有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

2-(4-氯苯基)-3-甲基-N个-(5-甲基噻唑-2-基)丁酰胺

浙江大学农业与生物技术学院,中华人民共和国杭州310029b条浙江大学生物技术研究所,中华人民共和国杭州310029
*通信电子邮件:fuchenglin@zj.com

(收到日期:2008年11月19日; 2008年12月17日接受; 在线2008年12月20日)

在标题化合物中,C15H(H)17氯化铵2OS,噻唑环,基本上是平面的,最大偏差为0.044(3)?,使二面角为54.76(8) 在晶体中,由双重旋转对称性相关的相邻分子通过成对的N-H…N氢键连接。

相关文献

有关背景,请参见:Holmstead等。(1978【Holmstead,R.L.,Fullmer,D.G.&Ruzo,L.O.(1978),《农业与食品化学杂志》,第26期,第954-959页。】); 福拉尼(1978)【Forlani,L.(1978),《化学与社会杂志》,《珀金译》第1期,第1169-1171页。】). 有关相关结构,请参见:Zhao等。(2006[Zhao,J.-H.,Cheng,J.-L.,Huang,Y.-K.&Zhu,G.-N.(2006).《结晶学报》E62,o4840-o4841]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C15H(H)17氯化铵2操作系统

  • M(M)第页= 308.83

  • 单诊所,C2/c(c)

  • = 14.9649 (6) Å

  • b条= 17.6062 (7) Å

  • c(c)=12.5606(5)Å

  • β= 99.9482 (11)°

  • V(V)= 3259.6 (2) Å

  • Z轴= 8

  • K(K)α辐射

  • μ=0.36毫米−1

  • T型=298(1)K

  • 0.41×0.33×0.26毫米

数据收集
  • Rigaku R轴快速衍射仪

  • 吸收校正:多次扫描(ABSCOR公司; 东芝,1995年[Higashi,T.(1995)。ABSCOR.Rigaku Corporation,日本东京。])T型最小值= 0.858,T型最大值= 0.911

  • 15655次测量反射

  • 3708个独立反射

  • 2559次反射F类2> 2σ(F类2)

  • R(右)整数=0.027

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.040

  • 水风险(F类2) = 0.172

  • S公司= 1.01

  • 3708次反射

  • 183个参数

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.27埃−3

  • Δρ最小值=-0.29埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
N1-H111和N2 0.86 2.08 2.929 (2) 168
对称代码:(i)[-x+1,y,-z+{\script{3\over 2}}].

数据收集:自动处理(里加库,1998年[Rigaku(1998)。PROCESS-AUTO。Rigaku-公司,日本东京。]); 细胞精细化: 自动处理; 数据缩减:晶体结构(里加库/MSC,2004年[理加库/MSC(2004)。晶体结构。理加库/MSC,美国得克萨斯州林地。]); 用于求解结构的程序:97新加坡元(阿尔托马雷等。, 1999【Altomare,A.,Burla,M.C.,Camalli,M.,Cascarano,G.L.,Giacovazzo,C.,Guagliardi,A.,Moliterni,A.G.,Polidori,G.&Spagna,R.(1999),《应用结晶杂志》,第32期,第115-119页。】); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:转运蛋白-3(Farrugia,1997年【Farrugia,L.J.(1997),《应用结晶杂志》,第30卷,第565页。】); 用于准备出版材料的软件:晶体结构.

支持信息


注释顶部

2-(4-氯苯基)-3-甲基丁酰氯是合成优良杀虫剂氰戊菊酯(Holmstead)的中间体等。, 1978). 2-氨基-5-甲基-噻唑是另一种杂环中间体(Forlani,1978)。作为我们对设计和合成新农药的持续兴趣的一部分,我们分离出标题化合物(I),即2-(4-氯苯基)-3-甲基丁酰氯和5-甲基-2-氨基噻唑之间缩合反应的产物,作为适合X射线分析的无色晶体。

(I)的分子结构如图1所示。N2、C10、C11、S1、C9和N1原子共面,N1原子的最大偏差为0.044(3)Ω。正如预期的那样,苯环是平面的,原子Cl1与由环C原子及其自身定义的平面之间的距离仅为0.018(4)Au。这两个环之间的夹角为54.76(8)°,小于化合物2-(4-氯苯基)-3-甲基的噻唑环和苯环之间的角度-N个-(噻唑-2-基)丁酰胺(Zhao等。, 2006). 晶体结构,这导致氢键二聚体的形成(图2和图3)。

相关文献顶部

有关背景,请参见:Holmstead等。(1978年);福拉尼(1978)。有关相关结构,请参见:Zhao等。(2006).

