有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

(电子)-N个′-(1,3-苯并二恶唑-5-甲基烯)烟肼一水合物

河南农业大学科学院应用化学系,郑州450002
*通信电子邮件:bfyu2008@126.com

(2009年8月21日收到; 2009年8月28日接受; 在线2009年9月5日)

在标题化合物中,C14H(H)11N个O(运行)·H(H)2O、 平面[最大偏差0.135(1)Au]1,3-苯并二唑环体系相对于吡啶环的二面角为13.93(7)°。晶体结构中存在广泛的分子间N-H·O、O-H·O,O-H·N和弱的C-H·O氢键。

相关文献

有关希夫碱化合物的应用,请参见:Kahwa等。(1986[Kahwa,I.A.,Selbin,I.,Hsieh,T.C.Y.&Laine,R.A.(1986)。《无机化学学报》,118,179-185。]); 桑托斯等。(2001【Santos,M.L.P.,Bagatin,I.A.,Pereira,E.M.&Ferreira,A.M.D.C.(2001),《化学社会杂志》,Dalton Trans.第838-844页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类14H(H)11N个O(运行)·H(H)2O(运行)

  • M(M)第页= 287.28

  • 单诊所,P(P)21/n个

  • = 8.6414 (2) Å

  • b=12.0874(2)Å

  • c(c)= 13.4464 (3) Å

  • β= 103.161 (1)°

  • V(V)= 1367.61 (5) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.11毫米−1

  • T型=293千

  • 0.26×0.21×0.17毫米

数据收集
  • Bruker SMART CCD面阵探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(萨达布; 布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。])T型最小值= 0.974,T型最大值= 0.982

  • 19494次测量反射

  • 2691次独立反射

  • 1839次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.044

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.041

  • 水风险(F类2) = 0.112

  • S公司= 1.04

  • 2691次反射

  • 199个参数

  • 3个约束

  • 通过独立和约束精化的混合物处理的H原子

  • Δρ最大值=0.15埃−3

  • Δρ最小值=−0.13埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月一个 D类-H(H) H月一个 D类一个 D类-H月一个
N2-H2气体一个●O4 0.86 2.04 2.8819 (17) 164
O4-H4型一个…N3 0.848 (9) 1.980 (17) 2.825 (2) 174 (2)
O4-H4型B类·臭氧层ii(ii) 0.839 (9) 2.106 (15) 2.9019 (19) 158.2 (16)
C3-H3型B类·臭氧层 0.97 2.57 3.495 (2) 160
C8-H8型一个●O4 0.93 2.51 3.312 (2) 144
C11-H11型一个●O4 0.93 2.45 3.324(2) 156
对称代码:(i)[-x-{\script{1\over2}},y-{\script}1\over 2}},-z+{\script{1\ver2}}]; (ii)x个-1中,z(z); (iii)-x个+1, -+1, -z(z).

数据收集:智能(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1998年[Bruker(1998)。SMART、SAINT和SADABS。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊。]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于细化结构的程序:SHELXTL公司; 分子图形:SHELXTL公司; 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司

支持信息


注释顶部

化学希夫碱近年来引起了人们的极大兴趣。这些化合物在各种蛋白质和酶(Kahwa等。, 1986; 桑托斯等。, 2001). 作为我们对配位化学兴趣的一部分希夫碱,我们合成了标题化合物,并报告了其晶体结构。

标题分子以E构象结晶(图1),N2-N1-C8-C7扭转角为179.60(13)°。1,3-苯并二唑环体系与吡啶环的二面角为13.93(7)°。广泛的分子间经典N-H··O、O-H··O、O-H··N和弱C-H···O氢键存在于晶体结构(表1和图2)。

相关文献顶部

有关希夫碱化合物的应用,请参阅:Kahwa等。(1986); 桑托斯等。(2001).

实验顶部

将烟碱酰肼(1 mmol,0.137 g)溶解在乙醇(15 ml)中。将溶液在351 K下搅拌几分钟,然后逐滴添加乙醇(8 mm l)中的1,3-苯并二氧杂环-5-甲醛(1 mmol,0.150 g)。将混合物回流2 h。从甲醇-水溶液中分离并重结晶固体产物。标题化合物在3天后获得无色单晶。

