金属有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

聚[二水]-μ2-异烟酰胺-μ2-草酸-铽(III)]

华南师范大学化学与环境学院,广州510006,中华人民共和国
*通信电子邮件:zhqfang77@yahoo.com.cn

(收到日期:2008年10月21日; 2008年12月15日接受; 在线2008年12月20日)

晶体结构标题复合体的[Tb(C6H(H)42)(C)2O(运行)4)(H)2O)2]n个、Tb离子由两个异烟酸根阴离子的两个O原子、两个草酸根阴离子的四个O原子和两个水分子配位,显示出扭曲的正方形反棱镜几何结构。Tb公司离子、离子负离子和水分子占据一般位置。两个晶体独立的草酸盐阴离子中的一个位于反转中心,而第二个位于双重旋转轴上。离子和草酸阴离子的羧酸基团将铽金属中心连接成层。这些层通过O-H…O和N-H…O氢键连接成三维网络。

相关文献

背景请参见:Eddaoudi等人。(2001年【Eddaoudi,M.,Moler,D.B.,Li,H.L.,Chen,B.L.,Reineke,T.M.,O'Keeffe,M.&Yaghi,O.M.(2001),《化学研究院会刊》34,319-330。】); 里兹克等人。(2005【Rizk,A.T.、Kilner,C.A.和Halcrow,M.A.(2005)。《晶体工程通讯》,第7期,第359-362页。】). 前一篇论文中报告了对这种结构的独立测定,参见:Song等人。(2009【宋伟东、李胜杰、秦平伟、胡胜伟(2009),《结晶学报》E65,m117。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [Tb(C6H(H)42)(C)2O(运行)4)(H)2O)2]

  • M(M)第页= 405.07

  • 单诊所,C2/c(c)

  • = 17.7919 (18) Å

  • b条= 9.9259 (10) Å

  • c(c)= 12.9670 (13) Å

  • β= 112.4140 (10)°

  • V(V)= 2117.0 (4) Å

  • Z轴= 8

  • K(K)α辐射

  • μ=6.72毫米−1

  • T型=296(2)K

  • 0.23×0.22×0.20毫米

数据收集
  • 布鲁克APEXII区域探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(4月2日布鲁克,2004[Bruker(2004),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市])T型最小值= 0.241,T型最大值= 0.272

  • 5243次测量反射

  • 1907独立反射

  • 1674次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.031

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.025

  • 水风险(F类2)=0.063

  • S公司= 1.01

  • 1907次反射

  • 163个参数

  • 6个约束

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=1.40埃−3

  • Δρ最小值=-1.31埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) 小时A类 D类A类 D类-H月A类
O1公司W公司-氢气W公司●臭氧 0.84 2.22 2.992 (5) 153
氧气W公司-H4型W公司2010年1月W公司ii(ii) 0.84 2.19 3.003 (5) 163
O1公司W公司-上半年W公司●N1 0.84 1.83 2.661 (5) 167
氧气W公司-H3级W公司2006年1月iv(四) 0.84 2.01 2.836 (5) 172
对称代码:(i)[x,-y,z+{\script{1\over 2}}](ii)[-x+{\script{3\超过2}},-y+{\sscript{1\超过2}{,-z+1](iii)-x个+1, -, -z(z)+1(iv)-x个+2, -, -z(z)+1.

数据收集:4月2日(布鲁克,2004年[Bruker(2004),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞细化: 圣保罗(布鲁克,2004年[Bruker(2004),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 数据缩减:圣保罗用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:柏拉图式的(斯佩克,2003年【Spek,A.L.(2003),《应用结晶杂志》,第36期,第7-13页。】)和谢尔克斯特尔(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.

