有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

4-(4-硝基苯甲酰基)吗啉

四川大学化工学院应用化学系,成都610041,中华人民共和国,b条四川大学华西医学院华西医院生物治疗与癌症中心国家重点实验室,成都610041c(c)中华人民共和国成都610041四川大学华西药学院
*通信电子邮件:xieym@scu.edu.cn

(收到日期:2011年1月6日; 2011年2月17日接受; 在线2011年3月2日)

在标题化合物中,C11H(H)14N个2O(运行),硝基O原子和相邻苯环之间的分子间相互作用有助于稳定晶体结构[N­形心=3.933(2)¦Μ]。晶体填充中未观察到经典氢键。

相关文献

有关4-(4-硝基苯甲酰基)吗啉衍生物的生物活性,请参见:Lan等人。(2010[Lan,P.,Chen,W.N.,Xiao,G.K.,Sun,P.H.&Chen,W.M.(2010).生物有机医学化学快报20,6764-6772.]); 巴韦提亚斯等人。(2010【Bavetsias,V.、Large,J.M.、Sun,C.、Bouloc,N.、Kosmopoulou,M.、Matteuci,M.,Wilsher,N.E.、Martins,V..、Reynisson,J.、Atrash,B.、Faisal,A.、Urban,F.、Valenti,M.和Brandon,A.H.、Box,G.、Raynaud,F.I.、Workman,P.、Eccles,S.A.、Richard,B.、Julian,L.S.和McDonald,E.(2010)。《医学化学杂志》第53期,第5213-5228页。】). 合成见:Tsou等人。(2008【Tsou,H.R.、Otteng,M.、Tran,T.、Brawner Floyd,M.,Marvin Reich,Jr、Birnberg,G.、Kutter,K.、Ayral-Kaloustian,S.、Ravi,M.和Nilakatan,R.、Grillo,M.以及McGinnis,J.P.和Rabindran,S.K.(2008)。《医学化学杂志》第51期,第3507-3525页。】). 有关标准粘结长度,请参见:艾伦等人。(1987【Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987)。《化学文摘》,Perkin Trans.2,第1-19页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类11H(H)14N个2O(运行)

  • M(M)第页= 222.24

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 6.1371 (2) Å

  • b条= 8.2535 (4) Å

  • c(c)= 21.9867 (9) Å

  • β= 94.929 (3)°

  • V(V)= 1109.58 (8) Å

  • Z= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.10毫米−1

  • T型=293千

  • 0.40×0.30×0.25毫米

数据收集
  • 牛津衍射Xcalibur Eos衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(CrysAlis专业; 牛津衍射,2006【牛津衍射(2006)。CrysAlis PRO.牛津衍射有限公司,英国阿宾顿。】)T型最小值= 0.946,T型最大值= 1.0

  • 6059次测量反射

  • 2264个独立反射

  • 1640次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.018

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.044

  • 水风险(F类2) = 0.106

  • S公司= 1.04

  • 2264次反射

  • 145个参数

  • H原子参数受约束

  • Δρ最大值=0.12埃−3

  • Δρ最小值=−0.13埃−3

数据收集:CrysAlis专业(牛津衍射,2006【牛津衍射(2006)。CrysAlis PRO.牛津衍射有限公司,英国阿宾顿。】); 细胞精细化: CrysAlis专业; 数据缩减:CrysAlis专业; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:有机发光二极管2(多洛曼诺夫等人。, 2009【Dolomanov,O.V.、Bourhis,L.J.、Gildea,R.J.、Howard,J.A.K.和Puschmann,H.(2009),《应用结晶杂志》第42期,第339-341页。】); 用于准备出版材料的软件:有机发光二极管2.

支持信息


注释顶部

4-(4-硝基苄基)吗啉衍生物由于其抗癌活性(Lan等人。, 2010; 巴韦提亚斯等人。, 2010). 标题化合物是我们抗癌药物合成研究中的关键中间体之一。本文合成了标题化合物并报道了其晶体结构。在标题化合物中,C11H(H)14N个2O(运行),(图1),键的长度和角度在正常范围内(艾伦等人。, 1987). 苯基环和吗啉环之间最佳平面的二面角为87.78(10)°。硝基原子O3和苯环之间的分子间相互作用有助于稳定晶体结构。距离O3··Cg(1)为3.647(2)Ω(图2,Cg(1)是苯环C1-C6的质心,对称运算(a) :-x个, -1/2+, 1/2-z(z)). 在晶体填料中没有观察到经典氢键。

相关文献顶部

有关4-(4-硝基苄基)吗啉衍生物的生物活性,请参见:Lan等人。(2010); 巴韦提亚斯等人。(2010). 合成见:Tsou等人。(2008). 有关标准粘结长度,请参见:艾伦等人。(1987).