实验顶部

将2-氨基-5-甲基噻唑(1.14 g,10 mmol)、4-二甲氨基吡啶(0.12 g)、三乙胺(1.31 g)和氯仿(100 ml)添加到250 ml圆烧瓶中。将混合物搅拌并冷却至273 K,然后在30 min内逐滴添加2-(4-氯苯基)-3-甲基丁酰氯(3.47 g)。在室温下搅拌混合物3 h,然后添加1%盐酸水溶液(5 ml)。用水将有机层清洗至中性pH值,并在Na上干燥2SO公司4有机残渣经过滤浓缩后,用硅胶纯化柱色谱法,用乙酸乙酯-石油醚甲酸洗脱(10:80:1,v(v)/v(v)/v) ,得到白色固体(产率85%,2.5 g),(I)。然后从乙酸乙酯-石油醚(2:1,v(v)/v(v))提供无色块(熔点460–461 K)。

精炼顶部

将H原子包括在计算位置并使用骑行模型进行细化,其中甲基H原子的C-H距离限制为0.96º,芳基H原子的限制为0.93º,其余原子的限制是0.98º,N-H距离限制在0.86ºU型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C,N)或1.5U型等式(甲基C)。

计算详细信息顶部

数据收集:自动处理(里加库,1998年);细胞精细化: 自动处理(里加库,1998年);数据缩减:晶体结构(里加库/MSC,2004年);用于求解结构的程序:97新加坡元(阿尔托马雷等。, 1999); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:转运蛋白-3(Farrugia,1997);用于准备出版材料的软件:晶体结构.

数字顶部
[图1] 图1。(I)的分子结构,显示了原子标记方案。位移椭球是在30%的概率水平上绘制的。
[图2] 图2。单位细胞中的分子排列。
[图3] 图3。N-H··N氢键视图(虚线)[对称代码:(i)1-x个,, 3/2 -z].
2-(4-氯苯基)-3-甲基-N个-(5-甲基噻唑-2-基)丁酰胺顶部
水晶数据 顶部
C15H(H)17氯化铵2操作系统F类(000) = 1296.00
M(M)第页= 308.83D类x个=1.258毫克
单诊所,C2/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71075 Å
大厅符号:-C 2yc10539次反射的单元参数
= 14.9649 (6) Åθ= 3.3–27.4°
b条= 17.6062 (7) ŵ=0.36毫米1
c(c)= 12.5606 (5) ÅT型=298千
β= 99.9482 (11)°块状,无色
V(V)= 3259.6 (2) Å0.41×0.33×0.26毫米
Z轴= 8
数据收集 顶部
里加库R轴快速
衍射仪
2559次反射F类2> 2σ(F类2)
探测器分辨率:10.00像素mm-1R(右)整数=0.027
ω扫描θ最大值= 27.4°
吸收校正:多扫描
(ABSCOR公司; 东芝,1995年)
小时=1919
T型最小值=0.858,T型最大值= 0.911k=2222
15655次测量反射=1615
3708个独立反射
精炼 顶部
优化于F类2受约束的氢原子参数
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.040 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.121P(P))2]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
水风险(F类2) = 0.172(Δ/σ)最大值=0.001
S公司= 1.01Δρ最大值=0.27埃
3708次反射Δρ最小值=0.29埃
183个参数消光校正:SHELXL公司
0个约束消光系数:0.0028(7)
水晶数据 顶部
C15H(H)17氯化铵2操作系统V(V)= 3259.6 (2) Å
M(M)第页= 308.83Z轴= 8
单诊所,C2/c(c)K(K)α辐射
= 14.9649 (6) ŵ=0.36毫米1
b条= 17.6062 (7) ÅT型=298千
c(c)= 12.5606 (5) Å0.41×0.33×0.26毫米
β= 99.9482 (11)°
数据收集 顶部
Rigaku R轴快速
衍射仪
3708个独立反射
吸收校正:多扫描
(ABSCOR公司; 东芝,1995年)
2559次反射F类2> 2σ(F类2)
T型最小值= 0.858,T型最大值= 0.911R(右)整数=0.027
15655次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0400个约束
水风险(F类2) = 0.172受约束的氢原子参数
S公司= 1.01Δρ最大值=0.27埃
3708次反射Δρ最小值=0.29埃
183个参数
特殊细节 顶部