支持信息


注释顶部

由功能化有机分子或阴离子作为金属中心之间的桥梁而形成的配位网络的设计、合成、表征和性质非常有趣(Rizk等人。, 2005; Eddaoudi公司等人。, 2001). 作为构建块,异烟酸和草酸是构建此类化合物的理想候选。在我们正在进行的该领域的研究中,制备了标题化合物并对其进行了结构表征。

晶体结构标题化合物的每个Tb中心由来自两个对称相关的离子负离子、两个晶体学独立的草酸盐负离子和两个晶体学独立的水分子的六个氧原子在扭曲的双包三角棱镜几何中进行配位(图1)。Tb公司离子通过离子和草酸阴离子连接成层,层平行于b-c平面(图2)。Tb···Tb分离量分别为6.177(4)和5.047(5)奥。这些层通过水H原子和inic之间的O-H··O和N-H··O氢键以及两个晶体学上独立的草酸阴离子之一连接成三维网络(表1)。

相关文献顶部

背景请参见:Eddaoudi等人。(2001); 里兹克等人。(2005). 前一篇论文中报告了对这种结构的独立测定,参见:Song等人。(2009).

实验顶部

Tb混合物4O(运行)7(0.189 g;0.25 mmol)、异烟酸(0.135 g;1.5 mmol),草酸(0.135g;1.5 mm ol),水(10 mL)和HNO将(0.385 mmol;0.92g/ml)搅拌20 min,然后密封在20 ml Teflon-lined不锈钢高压釜中。将高压灭菌器加热至433K达3天,然后在5K小时冷却至室温-1通过此过程,获得了标题化合物的无色块状晶体。

精炼顶部

水氢原子位于不同的傅里叶映射中,其键长被设置为O–H=0.84的理想值,最后使用骑乘模型对其各向同性进行细化U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(O) ●●●●。将C-H H原子放置在计算位置,并将其视为骑在母体C原子上,C-H=0.93ºU型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2004);细胞细化: 圣保罗(布鲁克,2004);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2004);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:柏拉图式的(斯佩克,2003)和SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXL97型(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。标题化合物的部分晶体结构,标记和置换椭球体绘制在30%概率水平。对称码:(i)1.5-x,0.5-y,1-z;(ii)1.5-x,-0.5-y,1-z;(iii)2-x,y,1.5-z;
[图2] 图2。标题化合物的晶体结构,沿c轴观察。
聚[diaqua-µ2-异烟酸-µ2-草酸-铽(III)]顶部
水晶数据 顶部
[Tb(C6H(H)42)(C)2O(运行)4)(H)2O)2]F类(000) = 1536
M(M)第页=405.07D类x个=2.542毫克
单诊所,C2/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 17.7919 (18) Å2410次反射的细胞参数
b条= 9.9259 (10) Åθ= 2.4–27.7°
c(c)= 12.9670 (13) ŵ=6.72毫米1
β= 112.414 (1)°T型=296千
V(V)= 2117.0 (4) Å块,无色
Z轴= 80.23×0.22×0.20毫米
数据收集 顶部
Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
1674次反射> 2σ()
辐射源:细焦点密封管R(右)整数= 0.031
ϕω扫描θ最大值= 25.2°,θ最小值= 2.4°
吸收校正:多扫描
(4月2日布鲁克,2004年)
小时=2120
T型最小值= 0.241,T型最大值= 0.272k个=511
5243次测量反射=1515
1907独立反射
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.025氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.063受约束的氢原子参数
S公司= 1.01 w个= 1/[σ2(F类2) + (0.0363)2]
哪里= (F类2+ 2F类c(c)2)/3
1907次反射(Δ/σ)最大值= 0.002
163个参数Δρ最大值=1.40埃
6个约束Δρ最小值=1.31埃
水晶数据 顶部
[Tb(C6H(H)42)(C)2O(运行)4)(H)2O)2]V(V)=2117.0(4)Å
M(M)第页= 405.07Z轴= 8
单诊所,C2/c(c)K(K)α辐射
=17.7919(18)ŵ=6.72毫米1
b条= 9.9259 (10) ÅT型=296千
c(c)= 12.9670 (13) Å0.23×0.22×0.20毫米
β= 112.414 (1)°
数据收集 顶部
Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
1907独立反射
吸收校正:多扫描
(4月2日布鲁克,2004年)
1674次反射> 2σ()
T型最小值= 0.241,T型最大值= 0.272R(右)整数= 0.031
5243次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0256个约束
水风险(F类2) = 0.063受约束的氢原子参数
S公司= 1.01Δρ最大值=1.40埃
1907次反射Δρ最小值=1.31埃
163个参数
特殊细节 顶部

