有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

1-羧氧基甲基-2-乙基-4-甲基-1H(H)-咪唑-3-氯化铵一水合物

中华人民共和国无锡市江南大学化学与材料工程学院,邮编:214122b条江苏省核医学研究所卫生部核医学重点实验室,无锡,214063,中华人民共和国
*通信电子邮件:shineng914@yahoo.com.cn

(收到日期:2009年3月27日; 2009年4月9日接受; 在线2009年4月22日)

在标题化合物中,C8H(H)13N个22+·氯离子·H(H)2O、 乙基的甲基C原子略微超出咪唑平面,N-C(环)-C-C扭转角为−15.1(2)°。晶体结构,溶剂-水分子、游离氯离子和有机阳离子之间存在着强烈的分子间氢键相互作用,在分子间形成了二维超分子网络ab公司平面。

相关文献

标题化合物是合成二膦酸的重要中间体,2-(2-乙基-4-甲基-1H(H)-咪唑-1-基)-1-羟基乙烷-1,1-二烷基二膦酸;有关双磷酸盐的一般背景,请参见:Dawson(2003)【Dawson,N.A.(2003),《实验操作药理学》第4期,第705-716页。】); 瓦西雷迪等。(2003【Vasireddy,S.、Talwakar,A.、Miller,H.、Mehan,H.和David,R.S.(2003)。临床风湿病。22,376-380。】). 相关结构见:高等。(2004[高,S.,赵,H.,霍,L.-H.,高,J.-S.,宰,S.M.&Ng,S.W.(2004).《结晶学报》E60,o1391-o1393.]); 巴钦斯基等。(2008【Barczynski,P.,Komasa,A.,Ratajczak-Sitarz,M.,Katrusiak,A.,Huczynki,A.&Brzezinski,B.(2008),《分子结构杂志》876,170-176。】). 关于合成,请参见:Zederenko等。(1994【Zederenko,P.、Gil,M.S.和Ballesteros,P.(1994),《组织化学杂志》59,6268-6273。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类8H(H)13N个22+·氯离子·H(H)2

  • M(M)第页= 222.67

  • 单诊所,P(P)21/n个

  • = 11.077 (2) Å

  • b条= 8.4542 (18) Å

  • c(c)= 11.938 (3) Å

  • β= 90.265 (3)°

  • V(V)= 1117.9 (4) Å

  • Z= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.33毫米−1

  • T型=93千

  • 0.40×0.40×0.35毫米

数据收集
  • Rigaku SPIDER衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(快速自动; 里加库,2004年[Rigaku(2004)。RAPID-AUTO。日本东京Rikaku公司。])T型最小值= 0.880,T型最大值= 0.894

  • 8869次测量反射

  • 2532次独立反射

  • 2203次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.031

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.036

  • 水风险(F类2) = 0.099

  • S公司= 1.00

  • 2532次反射

  • 145个参数

  • 1个约束

  • 用独立和约束精化的混合物处理H原子

  • Δρ最大值=0.29埃−3

  • Δρ最小值=-0.20埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N1-H1型N个●氯1 0.881 (17) 2.300 (18) 3.1635 (14) 166.6 (15)
臭氧-H3A类●氯1 0.91 (2) 2.20 (2) 3.1062 (14) 177 (2)
O1-H1型●臭氧 0.96 (2) 1.60 (2) 2.5557 (16) 170 (2)
臭氧-H3B类●氯1ii(ii) 0.96 (2) 2.14 (2) 3.0860 (14) 168.2 (19)
对称代码:(i)[-x+{\script{3\over 2}},y+{\sscript{1\over 2{},-z+{\sScript{1\ever 2}{]; (ii)[-x+{\script{1\over2}},y-{\script}1\over 2}}].

数据收集:快速自动(里加库,2004年[Rigaku(2004)。RAPID-AUTO。日本东京Rikaku公司。]); 细胞精细化: 快速自动; 数据缩减:快速自动; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

具有咪唑环的双膦酸盐,即唑来膦酸盐,是一种有效的骨特异性姑息治疗方法,可以减少肿瘤引起的骨骼并发症。考虑到这个想法,我们打算合成一种第三代双膦酸盐化合物,2-(2-乙基-4-甲基-1H(H)-咪唑-1-基)-1-羟基乙烷-1,1-二膦酸,可能用于治疗患者。作为双膦酸分步反应的重要中间化合物晶体结构本文报道了标题化合物的。

在标题化合物(I)(图1)中,C8H(H)13N个22+.Cl类-.H型2O、 与咪唑环相连的所有碳原子(C4、C5和C7)几乎都与咪唑链共面。乙基略微超出咪唑平面,N1-C3(环)-C5-C6扭转角为-15.116(211)°。而1-取代乙酸基团近似垂直于咪唑环[二面角=77.438(111)°]。自由水分子(O3)、自由氯阴离子(Cl1)和来自有机阳离子的O1和N1之间存在强烈的分子间氢相互作用(表1)。以及晶体结构被这些强氢键相互作用稳定,形成二维超分子网络ab公司平面(表1和图2)。

相关文献顶部

关于二膦酸盐的一般背景,见:Dawson(2003);瓦西雷迪等。(2003). 相关结构见:高等。(2004); 巴钦斯基等。(2008). 合成见:Zederenko等。(1994).