几何图形输入分子几何的特殊细节

精炼.使用所有反射进行优化。加权R(右)-因子(水风险)以及贴合度(S公司)基于F类2.R(右)-系数(gt)基于F类。的阈值表达式F类2> 2.0σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt)。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个zU型国际标准化组织*/U型等式
第1类0.02408 (6)0.70387 (4)0.59960 (9)0.1206 (3)
S1(第一阶段)0.46203 (3)0.39223 (3)0.44117 (3)0.0559 (2)
O1公司0.29216 (10)0.40983 (10)0.48366(10)0.0696(4)
N1型0.40090 (10)0.41256 (9)0.63283 (11)0.0496 (3)
氮气0.55713 (11)0.40575 (9)0.63079 (12)0.0530 (4)
C10.24241 (12)0.41401 (12)0.65622 (13)0.0534 (4)
指挥与控制0.18766 (12)0.48677 (12)0.64116 (13)0.0531 (4)
C3类0.18371 (13)0.53424 (12)0.72811 (17)0.0611 (5)
补体第四成份0.13313(17)0.60024 (12)0.7171 (2)0.0739 (6)
C5型0.08679(16)0.61988 (13)0.6158 (2)0.0756 (6)
C6级0.08973 (17)0.57396 (14)0.5282 (2)0.0790 (6)
抄送70.13902 (13)0.50774 (13)0.54031(16)0.0667 (5)
抄送80.31263 (12)0.41250 (11)0.58189 (13)0.0506 (4)
C9级0.47375 (12)0.40501 (10)0.57886 (13)0.0452 (4)
第10条0.61571 (13)0.39512 (12)0.55850 (16)0.0583 (5)
C11号机组0.57888 (13)0.38625 (12)0.45425 (16)0.0563 (5)
第12项0.62499 (18)0.37260 (17)0.35901 (19)0.0818 (7)
第13页0.18427 (14)0.34156(12)0.63811 (17)0.0646 (5)
第14项0.24379 (18)0.27066(14)0.6583 (2)0.0850 (7)
第15项0.11223(17)0.34038 (16)0.7103 (2)0.0856(7)
H1型0.27510.41310.73090.064*
H3级0.21600.52130.79570.073*
H4型0.13030.63090.77660.089*
H6型0.05830.58770.46050.095*
H7型0.14000.47650.48080.080*
H10型0.67820.39420.58120.070*
H13型0.15350.34090.56260.078*
2011年上半年0.41190.41750.70200.060*
H121型0.68960.37320.38230.098*
2012年上半年0.60810.41180.30620.098*
H123型0.60680.32410.32760.098*
第141页0.27290.26940.73260.102*
第142页0.28900.27190.61260.102*
H143型0.20680.22620.64220.102*
H151型0.07500.29600.69460.103*
第152页0.07520.38500.69720.103*
H153型0.14120.33930.78480.103*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
第1类0.1126 (6)0.0730 (4)0.1748 (9)0.0221 (3)0.0210 (5)0.0226(5)
S1(第一阶段)0.0557 (3)0.0783 (3)0.0340 (2)0.0055 (2)0.0085 (2)0.00354 (19)
O1公司0.0527 (8)0.1174 (13)0.0374 (7)0.0055(7)0.0038 (5)0.0021 (6)
N1型0.0439 (8)0.0725 (9)0.0325(7)0.0020 (6)0.0070 (5)0.0005(6)
氮气0.0462 (8)0.0767 (10)0.0363 (7)0.0003 (6)0.0074(6)0.0030 (6)
C10.0451 (10)0.0762 (12)0.0382 (8)0.0032(8)0.0052 (7)0.0008 (8)
指挥与控制0.0412 (9)0.0713 (11)0.0466 (9)0.0028 (8)0.0073 (7)0.0040 (8)
C3类0.0579 (11)0.0705 (12)0.0553 (10)0.0004 (9)0.0109 (8)0.0006 (9)
补体第四成份0.0711 (15)0.0687 (14)0.0854 (17)0.0069 (10)0.0233 (12)0.0088 (11)
C5型0.0608 (13)0.0676 (13)0.0987 (19)0.0022(10)0.0142 (12)0.0143 (13)
C6级0.0658 (14)0.0892 (17)0.0771(15)0.0059 (11)0.0015 (11)0.0222 (13)
抄送70.0589 (11)0.0826 (14)0.0546 (11)0.0032 (10)0.0012 (8)0.0027 (10)
抄送80.0454 (9)0.0673 (11)0.0388 (9)0.0019(7)0.0060 (7)0.0025 (7)
C9级0.0487 (9)0.0531 (9)0.0338 (7)0.0006 (6)0.0071 (6)0.0013 (6)
第10条0.0463 (10)0.0830 (14)0.0472 (10)0.0028 (8)0.0127 (8)0.0056 (8)
C11号机组0.0564 (11)0.0683 (11)0.0465 (10)0.0072 (8)0.0159 (8)0.0059 (8)
第12项0.0754 (15)0.118 (2)0.0586 (12)0.0162 (14)0.0299 (11)0.0212 (13)
