金属有机化合物\(第5em段)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

[μ-1,4-双(1,2,4-三唑-1-基甲基)苯]双[水-(吡啶-2,6-二羧基原子)铜(II)]一水合物

河北联合大学化工学院,唐山063009b条河北联合大学迁安学院,唐山063009
*通信电子邮件:tsdgying@126.com

(收到日期:2011年6月7日; 2011年6月13日接受; 在线2011年6月18日)

标题化合物[Cu2(C)7H(H)4)2(C)12H(H)12N个6)(H)2O)2]·H2O、 显示了一个离散的双核结构,其中中央Cu原子在扭曲的方形金字塔配位几何中是五配位的,柔性配体1,4-双(1,2,4-三唑-1-基甲基)苯采用双单齿桥接模式连接铜原子。它是由O-H…O氢键相互作用进一步组装而成的,这些氢键相互反应涉及到协调和非协调的水分子。后者显示出一半的入住率。

相关文献

有关柔性1,4-双(1,2,4-三唑-1-基-甲基)苯配体和相关配合物的多功能构象,请参见:Arion等人。(2003[Arion,V.B.,Reisner,E.,Fremuth,M.,Jakupec,M.A.,Keppler,B.K.,Kukushkin,V.Y.和Pombeiro,A.J.(2003)。Inorg.Chem.426024-6031。]); 等人。(2004【彭永发、李炳中、周建华、李炳良、张毅(2004)。《中国结构化学》第23期,第985-988页。】, 2006【彭玉凤、葛华英、李炳良、张瑜(2006).晶体生长设计6,994-998.】); 等人。(2004[Meng,X.,Song,Y.,Hou,H,Han,H,Xiao,B.,Fan,Y.&Zhu,Y.(2004).无机化学.43,3528-3536.]); 等人。(2005【李伯乐、彭玉芬、李伯中、张玉英(2005).化学通讯.182333-2335.】); Lin&Dong(2007)[Lin,J.&Dong,G.Y.(2007),《晶体学报》,E63,m1944。]); 等人。(2009[丁,B.,刘,Y.-Y.,黄,Y.Q.,石,W.,程,P.,廖,D.-Z.和严,S.-P.(2009).《晶体生长设计》第9期,第593-601页。]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [铜2(C)7H(H)4)2(C)12H(H)12N个6)(H)2O)2]·H2O(运行)

  • M(M)第页= 751.63

  • 单诊所,P(P)21/c

  • = 4.9017 (4) Å

  • b条= 10.3022 (9) Å

  • c= 30.178 (3) Å

  • β= 93.541 (1)°

  • V(V)= 1521.0 (2) Å

  • Z轴= 2

  • K(K)α辐射

  • μ=1.47毫米−1

  • T型=298千

  • 0.20×0.15×0.11毫米

数据收集
  • Bruker SMART CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])T型最小值= 0.881,T型最大值= 0.901

  • 7340次测量反射

  • 2678次独立反射

  • 2256次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.029

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.047

  • 水风险(F类2) = 0.161

  • S公司= 1.06

  • 2678次反射

  • 217个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=1.40埃−3

  • Δρ最小值=−0.40埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
氧气W公司-氢气华盛顿州·氧气W公司 0.85 2.15 2.920(5) 151
氧气W公司-氢气工作分解结构·氧气W公司 0.85 1.96 2.807 (5) 179
O1W公司-H1型华盛顿州●O4 0.83 1.93 2.746 (5) 168
O1W公司-H1型工作分解结构●臭氧iv(四) 0.86 1.86 2.692 (5) 164
对称代码:(i)-x个+2, -+2, -z(z); (ii)-x个+1, -+2, -z(z); (iii)[-x,y+{\script{1\over2}},-z+{\sscript{1\ower2}}]; (iv)x个+1,,z(z).

数据收集:聪明的(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART和SAINT。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.

