有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

(E类)-4-氯苄基-3-(3-硝基苄基亚乙基)二硫代氨基甲酸酯

南京大学药物生物技术国家重点实验室,南京210093
*通信电子邮件:owengoal13@163.com

(收到日期:2009年11月9日; 2009年11月12日接受; 在线2009年11月14日)

在标题化合物中,C15H(H)12氯离子O(运行)2S公司2芳香环之间的二面角为89.71(10)°。在晶体中,发生由成对的N-H…S氢键连接的反转二聚体。

相关文献

有关碳二硫代酯化学的背景知识,请参阅:Tarafder等。(2002【Tarafder,M.T.H.,Chew,K.-B.,Crouse,K.C.,Ali,A.M.,Yamin,B.M.&Fun,H.K.(2002)。多面体,21,2683-2690。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类15H(H)12氯离子O(运行)2S公司2

  • M(M)第页= 365.85

  • 单诊所,P(P)21/n个

  • = 10.175 (2) Å

  • b条= 8.4958 (17) Å

  • c(c)= 19.318 (4) Å

  • β= 105.01 (3)°

  • V(V)= 1613.0 (6) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.51毫米−1

  • T型=293千

  • 0.25×0.15×0.15毫米

数据收集
  • Enraf–Nonius CAD-4衍射仪

  • 吸收校正:ψ扫描(北方等。, 1968【North,A.C.T.,Phillips,D.C.&Mathews,F.S.(1968),《结晶学报》A24,351-359。】)T型最小值= 0.884,T型最大值= 0.928

  • 10135次测量反射

  • 3086个独立反射

  • 2538次反射> 2σ()

  • 整数= 0.019

  • 每3次反射强度衰减200次标准反射:1%

精炼
  • [F类2> 2σ(F类2)] = 0.032

  • 水风险(F类2) = 0.086

  • S公司= 1.08

  • 3086次反射

  • 212个参数

  • 用独立和约束精化的混合物处理H原子

  • Δρ最大值=0.49埃−3

  • Δρ最小值=-0.44埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N1-H1和S2 0.83 (2) 2.73 (2) 3.4565 (18) 147.7 (18)
对称代码:(i)-x个+2, -+2, -z(z).

数据收集:CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989年[Enraf-Nonius(1989)。CAD-4软件。荷兰代尔夫特Enraf-Nius。]); 细胞精细化: CAD-4软件; 数据缩减:XCAD4公司(Harms&Wocadlo,1995年[Harms,K.&Wocadlo,S.(1995),XCAD4。德国马尔堡大学); 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.

支持信息


相关文献顶部

有关碳二硫酸酯化学的背景知识,请参阅:Tarafder等。(2002).

实验顶部

将碳二硫代苄肼(396 mg,2 mmol)和3-硝基苯甲醛(302 mg,2 mm ol)的混合物在甲醇(10 ml)中搅拌1 h。滤液在空气中保持7 d后,形成(I)的黄色块。

精炼顶部

H原子被几何定位(C-H=0.93–0.96º)并被细化为骑行U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。

计算详细信息顶部

数据收集:CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989);细胞精细化: CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989);数据缩减:XCAD4公司(Harms&Wocadlo,1995);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)的结构显示50%的位移椭球体。
(E类)-4-氯苄基3-(3-硝基亚苄基)二硫代氨基甲酸酯顶部
水晶数据 顶部
C类15H(H)12氯离子O(运行)2S公司2F类(000) = 752
M(M)第页= 365.85D类x个=1.507毫克米
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2yn25次反射的细胞参数
= 10.175 (2) Åθ= 9–12°
b条= 8.4958 (17) ŵ=0.51毫米1
c(c)= 19.318 (4) ÅT型=293千
β= 105.01 (3)°块,黄色
V(V)= 1613.0 (6) Å0.25×0.15×0.15毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Enraf–Nonius CAD-4公司
衍射仪
2538次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管整数= 0.019
石墨单色仪θ最大值= 26.0°,θ最小值= 2.1°
ω/2θ扫描小时=1211
吸收校正:ψ扫描
(北部等。, 1968)
k个=1010
T型最小值= 0.884,T型最大值= 0.928=2323
10135次测量反射每3次反射200次标准反射
3086个独立反射强度衰减:1%
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.032氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.086用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.08 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.0407P(P))2+ 0.5179P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
3086次反射(Δ/σ)最大值= 0.003
212个参数Δρ最大值=0.49埃
0个约束Δρ最小值=0.44埃
水晶数据 顶部
C类15H(H)12氯离子O(运行)2S公司2V(V)= 1613.0 (6) Å
M(M)第页= 365.85Z轴= 4
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射
= 10.175 (2) ŵ=0.51毫米1
b条= 8.4958 (17) ÅT型=293千
c(c)= 19.318 (4) Å0.25×0.15×0.15毫米
β= 105.01 (3)°
数据收集 顶部
Enraf–Nonius CAD-4公司
衍射仪
2538次反射> 2σ()
吸收校正:ψ扫描
(北部等。, 1968)
整数= 0.019
T型最小值= 0.884,T型最大值= 0.928每3次反射200次标准反射
10135次测量反射强度衰减:1%
3086个独立反射
精炼 顶部
[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0320个约束
水风险(F类2) = 0.086用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.08Δρ最大值=0.49埃
3086次反射Δρ最小值=0.44埃
212个参数
特殊细节 顶部