几何图形使用全协方差矩阵估计所有esd(除了两个l.s.平面之间二面角的esd)。在估计距离、角度和扭转角的esd时,单独考虑单元esd;细胞参数中esd之间的相关性仅在由晶体对称性定义时使用。细胞esd的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的esd。

精炼.F的细化2对抗所有反射。加权R系数wR和拟合优度S基于F2,传统的R系数R基于F,对于负F,F设置为零2F的阈值表达式2>2西格玛(F2)仅用于计算R系数(gt)等,与选择反射进行细化无关。基于F的R系数2从统计上看,是基于F的因子的两倍,而基于ALL数据的R因子将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数(Å2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
第1天0.824056 (12)0.03238(2)0.574780 (18)0.01553(10)
O5公司0.9618 (2)0.0185 (4)0.6050(3)0.0289 (9)
氧气0.6877 (2)0.0558 (4)0.4672 (3)0.0326 (9)
臭氧0.8029 (2)0.1491 (3)0.4403 (3)0.0239 (8)
抄送81.0149 (3)0.0110 (5)0.7019 (4)0.0192 (11)
O6公司1.0905 (2)0.0055 (4)0.7291 (3)0.0272 (9)
C1类0.6278 (3)0.1294 (5)0.4198 (4)0.0215 (11)
指挥与控制0.5442 (3)0.0692 (5)0.3902 (4)0.0172 (10)
C3类0.4756 (3)0.1501 (6)0.3627 (4)0.0264 (12)
H3级0.48000.24340.36180.032*
C6型0.5336 (3)0.0690(5)0.3874 (4)0.0241 (11)
人60.57810.12630.40500.029*
补体第四成份0.4010 (3)0.0890 (6)0.3366 (4)0.0315 (13)
H4型0.35560.14380.32060.038*
C5级0.4563 (3)0.1211 (5)0.3584 (5)0.0314 (13)
人50.45000.21420.35640.038*
N1型0.3903 (3)0.0438 (5)0.3330 (4)0.0309 (11)
抄送70.7582 (3)0.2447 (5)0.4457 (4)0.0201 (11)
O4号机组0.7261 (2)0.3320 (3)0.3724 (3)0.0252 (8)
O1公司0.6308 (2)0.2507 (4)0.3926 (3)0.0334(9)
O1瓦0.75857 (19)0.1250(3)0.6941 (3)0.0228 (8)
H1W(高度)0.71460.08770.68850.034*
H2W(氢气)0.77940.15460.75980.034*
O2瓦0.8300 (2)0.1188 (4)0.4029 (3)0.0312 (9)
高3瓦0.85540.07940.36910.047*
H4W型0.80510.18340.36310.047*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
第1天0.01241 (14)0.01564 (15)0.01830 (15)0.00225 (9)0.00558 (10)0.00106 (9)
O5公司0.0153 (18)0.048 (2)0.023 (2)0.0038 (17)0.0067 (16)0.0063 (18)
氧气0.0144 (18)0.052 (3)0.028 (2)0.0001 (18)0.0045 (16)0.001 (2)
臭氧层0.0271 (19)0.0201(18)0.0287 (19)0.0097 (16)0.0153(16)0.0047 (16)
抄送80.017 (3)0.018 (2)0.019 (3)0.003 (2)0.003 (2)0.000(2)
O6公司0.0132 (18)0.040 (2)0.027 (2)0.0019 (16)0.0068 (16)0.0024 (17)
C1类0.019 (3)0.031 (3)0.016 (2)0.006 (2)0.009 (2)0.007 (2)
指挥与控制0.017 (2)0.021 (3)0.014 (2)0.005 (2)0.0058 (19)0.001 (2)
C3类0.023 (3)0.028 (3)0.033 (3)0.004 (2)0.017 (2)0.008 (2)
C6级0.019 (3)0.022 (3)0.031 (3)0.003 (2)0.010 (2)0.001 (2)
补体第四成份0.019 (3)0.049 (4)0.030 (3)0.007 (3)0.014 (2)0.008 (3)
C5级0.036 (3)0.022 (3)0.040 (3)0.013 (3)0.018 (3)0.004 (3)
N1型0.023 (2)0.044 (3)0.026 (2)0.009 (2)0.010 (2)0.001 (2)
抄送70.019 (2)0.017 (3)0.023 (3)0.004 (2)0.006 (2)0.002 (2)
O4号机组0.033 (2)0.0225 (18)0.0218 (18)0.0081 (16)0.0128 (16)0.0050 (16)