实验顶部

标题化合物的制备方法与邹的类似等人。(2008). 适用于X射线分析的晶体是通过从二氯甲烷溶液中缓慢蒸发获得的。

精炼顶部

所有H原子均以几何方式定位(C-H=0.93–0.97 Au,N–H=0.91 Au),并允许骑在其母原子上U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(父级)。

计算详细信息顶部

数据收集:CrysAlis专业(牛津衍射,2006);细胞精细化: CrysAlis专业(牛津衍射,2006);数据缩减:CrysAlis专业(牛津衍射,2006);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:OLEX2(多洛曼诺夫等人。, 2009); 用于准备出版材料的软件:OLEX2(多洛曼诺夫等人。, 2009).

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构和原子编号方案。位移椭球体是在30%的概率水平上绘制的。
[图2] 图2。标题化合物的堆积图显示了硝基原子O3和苯环C1-C6之间的分子间相互作用(虚线)(由粉红色球体表示的质心)。
4-(4-硝基苯)吗啉顶部
水晶数据 顶部
C类11H(H)14N个2O(运行)F类(000) = 472
M(M)第页= 222.24x个=1.330毫克
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.7107 Å
大厅符号:-P 2ybc2399次反射的细胞参数
= 6.1371 (2) Åθ= 3.1–29.2°
b条= 8.2535 (4) ŵ=0.10毫米1
c(c)= 21.9867 (9) ÅT型=293千
β= 94.929 (3)°块,黄色
V(V)= 1109.58 (8) Å0.40×0.30×0.25毫米
Z= 4
数据收集 顶部
牛津衍射Xcalibur Eos
衍射仪
2264个独立反射
辐射源:细焦点密封管1640次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.018
探测器分辨率:16.0874像素mm-1θ最大值= 26.4°,θ最小值= 3.1°
ω扫描小时=77
吸收校正:多扫描
(CrysAlis专业; 牛津衍射,2006)
k个=810
T型最小值= 0.946,T型最大值= 1.0=2527
6059次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.044氢站点位置:根据邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.106H原子参数受约束
S公司= 1.04 = 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0423P(P))2+ 0.1325P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
2264次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
145个参数Δρ最大值=0.12埃
0个约束Δρ最小值=0.13埃
水晶数据 顶部
C类11H(H)14N个2O(运行)V(V)= 1109.58 (8) Å
M(M)第页= 222.24Z= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 6.1371 (2) ŵ=0.10毫米1
b条= 8.2535 (4) ÅT型=293千
c(c)= 21.9867 (9) Å0.40×0.30×0.25毫米
β= 94.929 (3)°
数据收集 顶部
牛津衍射Xcalibur Eos
衍射仪
2264个独立反射
吸收校正:多扫描
(CrysAlis专业; 牛津衍射,2006)
1640次反射> 2σ()
T型最小值= 0.946,T型最大值= 1.0R(右)整数= 0.018
6059次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0440个约束
水风险(F类2) = 0.106H原子参数受约束
S公司= 1.04Δρ最大值=0.12埃
2264次反射Δρ最小值=0.13埃
145个参数
特殊细节 顶部