几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)都是使用全协方差矩阵估计的。在估计距离、角度和扭转角中的e.s.d.时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.完善F类2对抗所有反射。加权-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规-因素基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算-因子(gt).与选择反射进行细化无关。-因素基于F类2在统计上大约是基于F类,以及-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
C1类0.88396 (19)0.8024 (2)0.29108 (9)0.0425 (4)
指挥与控制0.9588 (2)0.6812 (3)0.33047 (11)0.0549 (5)
氢气1.03350.64100.31700.066*
C3类0.9240 (2)0.6188 (3)0.38966 (11)0.0590 (5)
H3级0.97490.53750.41580.071*
补体第四成份0.8134 (2)0.6784 (3)0.40920 (10)0.0508 (5)
C5级0.7369 (2)0.7970 (3)0.37079 (11)0.0565 (5)
H5型0.66190.83640.38430.068*
C6级0.7724 (2)0.8578 (3)0.31159 (10)0.0509 (5)
H6型0.71980.93760.28510.061*
抄送70.9279 (2)0.8774 (2)0.23026 (9)0.0481 (5)
H7A型1.02610.88960.24330.058*
H7B型0.88730.98100.22060.058*
抄送80.96762 (18)0.8426 (2)0.09548 (9)0.0379 (4)
C9级0.8344 (2)0.6100 (2)0.05521 (9)0.0435 (4)
H9型0.89600.64240.08040.052*
C10号机组0.72835 (18)0.49645 (19)0.08815 (9)0.0377 (4)
C11号机组0.74117 (18)0.41334 (19)0.14820 (8)0.0364 (4)
H11型0.81640.42810.16640.044*
第12项0.63997 (18)0.30863 (19)0.18004 (8)0.0363 (4)
第13页0.52623 (19)0.2843 (2)0.15556 (10)0.0442 (4)
H13型0.45910.21380.17840.053*
第14项0.5144 (2)0.3672 (3)0.09628 (10)0.0515 (5)
H14型0.43850.35240.07860.062*
第15项0.6144 (2)0.4724 (2)0.06269 (10)0.0480 (5)
H15型0.60510.52750.02260.058*
第1类0.77017 (6)0.60320 (8)0.48441 (3)0.0716 (2)
上半年0.974 (2)0.822 (3)0.0005 (11)0.050 (6)*
N1型0.94398 (17)0.77726 (19)0.03009 (8)0.0448 (4)
氮气0.84407 (16)0.66553 (17)0.00735 (8)0.0423 (4)
第3页0.65325 (16)0.22357 (18)0.24405 (8)0.0425 (4)
O1公司0.74879 (15)0.25400 (16)0.26884 (7)0.0530 (4)
氧气0.56589 (15)0.12601 (19)0.27048 (8)0.0667 (4)
S1(第一阶段)0.87573 (5)0.75559 (6)0.15042 (2)0.04588 (15)
S2系列1.07801 (5)0.98879 (6)0.11887 (2)0.04813 (15)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0481 (11)0.0450 (10)0.0339 (8)0.0057 (8)0.0095 (8)0.0079 (8)
指挥与控制0.0586 (13)0.0574 (12)0.0536 (11)0.0094 (10)0.0232 (10)0.0032 (10)
C3类0.0710 (15)0.0550 (12)0.0506 (12)0.0065 (11)0.0152 (10)0.0067 (9)
补体第四成份0.0549 (12)0.0612 (12)0.0362 (9)0.0174 (10)0.0114 (8)0.0053 (9)
C5级0.0443 (11)0.0792 (15)0.0484 (11)0.0008 (11)0.0166 (9)0.0039 (11)
C6级0.0464 (11)0.0605 (12)0.0442 (10)0.0040 (9)0.0091 (8)0.0001 (9)
抄送70.0577 (12)0.0491 (11)0.0389 (9)0.0120 (9)0.0149 (8)0.0094 (8)
抄送80.0423 (10)0.0372 (9)0.0337 (8)0.0012 (7)0.0089 (7)0.0011 (7)
C9级0.0534 (11)0.0424 (10)0.0369 (9)0.0059 (8)0.0156 (8)0.0009 (8)