支持信息


注释顶部

1,4-双(1,2,4-三唑-1-基甲基)苯(btx=1,4-双(2,2,4-三氮唑-1-甲基)苯)是一种含有二三唑的桥式配体,其中间隔物的柔性允许配体在与金属中心配位时弯曲和旋转,以符合金属离子的配位几何。(阿里昂,等人。, 2003; 彭,等人。, 2004, 2006; 孟,等人。, 2004; 等人。, 2005;等人。2007; 丁,等人。2009)为了进一步了解该配体的配位行为,我们在此报告晶体结构标题化合物(I)。

这个非对称单元(I)包含一个铜,一个2,6-吡啶二羧基,一个半btx配体,一个配位水分子和一个半自由水分子。铜中心是五坐标的扭曲方形金字塔坐标几何体。如图1所示,选定的几何参数见表1。每个铜由一个三齿双齿配体配位通过它们的羧酸盐和氮供体。(Cu1-N1=1.908(3);Cu1-O1=2.007(3);Cu(1)-O(3)=2.048。两个羧酸氧原子和两个氮原子定义了一个四角赤道平面,水-氧原子占据顶部位置。每个btx配体将两个由双轴相连的铜原子桥接成双核结构。在相同的btx配体中,咪唑环和苯环之间的二面角为70.0(4)°。值得注意的是,存在强大的氢键相互作用(表2),涉及双吡啶配体的羧基氧原子以及配位和自由水分子,这可能会进一步稳定晶体结构。

相关文献顶部

有关柔性1,4-双(1,2,4-三唑-1-基-甲基)苯配体和相关配合物的多功能构象,请参见:Arion等人。(2003); 等人。(2004, 2006); 等人。(2004); 等人。(2005); Lin&Dong(2007);等人。(2009年)。

实验顶部

Cu(NO)混合物)23小时2将O(120.5 mg,0.5 mmol)、2,6-吡啶二甲酸(167 mg,1 mmol),NaOH(80 mg,2 mm mol),btx(60 mg,0.5 mm2)和水(12 ml)密封在25 ml四氟乙烯内衬不锈钢反应器中并加热至413 K达72 h。在24 h内将反应冷却至室温。获得了适合X射线衍射分析的蓝色棱镜晶体1,产率为37%(基于btx)

精炼顶部

H原子被放置在计算位置,C-H=0.93或0.97Ω包含在精炼使用骑行模型U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(父原子)。水氢原子位于傅里叶差分图中,呈各向同性。

计算详细信息顶部

数据收集:聪明的(布鲁克,1998);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1998);数据缩减:圣保罗(布鲁克,1998);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。图1。(I)的部分分子结构,显示原子在30%概率水平下的位移椭球[对称代码:(I)-x个, -+ 3, -z(z))
[µ-1,4-双(1,2,4-三唑-1-基甲基)苯]双[水(吡啶-2,6-二羧酸)铜(II)]一水合物顶部
水晶数据 顶部
[铜2(C)7H(H)4)2(C)12H(H)12N个6)(H)2O)2]·H2O(运行)F类(000) = 764
M(M)第页= 751.63D类x个=1.641毫克
单诊所,P(P)21/cK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2ybc3568次反射的细胞参数
= 4.9017 (4) Åθ= 22.3–3.6°
b条= 10.3022 (9) ŵ=1.47毫米1
c= 30.178 (3) ÅT型=298千
β= 93.541 (1)°棱镜,蓝色
V(V)= 1521.0 (2) Å0.20×0.15×0.11毫米
Z轴= 2
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2678次独立反射
辐射源:细焦点密封管2256次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.029
ϕω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 2.1°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
小时=55
T型最小值= 0.881,T型最大值= 0.901k个=1212
7340次测量反射=3527
精炼 顶部
优化于F类2初级原子位点定位:结构不变的直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.047氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.161受约束的氢原子参数
S公司= 1.06 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.1045P(P))2+ 1.8845P(P)]
哪里P(P)=(F类o(o)2+ 2F类c2)/3
2678次反射(Δ/σ)最大值<0.001
217个参数Δρ最大值=1.40埃
0个约束Δρ最小值=0.40埃
水晶数据 顶部
[铜2(C)7H(H)4)2(C)12H(H)12N个6)(H)2O)2]·H2O(运行)V(V)= 1521.0 (2) Å
M(M)第页= 751.63Z轴= 2
单诊所,P(P)21/cK(K)α辐射
= 4.9017 (4) ŵ=1.47毫米1
b条= 10.3022 (9) ÅT型=298千
c= 30.178 (3) Å0.20×0.15×0.11毫米
β= 93.541 (1)°
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2678次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
2256次反射> 2σ()
T型最小值= 0.881,T型最大值= 0.901R(右)整数= 0.029
7340次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.0470个约束
水风险(F类2) = 0.161受约束的氢原子参数
S公司= 1.06Δρ最大值=1.40埃
2678次反射Δρ最小值=0.40埃
217个参数
特殊细节 顶部

