有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

1-(2-羟基-4,5-二甲氧基)丙烷-1-酮

海南师范大学化学化工学院热带药用植物化学海南省重点实验室,海口571158
*通信电子邮件:chgying123@163.com,hchr116@hainnu.edu.cn

(收到日期:2009年9月26日; 2009年10月13日接受; 在线2009年10月23日)

在标题化合物中,C11H(H)14O(运行)4叶状三棱菊分子内O-H…O氢键有助于建立分子的基本平面构象(均方根偏差=0.044Ω)。

相关文献

有关植物和生物化学背景,请参阅:Tempeam等。(2005【Tempeam,A.,Thasana,N.,Pavaro,C.,Chuakul,W.,Siripong,P.&Ruchirawat,S.(2005),《化学制药公告》,第53期,第1321-1323页。】); 等。(2009[陈海东、何晓芳、艾杰、耿明玉和岳杰(2009)。组织公报11,4080-4083。]). 有关该系列化合物的药用用途,请参见:Chuakul等。(1997【Chuakul,W.,Saralump,P.&Prathanturarug,S.(1997)。泰国药用植物,第二卷,第192-193页。曼谷:阿玛林印刷出版公共有限公司); Tempeam公司等。(2002【Tempeam,A.,Thasana,N.,Thavornkitcharat,A.,Pavaro,C.&Ruchirawat,S.(2002),《药物科学杂志》29,25-31.】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类11H(H)14O(运行)4

  • M(M)第页= 210.22

  • 单诊所,P(P)21/c(c)

  • = 7.1933 (7) Å

  • b条=9.4874(12)Å

  • c(c)= 17.198 (2) Å

  • β= 113.164 (5)°

  • =1079.1(2)Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.10毫米−1

  • T型=293千

  • 0.31×0.16×0.14毫米

数据收集
  • Bruker SMART CCD衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 布鲁克,1997年[Bruker(1997)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.066,T型最大值= 0.185

  • 7549次测量反射

  • 2673次独立反射

  • 1749次反射>2个σ()

  • R(右)整数= 0.044

精炼
  • R(右)[F类2>2个σ(F类2)] = 0.094

  • 水风险(F类2) = 0.295

  • = 1.12

  • 2673次反射

  • 136个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.41埃−3

  • Δρ最小值=-0.28埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-小时A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-小时A类
O1-H1氧气 0.82 1.86 2.577 (4) 146

数据收集:智能(布鲁克,1997年[Bruker(1997)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1997年[Bruker(1997)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

刺五加植物中的次生代谢产物主要是水蚤烷二萜类,菲,生物碱香豆素类(Tempeam公司等。, 2005; 等。, 2009). 该家族的植物被用于民间医学,如治疗食物中毒的催吐剂、泻药和平喘药,也被用于治疗带血和粘液的痰或粪便。它用于减少脓肿,减轻扭伤、肿胀和擦伤,对治疗蛇咬伤特别有效,尤其是对抗蛇神经毒素。(恰库尔等。, 1997; Tempeam公司等。, 2002). 标题化合物是从海南省尖峰岭县三棱菊茎75%乙醇提取物中分离得到的。R(右).中国。我们已经接受了X光检查晶体结构分析标题化合物,以确定其分子结构和相对立体化学。

氢键和角度如表1所示。

相关文献顶部

有关植物和生物化学背景,请参阅:Tempeam等。(2005); 等。(2009). 有关该系列化合物的药用用途,请参见:Chuakul等。(1997); Tempeam公司等。(2002).

实验顶部

将风干的荆芥茎(5.9 kg)研磨并在333 K下用75%的EtOH过滤(3×2.5 h),将其悬浮在1.5 l水中,然后依次用石油醚、氯仿、乙酸乙酯和n-BuOH分隔,得到石油醚提取物、氯仿提取物、,乙酸乙酯提取物和正丁醇提取物。石油醚提取物首先用石油醚作为硅胶CC柱洗脱液然后用EtOAc增加极性,得到20个分数(A-T)。馏分D进一步分离为柱色谱法用石油醚-EtOAc梯度得到标题化合物。将粗产物溶解在少量乙酸乙酯中,通过在298 K下缓慢蒸发乙酸乙酯溶液获得无色的(I)块。