C10号机组0.0447 (10)0.0361 (9)0.0327 (8)0.0001 (7)0.0105 (7)0.0009 (7)
C11号机组0.0401 (10)0.0376 (9)0.0330 (8)0.0016 (7)0.0119 (7)0.0030 (7)
第12项0.0417 (10)0.0353 (9)0.0312 (8)0.0050 (7)0.0082 (7)0.0000 (7)
第13页0.0412 (10)0.0468 (10)0.0437 (10)0.0042 (8)0.0094 (8)0.0050 (8)
第14项0.0455 (11)0.0659 (13)0.0485 (11)0.0049 (10)0.0218 (9)0.0070 (9)
第15项0.0534 (12)0.0546 (11)0.0402 (10)0.0017 (9)0.0197 (8)0.0091 (9)
第1类0.0795 (4)0.0922 (5)0.0438 (3)0.0314 (3)0.0171 (3)0.0014 (3)
N1型0.0569 (10)0.0442 (9)0.0360 (8)0.0148 (7)0.0169 (7)0.0038 (7)
氮气0.0525 (9)0.0395 (8)0.0354 (7)0.0078 (7)0.0124 (7)0.0027 (6)
第3页0.0437 (9)0.0431 (8)0.0388 (8)0.0061 (7)0.0073 (7)0.0050 (7)
O1公司0.0554 (9)0.0634 (9)0.0457 (7)0.0008 (7)0.0231 (7)0.0067 (6)
氧气0.0573 (9)0.0734 (10)0.0703 (10)0.0139 (8)0.0183 (7)0.0364 (8)
S1(第一阶段)0.0549 (3)0.0488 (3)0.0358 (2)0.0159 (2)0.0151 (2)0.00558 (19)
S2系列0.0555 (3)0.0466 (3)0.0414 (3)0.0161 (2)0.0111 (2)0.0018 (2)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-C6号机组1.379 (3)C9-N21.277 (2)
C1-C2类1.385 (3)C9-C10型1.464 (2)
C1-C71.503 (3)C9-H90.9300
C2-C3型1.387 (3)C10-C15年1.387 (3)
C2-H2型0.9300C10-C11号机组1.393 (2)
C3至C41.373 (3)C11-C12号机组1.379 (2)
C3至H30.9300C11-H11型0.9300
C4-C5型1.369 (3)C12-C13型1.375 (3)
C4-Cl1型1.745 (2)C12-N3型1.468 (2)
C5至C61.385 (3)C13至C141.376 (3)
C5-H5型0.9300C13-H13型0.9300
C6-H6型0.9300C14-C15号1.383 (3)
C7-S1型1.8186 (18)C14-H14型0.9300
C7-H7A型0.9700C15-H15型0.9300
C7-H7B型0.9700N1-N2型1.377 (2)
C8-N1型1.343 (2)N1-H1型0.83 (2)
C8-S2型1.6571 (18)N3-O1型1.218 (2)
C8-S1型1.7495 (18)N3-O21.226 (2)
C6-C1-C2型118.19 (18)N2-C9-H9型119.3
C6-C1-C7型120.93 (18)C10-C9-H9型119.3
C2-C1-C7120.79 (18)C15-C10-C11型119.20 (16)
C1-C2-C3121.03 (19)C15-C10-C9型122.19 (16)
C1-C2-H2119.5C11-C10-C9118.59 (16)
C3-C2-H2119.5C12-C11-C10118.58 (16)
C4-C3-C2型119.2 (2)C12-C11-H11型120.7
C4-C3-H3型120.4C10-C11-H11号机组120.7
C2-C3-H3型120.4C13-C12-C11122.78 (16)
C5-C4-C3120.97 (19)C13-C12-N3型119.02 (16)
C5-C4-Cl1119.35 (17)C11-C12-N3型118.17 (15)
C3-C4-氯1119.68 (17)C12-C13-C14型118.20 (17)
C4-C5-C6119.2 (2)C12-C13-H13型120.9
C4-C5-H5型120.4C14-C13-H13型120.9
C6-C5-H5型120.4C13-C14-C15型120.57 (18)
C1-C6-C5型121.4 (2)C13-C14-H14119.7
C1-C6-H6型119.3C15-C14-H14型119.7
C5-C6-H6119.3C14-C15-C10120.67 (17)
C1-C7-S1型109.93 (13)C14-C15-H15型119.7
C1-C7-H7A型109.7C10-C15-H15型119.7
S1-C7-H7A型109.7C8-N1-N2121.50 (16)
C1-C7-H7B型109.7C8-N1-H1型118.1 (15)
S1-C7-H7B型109.7N2-N1-H1118.0 (15)
H7A-C7-H7B型108.2C9-N2-N1115.23 (15)
N1-C8-S2型120.64 (14)O1-N3-O2123.12 (15)