O1公司0.038 (2)0.027 (2)0.041 (2)0.0189 (18)0.0211 (19)0.0120 (19)
O1瓦0.0180 (17)0.027 (2)0.0260 (18)0.0064 (15)0.0116 (15)0.0071 (16)
O2瓦0.049 (2)0.024 (2)0.029 (2)0.0045 (18)0.0241 (18)0.0045 (17)
几何参数(λ,º) 顶部
Tb1-O1型2.280 (3)C2-C3型1.389 (7)
Tb1-O2号2.303(3)C3-C4型1.379 (7)
第1-O5天2.383 (3)C3-H3型0.9300
Tb1-O4号机组ii(ii)2.385 (3)C6-C5型1.380 (7)
Tb1-O2瓦2.427 (3)C6-H6型0.9300
Tb1-O3号2.435 (3)C4-N1型1.330 (8)
Tb1-O6号2.443 (4)C4-H4型0.9300
Tb1-O1W型2.443 (3)C5-N1型1.335 (7)
O5-C8型1.254 (6)C5-H5型0.9300
氧气-C11.244 (6)C7-O4型1.251 (6)
臭氧-C71.259 (6)C7-C7号机组ii(ii)1.545 (10)
C8-O6型1.256 (6)O4-Tb1型ii(ii)2.385 (3)
C8-C8号机组1.529(10)O1-Tb1型2.280(3)
O6-Tb1型2.443 (4)O1W至H1W0.8429
C1-O1型1.261 (6)O1W-H2W型0.8420
C1-C2类1.511 (6)O2W-H3W型0.8367
C2-C6型1.383 (7)O2W-H4W型0.8365
O1公司-Tb1-O2号103.43 (14)O6-C8-C8型116.0 (5)
O1公司-第1-O5天84.39 (13)C8-O6-Tb1型118.3 (3)
O2-Tb1-O5型154.22 (14)氧气-C1-O1125.4 (5)
O1公司-Tb1-O4号机组ii(ii)151.43 (12)O2-C1-C2型117.9 (5)
O2-Tb1-O4型ii(ii)80.50 (13)O1-C1-C2型116.7 (5)
O5-Tb1-O4型ii(ii)104.46 (13)C6-C2-C3118.0(4)
O1公司-Tb1-O2瓦72.60(12)C6-C2-C1120.7 (4)
氧合二-Tb1-O2W79.21 (13)C3-C2-C1121.3 (5)
O5-Tb1-O2W型79.88 (13)C4-C3-C2型118.6 (5)
O4号机组ii(ii)-Tb1-O2瓦135.25 (12)C4-C3-H3型120.7
O1公司-Tb1-O3号141.11 (12)C2-C3-H3型120.7
O2-Tb1-O378.56 (13)C5-C6-C2型119.4 (5)
O5-Tb1-O3型80.16 (12)C5-C6-H6120.3
O4号机组ii(ii)-Tb1-O3号67.43 (11)C2-C6-H6型120.3
O2W-Tb1-O3型69.67 (11)N1-C4-C3型123.8 (5)
O1公司-Tb1-O6号85.24 (13)N1-C4-H4型118.1
O2-Tb1-O6型137.67 (13)C3至C4118.1
O5-Tb1-O6型66.65(12)N1-C5-C6122.9 (5)
O4号机组ii(ii)-Tb1-O6型74.06 (12)N1-C5-H5型118.6
O2W-Tb1-O6型141.48 (12)C6-C5-H5型118.6
O3-Tb1-O6型119.77 (12)C4-N1-C5117.4 (4)
O1公司-Tb1-O1W型75.34 (12)O4-C7-O3126.5 (5)
O2-Tb1-O1W型72.48 (13)O4-C7-C7型ii(ii)117.1 (5)
O5-Tb1-O1W型133.16 (12)O3-C7-C7型ii(ii)116.4 (5)
O4号机组ii(ii)-Tb1-O1W型79.12 (11)C7-O4-Tb1型ii(ii)118.1 (3)
O2W-Tb1-O1W型130.27 (12)C1-O1-Tb1型154.0 (4)
O3-Tb1-O1W型138.71 (11)Tb1-O1W-H1W型115.5
O6公司-Tb1-O1W型69.91 (12)Tb1-O1W-H2W型129.8
C8-O5-Tb1型119.1 (3)H1W-O1W-H2W型106
C1-O2-Tb1型149.9 (4)Tb1-O2W-H3W型122.5
C7-O3-Tb1型116.5 (3)Tb1-O2W-H4W型129.8
O5-C8-O6型127.0 (5)H3W-O2W-H4W型107.4
O5-C8-C8型117.0 (5)
对称代码:(i)x个+3/2,+1/2,z(z)+1; (ii)x个+3/2,1/2,z(z)+1; (iii)x个+2,,z(z)+3/2.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1公司W公司-氢气W公司···臭氧iv(四)0.842.222.992 (5)153
氧气W公司-H4型W公司···O1公司W公司0.842.193.003 (5)163
O1公司W公司-上半年W公司···N1型v(v)0.841.832.661 (5)167
氧气W公司-H3级W公司···O6公司0.842.012.836 (5)172
对称代码:(i)x个+3/2,+1/2,z(z)+1; (iv)x个,,z(z)+1/2; (v)x个+1,,z(z)+1; (vi)x个+2,,z(z)+1.

