有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

哌嗪-1,4-二氢双(3,5-二羧氧基苯甲酸盐)

河北工业大学化学工程与生物技术学院,唐山063009b条巴基斯坦拉合尔54000政府学院大学化学系材料化学实验室
*通信电子邮件:iukhangcu@126.com

(收到日期:2010年4月5日; 2010年4月9日接受; 在线2010年4月17日)

这个非对称单元标题盐,C4H(H)12N个22+·2摄氏度9H(H)5O(运行)6负极由位于反转中心的哌嗪-1,4-二碘指示物的一半和一个3,5-二羧基苯甲酸阴离子组成。在晶体中,离子通过N-H…O和O-H…O氢键连接成平行于(101)的二维框架。

相关文献

有关相关结构,请参见:Divya等。(2003【Divya,K.和Ramaswamy,M.(2003),《印度化学杂志》A辑,42,2267-2276。】); 夏尔马和扎沃罗特科等。(1996【Sharma,C.V.K.和Zaworotko,M.J.(1996),《化学与社会化学杂志》,第2655-2666页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C4H(H)12N个22+·2摄氏度9H(H)5O(运行)6负极

  • M(M)第页= 506.42

  • 三联诊所,[P\上一行]

  • = 7.3029 (15) Å

  • b条= 8.6758 (17) Å

  • c(c)= 9.0422 (18) Å

  • α= 87.04 (3)°

  • β= 69.94 (3)°

  • γ= 83.76 (3)°

  • = 534.9 (2) Å

  • Z轴= 1

  • K(K)α辐射

  • μ=0.13毫米−1

  • T型=295千

  • 0.22×0.21×0.20毫米

数据收集
  • Bruker SMART CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])T型最小值=0.968,T型最大值= 0.971

  • 5586次测量反射

  • 2443次独立反射

  • 1563次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.048

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.069

  • 水风险(F类2) = 0.219

  • S公司= 1.00

  • 2443次反射

  • 165个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.35埃−3

  • Δρ最小值=-0.22埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N1-H1型A类●O4 0.90 1.85 2.725 (4) 165
N1-H1型B2006年1月ii(ii) 0.90 1.92 2.751 (4) 153
氧气-氢气 0.82 1.87 2.612 (4) 149
O5-H5……臭氧iv(四) 0.82 1.79 2.584 (4) 164
对称代码:(i)x个,+1中,z(z)+1; (ii)x个+1中,+1中,z(z); (iii)x个,+1中,z(z); (iv)x个-1,,z(z)+1.

数据收集:智能(布鲁克,1998年[Bruker(1998).SMART.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1999年[Bruker(1999)。SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.

支持信息


注释顶部

1,3,5-苯三甲酸是晶体工程中的一个重要组成部分,因为它可以预测在晶体中形成蜂窝状结构晶格。它在三个羧酸基团中有六个潜在的供体位点,可以通过去质子化形成单、二和三离子配体。4,4'-联吡啶与三聚酸(1,3,5-苯三甲酸)的加合物的化学计量比为2:3,并形成二维网络(Sharma&Zaworotko,1996)。我们在这里报告晶体结构标题化合物(I)。

这个非对称单元化合物(I)由位于反转中心的哌嗪-1,4-二正离子和一个3,5-二羧基苯甲酸阴离子的一半组成(图1)。(I)中的键距离和角度正常(Divya等。, 2003).

晶体结构,阳离子和阴离子通过N-H··O和O-H··O氢键相互连接(表1),产生平行于(101)的二维氢键框架结构[图2]。

相关文献顶部

有关相关结构,请参见:Divya等。(2003); 夏尔马和扎沃特科等。(1996).

实验顶部

将1,3,5-苯三甲酸(1.06 g,5 mmol)和哌嗪(0.43 g,5 mm ol)溶解在温水(30 ml)中。标题化合物的单晶是通过缓慢蒸发该溶液获得的。

精炼顶部

H原子的几何位置为[O–H=0.82 Au,N–H=0.90 Au和C–H=0.93或0.97 Au],并使用骑乘模型进行细化,其中Uiso(H)=1.5U等式(O) 和1.2U等式(C,N)。

结构描述顶部

1,3,5-苯三甲酸是晶体工程中的一个重要组成部分,因为它可以预测在晶体中形成蜂窝状结构晶格。它在三个羧酸基团中有六个潜在的供体位点,可以通过脱质子形成单、双和三阴离子配体物种。4,4'-联吡啶与三聚酸(1,3,5-苯三甲酸)的加合物的化学计量为2:3,并形成二维网络(Sharma&Zaworotko,1996)。我们在这里报告晶体结构标题化合物(I)。

这个非对称单元化合物(I)由位于反转中心的哌嗪-1,4-二正离子和一个3,5-二羧基苯甲酸阴离子的一半组成(图1)。(I)中的键距离和角度正常(Divya等。, 2003).

