有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

4-溴-3-羟基苯甲酸甲酯

广东工业大学化工与轻工业学院,广东广州510006,中华人民共和国
*通信电子邮件:corihhr@yahoo.cn

(收到日期:2010年11月25日; 2010年12月8日接受; 在线2010年12月11日)

在标题化合物中,C8H(H)7溴化氢,甲氧羰基相对于苯环以8.06(4)°的二面角扭曲。在晶体中,分子通过O-H­O氢键连接成沿着b条轴。

相关文献

有关3-羟基苯甲酸甲酯衍生物在合成各种广谱抗菌剂中的应用,请参见:Zhong等人。(2001【Zhong,Z.、Ikeda,A.、Shinkai,S.、Sakamoto,S.和Yamaguchi,K.(2001)。组织通讯3,1085-1087。】). 标题化合物的合成参见:聂等人。(2005[聂,Z.,佩雷塔,C.,卢,J.,苏,Y.,马戈西亚克,S.,加吉瓦拉,K.S.,科尔特斯,J.、尼库林,V.,Yager,K.M.,Appelt,K.&Chu,S.(2005).医学化学杂志.481596-1609.])。

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类8H(H)7溴化氢

  • M(M)第页= 231.05

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 10.812 (4) Å

  • b条= 6.317 (2) Å

  • c(c)=12.490(5)Å

  • β= 100.164 (6)°

  • = 839.7 (5) Å

  • Z轴= 4

  • Kα辐射

  • μ=4.86毫米−1

  • T型=293千

  • 0.27×0.24×0.16毫米

数据收集
  • Bruker SMART CCD 1000衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])T型最小值= 0.354,T型最大值= 0.511

  • 4755次测量反射

  • 1831独立反射

  • 1129次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.042

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.058

  • 水风险(F类2) = 0.172

  • S公司= 1.08

  • 1831次反射

  • 111个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.46埃−3

  • Δρ最小值=-0.55埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) 小时A类 D类A类 D类-H月A类
O1-H1氧气 0.82 1.87 2.681 (7) 170
对称代码:(i)[-x+1,y+{\script{1\over2}},-z+{\sscript{3\over2{}]

数据收集:智能(布鲁克,1999年[Bruker(1999)。SMART和SAINT-Plus.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞精细化: 圣普卢斯(布鲁克,1999年[Bruker(1999)。SMART和SAINT-Plus.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 数据缩减:圣普卢斯; 用于求解结构的程序:架子97(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司

支持信息


注释顶部

3-羟基苯甲酸甲酯衍生物作为重要的起始原料,已被应用于合成各种广谱抗菌剂(Nie等人。,2005),并设计超分子化学自组装中的隐黄素衍生物(钟等人。, 2001). 这里我们报告了标题化合物的结构(图1)。

晶体结构在标题化合物中,羟基和羰基之间通过分子间O-H··O氢键连接,沿着b条轴(表1和图2)。链之间没有观察到明显的相互作用。

相关文献顶部

有关3-羟基苯甲酸甲酯衍生物在合成各种广谱抗菌剂中的应用,请参见:钟等人。(2001). 标题化合物的合成参见:聂等人。(2005).

实验顶部

标题化合物的合成与之前的报道相同(聂等人。, 2005). 电喷雾电离质谱(ESI-MS)显示分子离子在/z(z)室温下从甲醇溶液中获得了适合于X射线衍射的单晶。

精炼顶部

H原子被放置在计算位置,O-H=0.82,C-H=0.93-0.96 Au,并在骑行模式下用U进行细化国际标准化组织(H) =1.5单位等式羟基H和甲基H原子的(O,C)和1.2U等式(C) 为其他人。

结构描述顶部

3-羟基苯甲酸甲酯衍生物作为重要的起始原料,已被应用于合成各种广谱抗菌剂(Nie等人。,2005),并设计超分子化学自组装中的隐黄素衍生物(钟等人。, 2001). 这里我们报告了标题化合物的结构(图1)。

