有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

N个′-(丙-2-亚乙基)烟酰胺

河南农业大学科学院应用化学系,郑州450002b条沙隆达郑州农药有限公司,中国郑州450009
*通信电子邮件:bfyu2008@126.com

(收到日期:2009年8月27日; 2009年8月29日接受; 在线2009年9月5日)

标题化合物C的晶体9H(H)11N个O、 由烟碱酰肼和丙酮的缩合反应得到。在分子结构中,吡啶环相对于酰胺平面的二面角为36.28(10)°。晶体结构,分子是相互联系的通过N-H…O氢键,形成链。

相关文献

有关希夫碱化合物的应用,请参阅:Kahwa等。(1986[Kahwa,I.A.,Selbin,I.,Hsieh,T.C.Y.&Laine,R.A.(1986)。《无机化学学报》,118,179-185。]); 桑托斯等。(2001【Santos,M.L.P.,Bagatin,I.A.,Pereira,E.M.&Ferreira,A.M.D.C.(2001),《化学社会杂志》,Dalton Trans.第838-844页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类9H(H)11N个O(运行)

  • M(M)第页= 177.21

  • 单诊所,21/n个

  • = 7.5439 (4) Å

  • b条= 18.0292 (9) Å

  • c(c)= 7.6172 (4) Å

  • β= 115.937 (3)°

  • V(V)=931.67(8)Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.09毫米−1

  • T型=296千

  • 0.42×0.21×0.12毫米

数据收集
  • Bruker SMART CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多次扫描(SADABS公司; 布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.978,T型最大值= 0.990

  • 14297次测量反射

  • 2172次独立反射

  • 1301次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.046

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.053

  • 水风险(F类2) = 0.161

  • S公司= 1.02

  • 2172次反射

  • 120个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.21埃−3

  • Δρ最小值=-0.22埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N2-H2气体A类年O 0.86 2.08 2.9136 (18) 162
对称代码:(i)[x-{\script{1\over 2}},-y+{\script{1\ over 2{},z-{\script}1\over2}}].

数据收集:智能(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXTL公司; 分子图形:SHELXTL公司; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

化学希夫碱近年来引起了人们的极大兴趣。这些化合物在各种蛋白质和酶(Kahwa等。, 1986; 桑托斯等。, 2001). 作为我们对配位化学兴趣的一部分希夫碱,我们合成了标题化合物,并报告了其晶体结构。

在分子结构(图1)中,吡啶环相对于N2/C4/O平面定向,二面角为36.28(10)°。晶体结构分子间N-H··O氢键将分子连接起来,形成一维链(表1)。

相关文献顶部

有关希夫碱化合物的应用,请参阅:Kahwa等。(1986); 桑托斯等。(2001).

实验顶部

将烟碱酰肼(1 mmol,0.137 g)溶解在无水乙醇(15 ml)中。在351 K下搅拌混合物几分钟,然后逐滴添加乙醇(8 ml)中的丙酮(1 mmol,0.058 g),并在回流温度下搅拌混合物2 h。从甲醇中分离并重结晶固体产物。3d后获得无色单晶。

精炼顶部

所有H原子均以几何方式定位,并在C-H=0.93(芳香族)、0.96?(甲基)和N-H=0.86?的条件下进行细化。U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(C) 对于甲基H原子和U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C,N个)为其他人。