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼F的细化2对抗所有反射。加权R系数wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O1公司0.40024 (19)0.31753 (14)0.53296 (5)0.0556 (3)
氧气0.4376 (2)0.42771 (17)0.28701 (7)0.0751 (4)
臭氧0.1642 (2)0.57082 (16)0.32340 (8)0.0808 (5)
N1型0.33645 (19)0.14840 (16)0.41946 (6)0.0417 (3)
氮气0.2491 (2)0.44089 (19)0.30912 (6)0.0530 (4)
C1类0.1173 (2)0.29260 (19)0.31894 (7)0.0413 (4)
指挥与控制0.2096 (2)0.1454 (2)0.30324 (7)0.0461 (4)
氢气0.35210.13920.28530.055*
C3类0.0870 (2)0.0064 (2)0.31460 (7)0.0467 (4)
H3级0.14840.09410.30440.056*
补体第四成份0.1268 (2)0.0148 (2)0.34109 (7)0.0420 (4)
C5级0.2166 (2)0.1668 (2)0.35492 (7)0.0468 (4)
H5型0.36050.17430.37180.056*
C6级0.0965 (3)0.3056 (2)0.34414 (7)0.0471 (4)
H6型0.15760.40660.35360.057*
抄送70.2629 (3)0.1353 (2)0.35452 (7)0.0493 (4)
H7A型0.38930.13250.33090.059*
H7B型0.17710.23020.34210.059*
抄送80.5018 (2)0.2751 (2)0.43006 (8)0.0499 (4)
H8B型0.44090.37850.41620.060*
H8A型0.62560.25130.40690.060*
C9级0.5767 (3)0.2851 (2)0.49693 (9)0.0550 (5)
H9A型0.64510.18350.51000.066*
H9B型0.68530.37010.50330.066*
C10号机组0.1559 (2)0.1839 (2)0.45620 (8)0.0502 (4)
H10A型0.04660.09910.45070.060*
H10B型0.08790.28550.44300.060*
C11号机组0.2381 (3)0.1952 (2)0.52265 (8)0.0566 (5)
H11B型0.11650.21910.54660.068*
H11A型0.29920.09160.53610.068*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O1公司0.0660 (7)0.0481 (7)0.0523 (7)0.0032 (6)0.0017 (6)0.0124 (6)
氧气0.0609 (8)0.0800 (10)0.0819 (10)0.0136 (7)0.0089 (7)0.0130 (8)
臭氧0.0861 (10)0.0489 (9)0.1079 (12)0.0023 (7)0.0107 (8)0.0089 (8)
N1型0.0422 (7)0.0462 (8)0.0372 (7)0.0052 (6)0.0053 (5)0.0017 (6)
氮气0.0584 (9)0.0565 (10)0.0451 (8)0.0045 (7)0.0101 (7)0.0050 (7)
C1类0.0460 (9)0.0465 (10)0.0314 (8)0.0000 (7)0.0045 (6)0.0033 (7)
指挥与控制0.0416 (8)0.0573 (11)0.0385 (9)0.0041 (7)0.0026 (7)0.0006 (8)
C3类0.0516 (9)0.0469 (10)0.0408 (9)0.0081 (7)0.0002 (7)0.0019 (7)
补体第四成份0.0474 (9)0.0495 (10)0.0294 (8)0.0016 (7)0.0055 (6)0.0017 (7)
C5级0.0399 (8)0.0607 (12)0.0394 (9)0.0034 (8)0.0001 (7)0.0014 (8)
C6级0.0502 (9)0.0476 (10)0.0435 (9)0.0104 (7)0.0044 (7)0.0016 (8)
抄送70.0542 (9)0.0555 (11)0.0386 (9)0.0047 (8)0.0065 (7)0.0027 (8)
抄送80.0463 (9)0.0492 (11)0.0546 (11)0.0072 (7)0.0059 (7)0.0007 (8)
C9级0.0523 (10)0.0501 (11)0.0610 (12)0.0059 (8)0.0047 (8)0.0050 (9)
C10号机组0.0457 (9)0.0588 (11)0.0468 (10)0.0069 (7)0.0080 (7)0.0067 (8)
C11号机组0.0632 (11)0.0609 (12)0.0472 (10)0.0092 (9)0.0128 (8)0.0105 (9)
几何参数(λ,º) 顶部
O1至C91.421 (2)C5-H5型0.9300
2011年1月1.4218 (19)C5至C61.372 (2)
氧气-氮气1.2210 (17)C6-H6型0.9300
O3-N2气体1.2214 (17)C7-H7A型0.9700
N1-C7型1.4641 (19)C7-H7B型0.9700
N1-C8型1.4616 (19)C8-H8B型0.9700
N1-C10型1.456 (2)C8-H8A型0.9700
N2-C1气体1.473 (2)C8-C91.504 (2)
C1-C2类1.372 (2)C9-H9A型0.9700
C1-C6号机组1.384 (2)C9-H9B型0.9700
C2-H2型0.9300C10-H10A型0.9700
C2-C3型1.383 (2)C10-H10B型0.9700
C3-H3型0.9300C10-C11号机组1.507 (2)
C3-C4型1.3911 (19)C11-H11B型0.9700
C4-C5型1.393 (2)C11-H11A型0.9700
C4至C71.509 (2)
O1-C9-C8111.83 (13)C4-C3-H3型119.6
O1-C9-H9A型109.3C4-C5-H5型119.4
O1-C9-H9B型109.3C4-C7-H7A型109.3
O1-C11-C10型111.71 (14)C4-C7-H7B型109.3
O1-C11-H11B型109.3C5-C4-C7119.67 (13)
O1-C11-H11A型109.3C5-C6-C1118.75 (15)
氧气-N2-O3123.32 (15)C5-C6-H6120.6
氧气-N2-C1118.31 (15)C6-C1-N2118.95 (15)
臭氧-N2-C1118.38 (14)C6-C5-C4121.20 (14)
N1-C7-C4111.73 (13)C6-C5-H5型119.4
N1-C7-H7A型109.3H7A-C7-H7B型107.9
N1-C7-H7B型109.3C8-N1-C7号机组111.09 (12)
N1-C8-H8B型109.6C8-C9-H9A型109.3
N1-C8-H8A型109.6C8-C9-H9B型109.3
N1-C8-C9110.15 (14)H8B-C8-H8A型108.1
N1-C10-H10A109.6C9-O1-C11109.49 (13)
N1-C10-H10B109.6C9-C8-H8B109.6
N1-C10-C11号机组110.07 (13)C9-C8-H8A109.6
C1-C2-H2120.6H9A-C9-H9B107.9
C1-C2-C3118.87 (14)C10-N1-C7号机组111.73 (12)
C1-C6-H6型120.6C10-N1-C8号机组108.57 (13)
C2-C1-N2型119.30 (14)C10-C11-H11B型109.3
C2-C1-C6型121.76 (15)C10-C11-H11A型109.3
C2-C3-H3型119.6H10A-C10-H10B型108.2
C2-C3-C4型120.88 (15)C11-C10-H10A型109.6
C3-C2-H2120.6C11-C10-H10B型109.6
C3-C4-C5型118.51 (15)H11B-C11-H11A107.9
C3-C4-C7型121.81 (15)