晶体结构,阳离子和阴离子通过N-H··O和O-H··O氢键相互连接(表1),产生平行于(101)的二维氢键骨架结构[图2]。

有关相关结构,请参见:Divya等。(2003); 夏尔马和扎沃特科等。(1996).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1998);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1999);数据缩减:圣保罗(布鲁克,1999);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的结构,显示原子编号和30%概率位移椭球体。标有后缀A的原子由对称操作(1-x、1-y、1-z)生成。
[图2] 图2。标题化合物的部分包装图。氢键显示为虚线
哌嗪-1,4-二ium双(3,5-二羧基苯甲酸盐)顶部
水晶数据 顶部
C4H(H)12N个22+·2摄氏度9H(H)5O(运行)6负极Z轴= 1
M(M)第页= 506.42F类(000) = 264
三联诊所,P(P)1D类x个=1.572毫克/米负极
大厅符号:-P 1K(K)α辐射,λ=0.71073Å
= 7.3029 (15) Å2886次反射的细胞参数
b条= 8.6758 (17) Åθ= 4.1–23.7°
c(c)= 9.0422 (18) ŵ=0.13毫米负极1
α=87.04(3)°T型=295千
β= 69.94 (3)°无色棱镜
γ= 83.76 (3)°0.22×0.21×0.20毫米
= 534.9 (2) Å
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2443次独立反射
辐射源:细焦点密封管1563次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.048
φω扫描θ最大值=27.5°,θ最小值= 3.1°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
小时=负极99
T型最小值= 0.968,T型最大值= 0.971k个=负极1111
5586次测量反射=负极1111
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:满二次原子位置:差分傅立叶图
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.069氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.219受约束的氢原子参数
S公司= 1.00 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.1021P(P))2+ 0.7768P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2443次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
165个参数Δρ最大值=0.35埃负极
0个约束Δρ最小值=负极0.22埃负极
水晶数据 顶部
C4H(H)12N个22+·2摄氏度9H(H)5O(运行)6负极γ= 83.76 (3)°
M(M)第页= 506.42= 534.9 (2) Å
三联诊所,P(P)1Z轴=1
= 7.3029 (15) ÅK(K)α辐射
b条= 8.6758 (17) ŵ=0.13毫米负极1
c(c)= 9.0422 (18) ÅT型=295千
α= 87.04 (3)°0.22×0.21×0.20毫米
β= 69.94 (3)°
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2443次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
1563次反射> 2σ()
T型最小值= 0.968,T型最大值= 0.971R(右)整数= 0.048
5586次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0690个约束
水风险(F类2) = 0.219受约束的氢原子参数
S公司= 1.00Δρ最大=0.35埃负极
2443次反射Δρ最小值=负极0.22埃负极
165个参数
特殊细节 顶部