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1998);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1998);数据缩减:圣保罗(布鲁克,1998);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(Sheldrick,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构。位移椭球是在30%的概率水平上绘制的。
N个'-(丙-2-亚基)烟碱酰肼顶部
水晶数据 顶部
C类9H(H)11N个O(运行)F类(000) = 376
M(M)第页=177.21D类x个=1.263毫克
单诊所,21/n个K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2yn3071次反射的细胞参数
= 7.5439 (4) Åθ= 2.3–27.0°
b条= 18.0292 (9) ŵ=0.09毫米1
c(c)= 7.6172 (4) ÅT型=296千
β= 115.937 (3)°块,无色
V(V)= 931.67 (8) Å0.42×0.21×0.12毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2172次独立反射
辐射源:细焦点密封管1301次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.046
ω扫描θ最大值= 27.7°,θ最小值= 2.3°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1998年)
小时=99
T型最小值= 0.978,T型最大值= 0.990k个=2323
14297次测量反射=99
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.053氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.161受约束的氢原子参数
S公司= 1.02 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0882)2+0.0683]
哪里= (F类o个2+2个F类c(c)2)/3
2172次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
120个参数Δρ最大值=0.21埃
0个约束Δρ最小值=0.22埃
水晶数据 顶部
C类9H(H)11N个O(运行)V(V)= 931.67 (8) Å
M(M)第页= 177.21Z轴= 4
单诊所,21/n个K(K)α辐射
= 7.5439 (4) ŵ=0.09毫米1
b条= 18.0292 (9) ÅT型=296千
c(c)= 7.6172 (4) Å0.42×0.21×0.12毫米
β= 115.937 (3)°
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2172次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1998年)
1301次反射> 2σ()
T型最小值= 0.978,T型最大值= 0.990R(右)整数=0.046
14297次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0530个约束
水风险(F类2) = 0.161受约束的氢原子参数
S公司= 1.02Δρ最大值=0.21埃
2172次反射Δρ最小值=0.22埃
120个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单元e.s.d.单独考虑;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.6021 (2)0.20018 (9)0.3243 (2)0.0526 (4)
氮气0.5607 (2)0.23097(8)0.1426 (2)0.0498 (4)
过氧化氢0.48960.20780.03610.060*
N3号机组0.5259 (3)0.44511 (10)0.2362 (3)0.0683 (5)
O(运行)0.74766 (19)0.33093 (7)0.29001 (19)0.0640 (4)
C1类0.5162 (3)0.07664(11)0.1687 (3)0.0707 (6)
甲型H1A0.37510.07250.10650.106*
H1B型0.57310.02900.21840.106*
H1C型0.56120.09350.07550.106*
指挥与控制0.5773 (2)0.13080 (11)0.3328 (3)0.0522 (5)
C3类0.6197 (3)0.10093 (13)0.5301 (3)0.0748 (6)
H3A型0.67120.13980.62520.112*
H3B型0.71470.06170.56270.112*
H3C公司0.50030.08210.52930.112*
补体第四成份0.6361 (2)0.29792(10)0.1407 (3)0.0470 (5)
C5级0.5842(2)0.33173 (9)0.0540 (2)0.0448 (4)
C6级0.5646 (3)0.29200 (11)0.2158 (3)0.0553 (5)
H7A型0.57700.24060.21010.066*
抄送70.5262 (3)0.32960 (13)0.3867 (3)0.0649 (6)
H8A型0.51290.30400.49780.078*
抄送80.5083 (3)0.40459 (13)0.3895(3)0.0678 (6)
H9A型0.48210.42920.50550.081美元*
C9级0.5659 (3)0.40808 (11)0.0721 (3)0.0547 (5)
H10A型0.58270.43530.03770.066*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0529 (9)0.0484(9)0.0449 (9)0.0063 (7)0.0108(7)0.0040 (7)
氮气0.0472 (8)0.0448 (9)0.0428 (8)0.0020 (7)0.0062 (6)0.0001 (7)
N3号机组0.0776 (12)0.0534(11)0.0617 (11)0.0046 (8)0.0191 (9)0.0067 (9)
O(运行)0.0620 (8)0.0498 (8)0.0513 (8)0.0055 (6)0.0019 (6)0.0041 (6)
C1类0.0713 (13)0.0476 (12)0.0699 (14)0.0045 (10)0.0092 (11)0.0022 (10)
指挥与控制0.0411 (9)0.0499 (11)0.0542 (11)0.0086 (8)0.0103 (8)0.0066 (9)
C3类0.0817(14)0.0678 (14)0.0718 (15)0.0150(12)0.0306 (12)0.0183 (12)
补体第四成份0.0382 (8)0.0406 (10)0.0480 (10)0.0027 (7)0.0056 (7)0.0036 (8)
C5级0.0341 (8)0.0432 (10)0.0481 (11)0.0022 (7)0.0096 (7)0.0036 (8)
C6级0.0563 (11)0.0473 (11)0.0605 (13)0.0027(8)0.0239 (9)0.0063 (9)
抄送70.0699(13)0.0732 (15)0.0559 (13)0.0130 (11)0.0315 (10)0.0100 (11)
抄送80.0732 (13)0.0705 (15)0.0555 (13)0.0120 (11)0.0244 (11)0.0041 (11)
C9级0.0528 (10)0.0466 (11)0.0532 (11)0.0041 (8)0.0127 (8)0.0030 (9)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C2型1.271 (2)C3-H3A型0.9600
N1-N2型1.394 (2)C3-H3B型0.9600
N2-C4气体1.337 (2)C3-H3C型0.9600
N2-H2A气体0.8600C4-C5型1.489(2)
N3-C9型1.330 (2)C5-C6型1.376 (2)
N3-C8号1.334 (3)C5至C91.384 (2)
O-C4型1.232 (2)C6至C71.382(3)
C1-C2类1.492 (3)C6-H7A型0.9300
C1-H1A型0.9600C7-C8号机组1.358 (3)
C1-H1B型0.9600C7-H8A型0.9300
C1-H1C型0.9600C8小时9分0.9300
C2-C3型1.493 (3)C9-H10A0.9300
C2-N1-N2117.96 (15)H3B-C3-H3C型109.5
C4-N2-N1型117.32 (14)O-C4-N2型123.21 (17)
C4-N2-H2A型121.3O-C4-C5型119.84 (16)
N1-N2-H2A型121.3N2-C4-C5气体116.93 (14)
C9-N3-C8116.26 (18)C6-C5-C9117.46 (17)
C2-C1-H1A型109.5C6-C5-C4123.87 (16)
C2-C1-H1B型109.5C9-C5-C4118.56 (16)
H1A-C1-H1B109.5C5-C6-C7118.99 (18)
C2-C1-H1C型109.5C5-C6-H7A120.5
H1A-C1-H1C型109.5C7-C6-H7A型120.5
H1B-C1-H1C型109.5C8-C7-C6118.78 (19)
N1-C2-C1126.87 (17)C8-C7-H8A型120.6
N1-C2-C3型115.77(18)C6-C7-H8A型120.6
C1-C2-C3117.34 (18)编号3-C8-C7124.1 (2)
C2-C3-H3A型109.5N3-C8-H9A型117.9
C2-C3-H3B型109.5C7-C8-H9A型117.9
H3A-C3-H3B型109.5N3-C9-C5型124.38 (18)
C2-C3-H3C型109.5N3-C9-H10A117.8
H3A-C3-H3C型109.5C5-C9-H10A117.8
氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N2-H2气体A类···O(运行)0.862.082.9136 (18)162
对称代码:(i)x个1/2,+1/2,z(z)1/2。