几何图形所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)都是使用全协方差矩阵估计的。在估计距离、角度和扭转角中的e.s.d.时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类,以及R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式开路特性。(<1)
铜10.08344(10)0.98034 (5)0.149509 (16)0.0318 (2)
臭氧0.1809(6)0.9403 (3)0.19769 (10)0.0376 (7)
O10.3528 (6)0.9508 (3)0.10311 (10)0.0392 (7)
N1型0.1905 (7)0.8071 (3)0.16460 (11)0.0300 (8)
抄送70.1409 (9)0.8318 (4)0.21771 (14)0.0328 (9)
O4号机组0.2555 (7)0.7960 (3)0.25024 (11)0.0469(8)
4号机组0.0779 (7)1.1422 (3)0.12697 (12)0.0346 (8)
C20.3801 (9)0.7519 (4)0.14164 (14)0.0335(9)
C3类0.4592 (10)0.6261(4)0.15103 (16)0.0419 (11)
H3级0.59170.58590.13500.050*
C6级0.0697 (8)0.7462 (4)0.19736 (13)0.0309 (9)
氧气0.6818 (8)0.8113 (4)0.08671 (12)0.0565 (10)
C11号机组0.1952 (9)1.4310 (5)0.02197 (15)0.0415 (11)
C1类0.4833 (9)0.8436 (4)0.10695 (14)0.0358 (10)
C5级0.1422 (10)0.6216 (4)0.20832 (16)0.0417 (11)
H5型0.06130.57870.23120.050*
第12项0.0882(11)1.3819 (5)0.01557 (17)0.0486 (12)
H12型0.14731.30160.02660.058*
补体第四成份0.3384 (10)0.5605 (5)0.18465(17)0.0453 (11)
H4型0.38900.47540.19140.054*
O1瓦0.3552(8)1.0793(4)0.20033 (14)0.0698 (13)
氮气0.2780 (8)1.2853 (4)0.08451 (13)0.0439 (10)
第13页0.1072 (11)1.5492 (5)0.03729 (17)0.0492 (12)
H13型0.17881.58410.06250.059*
C10号机组0.4037 (11)1.3552 (6)0.04620 (19)0.0576 (15)
H10A型0.54111.41440.05620.069*
H10B型0.49421.29360.02590.069*
C9级0.1903 (11)1.1643(5)0.08746 (16)0.0465 (12)
H9型0.20641.10370.06460.056*
第3页0.2233 (16)1.3460 (5)0.12323 (17)0.092(2)
抄送80.1028 (17)1.2542 (6)0.14744 (19)0.080 (2)
H8型0.03981.26720.17680.096*
O2瓦0.746 (3)0.9295 (7)0.0049 (2)0.092 (4)0.50
H2WA公司0.91520.94720.00770.137*0.50
过氧化氢0.59660.97140.00180.137*0.50
H1WA公司0.32011.13700.21830.137*
H1WB公司0.51771.04750.20230.137*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
铜10.0373 (4)0.0240 (3)0.0348 (4)0.0079 (2)0.0068 (2)0.00618 (19)
臭氧0.0425 (17)0.0334 (16)0.0376(16)0.0129 (14)0.0083 (13)0.0073 (14)
O10.0469 (18)0.0330 (16)0.0390 (17)0.0053(14)0.0130 (14)0.0077 (13)
N1型0.0351 (19)0.0255 (17)0.0296 (18)0.0040 (14)0.0026 (14)0.0005 (14)
抄送70.037 (2)0.030 (2)0.033 (2)0.0001 (18)0.0042 (18)0.0012 (17)
O4号机组0.063 (2)0.0381 (18)0.0418(18)0.0049 (16)0.0205(16)0.0073 (15)
4号机组0.042 (2)0.0274 (18)0.035 (2)0.0085 (15)0.0039(15)0.0055 (15)