精炼顶部

水分子的H原子位于差分傅里叶映射中,并在O-H和H··H距离限制为0.85(1)和1.37(2)a的情况下进行各向同性细化。其他H原子的几何定位和细化为C-H=0.93(芳香族)、0.97(亚甲基)和N-H=0.86,U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C,N个).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1998);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,1998);数据缩减:圣保罗(布鲁克,1998);用于求解结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于细化结构的程序:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的分子结构。位移椭球是在30%的概率水平上绘制的。
[图2] 图2。以虚线表示分子间氢键的单位电池包装图。
(电子)-N个'-(1,3-苯并二恶唑-5-乙烯)烟肼一水合物顶部
水晶数据 顶部
C类14H(H)11N个O(运行)·H(H)2O(运行)F类(000) = 600
M(M)第页=287.28D类x个=1.395毫克
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2yn2884次反射的细胞参数
= 8.6414 (2) Åθ= 2.3–26.0°
b= 12.0874 (2) ŵ=0.11毫米1
c(c)= 13.4464 (3) ÅT型=293千
β=103.161(1)°块,无色
V(V)= 1367.61 (5) Å0.26×0.21×0.17毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2691次独立反射
辐射源:细焦点密封管1839次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.044
ω扫描θ最大值= 26.0°,θ最小值= 2.3°
吸收校正:多扫描
(萨达布; 布鲁克,1998年)
小时=1010
T型最小值= 0.974,T型最大值= 0.982k个=1414
19494次测量反射=1616
精炼 顶部
优化于F类2二次原子位置:差分傅里叶映射
最小二乘矩阵:完整氢站点位置:从邻近站点推断
R(右)[F类2> 2σ(F类2)]=0.041通过独立和约束精化的混合物处理的H原子
水风险(F类2) = 0.112 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0582P(P))2+ 0.0682P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
S公司= 1.04(Δ/σ)最大值= 0.010
2691次反射Δρ最大值=0.15埃
199个参数Δρ最小值=0.13埃
3个约束消光校正:SHELXTL公司(版本5.1;Sheldrick,2008),Fc*=kFc[1+0.001xFc2λ/罪(2θ)]-1/4
主原子位置定位:结构-变量直接方法消光系数:0.0058(14)
水晶数据 顶部
C类14H(H)11N个O(运行)·H(H)2O(运行)V(V)= 1367.61 (5) Å
M(M)第页= 287.28Z轴= 4
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射
= 8.6414 (2) ŵ=0.11毫米1
b=12.0874(2)ÅT型=293千
c(c)= 13.4464 (3) Å0.26×0.21×0.17毫米
β= 103.161 (1)°
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2691次独立反射
吸收校正:多扫描
(萨达布; 布鲁克,1998年)
1839次反射> 2σ()
T型最小值= 0.974,T型最大值=0.982R(右)整数= 0.044
19494次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0413个约束
水风险(F类2) = 0.112通过独立和约束精化的混合物处理的H原子
S公司= 1.04Δρ最大值=0.15埃
2691次反射Δρ最小值=0.13埃
199个参数
特殊细节 顶部