实验细节

水晶数据
化学配方C类9H(H)11N个O(运行)
M(M)第页177.21
晶体系统,空间组单诊所,21/n个
温度(K)296
b条c(c)(Å)7.5439 (4), 18.0292 (9), 7.6172 (4)
β(°)115.937 (3)
V(V))931.67 (8)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.09
晶体尺寸(mm)0.42 × 0.21 × 0.12
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 布鲁克,1998年)
T型最小值T型最大值0.978, 0.990
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
14297, 2172, 1301
R(右)整数0.046
(罪θ/λ)最大值1)0.655
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.053, 0.161, 1.02
反射次数2172
参数数量120
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.21,0.22

计算机程序:智能(布鲁克,1998),圣保罗(布鲁克,1998),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N2-H2A···O0.862.082.9136 (18)162
对称代码:(i)x个1/2,+1/2,z(z)1/2.
 

工具书类

第一次引用布鲁克(1998)。智能圣保罗SADABS公司.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Kahwa,I.A.、Selbin,I.、Hsieh,T.C.Y.和Laine,R.A.(1986年)。无机烟囱。学报118, 179–185. 交叉参考 中国科学院 科学网 谷歌学者
第一次引用Santos,M.L.P.、Bagatin,I.A.、Pereira,E.M.和Ferreira,A.M.D.C.(2001)。化学杂志。Soc.道尔顿Trans。第838–844页科学网 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890