第13页0.0569 (11)0.0775 (13)0.0589 (11)0.0026(9)0.0083 (9)0.0043 (10)
第14项0.0848 (17)0.0730(15)0.0990 (19)0.0032(12)0.0214(14)0.0015 (13)
第15项0.0702 (15)0.0908 (17)0.1022 (19)0.0038 (12)0.0331 (13)0.0192 (14)
几何参数(λ,º) 顶部
氯1-C51.744 (2)C13至C141.529 (3)
S1-C9号机组1.7227 (17)C13-C15年1.524 (3)
S1-C11号机组1.731 (2)N1-H111号0.860
O1-C8型1.220 (2)C1-H1型0.980
N1-C8型1.365 (2)C3-H3型0.930
N1-C9型1.386 (2)C4-H4型0.930
N2-C9气体1.304 (2)C6-H6型0.930
N2-C10气体1.380(2)C7-H7型0.930
C1-C2类1.515 (2)C10-H10型0.930
C1-C8号机组1.522 (2)C12-H121号0.960
C1-C13号机组1.539 (2)第122页0.960
C2-C3型1.385 (2)C12-H123型0.960
C2-C7型1.397 (2)C13-H13型0.980
C3-C4型1.381 (3)C14-H141号0.960
C4-C5型1.384 (3)C14-H142型0.960
C5至C61.372 (3)C14-H143型0.960
C6至C71.374 (3)C15-H151型0.960
C10-C11号机组1.339 (2)C15-H152型0.960
C11-C12号机组1.500 (3)C15-H153号0.960
C9-S1-C1189.24 (9)C13-C1-H1107.7
C8-N1-C9型123.37 (14)C2-C3-H3型119.1
C9-N2-C10109.35 (15)C4-C3-H3型119.1
C2-C1-C8型110.74 (16)C3-C4-H4型120.6
C2-C1-C13型113.75 (15)C5-C4-H4120.6
C8-C1-C13号机组109.12 (16)C5-C6-H6119.9
C1-C2-C3120.52 (15)C7-C6-H6型119.9
C1-C2-C7型121.50 (17)C2-C7-H7型119.7
C3-C2-C7型117.97 (19)C6-C7-H7型119.7
C2-C3-C4型121.75 (19)N2-C10-H10型121.4
C3-C4-C5型118.8(2)C11-C10-H10型121.4
氯1-C5-C4119.5 (2)C11-C12-H121109.5
氯1-C5-C6119.8 (2)C11-C12-H122109.5
C4-C5-C6120.6(2)C11-C12-H123109.5
C5-C6-C7120.1 (2)H121-C12-H122型109.5
C2-C7-C6型120.7 (2)H121-C12-H123109.5
O1-C8-N1型121.86 (17)H122-C12-H123型109.5
O1-C8-C1122.81(15)C1-C13-H13108.2
N1-C8-C1115.30 (14)C14-C13-H13型108.2
S1-C9-N1型123.45 (12)C15-C13-H13型108.2
S1-C9-N2型115.22(14)C13-C14-H141型109.5
N1-C9-N2型121.32 (15)C13-C14-H142型109.5
N2-C10-C11型117.29 (18)C13-C14-H143型109.5
S1-C11-C10型108.91 (16)H141-C14-H142型109.5
S1-C11-C12型122.03 (14)H141-C14-H143型109.5
C10-C11-C12号机组129.06 (19)H142-C14-H143型109.5
C1-C13-C14110.73 (18)C13-C15-H151型109.5
C1-C13-C15型111.30 (18)C13-C15-H152型109.5
C14-C13-C15型110.0(2)C13-C15-H153型109.5
C8-N1-H111型118.3H151-C15-H152型109.5
C9-N1-H111型118.3H151-C15-H153型109.5
C2-C1-H1型107.7H152-C15-H153型109.5
C8-C1-H1型107.7
C9-S1-C11-C100.73 (16)C13-C1-C2-C765.9 (2)
C9-S1-C11-C12178.9 (2)C8-C1-C13-C1457.6 (2)
C11-S1-C9-N1178.04 (16)C8-C1-C13-C15179.67 (16)
C11-S1-C9-N2型0.70(15)C13-C1-C8-O160.1 (2)
C8-N1-C9-S11.7 (2)C13-C1-C8-N1118.44 (17)
C8-N1-C9-N2型179.66 (17)C1-C2-C3-C4型178.9 (2)
C9-N1-C8-O14.1 (2)C1-C2-C7-C6180.0 (2)
C9-N1-C8-C1174.50 (16)C3-C2-C7-C60.7 (3)
C9-N2-C10-C110.2(2)C7-C2-C3-C40.4 (3)
C10-N2-C9-S1型0.4 (2)C2-C3-C4-C5型1.3 (3)
C10-N2-C9-N1178.33(16)C3-C4-C5-Cl1型178.89 (19)
C2-C1-C8-O1型65.9(2)C3-C4-C5-C6型1.1 (3)
C2-C1-C8-N1型115.61 (17)氯1-C5-C6-C7179.97 (13)
C8-C1-C2-C3123.34 (19)C4-C5-C6-C7型0.0 (3)
C8-C1-C2-C757.4 (2)C5-C6-C7-C2型0.9 (3)
C2-C1-C13-C14型178.17 (17)N2-C10-C11-S10.7 (2)
C2-C1-C13-C15型55.5 (2)N2-C10-C11-C12178.9 (2)
C13-C1-C2-C3113.3 (2)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H111···N20.862.082.929 (2)168
对称代码:(i)x个+1,,z+3/2.