精炼顶部

结合到C原子上的H原子被放置在几何计算位置,并使用骑乘模型进行细化U型国际标准化组织(H) =1.2U型当量(C) ●●●●。在不同的傅里叶合成中发现了附着在O原子上的H原子,并使用骑乘模型对其进行了细化,O-H距离与最初发现的一样固定U型国际标准化组织(H) 值设置为1.5U型等式(O)。

结构描述顶部

刺五加植物中的次生代谢产物主要是水蚤烷二萜类化合物,菲,生物碱香豆素类(Tempeam公司等。, 2005; 等。, 2009). 该科植物用于民间医药,如食物中毒催吐剂、泻药和平喘药,也用于治疗血性和粘液性痰或大便。它用于减少脓肿,减轻扭伤、肿胀和擦伤,对治疗蛇咬伤特别有效,尤其是对抗蛇神经毒素。(恰库尔等。, 1997; Tempeam公司等。, 2002). 标题化合物是从海南省尖峰岭县三棱菊茎75%乙醇提取物中分离得到的。R(右).中国。我们已经做了X光检查晶体结构分析标题化合物,以确定其分子结构和相对立体化学。

氢键和角度如表1所示。

有关植物和生物化学背景,请参阅:Tempeam等。(2005); 等。(2009). 有关该系列化合物的药用用途,请参见:Chuakul等。(1997); Tempeam公司等。(2002).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1997);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1997);数据缩减:圣保罗(布鲁克,1997);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(Sheldrick,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(Sheldrick,2008);分子图形学:SHELXP-97(Sheldrick,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。以30%概率水平绘制位移椭球体的(I)视图。
[图2] 图2。(I)的分子堆积观点。
1-(2-羟基-4,5-二甲氧基苯基)丙烷-1-酮顶部
水晶数据 顶部
C类11H(H)14O(运行)4F类(000) = 448
M(M)第页= 210.22D类x个=1.294毫克
单诊所,P(P)21/c(c)熔点:未测量K
大厅符号:-P 2ybcK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 7.1933 (7) Å2673次反射的单元参数
b条= 9.4874 (12) Åθ= 2.5–28.4°
c(c)= 17.198 (2) ŵ=0.10毫米1
β= 113.164 (5)°T型=293千
= 1079.1 (2) Å块,无色
Z轴= 40.31×0.16×0.14毫米
数据收集 顶部
布鲁克智能CCD
衍射仪
2673次独立反射
辐射源:细焦点密封管1749次反射>2个σ()
石墨单色仪R(右)整数=0.044
ω扫描θ最大值= 28.4°,θ最小值= 2.5°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1997年)
小时=99
T型最小值= 0.066,T型最大值= 0.185k个=1212
7549次测量反射=2213
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2>2个σ(F类2)] = 0.094氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2)=0.295受约束的氢原子参数
= 1.12 w个= 1/[σ2(F类o(o)2) + (0.1225P(P))2+ 1.1131P(P)]
哪里P(P)= (F类o(o)2+ 2F类c(c)2)/3
2673次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
136个参数Δρ最大值=0.41埃
0个约束Δρ最小值=0.28埃
水晶数据 顶部
C类11H(H)14O(运行)4= 1079.1 (2) Å
M(M)第页= 210.22Z轴= 4
单诊所,P(P)21/c(c)K(K)α辐射
= 7.1933 (7) ŵ=0.10毫米1
b条= 9.4874 (12) ÅT型=293千
c(c)= 17.198 (2) Å0.31×0.16×0.14毫米
β= 113.164 (5)°
数据收集 顶部
布鲁克智能CCD
衍射仪
2673次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1997年)
1749次反射>2个σ()
T型最小值= 0.066,T型最大值= 0.185R(右)整数= 0.044
7549次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2>2个σ(F类2)] = 0.0940个约束
水风险(F类2) = 0.295受约束的氢原子参数
= 1.12Δρ最大值=0.41埃
2673次反射Δρ最小值=0.28埃
136个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类为负数设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型当量
O10.3767 (5)0.3553 (3)0.52714 (19)0.0723(9)
上半年0.33230.37570.47680.080*
氧气0.1907 (5)0.3117 (3)0.36706 (18)0.0763 (9)
臭氧0.2687 (4)0.2066(3)0.58386 (15)0.0600 (8)
O4号机组0.4475(4)0.0386 (3)0.71051 (14)0.0581 (7)
C1类0.3465 (5)0.2161 (4)0.5358 (2)0.0497 (8)
C20.2485 (5)0.1275 (3)0.4653 (2)0.0435 (7)
C3类0.2245 (5)0.0169 (4)0.48170 (19)0.0437 (7)
H3级0.16240.07760.43640.080*
补体第四成份0.2907 (5)0.0694 (3)0.5629 (2)0.0432 (7)
C5型0.3876 (5)0.0225 (4)0.63263 (19)0.0441 (7)
C6级0.4134 (5)0.1631 (4)0.6178(2)0.0499 (8)
H6型0.47640.22320.66330.080*
抄送70.1702 (5)0.1852 (4)0.3788(2)0.0509 (8)
抄送80.0636 (6)0.0885(4)0.3045 (2)0.0569 (9)