实验顶部

标题化合物(I)是根据以前的文献合成的(Zederenko等。, 1994). 反应后,获得白色粉末(产率65%)。Mp 170–171°C。然后,化合物(I)从丙酮溶剂中重结晶;几天后形成无色块状晶体(产率61%)。C的分析计算8H(H)15氯离子2:43.15,H 6.79,N 12.58%;发现:C 43.01,H 6.96,N 12.45%。

计算详细信息顶部

数据收集:快速自动(里加库,2004年);细胞精细化: 快速自动(里加库,2004年);数据缩减:快速自动(里加库,2004年);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)的分子结构,具有原子标记和非H原子30%概率位移椭球。
[图2] 图2。从强分子间氢键(虚线)构建超分子网络的透视图。省略了氢键中不涉及的氢原子。
1-羧甲基-2-乙基-4-甲基-1H(H)-咪唑-3-氯化铵一水合物顶部
水晶数据 顶部
C类8H(H)13N个22+·氯离子·H(H)2F类(000) = 472
M(M)第页= 222.67D类x=1.323毫克
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-P 2yn3544次反射的单元参数
= 11.077 (2) Åθ= 3.0–27.5°
b条= 8.4542 (18) ŵ=0.33毫米1
c(c)= 11.938 (3) ÅT型=93千
β= 90.265 (3)°块状,无色
V(V)= 1117.9 (4) Å0.40×0.40×0.35毫米
Z= 4
数据收集 顶部
Rigaku蜘蛛
衍射仪
2532次独立反射
辐射源:旋转阳极2203次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.031
ω扫描θ最大值= 27.5°,θ最小值= 3.0°
吸收校正:多扫描
(快速自动; 里加库,2004年)
小时=1314
T型最小值= 0.880,T型最大值= 0.894k个=1010
8869次测量反射=1514
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.036氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.099用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.00 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0582P(P))2+ 0.06P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2532次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
145个参数Δρ最大值=0.29埃
1个约束Δρ最小值=0.20埃
水晶数据 顶部
C类8H(H)13N个22+·氯离子·H(H)2V(V)= 1117.9 (4) Å
M(M)第页= 222.67Z= 4
单诊所,P(P)21/n个K(K)α辐射
= 11.077 (2) ŵ=0.33毫米1
b条= 8.4542 (18) ÅT型=93千
c(c)= 11.938 (3) Å0.40×0.40×0.35毫米
β= 90.265 (3)°
数据收集 顶部
Rigaku蜘蛛
衍射仪
2532次独立反射
吸收校正:多扫描
(快速自动; 里加库,2004年)
2203次反射> 2σ()
T型最小值= 0.880,T型最大值= 0.894R(右)整数= 0.031
8869次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0361个约束
水风险(F类2) = 0.099用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.00Δρ最大值=0.29埃
2532次反射Δρ最小值=0.20埃
145个参数
特殊细节 顶部