几何形状使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼.F的细化2对抗所有反射。加权R因子wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
臭氧层0.5054 (4)负极0.0789 (3)负极0.2891 (3)0.0327 (7)
O4号机组0.3840 (4)负极0.2898 (3)负极0.1607 (3)0.0351 (7)
O5公司负极0.2059 (4)0.0124 (3)0.4770 (3)0.0299 (6)
H5型负极0.2853负极0.03310.54790.045美元*
O6公司负极0.0820 (4)负极0.2283(3)0.3989 (3)0.0401 (8)
C6级0.0627 (5)0.1419 (4)0.2228 (4)0.0244 (8)
H6型负极0.01040.20460.30730.029*
氧气0.3069(5)0.4294 (3)负极0.0579 (3)0.0507 (9)
氢气0.31100.5232负极0.05470.076*
指挥与控制0.2932 (5)0.1130 (4)负极0.0401 (4)0.0213 (7)
过氧化氢0.37400.1567负极0.13220.026*
C3类0.2797 (5)负极0.0471 (4)负极0.0306 (4)0.0200 (7)
C5型0.0477 (5)负极0.0166 (4)0.2327 (4)0.0220 (7)
C1类0.1875 (5)0.2071 (4)0.0863 (4)0.0238 (8)
补体第四成份0.1576 (5)负极0.1116 (4)0.1067 (4)0.0231 (8)
H4型0.1490负极0.21810.11460.028*
抄送80.3998 (5)负极0.1456(4)负极0.1710 (4)0.0221 (7)
O1公司0.1355 (6)0.4589 (3)0.1961 (4)0.0588 (10)
C9级负极0.0858 (5)负极0.0890(4)0.3773 (4)0.0243 (8)
抄送70.2045 (6)0.3776 (4)0.0825 (4)0.0324 (9)
N1型0.6111 (5)0.5988 (3)0.5510 (3)0.0294 (7)
甲型H1A0.53320.61810.65090.035*
H1B型0.71840.64950.53110.035*
C11号机组0.5066 (7)0.6562 (4)0.4430 (5)0.0375 (10)
H11A型0.59460.64390.33520.045美元*
H11B型0.46560.76590.46020.045美元*
C10号机组0.3299 (6)0.5704 (4)0.4671 (5)0.0385 (10)
H10A型0.23570.59060.57160.046*
H10B型0.26820.60680.39070.046*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
臭氧层0.0350 (14)0.0304 (14)0.0214 (13)负极0.0079 (11)0.0066 (11)负极0.0010 (10)
O4号机组0.0490 (17)0.0175 (13)0.0256 (14)负极0.0037(12)0.0047 (12)负极0.0024 (10)
O5公司0.0265 (14)0.0288 (14)0.0223 (13)负极0.0038 (11)0.0074 (10)0.0010 (10)
O6公司0.0459 (17)0.0261 (14)0.0318 (15)负极0.0108 (12)0.0099 (13)0.0006 (11)
C6级0.0257 (18)0.0196 (16)0.0219 (17)负极0.0002 (14)负极0.0002(14)负极0.0049 (13)
氧气0.085 (2)0.0214 (14)0.0282 (15)负极0.0164 (15)0.0054 (15)0.0018 (11)
指挥与控制0.0253 (18)0.0196 (16)0.0157 (15)负极0.0037 (14)负极0.0025 (13)0.0021 (13)
C3类0.0183 (16)0.0200 (16)0.0189 (16)负极0.0021 (13)负极0.0027 (13)负极0.0005 (12)
C5型0.0229 (17)0.0230 (17)0.0162 (16)负极0.0035(14)负极0.0015 (13)0.0003(13)
C1类0.0280 (18)0.0199 (17)0.0224 (17)负极0.0043 (14)负极0.0064 (14)0.0000 (13)
补体第四成份0.0268 (18)0.0203(16)0.0207 (17)负极0.0048 (14)负极0.0052 (14)负极0.0014 (13)
抄送80.0220 (17)0.0220 (17)0.0198 (16)负极0.0035(14)负极0.0034 (14)负极0.0008 (13)
O1公司0.091 (3)0.0257 (15)0.0370 (17)负极0.0137(16)0.0105 (17)负极0.0093 (13)
C9级0.0232 (17)0.0249 (18)0.0208 (17)负极0.0078 (15)负极0.0010 (14)0.0005 (14)
抄送70.041 (2)0.0224 (18)0.0285 (19)负极0.0098 (17)负极0.0025 (17)0.0000 (15)
N1型0.0306 (17)0.0261 (16)0.0255 (16)负极0.0069 (13)0.0001(13)负极0.0063 (13)
C11号机组0.058(3)0.0202 (18)0.033 (2)负极0.0037 (18)负极0.0124 (19)负极0.0006(15)
C10号机组0.038 (2)0.033 (2)0.044 (2)0.0074 (18)负极0.0150 (19)负极0.0115 (18)
几何参数(λ,º) 顶部
臭氧-C81.240 (4)C5-C4型1.396 (5)
O4-C8型1.265 (4)C5至C91.493 (4)
O5-C9型1.314 (4)C1-C7号机组1.496 (5)
O5-H5型0.82C4-H4型0.93
O6-C9型1.213(4)O1-C7型1.204 (5)
C6-C5型1.387 (5)第1页至第11页1.471 (5)
C6-C1型1.394(5)N1-C10型1.485 (5)
C6-H6型0.93N1-H1A型0.90
氧气-C71.318 (4)N1-H1B型0.90
氧气-氢气0.8200C11-C10型1.505 (6)
C2-C1型1.387 (5)C11-H11A型0.97
C2-C3型1.399 (4)C11-H11B型0.97
C2-H2A型0.93C10-N1号机组1.485 (5)
C3-C4型1.388 (5)C10-H10A型0.97
C3-C8型1.516 (5)C10-H10B型0.97
C9-O5-H5109.5O6-C9-C5型122.5 (3)
C5-C6-C1120.0 (3)O5-C9-C5型113.5 (3)
C5-C6-H6120O1-C7-O2123.3 (3)
C1-C6-H6型120O1-C7-C1123.8 (3)
C7-O2-H2109.5O2-C7-C1112.9 (3)
C1-C2-C3120.7 (3)C11-N1-C10型111.1(3)
C1-C2-H2A119.6C11-N1-H1A型109.4
C3-C2-H2A119.6C10号机组-N1-H1A型109.4
C4-C3-C2型119.4(3)C11-N1-H1B型109.4
C4-C3-C8型121.7 (3)C10号机组-N1-H1B型109.4
C2-C3-C8型118.9 (3)H1A-N1-H1B型108
C6-C5-C4120.3 (3)N1-C11-C10111.5 (3)
C6-C5-C9121.0 (3)N1-C11-H11A型109.3
C4-C5-C9型118.7 (3)C10-C11-H11A型109.3
C2-C1-C6型119.6 (3)N1-C11-H11B型109.3
C2-C1-C7型122.1 (3)C10-C11-H11B型109.3
C6-C1-C7型118.3 (3)H11A-C11-H11B型108
C3-C4-C5型119.9 (3)N1型-C10-C11号机组110.1 (3)
C3-C4-H4型120N1型-C10-H10A型109.6
C5-C4-H4120C11-C10-H10A型109.6
O3-C8-O4型124.4 (3)N1型-C10-H10B型109.6
O3-C8-C3117.7 (3)C11-C10-H10B型109.6
O4-C8-C3117.9 (3)H10A-C10-H10B型108.2
O6-C9-O5型124.0 (3)
对称代码:(i)负极x个+1中,负极+1中,负极z(z)+1.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N1-H1型A类···O4号机组ii(ii)0.901.852.725 (4)165
N1-H1型B···O6公司0.901.922.751(4)153
O2-H2··O4iv(四)0.821.872.612 (4)149
O5-H5···O3v(v)0.821.792.584 (4)164
对称代码:(ii)x个,+1中,z(z)+1; (iii)x个+1中,+1中,z(z); (iv)x个,+1中,z(z); (v)x个负极1,,z(z)+1.