H8A型0.05290.04760.31110.080*
H8B型0.15450.01200.30610.080*
C9级0.0065 (8)0.1589 (5)0.2186 (3)0.0801 (14)
H9A型0.06990.09020.17520.080*
H9B型0.10770.19900.21100.080*
H9C型0.10170.23190.21520.080*
C10号机组0.1800 (6)0.3028 (4)0.5156 (2)0.0600 (10)
H10A型0.17140.39450.53760.080*
H10B型0.26210.30790.48310.080*
H10C型0.04690.27090.48010.080*
C11号机组0.5335 (7)0.0537 (5)0.7830(2)0.0699 (12)
H11A型0.56840.00030.83400.080*
H11B型0.43640.12460.78090.080*
H11C型0.65270.09800.78210.080*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O10.107(2)0.0456 (15)0.0605 (17)0.0084 (14)0.0294 (16)0.0016 (13)
氧气0.115 (3)0.0534 (17)0.0561 (16)0.0070 (16)0.0287 (17)0.0092 (13)
臭氧0.0858 (18)0.0402 (13)0.0372 (12)0.0007 (12)0.0062 (12)0.0020(10)
O4号机组0.0790 (17)0.0490 (14)0.0347 (12)0.0005 (12)0.0098 (11)0.0045 (10)
C1类0.0556(19)0.0434 (18)0.0509 (18)0.0009 (15)0.0219 (15)0.0022 (14)
C20.0482 (17)0.0395 (16)0.0422(16)0.0051 (13)0.0170 (13)0.0005 (13)
C3类0.0472(17)0.0426 (17)0.0377 (15)0.0044 (13)0.0129 (13)0.0046 (13)
补体第四成份0.0444 (16)0.0399 (16)0.0413 (16)0.0072 (13)0.0125 (13)0.0007 (13)
C5型0.0459 (16)0.0452 (17)0.0371 (15)0.0061 (14)0.0120 (12)0.0036 (13)
C6级0.0551 (19)0.0473 (19)0.0437 (17)0.0005 (15)0.0155 (15)0.0091 (14)
抄送70.058 (2)0.048 (2)0.0461 (18)0.0053 (15)0.0200 (15)0.0048 (15)
抄送80.069 (2)0.057 (2)0.0405 (17)0.0013 (17)0.0162(16)0.0066 (15)
C9级0.107 (4)0.073 (3)0.045 (2)0.001 (3)0.013 (2)0.012 (2)
C10号机组0.078 (3)0.0443 (19)0.0439 (18)0.0030 (17)0.0091 (17)0.0015 (15)
C11号机组0.098(3)0.065 (3)0.0358 (17)0.002 (2)0.0149 (19)0.0100(17)
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C1型1.355 (4)C6-H6型0.9300
O1-H1型0.8200C7-C8号机组1.513 (5)
氧气-C71.235 (4)C8-C9型1.516 (5)
臭氧-C41.376 (4)C8-H8A型0.9700
臭氧-C101.424 (4)C8-H8B型0.9700
O4-C51.364 (4)C9-H9A型0.9600
O4-C11型1.448 (4)C9-H9B型0.9600
C1-C61.393(5)C9-H9C型0.9600
C1-C2类1.415 (5)C10-H10A型0.9600
C2-C3型1.423 (5)C10-H10B型0.9600
C2-C7型1.473 (5)C10-H10摄氏度0.9600
C3-C4型1.379 (4)C11-H11A型0.9600
C3-H3型0.9300C11-H11B型0.9600
C4-C5型1.423 (4)C11-H11C型0.9600
C5至C61.385 (5)
C1-O1-H1109.5C7-C8-C9114.8 (3)
C4-O3-C10型116.8 (3)C7-C8-H8A型108.6
C5-O4-C11型116.8 (3)C9-C8-H8A108.6
O1-C1-C6型117.2 (3)C7-C8-H8B型108.6
O1-C1-C2型122.2 (3)C9-C8-H8B108.6
C6-C1-C2型120.7(3)H8A-C8-H8B107.5
C1-C2-C3117.4 (3)C8-C9-H9A基因109.5
C1-C2-C7型120.5 (3)C8-C9-H9B型109.5
C3-C2-C7型122.0 (3)H9A-C9-H9B109.5
C4-C3-C2型121.9 (3)C8-C9-H9C型109.5
C4-C3-H3型119.1H9A-C9-H9C109.5
C2-C3-H3型119.1H9B-C9-H9C型109.5
臭氧-C4-C3125.3 (3)臭氧-C10-H10A109.5
臭氧-C4-C5115.3 (3)O3-C10-H10B型109.5
C3-C4-C5型119.4 (3)H10A-C10-H10B型109.5
O4-C5-C6125.2 (3)臭氧-C10-H10C109.5
O4-C5-C4115.3 (3)H10A-C10-H10C型109.5
C6-C5-C4119.4 (3)H10B-C10-H10C型109.5
C5-C6-C1121.1 (3)O4-C11-H11A型109.5
C5-C6-H6119.4O4-C11-H11B型109.5
C1-C6-H6型119.4H11A-C11-H11B型109.5
O2-C7-C2型120.2 (3)O4-C11-H11C型109.5
O2-C7-C8型120.3 (3)H11A-C11-H11C型109.5
C2-C7-C8型119.5 (3)H11B-C11-H11C型109.5
氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)小时···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1··O20.821.862.577(4)146