N1-C8-S1型113.72 (13)O1-N3-C12型118.93 (15)
S2-C8-S1系列125.62 (10)氧气-N3-C12117.94 (16)
N2-C9-C10型121.48 (17)C8-S1-C7号机组100.92 (8)
C6-C1-C2-C31.0 (3)C11-C12-C13-C140.7 (3)
C7-C1-C2-C3175.56 (18)编号:N3-C12-C13-C14178.84 (17)
C1-C2-C3-C4型0.1 (3)C12-C13-C14-C150.2 (3)
C2-C3-C4-C5型0.6 (3)C13-C14-C15-C100.1 (3)
C2-C3-C4-Cl1型178.96 (16)C11-C10-C15-C140.0 (3)
C3-C4-C5-C6型0.3 (3)C9-C10-C15-C14178.26 (18)
Cl1-C4-C5-C6179.27 (16)S2-C8-N1-N2174.10 (14)
C2-C1-C6-C5型1.4 (3)S1-C8-N1-N27.3 (2)
C7-C1-C6-C5175.24 (18)C10-C9-N2-N1176.76 (16)
C4-C5-C6-C1型0.7 (3)C8-N1-N2-C9178.30 (17)
C6-C1-C7-S1102.99 (19)C13-C12-N3-O1型174.50 (16)
C2-C1-C7-S180.5 (2)C11-C12-N3-O1型3.7 (2)
N2-C9-C10-C15型16.4 (3)C13-C12-N3-O24.7 (2)
N2-C9-C10-C11型165.39 (17)C11-C12-N3-O2177.13 (16)
C15-C10-C11-C120.5 (2)N1-C8-S1-C7型177.81 (14)
C9-C10-C11-C12178.76 (15)S2-C8-S1-C7系列3.71 (15)
C10-C11-C12-C130.8 (3)C1-C7-S1-C8型167.97 (14)
C10-C11-C12-N3号机组178.97 (14)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··S20.83 (2)2.73 (2)3.4565 (18)147.7 (18)
对称代码:(i)x个+2,+2,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方C类15H(H)12氯离子O(运行)2S公司2
M(M)第页365.85
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/n个
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)10.175 (2), 8.4958 (17), 19.318 (4)
β(°)105.01 (3)
V(V))1613.0 (6)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.51
晶体尺寸(mm)0.25 × 0.15 × 0.15
数据收集
衍射仪Enraf–Nonius CAD-4公司
衍射仪
吸收校正ψ扫描
(北部等。, 1968)
T型最小值,T型最大值0.884, 0.928
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
10135, 3086, 2538
整数0.019
(罪θ/λ)最大值1)0.617
精炼
[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.032, 0.086, 1.08
反射次数3086
参数数量212
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.49,0.44

计算机程序:CAD-4软件(Enraf–Nonius,1989),XCAD4公司(Harms&Wocadlo,1995),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1··S20.83 (2)2.73 (2)3.4565 (18)147.7 (18)
对称代码:(i)x个+2,+2,z(z).
 

致谢

这项工作由国家自然科学基金(项目30772627)和中国博士后科学基金会(项目20080441043)资助。

工具书类

第一次引用Enraf–Nonius(1989)。CAD-4软件Enraf–荷兰代尔夫特的Nonius。 谷歌学者
第一次引用Harms,K.和Wocadlo,S.(1995年)。XCAD4公司德国马尔堡大学。 谷歌学者
第一次引用North,A.C.T.,Phillips,D.C.&Mathews,F.S.(1968年)。《水晶学报》。A类24, 351–359. 交叉参考 IUCr日志 科学网 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Tarafder,M.T.H.、Chew,K.-B.、Crouse,K.C.、Ali,A.M.、Yamin,B.M.和Fun,H.K.(2002)。多面体,21, 2683–2690. 科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者

这是一篇根据知识共享署名(CC-BY)许可证它允许在任何介质中不受限制地使用、分发和复制,前提是引用了原始作者和来源。

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890