实验细节

水晶数据
化学配方C4H(H)12N个22+·2摄氏度9H(H)5O(运行)6负极
M(M)第页506.42
晶体系统,空间组三联诊所,P(P)1
温度(K)295
,b条,c(c)(Å)7.3029 (15), 8.6758 (17), 9.0422 (18)
α,β,γ(°)87.04 (3), 69.94 (3), 83.76 (3)
)534.9 (2)
Z轴1
辐射类型K(K)α
µ(毫米负极1)0.13
晶体尺寸(mm)0.22 × 0.21 × 0.20
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD区域探测器
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
T型最小值,T型最大值0.968, 0.971
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
5586、2443、1563
R(右)整数0.048
(罪θ/λ)最大值负极1)0.649
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.069, 0.219, 1.00
反射次数2443
参数数量165
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eÅ)负极)0.35,负极0.22

计算机程序:聪明的(布鲁克,1998),圣保罗(布鲁克,1999),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
N1-H1A··O40.901.852.725 (4)165
N1-H1B··O6ii(ii)0.901.922.751 (4)153
O2-H2··O40.821.872.612 (4)149
O5-H5···O3iv(四)0.821.792.584 (4)164
对称代码:(i)x个,+1中,z(z)+1; (ii)x个+1中,+1中,z(z); (iii)x个,+1中,z(z); (iv)x个负极1,,z(z)+1.
 

致谢

作者感谢河北工业大学和政府学院对这项工作的支持。

工具书类

第一次引用布鲁克(1998)。智能.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用布鲁克(1999)。圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Divya,K.和Ramaswamy,M.(2003)。印度化学杂志。第节。A类,42, 2267–2276. 谷歌学者
第一次引用Sharma,C.V.K.和Zaworotko,M.J.(1996)。化学杂志。社会化学。Commun公司。第2655–2666页交叉参考 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(1996)。SADABS公司德国哥廷根大学。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008年)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

这是一篇开放获取的文章,根据知识共享署名(CC-BY)许可证它允许在任何介质中不受限制地使用、分发和复制,前提是引用了原始作者和来源。

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890