晶体结构在标题化合物中,羟基和羰基之间通过分子间O-H··O氢键连接,形成沿b条轴(表1和图2)。链之间没有观察到明显的相互作用。

有关3-羟基苯甲酸甲酯衍生物在合成各种广谱抗菌剂中的应用,请参见:钟等人。(2001). 标题化合物的合成参见:聂等人。(2005).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1999);细胞精细化: 圣普卢斯(布鲁克,1999);数据缩减:圣普卢斯(Bruker,1999;用于求解结构的程序:架子97(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题分子显示了30%概率的位移椭球和原子编号方案。
[图2] 图2。标题化合物的晶体堆积,沿b条轴。虚线表示螺旋氢键链对称性:A=-x个+ 1,+ 1/2, -z(z)+1.5; B=-x个+ 1,- 1/2, -z(z)+1.5.
4-溴-3-羟基苯甲酸甲酯顶部
水晶数据 顶部
C类8H(H)7溴化氢F类(000) = 456
M(M)第页=231.05D类x个=1.828毫克米
单诊所,P(P)21/c(c)Kα辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2ybc1334次反射的单元参数
= 10.812 (4) Åθ= 2.3–24.2°
b条= 6.317 (2) ŵ=4.86毫米1
c(c)= 12.490 (5) ÅT型=293千
β= 100.164 (6)°平板,无色
= 839.7 (5) Å0.27×0.24×0.16毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
布鲁克智能CCD 1000
衍射仪
1831独立反射
辐射源:精细聚焦密封管1129次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.042
探测器分辨率:10.0像素mm-1个θ最大值= 27.2°,θ最小值= 1.9°
φω扫描小时=1313
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
k个=8
T型最小值= 0.354,T型最大值= 0.511=1516
4755次测量反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.058氢位置:差分傅里叶图
水风险(F类2) = 0.172受约束的氢原子参数
S公司= 1.08 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0685P(P))2+ 2.8188P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3个
1831次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
111个参数Δρ最大值=0.46埃
0个约束Δρ最小值=0.55埃
水晶数据 顶部
C类8H(H)7溴化氢= 839.7 (5) Å
M(M)第页= 231.05Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)Kα辐射
= 10.812 (4) ŵ=4.86毫米1
b条= 6.317 (2) ÅT型=293千
c(c)= 12.490 (5) Å0.27×0.24×0.16毫米
β=100.164(6)°
数据收集 顶部
布鲁克智能CCD 1000
衍射仪
1831独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
1129次反射> 2σ()
T型最小值= 0.354,T型最大值= 0.511R(右)整数= 0.042
4755次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0580个约束
水风险(F类2) = 0.172受约束的氢原子参数
S公司= 1.08Δρ最大值=0.46埃
1831次反射Δρ最小值=0.55埃
111个参数
特殊细节 顶部

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。使用细胞静电放电的近似(各向同性)处理来估计涉及l.s.平面的静电放电。