实验细节

水晶数据
化学配方[Tb(C6H(H)42)(C)2O(运行)4)(H)2O)2]
M(M)第页405.07
晶体系统,空间组单诊所,C2/c(c)
温度(K)296
,b条,c(c)(Å)17.7919 (18), 9.9259 (10), 12.9670 (13)
β(°)112.414 (1)
V(V))2117.0 (4)
Z轴8
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)6.72
晶体尺寸(mm)0.23 × 0.22 × 0.20
数据收集
衍射仪Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(4月2日布鲁克,2004年)
T型最小值,T型最大值0.241, 0.272
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
5243, 1907, 1674
R(右)整数0.031
(罪θ/λ)最大值1)0.599
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.025、0.063、1.01
反射次数1907
参数数量163
约束装置数量6
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))1.40,1.31

计算机程序:4月2日(布鲁克,2004),圣保罗(布鲁克,2004),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),柏拉图式的(斯佩克,2003)和SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1W-H2W···O30.842.222.992 (5)153.3
O2W-H4W··O1Wii(ii)0.842.193.003 (5)163.2
O1W-H1W···N10.841.832.661 (5)167.3
O2W-H3W··O6iv(四)0.842.012.836 (5)171.6
对称代码:(i)x个,,z(z)+1/2; (ii)x个+3/2,+1/2,z(z)+1; (iii)x个+1,,z(z)+1; (iv)x个+2,,z(z)+1.
 

致谢

作者感谢华南师范大学对这项工作的支持。

工具书类

第一次引用布鲁克(2004)。4月2日圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Eddaoudi,M.、Moler,D.B.、Li,H.L.、Chen,B.L.、Reineke,T.M.、O'Keeffe,M.和Yaghi,O.M.(2001)。Acc.Chem.化学。物件。34, 319-330. 科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Rizk,A.T.、Kilner,C.A.和Halcrow,M.A.(2005)。晶体工程通讯,7, 359–362. 科学网 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Song,W.-D.,Li,S.-J.,Qin,P.-W.和Hu,S.-W.(2009)。《水晶学报》。E类65,m117科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Spek,A.L.(2003)。J.应用。克里斯特。 36,7-13科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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