几何图形所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)都是使用全协方差矩阵估计的。在估计距离、角度和扭转角中的e.s.d.时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.25573 (14)0.30595 (11)0.16863 (10)0.0528 (4)
C70.46242(17)0.23623 (12)0.09399 (11)0.0469 (4)
臭氧0.08396 (13)0.45982 (9)0.23857 (10)0.0702 (4)
C10号机组0.09502 (16)0.32960 (12)0.28168 (11)0.0442 (4)
氧气0.84690 (15)0.27321 (11)0.03215 (11)0.0807(4)
氮气0.12618 (14)0.27993 (10)0.20830 (10)0.0516 (4)
过氧化氢0.09720.21220.21160.062*
指挥与控制0.65230 (18)0.34247 (13)0.03595(12)0.0522 (4)
N3号机组0.33050 (15)0.39773 (11)0.32710 (11)0.0596 (4)
O1公司0.73361 (16)0.43293 (10)0.01301 (11)0.0842 (5)
C6级0.53331 (19)0.14169 (13)0.06740 (13)0.0544(4)
H6A型0.49080.07320.07810.065*
抄送80.32492 (19)0.22390 (13)0.13835 (12)0.0530 (4)
H8A型0.28600.15320.14490.064*
C11号机组0.12747 (19)0.22473 (13)0.31162 (13)0.0523(4)
H11A型0.06060.16590.30590.063*
C5级0.66608 (19)0.14538 (13)0.02518 (13)0.0576 (5)
H5A型0.71420.08140.00840.069*
第13页0.35719 (19)0.29587 (15)0.35623 (13)0.0607 (5)
H13A型0.44660.28350.38220.073*
补体第四成份0.72117 (19)0.24715 (14)0.00991 (13)0.0530 (4)
C9级0.04620(17)0.36199 (12)0.24153 (12)0.0489 (4)
C1类0.52308 (19)0.34048 (12)0.07778 (12)0.0520 (4)
H1B型0.47710.40530.09480.062*
第12项0.26006 (19)0.20836 (14)0.34996 (13)0.0606 (5)
H12A型0.28340.13840.37140.073*
第14项0.20100 (18)0.41282 (13)0.29066 (12)0.0523 (4)
H14A型0.18050.48370.27000.063*
C3类0.8597 (2)0.38998(17)0.02752 (16)0.0772 (6)
H3B型0.85350.41970.09530.093*
H3C公司0.96120.41120.01570.093*
O4号机组0.59280 (17)0.54330 (10)0.28071 (14)0.0854(5)
H4A型0.5119 (16)0.5021 (15)0.2985 (18)0.112 (8)*
H4B型0.6745 (16)0.5040 (15)0.2633 (16)0.102 (8)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0450 (7)0.0537 (8)0.0663 (9)0.0044 (6)0.0260 (7)0.0009 (7)
C70.0436 (8)0.0483 (9)0.0525(9)0.0015 (7)0.0187 (7)0.0012 (7)
臭氧0.0679 (8)0.0461 (7)0.1111 (10)0.0071 (5)0.0505 (7)0.0048 (6)
C10号机组0.0375 (8)0.0476 (9)0.0491 (9)0.0033 (6)0.0135 (7)0.0031 (7)
氧气0.0748 (9)0.0758(9)0.1108 (11)0.0141 (7)0.0614 (8)0.0153 (7)
氮气0.0440 (7)0.0454 (7)0.0729 (9)0.0049 (6)0.0294 (7)0.0021 (6)
指挥与控制0.0550 (10)0.0463 (9)0.0600 (10)0.0091 (7)0.0234 (8)0.0017 (7)
N3号机组0.0461 (8)0.0603 (9)0.0782 (10)0.0029 (7)0.0260 (7)0.0028 (7)
O1公司0.0930 (10)0.0566(8)0.1237 (11)0.0162 (7)0.0675 (9)0.0050 (7)
C6级0.0545 (10)0.0448 (9)0.0698 (11)0.0030 (7)0.0262 (8)0.0015 (8)
抄送80.0500 (9)0.0483 (9)0.0663 (11)0.0057 (7)0.0249 (8)0.0030 (8)
C11号机组0.0499 (9)0.0474 (9)0.0645 (10)0.0006 (7)0.0235 (8)0.0002 (8)
C5级0.0563 (10)0.0476(10)0.0754 (12)0.0023(7)0.0286 (9)0.0088 (8)
第13页0.0483 (10)0.0688 (11)0.0733 (12)0.0067 (8)0.0312 (9)0.0040 (9)
补体第四成份0.0455 (9)0.0601(10)0.0597 (10)0.0035 (7)0.0252 (8)0.0067 (8)
C9级0.0448 (9)0.0466 (9)0.0593 (10)0.0027 (7)0.0200 (8)0.0003 (7)
C1类0.0540 (9)0.0454 (9)0.0621 (10)0.0009 (7)0.0245 (8)0.0062 (7)
第12项0.0624 (11)0.0522 (10)0.0754 (12)0.0086 (8)0.0329(10)0.0020 (8)
第14项0.0472 (9)0.0467 (9)0.0672 (10)0.0015 (7)0.0216 (8)0.0019 (8)
C3类0.0742 (13)0.0751 (13)0.0953 (15)0.0113 (11)0.0461 (11)0.0042 (11)
O4号机组0.0518 (8)0.0474 (7)0.1622 (15)0.0012 (6)0.0353 (9)0.0012 (8)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C8型1.2719 (19)O1-C3型1.423 (2)
N1-N2型1.3815 (16)C6-C5型1.392 (2)
C7-C6型1.382 (2)C6-H6A型0.9300
C7-C11.401 (2)C8-H8A型0.9300
C7-C8号机组1.453 (2)C11-C12号机组1.374(2)
臭氧层至C91.2299 (17)C11-H11A型0.9300
C10-C11号机组1.378 (2)C5-C4类1.351 (2)
C10-C14号机组1.384 (2)C5-H5A型0.9300
C10-C9号机组1.4946 (19)C13-C12号机组1.365 (2)
氧气-C41.3709 (18)C13-H13A型0.9300
氧气-C31.416(2)C1-H1B型0.9300
N2-C9气体1.3423 (18)C12-小时12a0.9300
N2-H2A气体0.8600C14-H14A型0.9300
C2-C1型1.360 (2)C3-H3B型0.9700
C2-O1型1.3723 (18)C3-H3C型0.9700
C2-C4型1.378 (2)O4-H4A型0.848 (9)
编号3-C131.328 (2)O4-H4B型0.839 (9)
编号3-C141.3324(19)
C8-N1-N2115.31 (13)C6-C5-H5A型121.9
C6-C7-C1120.01 (14)编号3-C13-C12123.35 (15)
C6-C7-C8118.26 (13)N3-C13-H13A号118.3
C1-C7-C8121.73 (14)C12-C13-H13A型118.3
C11-C10-C14号机组117.41 (13)C5-C4-O2127.70 (15)
C11-C10-C9125.71 (14)C5-C4-C2型122.33 (14)
C14-C10-C9型116.88 (13)氧气-C4-C2109.96 (14)
C4-O2-C3105.81(12)臭氧-C9-N2122.63 (13)
C9-N2-N1118.97 (12)臭氧-C9-C10120.53 (13)
C9-N2-H2A120.5N2-C9-C10型116.83 (13)
N1-N2-H2A型120.5C2-C1-C7型116.86 (14)
C1-C2-O1型128.15 (14)C2-C1-H1B型121.6
C1-C2-C4122.21 (14)C7-C1-H1B型121.6
O1-C2-C4型109.64 (13)C13-C12-C11119.27 (16)
C13-N3-C14型116.88 (14)C13-C12-H12A型120.4
C2-O1-C3105.75 (13)C11-C12-H12A型120.4
C7-C6-C5122.29 (14)N3-C14-C10型124.09 (15)
C7-C6-H6A型118.9N3-C14-H14A型118
C5-C6-H6A118.9C10-C14-H14A118
N1-C8-C7型122.63 (15)氧气-C3-O1108.74 (13)
N1-C8-H8A型118.7O2-C3-H3B型109.9
C7-C8-H8A型118.7O1-C3-H3B型109.9
C12-C11-C10118.99 (15)氧气-C3-H3C109.9
C12-C11-H11A型120.5臭氧-C3-H3C109.9
C10-C11-H11A型120.5H3B-C3-H3C型108.3
C4-C5-C6116.29 (14)H4A-O4-H4B109.5 (18)
C4-C5-H5A型121.9
氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-H(H)···一个D类-H(H)H(H)···一个D类···一个D类-H(H)···一个
N2-H2气体一个···O4号机组0.862.042.8819 (17)164
O4-H4型一个···N3号机组0.85 (1)1.98 (2)2.825(2)174 (2)
O4-H4型B类···臭氧ii(ii)0.84 (1)2.11 (2)2.9019 (19)158 (2)
C3-H3型B类···臭氧0.972.573.495 (2)160
C8-H8型一个···O4号机组0.932.513.312 (2)144
C11-H11型一个···O4号机组0.932.453.324 (2)156
对称代码:(i)x个1/2,1/2,z(z)+1/2; (ii)x个1,z(z); (iii)x个+1,+1,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方C类14H(H)11N个O(运行)·H(H)2O(运行)
M(M)第页287.28
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/n个
温度(K)293
bc(c)(Å)8.6414 (2), 12.0874 (2), 13.4464 (3)
β(°)103.161 (1)
V(V))1367.61 (5)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.11
晶体尺寸(mm)0.26 × 0.21 × 0.17
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(萨达布; 布鲁克,1998年)
T型最小值T型最大值0.974, 0.982
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
19494, 2691, 1839
R(右)整数0.044
(罪θ/λ)最大值1)0.617
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.041, 0.112, 1.04
反射次数2691
参数数量199
约束装置数量
氢原子处理通过独立和约束精化的混合物处理的H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.15,0.13