C20.038 (2)0.030 (2)0.032(2)0.0025(18)0.0025 (17)0.0045 (17)
C3类0.047 (3)0.031 (2)0.048 (3)0.013 (2)0.009(2)0.003 (2)
C6级0.036 (2)0.026 (2)0.030 (2)0.0017 (17)0.0005 (17)0.0018 (17)
氧气0.063 (2)0.054 (2)0.056 (2)0.0176 (18)0.0296 (18)0.0073 (17)
C11号机组0.043 (3)0.038 (3)0.043 (3)0.010 (2)0.006 (2)0.015 (2)
C1类0.044 (3)0.031 (2)0.033 (2)0.0020 (19)0.0056 (19)0.0015 (17)
C5级0.051 (3)0.030 (2)0.044 (3)0.004 (2)0.008 (2)0.008 (2)
第12项0.062 (3)0.031 (2)0.051 (3)0.004 (2)0.003 (2)0.003 (2)
补体第四成份0.056 (3)0.024(2)0.056 (3)0.010 (2)0.008 (2)0.006 (2)
O1瓦0.049 (2)0.074(3)0.083 (3)0.026 (2)0.0229 (19)0.046 (2)
氮气0.046 (2)0.041(2)0.045 (2)0.0095 (18)0.0008 (17)0.0148 (18)
第13页0.066 (3)0.045(3)0.037 (3)0.013 (3)0.007 (2)0.003 (2)
C10号机组0.049 (3)0.060 (3)0.063 (3)0.010 (3)0.004 (2)0.034 (3)
C9级0.068 (3)0.031 (2)0.040 (3)0.005 (2)0.005 (2)0.006 (2)
第3页0.173 (6)0.051 (3)0.049 (3)0.057 (4)0.007 (3)0.000 (2)
抄送80.155 (7)0.043 (3)0.039 (3)0.042 (4)0.015(3)0.001 (2)
O2瓦0.235 (12)0.026 (4)0.017 (3)0.038 (5)0.034 (5)0.010 (3)
几何参数(λ,º) 顶部
Cu1-N1型1.908 (3)C11-C10型1.510 (7)
铜1-N41.950(3)C5-C4类1.384 (7)
Cu1-O12.006 (3)C5-H5型0.9300
Cu1-O32.048 (3)C12-C13型1.389(7)
铜-O1W2.217 (4)C12-H12型0.9300
臭氧-C71.280 (5)C4-H4型0.9300
O1-C1型1.278 (5)O1W-H1WA型0.8301
N1-C2型1.322 (5)O1W-H1WB型0.8599
N1-C6型1.339 (5)N2-C9气体1.319 (6)
C7-O4型1.218 (5)N2-N3气体1.338 (6)
C7-C6型1.517 (6)N2-C10气体1.466 (6)
N4-C9型1.302 (6)C13-C12号机组1.389(7)
编号4-C81.318 (7)C13-H13型0.9300
C2-C3型1.377 (6)C10-H10A型0.9700
C2-C1型1.520 (6)C10-H10B型0.9700
C3-C4型1.382 (7)C9-H90.9300
C3至H30.9300N3-C8号1.313 (7)
C6-C5型1.367 (6)C8-H8型0.9300
氧气-C11.226 (5)O2W-H2WA型0.8500
C11-C13号机组1.364 (8)氧气-H2WB0.8482
C11-C12号机组1.374 (7)
N1-Cu1-N4型169.43 (16)氧气-C1-C2118.8 (4)
N1-Cu1-O1型80.88 (13)O1-C1-C2型114.4 (4)
N4-Cu1-O199.00 (14)C6-C5-C4118.7 (4)
N1-Cu1-O3型79.57 (13)C6-C5-H5型120.6
N4-铜1-O399.15 (13)C4-C5-H5型120.6
O1-Cu1-O3159.60 (14)C11-C12-C13型120.7 (5)
N1-Cu1-O1W型96.92 (16)C11-C12-H12型119.7
N4-Cu1-O1W型93.53 (15)第13页-C12-H12型119.7
O1-Cu1-O1W型99.18 (15)C3-C4-C5型120.0 (4)
O3-Cu1-O1W型88.91 (16)C3-C4-H4型120
C7-O3-Cu1115.2 (3)C5-C4-H4120
C1-O1-Cu1114.5 (3)Cu1-O1W-H1WA129.9
C2-N1-C6122.9 (4)Cu1-O1W-H1WB112.7
C2-N1-Cu1118.0 (3)H1WA-O1W-H1WB117.2