精炼.F的细化2对抗所有反射。加权R系数wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
溴10.92070 (8)1.12616 (14)0.78430 (7)0.0617 (4)
C1类0.8397 (6)0.8935 (11)0.8349 (5)0.0392 (15)
指挥与控制0.7180 (6)0.8391 (11)0.7823 (5)0.0382 (15)
C3类0.6621 (5)0.6667(10)0.8204(5)0.0357 (15)
人30.58090.62960.78770.043*
补体第四成份0.7238 (6)0.5454 (10)0.9072 (5)0.0331 (14)
C5级0.8426(6)0.6045 (11)0.9592 (5)0.0425 (16)
H5型0.88370.52741.01830.051*
C6级0.8996 (6)0.7797 (12)0.9223 (6)0.0449 (17)
H6型0.97920.82060.95710.054*
抄送70.6617 (6)0.3570 (10)0.9440 (5)0.0396 (15)
抄送80.6834 (8)0.0661 (13)1.0640 (6)0.057 (2)
H8A型0.61940.11641.10200.086*
H8B型0.74780.00431.11420.086*
H8C型0.64710.03141.00820.086*
O1公司0.6635 (5)0.9620(9)0.6988(4)0.0565 (14)
上半年0.59470.91280.67240.085*
氧气0.5536 (5)0.3093 (9)0.9112 (4)0.0589 (15)
臭氧0.7379(4)0.2443 (7)1.0147 (4)0.0432 (11)
原子位移参数(Å2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
溴10.0603 (5)0.0604 (6)0.0619 (5)0.0167 (4)0.0043 (4)0.0095 (4)
C1类0.037 (3)0.039 (4)0.041 (3)0.006 (3)0.006 (3)0.002(3)
指挥与控制0.037 (3)0.043 (4)0.033 (3)0.003 (3)0.003 (3)0.001 (3)
C3类0.026 (3)0.043 (4)0.037 (3)0.004 (3)0.001 (2)0.006 (3)
补体第四成份0.033 (3)0.035(3)0.030 (3)0.002(3)0.001 (3)0.003 (3)
C5级0.041 (4)0.038 (4)0.044 (4)0.004 (3)0.008 (3)0.004 (3)
C6级0.037 (4)0.043 (4)0.050 (4)0.009(3)0.003 (3)0.005 (3)
抄送70.045 (4)0.036 (4)0.037 (3)0.002(3)0.006 (3)0.005 (3)
抄送80.072 (5)0.051 (5)0.049 (4)0.003 (4)0.009 (4)0.006(4)
O1公司0.050 (3)0.057 (3)0.055 (3)0.008 (3)0.011 (2)0.022(3)
氧气0.040 (3)0.057 (3)0.072 (3)0.014 (2)0.011 (2)0.014 (3)
臭氧0.044 (3)0.037 (3)0.044 (3)0.005 (2)0.003 (2)0.009 (2)
几何参数(λ,º) 顶部
溴-1-C11.876 (7)C5-H5型0.9300
C1-C6号机组1.370 (10)C6-H6型0.9300
C1-C2类1.406 (9)C7-O21.206 (8)
C2-O1型1.349 (8)C7-O31.307 (8)
C2-C3型1.371 (9)C8-O31.457 (9)
C3-C4型1.397 (9)C8-H8A型0.9600
C3-H3型0.9300C8-H8B型0.9600
C4-C5型1.384 (9)C8-H8C型0.9600
C4至C71.480(9)O1-H1型0.8200
C5至C61.385 (10)
C6-C1-C2型121.0 (6)C1-C6-C5型120.6 (6)
C6-C1-Br1型119.8 (5)C1-C6-H6型119.7
C2-C1-Br1型119.2 (5)C5-C6-H6119.7
O1-C2-C3型124.5 (6)O2-C7-O3123.5(6)
O1-C2-C1型117.7 (6)O2-C7-C4124.1 (6)
C3-C2-C1117.7 (6)O3-C7-C4112.4 (5)
C2-C3-C4型121.7 (6)O3-C8-H8A型109.5
C2-C3-H3型119.1O3-C8-H8B型109.5
C4-C3-H3型119.1H8A-C8-H8B109.5
C5-C4-C3型119.5 (6)臭氧-C8-H8C109.5
C5-C4-C7120.4 (6)H8A-C8-H8C型109.5
C3-C4-C7型120.1 (5)H8B-C8-H8C型109.5
C4-C5-C6119.3 (6)C2-O1-H1型109.5
C4-C5-H5型120.3C7-O3-C8型116.9 (6)
C6-C5-H5型120.3
C6-C1-C2-O1178.1 (6)C2-C1-C6-C5型1.7 (11)
溴-C1-C2-O11.8 (8)溴-1-C1-C6-C5178.5 (5)
C6-C1-C2-C3型0.9 (10)C4-C5-C6-C1型0.3 (10)
Br1-C1-C2-C3179.2 (5)C5-C4-C7-O2型171.3(7)
O1-C2-C3-C4179.8 (6)C3-C4-C7-O27.8 (10)
C1-C2-C3-C4型1.2 (9)C5-C4-C7-O310.2 (9)
C2-C3-C4-C5型2.6 (10)C3-C4-C7-O3170.7 (6)
C2-C3-C4-C7型178.3(6)O2-C7-O3-C8型7.1 (10)
C3-C4-C5-C6型1.8 (10)C4-C7-O3-C8型174.4 (5)
C7-C4-C5-C6179.1 (6)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1··O20.821.872.681 (7)170
对称代码:(i)x个+1,+1/2,z(z)+3/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C类8H(H)7溴化氢
M(M)第页231.05
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)10.812 (4), 6.317 (2), 12.490 (5)
β(°)100.164 (6)
)839.7 (5)
Z轴4
辐射类型Kα
µ(毫米1)4.86
晶体尺寸(mm)0.27 × 0.24 × 0.16
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD 1000
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
T型最小值,T型最大值0.354, 0.511
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
4755, 1831, 1129
R(右)整数0.042
(罪θ/λ)最大值1)0.643
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.058, 0.172, 1.08
反射次数1831
参数数量111
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eÅ))0.46,0.55

计算机程序:智能(布鲁克,1999),圣普卢斯(布鲁克,1999),圣普卢斯(布鲁克,1999年,架子97(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1··O20.821.872.681(7)170
对称代码:(i)x个+1,+1/2,z(z)+3/2.
 

鸣谢

这项工作由广东省211工程资助。

参考文献

第一次引用布鲁克(1999)。智能圣普卢斯.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Nie,Z.、Perretta,C.、Lu,J.、Su,Y.、Margosiak,S.、Gajiwala,K.S.、Cortez,J.,Nikulin,V.、Yager,K.M.、Appelt,K.和Chu,S.(2005)。医学化学杂志。 48,1596年至1609年科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(1996)。SADABS公司德国哥廷根大学。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Zhong,Z.,Ikeda,A.,Shinkai,S.,Sakamoto,S.&Yamaguchi,K.(2001)。组织出租。 , 1085–1087. 科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者

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