实验细节

水晶数据
化学配方C类11H(H)14O(运行)4
M(M)第页210.22
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/c(c)
温度(K)293
,b条,c(c)(Å)7.1933 (7), 9.4874 (12), 17.198 (2)
β(°)113.164 (5)
)1079.1 (2)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.10
晶体尺寸(mm)0.31 × 0.16 × 0.14
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD(电荷耦合器件)
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1997年)
T型最小值,T型最大值0.066, 0.185
测量、独立和
观察到的[>2个σ()]反射
7549、2673、1749
R(右)整数0.044
(罪θ/λ)最大值1)0.669
精炼
R(右)[F类2>2个σ(F类2)],水风险(F类2),0.094, 0.295, 1.12
反射次数2673
参数数量136
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.41,0.28

计算机程序:智能(布鲁克,1997),圣保罗(布鲁克,1997),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXP-97(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)小时···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1-H1··O20.821.862.577 (4)146
 

致谢

本研究得到了国家自然科学基金(20862005)、高校新世纪优秀人才计划(NCET-08-0656)、海南省自然科学基金项目(070207号)和海南省大学生创新科学研究项目(Hxwsy2008-17号)的支持。感谢冰晶鑫收集晶体数据。

工具书类

第一次引用布鲁克(1997)。智能,圣保罗SADABS公司.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Chen,H.D.、He,X.F.、Ai,J.、Geng,M.Y.和Yue,J.M.(2009)。组织出租。 11, 4080–4083. 科学网 交叉参考 公共医学 计算机辅助系统 谷歌学者
第一次引用Chuakul,W.、Saralump,P.和Prathanturarug,S.(1997年)。泰国的药用植物第二卷,第192-193页。曼谷:阿玛林印刷出版公共有限公司谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 计算机辅助系统 IUCr日志 谷歌学者
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