实验细节

水晶数据
化学配方C15H(H)17氯化铵2操作系统
M(M)第页308.83
晶体系统,空间组单诊所,C2/c(c)
温度(K)298
,b条,c(c)(Å)14.9649 (6), 17.6062 (7), 12.5606 (5)
β(°)99.9482 (11)
V(V))3259.6 (2)
Z轴8
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.36
晶体尺寸(mm)0.41 × 0.33 × 0.26
数据收集
衍射仪Rigaku R轴快速
衍射仪
吸收校正多扫描
(ABSCOR公司; 东芝,1995年)
T型最小值,T型最大值0.858, 0.911
测量、独立和
观察到的[F类2> 2σ(F类2)]反射
15655, 3708, 2559
R(右)整数0.027
(罪θ/λ)最大值1)0.648
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.040, 0.172, 1.01
反射次数3708
参数数量183
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.27,0.29

计算机程序:自动处理(Rigaku,1998),晶体结构(里加库/MSC,2004年),97新加坡元(阿尔托马雷等。, 1999),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),转运蛋白-3(Farrugia,1997),晶体结构.

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
N1-H111···N20.862.082.929(2)168
对称代码:(i)x个+1,,z+3/2.
 

致谢

作者感谢国家自然科学基金(编号30700532)的支持,也感谢顾建明教授在晶体数据分析方面的帮助。

工具书类

第一次引用Altomare,A.,Burla,M.C.,Camalli,M.,Cascarano,G.L.,Giacovazzo,C.,Guagliardi,A.,Moliterni,A.G.G.,Polidori,G.&Spagna,R.(1999)。J.应用。克里斯特。 32, 115–119. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Farrugia,L.J.(1997)。J.应用。克里斯特。 30, 565. 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Forlani,L.(1978年)。化学杂志。Soc.Perkin变速箱。1第1169-1171页交叉参考 科学网 谷歌学者
第一次引用Higashi,T.(1995)。ABSCOR公司Rigaku Corporation,日本东京。 谷歌学者
第一次引用Holmstead,R.L.、Fullmer,D.G.和Ruzo,L.O.(1978年)。《农业杂志》。食品化学。 26, 954–959. 交叉参考 中国科学院 科学网 谷歌学者
第一次引用里加库(1998)。自动处理Rigaku Corporation,日本东京。 谷歌学者
第一次引用里加库/MSC(2004)。晶体结构里加库/MSC,美国德克萨斯州伍德兰谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。阿克塔·克里斯特。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Zhao,J.-H.,Cheng,J.-L.,Huang,Y.-K.和Zhu,G.-N.(2006)。阿克塔·克里斯特。电子62,o4840–o4841科学网 CSD公司 交叉参考 IUCr日志 谷歌学者

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