几何形状.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单元e.s.d.单独考虑;只有当由晶体对称性定义时,才使用电解槽参数中e.s.d.之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
第1类0.19761 (3)0.57092 (4)0.31835 (3)0.02509 (14)
O1公司0.88525 (10)0.95264 (13)0.14174 (10)0.0295 (3)
氧气0.79630 (9)0.72040 (13)0.17923 (9)0.0273 (3)
臭氧0.40590 (10)0.32662 (16)0.33959 (12)0.0382 (3)
N1型0.42391 (11)0.70595 (14)0.18900 (10)0.0184 (3)
氮气0.57147 (10)0.84373 (14)0.12622 (10)0.0184 (3)
C1类0.42085 (12)0.68984 (18)0.07348 (12)0.0210 (3)
指挥与控制0.51409 (12)0.77535 (17)0.03442 (12)0.0211 (3)
氢气0.53660.78690.04180.025*
C3类0.51465 (12)0.79974 (16)0.21927 (12)0.0178 (3)
补体第四成份0.32597 (14)0.5958 (2)0.01537 (14)0.0292 (4)
H4A型0.34260.59340.06520.035*
H4B型0.24690.64450.02810.035*
H4C型0.32580.48770.04490.035*
C5级0.54916 (13)0.84647 (19)0.33464 (12)0.0234 (3)
H5A型0.56770.96100.33550.028*
H5B型0.62360.78910.35620.028*
C6型0.45261 (15)0.8131 (2)0.42068 (13)0.0304 (4)
H6A型0.37890.87100.40080.037*
人6b0.48090.84730.49470.037*
H6C型0.43550.69940.42220.037*
抄送70.67760 (12)0.94450 (17)0.12097 (12)0.0202 (3)
H7A型0.66721.03450.17310.024*
H7B型0.68490.98790.04430.024*
抄送80.79233 (12)0.85727 (18)0.15091 (12)0.0205 (3)
甲型H1N0.3693 (15)0.667 (2)0.2348 (14)0.027 (4)*
上半年0.961 (2)0.900 (3)0.1558 (18)0.060 (7)*
H3A型0.344 (2)0.397 (3)0.336 (2)0.077 (8)*
H3B型0.385 (2)0.243 (3)0.289 (2)0.067 (7)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
第1类0.0190 (2)0.0276 (2)0.0287 (2)0.00309 (14)0.00545 (15)0.00028 (14)
O1公司0.0168 (5)0.0245 (6)0.0472 (7)0.0020 (5)0.0009 (5)0.0008 (5)
氧气0.0199 (5)0.0236 (6)0.0384 (6)0.0035 (4)0.0019 (5)0.0087 (5)
臭氧0.0206 (6)0.0333 (7)0.0605 (9)0.0012 (5)0.0053 (6)0.0059 (6)
N1型0.0141 (6)0.0215 (6)0.0196 (6)0.0007 (5)0.0018 (5)0.0005 (5)
氮气0.0139 (6)0.0212 (6)0.0202 (6)0.0015 (5)0.0002 (5)0.0007 (5)
C1类0.0162 (7)0.0250 (8)0.0220 (7)0.0033 (6)0.0002 (6)0.0028 (6)
指挥与控制0.0178 (7)0.0276 (8)0.0178 (7)0.0040 (6)0.0004 (5)0.0008 (6)
C3类0.0139 (6)0.0179 (7)0.0217 (7)0.0029 (5)0.0018 (5)0.0005 (5)
补体第四成份0.0202 (8)0.0392 (10)0.0281 (8)0.0016 (7)0.0013 (6)0.0088 (7)
C5级0.0236 (8)0.0269 (8)0.0197 (7)0.0040 (6)0.0004 (6)0.0027 (6)
C6型0.0303 (9)0.0381 (10)0.0229 (8)0.0054 (7)0.0031 (7)0.0040 (7)
抄送70.0165 (7)0.0195 (7)0.0247 (7)0.0007 (6)0.0021 (6)0.0018 (5)
抄送80.0173 (7)0.0232 (8)0.0211 (7)0.0001 (6)0.0021 (6)0.0003 (6)
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C8型1.3125 (18)C3-C5型1.481 (2)
O1-H1O型0.96 (2)C4-H4A型0.9800
氧气-C81.2063 (18)C4-H4B型0.9800
臭氧-H3A0.91 (2)C4-H4C型0.9800
臭氧-H3B0.96 (2)C5至C61.513 (2)
N1-C3型1.3290 (18)C5-H5A型0.9900
N1-C1型1.3860 (18)C5-H5B型0.9900
N1-H1N型0.881 (17)C6-H6A型0.9800
N2-C3气体1.3322 (18)C6-H6B型0.9800
N2-C2气体1.3903 (18)C6-H6C型0.9800
N2至C71.4534 (18)C7-C8号机组1.5109 (19)
C1-C2类1.346 (2)C7-H7A型0.9900
C1-C4类1.487 (2)C7-H7B型0.9900
C2-H2型0.9500
C8-O1-H1O112.3 (13)H4B-C4-H4C型109.5
H3A-O3-H3B型106.1 (16)C3至C5至C6113.66 (12)
C3-N1-C1110.13 (12)C3-C5-H5A型108.8
C3-N1-H1N125.1 (11)C6-C5-H5A型108.8
C1-N1-H1N124.5 (11)C3-C5-H5B型108.8
C3-N2-C2型108.97 (12)C6-C5-H5B型108.8
C3-N2-C7125.80 (12)H5A-C5-H5B型107.7
C2-N2-C7型125.22 (12)C5-C6-H6A型109.5
C2-C1-N1型106.06 (12)C5-C6-H6B型109.5
C2-C1-C4型131.87 (14)H6A-C6-H6B型109.5
N1-C1-C4122.06 (13)C5-C6-H6C109.5
C1-C2-N2107.40 (13)H6A-C6-H6C型109.5
C1-C2-H2126.3H6B-C6-H6C型109.5
N2-C2-H2气体126.3N2-C7-C8112.54 (12)
N1-C3-N2型107.43 (12)N2-C7-H7A型109.1
N1-C3-C5127.13 (13)C8-C7-H7A型109.1
N2-C3-C5气体125.44 (13)N2-C7-H7B型109.1
C1-C4-H4A型109.5C8-C7-H7B基因109.1
C1-C4-H4B型109.5H7A-C7-H7B型107.8
H4A-C4-H4B型109.5O2-C8-O1型125.81 (14)
C1-C4-H4C型109.5O2-C8-C7型124.34 (13)
周四至周四109.5O1-C8-C7型109.85 (13)
C3-N1-C1-C20.88 (16)C7-N2-C3-N1178.83 (12)
C3-N1-C1-C4177.84 (13)C2-N2-C3-C5型179.31 (13)
N1-C1-C2-N20.76 (16)C7-N2-C3-C50.3 (2)
C4-C1-C2-N2型177.78 (15)N1-C3-C5-C615.1 (2)
C3-N2-C2-C10.40 (16)N2-C3-C5-C6型165.88 (14)
C7-N2-C2-C1179.39 (13)C3-N2-C7-C877.86 (17)
C1-N1-C3-N20.63 (16)C2-N2-C7-C8100.96 (15)
C1-N1-C3-C5179.78 (14)N2-C7-C8-O22.0 (2)
C2-N2-C3-N10.14 (15)N2-C7-C8-O1型178.25 (12)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1型N个···第1类0.881 (17)2.300 (18)3.1635 (14)166.6 (15)
臭氧-H3A类···第1类0.91 (2)2.20 (2)3.1062 (14)177 (2)
O1-H1型···臭氧0.96 (2)1.60 (2)2.5557 (16)170 (2)
臭氧-H3B类···第1类ii(ii)0.96 (2)2.14 (2)3.0860 (14)168 (2)
对称代码:(i)x+3/2,+1/2,z(z)+1/2; (ii)x+1/2,1/2,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学式C类8H(H)13N个22+·氯离子·H(H)2
M(M)第页222.67
晶体系统,空间组单诊所,P(P)21/n个
温度(K)93
,b条,c(c)(Å)11.077 (2), 8.4542 (18), 11.938 (3)
β(°)90.265 (3)
V(V))1117.9 (4)
Z4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.33
晶体尺寸(mm)0.40 × 0.40 × 0.35
数据收集
衍射仪Rigaku蜘蛛
衍射仪
吸收校正多扫描
(快速自动; 里加库,2004年)
T型最小值,T型最大值0.880, 0.894
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
8869, 2532, 2203
R(右)整数0.031
(罪θ/λ)最大值1)0.649
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.036, 0.099, 1.00
反射次数2532
参数数量145
约束装置数量1
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.29,0.20