计算机程序:智能(布鲁克,1998),圣保罗(布鲁克,1998),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何结构(Å,º) 顶部
D类-H(H)···一个D类-H(H)H(H)···一个D类···一个D类-H(H)···一个
N2-H2A···O40.862.042.8819 (17)164
O4-H4A···N30.848 (9)1.980 (17)2.825 (2)174 (2)
O4-H4B···O3ii(ii)0.839 (9)2.106 (15)2.9019 (19)158.2 (16)
C3-H3B···O30.972.573.495 (2)160
C8-H8A···O40.932.513.312(2)144
C11-H11A···O40.932.453.324 (2)156
对称代码:(i)x个1/2,1/2,z(z)+1/2; (ii)x个1,z(z); (iii)x个+1,+1,z(z).
 

工具书类

第一次引用布鲁克(1998)。智能圣保罗萨达布.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Kahwa,I.A.、Selbin,I.、Hsieh,T.C.Y.和Laine,R.A.(1986年)。无机烟囱。学报118, 179–185. 交叉参考 中国科学院 科学网 谷歌学者
第一次引用Santos,M.L.P.、Bagatin,I.A.、Pereira,E.M.和Ferreira,A.M.D.C.(2001)。化学杂志。Soc.道尔顿Trans。第838–844页科学网 交叉参考 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。一个64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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