C6-N1-Cu1119.1 (3)C9-N2-N3109.6 (4)
O4-C7-O3125.5 (4)C9-N2-C10129.6(5)
O4-C7-C6120.6 (4)N3-N2-C10号120.7 (4)
O3-C7-C6113.9 (3)C11-C13-C12120.6(5)
C9-N4-C8103.3 (4)C11-C13-H13型119.7
C9-N4-Cu1化合物127.5 (3)第12项-C13-H13型119.7
C8-N4-Cu1型129.2 (3)N2-C10-C11型111.8 (4)
N1-C2-C3型119.7(4)N2-C10-H10A型109.2
N1-C2-C1111.6 (4)C11-C10-H10A型109.2
C3-C2-C1128.7 (4)N2-C10-H10B型109.2
C2-C3-C4型118.9 (4)C11-C10-H10B型109.2
C2-C3-H3型120.6H10A-C10-H10B型107.9
C4-C3-H3型120.6N4-C9-N2号110.2 (4)
N1-C6-C5119.9 (4)N4-C9-H9型124.9
N1-C6-C7号机组111.7 (3)N2-C9-H9型124.9
C5-C6-C7128.5 (4)C8-N3-N2型102.0 (5)
C13-C11-C12型118.7 (5)N3-C8-N4号114.9 (5)
C13-C11-C10120.4(5)N3-C8-H8型122.5
C12-C11-C10120.9 (5)N4-C8-H8型122.5
氧气-C1-O1126.7 (4)H2WA-O2W-H2WB137
对称代码:(i)x个,+3,z(z).
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
氧气W公司-氢气华盛顿州···氧气W公司0.852.152.920(5)151
氧气W公司-氢气工作分解结构···氧气W公司0.851.962.807 (5)179
O1W公司-H1型华盛顿州···O4号机组iv(四)0.831.932.746 (5)168
O1W公司-H1型工作分解结构···臭氧v(v)0.861.862.692 (5)164
对称代码:(ii)x个+2,+2,z(z); (iii)x个+1,+2,z(z); (iv)x个,+1/2,z(z)+1/2; (v)x个+1,,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方[铜2(C)7H(H)4)2(C)12H(H)12N个6)(H)2O)2]·H2O(运行)
M(M)第页751.63
水晶系统,太空组单诊所,P(P)21/c
温度(K)298
,b条,c(Å)2017年9月9日(4)、2022年10月10日(9)、1978年11月30日(3)
β(°)93.541 (1)
V(V))1521.0 (2)
Z轴2
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)1.47
晶体尺寸(mm)0.20 × 0.15 × 0.11
数据收集
衍射仪布吕克聪明的CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
T型最小值,T型最大值0.881, 0.901
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
7340, 2678, 2256
R(右)整数0.029
(罪θ/λ)最大值1)0.595
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.047, 0.161, 1.06
反射次数2678
参数数量217
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))1.40,0.40

计算机程序:聪明的(Bruker,1998),圣保罗(Bruker,1998),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O2W-H2WA··O2W0.852.1472.920 (5)151
O2W-H2WB··O2W0.851.9592.807 (5)179.11
O1W-H1WA··O40.831.9282.746 (5)167.54
O1W-H1WB···O3iv(四)0.861.8592.692(5)163.64
对称代码:(i)x个+2,+2,z(z); (ii)x个+1,+2,z(z); (iii)x个,+1/2,z(z)+1/2; (iv)x个+1,,z(z).
 

致谢

作者感谢河北联合大学对这项工作的支持。

工具书类

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第一次引用布鲁克(1998)。聪明的圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
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