计算机程序:快速自动(里加库,2004年),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H1N···Cl10.881 (17)2.300 (18)3.1635 (14)166.6 (15)
O3-H3A···Cl10.91 (2)2.20 (2)3.1062 (14)177 (2)
O1-H1O··O30.96 (2)1.60 (2)2.5557 (16)170 (2)
O3-H3B···Cl1ii(ii)0.96 (2)2.14 (2)3.0860 (14)168.2 (19)
对称代码:(i)x+3/2,+1/2,z(z)+1/2; (ii)x+1/2,1/2,z(z)+1/2.
 

致谢

本研究得到了吴洁平医学基金(32067500615)和国家自然科学基金(20801024)的资助。

工具书类

第一次引用Barczynski,P.、Komasa,A.、Ratajczak-Sitarz,M.、Katrusiak,A.、Huczynki,A.和Brzezinski,B.(2008)。J.分子结构。 876, 170–176. 科学网 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Dawson,N.A.(2003年)。实验操作。药物治疗。 4, 705–716. 科学网 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Gao,S.、Zhao,H.、Huo,L.-H.、Gao,J.-S.、Zain,S.M.和Ng,S.W.(2004)。《水晶学报》。E类601391年至1393年科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Rigaku(2004)。快速自动。Rigaku Corporation,日本东京。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Vasireddy,S.、Talwakar,A.、Miller,H.、Mehan,H.和David,R.S.(2003)。临床。风湿病。 22, 376–380. 科学网 交叉参考 公共医学 谷歌学者
第一次引用Zederenko,P.、Gil,M.S.和Ballesteros,P.(1994)。组织化学杂志。 59, 6268–6273. 谷歌学者

这是一篇根据知识共享署名(CC-BY)许可证它允许在任何介质中不受限制地使用、分发和复制,前提是引用了原始作者和来源。

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890