
C11-O2-H2B109.5N1-C7-H7型119.5
C13-O3-H3A109.5C6-C7-H7型119.5
C7-N1-N2114.36 (19)O1-C8-N2型122.96 (18)
C8-N2-N1120.34 (18)O1-C8-C9121.1 (2)
C8-N2-H2A型119.8N2-C8-C9115.90 (19)
N1-N2-H2A型119.8C10-C9-C14号机组121.39 (18)
C6-C1-C2型120.9 (3)C10-C9-C8号机组117.35 (19)
C6-C1-Cl1120.46 (19)C14-C9-C8121.3 (2)
C2-C1-Cl1型118.6 (2)C9-C10-C11118.7 (2)
C3-C2-C1120.1 (3)C9-C10-H10120.6
C3-C2-H2120C11-C10-H10型120.6
C1-C2-羟基120氧气-C11-C12117.05 (18)
C2-C3-C4型120.2 (3)氧气-C11-C10122.6 (2)
C2-C3-H3型119.9C12-C11-C10120.4 (2)
C4-C3-H3型119.9C13-C12-C11120.16 (18)
C3-C4-C5型120.4 (3)C13-C12-H12型119.9
C3-C4-H4型119.8C11-C12-H12型119.9
C5-C4-H4119.8O3-C13-C12型122.25 (18)
C4至C5至C6121.0 (3)O3-C13-C14型117.4 (2)
C4-C5-H5型119.5C12-C13-C14120.3 (2)
C6-C5-H5型119.5C9-C14-C13型118.9 (2)
C5-C6-C1117.4 (2)C9-C14-H14型120.6
C5-C6-C7121.1 (2)C13-C14-H14型120.6
C1-C6-C7型121.5 (2)H4A-O4-H4B116.3
N1-C7-C6120.9 (2)H5A-O5-H5B型109.2
C7-N1-N2-C8172.3 (2)O1-C8-C9-C1024.0 (3)
C6-C1-C2-C3型0.6 (4)N2-C8-C9-C10型154.7 (2)
Cl1-C1-C2-C3178.9 (2)O1-C8-C9-C14型156.3 (2)
C1-C2-C3-C4型1.1 (5)N2-C8-C9-C14型25.0 (3)
C2-C3-C4-C5型0.6 (5)C14-C9-C10-C112.8 (3)
C3-C4-C5-C6型0.4 (5)C8-C9-C10-C11号机组176.9 (2)
C4-C5-C6-C1型0.9 (4)C9-C10-C11-O2178.0 (2)
C4-C5-C6-C7型179.2 (3)C9-C10-C11-C121.0 (3)
C2-C1-C6-C5型0.4 (4)O2-C11-C12-C13型179.4 (2)
氯-1-C1-C6-C5179.9 (2)C10-C11-C12-C131.6 (4)
C2-C1-C6-C7型178.7 (2)C11-C12-C13-O3177.8 (2)
氯1-C1-C6-C71.7 (3)C11-C12-C13-C142.4 (4)
N2-N1-C7-C6179.62 (19)C10-C9-C14-C132.0 (4)
C5-C6-C7-N13.9 (4)C8-C9-C14-C13号机组177.7 (2)
C1-C6-C7-N1型177.8 (2)O3-C13-C14-C9179.6 (2)
N1-N2-C8-O11.5 (4)C12-C13-C14-C90.6 (4)
N1-N2-C8-C9179.82 (19)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
氧气-氢气B类···O5公司0.821.872.674 (3)168
臭氧-H3A类···O10.821.852.665 (2)169
N2-H2气体A类···氧气ii(ii)0.862.363.196 (3)164
O4-H4型B类···O10.852.122.960 (4)171
O5-H5型A类···O4号机组0.851.992.816 (4)163
O5-H5型B类···臭氧iv(四)0.852.142.902 (3)150
对称码:(i)x个,+1/2,z(z)1/2; (ii)x个+1,+1/2,z(z)+1/2; (iii)x个+1,,z(z); (iv)x个+1,1/2,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C类14H(H)11氯离子2O(运行)·2小时2O(运行)
M(M)第页326.73
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c
温度(K)296
,b条,c(Å)8.023 (2), 11.852 (4), 16.318 (5)
β(°)100.387 (4)
V(V))1526.1 (8)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.28
晶体尺寸(mm)0.44 × 0.12 × 0.07
数据收集
衍射仪布鲁克APEXII CCD
衍射仪
吸收校正
测量的、独立的和
观察到的[> 2σ()]反射
12729, 3522, 2286
R(右)整数0.040
(罪θ/λ)最大值1)0.653
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.051, 0.140, 1.03
反射次数3522
参数数量199
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.32,0.33

计算机程序:智能[或4月2日?] (Bruker,2001),圣普卢斯(布鲁克,2003),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O2-H2B··O50.821.872.674 (3)168.2
O3-H3A···O10.821.852.665 (2)169.3
N2-H2A··O2ii(ii)0.862.363.196 (3)163.5
O4-H4B···O10.852.122.960 (4)170.5
O5-H5A··O40.851.992.816 (4)163.2
O5-H5B···O3iv(四)0.852.142.902 (3)149.8
对称码:(i)x个,+1/2,z(z)1/2; (ii)x个+1,+1/2,z(z)+1/2; (iii)x个+1,,z(z); (iv)x个+1,1/2,z(z)+1/2.
 

致谢

本项目得到了国家自然科学基金(81102893号)、2011年宁夏科技攻关项目(2011-25号)和2009年宁夏科技重点项目(232号)的资助。

工具书类

第一次引用Brückner,C.、Rettig,S.J.和Dolphin,D.(2000)。无机化学 39, 6100–6106. 科学网 CSD公司 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
第一次引用布鲁克(2005)。4月2日圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Deng,S.、Han,L.、Huang,S.,Zhang,H.、Diao,Y.和Liu,K.(2009)。《水晶学报》。E类65,o721科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Diao,Y.-P.,Zhang,J.-K.,Xie,S.-Q.&Kang,T.-G.(2007)。《水晶学报》。E类63公元4908年科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Harrop,T.C.、Olmstead,M.M.和Mascharak,P.K.(2003)。化学。Commun公司。第410-411页科学网 CSD公司 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Huang,S.-S.,Diao,Y.-P.和Kang,T.G.(2008)。Z.克里斯塔洛格-新克里斯特。结构.223, 167–168. 中国科学院 谷歌学者
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第一次引用张海清、李建中、张永和张德良(2008)。下巴。无机化学杂志。 24, 990–993. 科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者

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