实验细节

水晶数据
化学配方C类11H(H)14N个2O(运行)
M(M)第页222.24
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)6.1371 (2), 8.2535 (4), 21.9867 (9)
β(°)94.929 (3)
V(V))1109.58 (8)
Z4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.10
晶体尺寸(mm)0.40 × 0.30 × 0.25
数据收集
衍射仪牛津衍射Xcalibur Eos
衍射仪
吸收校正多扫描
(CrysAlis专业; 牛津衍射,2006)
T型最小值,T型最大值0.946, 1.0
测量的、独立的和
观察到的[> 2σ()]反射
6059, 2264, 1640
R(右)整数0.018
(罪θ/λ)最大值1)0.625
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.044, 0.106, 1.04
反射次数2264
参数数量145
氢原子处理H原子参数受约束
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.12,0.13

计算机程序:CrysAlis专业(牛津衍射,2006),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),OLEX2(多洛曼诺夫等人。, 2009).

 

鸣谢

我们感谢四川大学分析测试中心的X射线测量。

工具书类

第一次引用Allen,F.H.、Kennard,O.、Watson,D.G.、Brammer,L.、Orpen,A.G.和Taylor,R.(1987年)。化学杂志。Soc.Perkin事务处理。2第1-19页交叉参考 科学网 谷歌学者
第一次引用Bavetsias,V.、Large,J.M.、Sun,C.、Bouloc,N.、Kosmopoulou,M.、Matteuci,M.,Wilsher,N.E.、Martins,V、Reynisson,J.、Atrash,B.、Faisal,A.、Urban,F.、Valenti,M.和Brandon,A.H.、Box,G.、Raynaud,F.I.、Workman,P.、Eccles,S.A.、Richard,B.、Julian,L.S.和McDonald,E.(2010年)。医学化学杂志。 53, 5213–5228. 科学网 交叉参考 中国科学院 公共医学 谷歌学者
第一次引用Dolomanov,O.V.、Bourhis,L.J.、Gildea,R.J.、Howard,J.A.K.和Puschmann,H.(2009)。J.应用。克里斯特。 42, 339–341. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Lan,P.、Chen,W.N.、Xiao,G.K.、Sun,P.H.和Chen,W.M.(2010)。生物有机医药化学。莱特。 20, 6764–6772. 科学网 交叉参考 中国科学院 公共医学 谷歌学者
第一次引用牛津衍射(2006)。CrysAlis专业英国阿宾顿牛津衍射有限公司。 谷歌学者
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